157 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_0991 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_0991  TatD-related deoxyribonuclease  100 
 
 		 380 aa  792    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2285  TatD-related deoxyribonuclease  62.71 
 
 		 307 aa  405  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.232496 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1549  TatD-related deoxyribonuclease  65.87 
 
 		 303 aa  402  1e-111  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.450153  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0159  TatD-related deoxyribonuclease  62.12 
 
 		 310 aa  403  1e-111  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0719337  hitchhiker  0.00000000000886366 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_7264  TatD-related deoxyribonuclease  59.73 
 
 		 328 aa  387  1e-106  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00204117  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0430  TatD-related deoxyribonuclease  57.68 
 
 		 328 aa  385  1e-106  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.340827  normal  0.921802 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2882  TatD-related deoxyribonuclease  56.4 
 
 		 342 aa  372  1e-102  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0088223 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_11120  predicted metal-dependent hydrolase with TIM-barrel fold protein  54.01 
 
 		 287 aa  319  5e-86  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.396729  normal  0.134022 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2328  TatD-related deoxyribonuclease  51.93 
 
 		 291 aa  308  6.999999999999999e-83  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0111836  normal  0.849083 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1555  TatD-related deoxyribonuclease  43.89 
 
 		 277 aa  221  1.9999999999999999e-56  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0778  TatD-related deoxyribonuclease  41.8 
 
 		 266 aa  214  1.9999999999999998e-54  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2472  TatD-related deoxyribonuclease  44 
 
 		 277 aa  207  3e-52  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.847165  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2432  TatD-related deoxyribonuclease  42.02 
 
 		 267 aa  205  1e-51  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1818  TatD-related deoxyribonuclease  41.25 
 
 		 267 aa  203  5e-51  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0988  TatD-related deoxyribonuclease  37.45 
 
 		 271 aa  197  3e-49  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.981061 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1417  TatD-related deoxyribonuclease  30.42 
 
 		 254 aa  116  6.9999999999999995e-25  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2017  TatD-related deoxyribonuclease  28.63 
 
 		 253 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0537  TatD-related deoxyribonuclease  28.2 
 
 		 262 aa  114  2.0000000000000002e-24  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1220  TatD-related deoxyribonuclease  29.57 
 
 		 253 aa  113  4.0000000000000004e-24  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0961  TatD-related deoxyribonuclease  27.41 
 
 		 251 aa  103  3e-21  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1205  TatD-related deoxyribonuclease  28.03 
 
 		 253 aa  99  1e-19  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4096  TatD-related deoxyribonuclease  29.27 
 
 		 275 aa  97.1  5e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.000024322  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3953  TatD-related deoxyribonuclease  29.53 
 
 		 275 aa  95.9  1e-18  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0197  TatD-related deoxyribonuclease  27.52 
 
 		 254 aa  95.9  1e-18  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.00720719  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0479  TatD-related deoxyribonuclease  27.65 
 
 		 253 aa  95.5  1e-18  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.671319  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4063  TatD-related deoxyribonuclease  28.29 
 
 		 275 aa  95.1  2e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.328978  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1429  TatD-related deoxyribonuclease  27.27 
 
 		 253 aa  95.1  2e-18  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.123471  normal  0.114014 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0471  TatD-related deoxyribonuclease  30.2 
 
 		 274 aa  79.3  0.00000000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.424562  normal  0.608215 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0107  hydrolase, TatD family  26.07 
 
 		 256 aa  69.7  0.00000000008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000974122  hitchhiker  0.000198831 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2529  TatD family hydrolase  24.64 
 
 		 256 aa  68.6  0.0000000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2843  TatD family hydrolase  23.84 
 
 		 256 aa  64.7  0.000000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0481  TatD-related deoxyribonuclease  26.69 
 
 		 256 aa  60.5  0.00000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0044  hydrolase, TatD family  26.14 
 
 		 256 aa  58.2  0.0000003  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0168  hydrolase, TatD family  26.07 
 
 		 255 aa  56.6  0.0000007  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.61634  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0049  TatD-related deoxyribonuclease  25.54 
 
 		 256 aa  55.5  0.000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000233797 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0129  hydrolase, TatD family  24.19 
 
 		 259 aa  54.7  0.000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0130316  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1774  deoxyribonuclease, putative  25.12 
 
 		 258 aa  54.7  0.000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2095  TatD family hydrolase  23.84 
 
 		 255 aa  54.7  0.000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5088  putative deoxyribonuclease, TatD family  22.01 
 
 		 254 aa  53.5  0.000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.279248  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0891  Sec-independent protein translocase TatD  28.37 
 
 		 250 aa  53.5  0.000006  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2510  TatD family hydrolase  27.78 
 
 		 462 aa  53.5  0.000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000460878  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0604  TatD-related deoxyribonuclease  23.79 
 
 		 262 aa  52.8  0.00001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1782  TatD family deoxyribonuclease  24.28 
 
 		 260 aa  52  0.00002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1695  Mg-dependent DNase  22.61 
 
 		 464 aa  52  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1096  deoxyribonuclease of TatD family protein  24.88 
 
 		 258 aa  51.6  0.00002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.664033  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0199  TatD-related deoxyribonuclease  21.69 
 
 		 256 aa  52  0.00002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0238  putative deoxyribonuclease, TatD family  21.27 
 
 		 254 aa  50.8  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.331267  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0034  hydrolase, TatD family  21.09 
 
 		 256 aa  50.8  0.00003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.301628  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0051  TatD family hydrolase  24.26 
 
 		 255 aa  51.6  0.00003  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.563269  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2238  hydrolase, TatD family  22.6 
 
 		 457 aa  51.2  0.00003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0963  TatD family hydrolase  26.09 
 
 		 256 aa  50.8  0.00004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0262  TatD family hydrolase  24.7 
 
 		 256 aa  50.8  0.00004  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0578567  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0068  hydrolase, TatD family  22.22 
 
 		 253 aa  50.4  0.00005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00105138  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3114  TatD family hydrolase  31.72 
 
 		 268 aa  50.4  0.00005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.677659  normal  0.341817 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_3219  hydrolase, TatD family  26.57 
 
 		 272 aa  49.7  0.00009  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1700  TatD-related deoxyribonuclease  25.27 
 
 		 270 aa  49.3  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.294138  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21920  hydrolase, TatD family  29.38 
 
 		 257 aa  49.3  0.0001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1656  hydrolase, TatD family  36.47 
 
 		 269 aa  49.7  0.0001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1991  TatD-related deoxyribonuclease  24.85 
 
 		 296 aa  48.9  0.0001  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.126048  decreased coverage  0.0000779322 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1289  TatD family hydrolase  24.82 
 
 		 259 aa  49.3  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0048  deoxyribonuclease, TatD family  23.3 
 
 		 255 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0034  TatD family hydrolase  23.19 
 
 		 255 aa  49.3  0.0001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0262  hydrolase, TatD family  25.98 
 
 		 251 aa  48.9  0.0001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000135646  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2489  TatD family deoxyribonuclease  23.94 
 
 		 462 aa  48.5  0.0002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0237  TatD family deoxyribonuclease  22.28 
 
 		 265 aa  48.1  0.0002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.108192  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0038  TatD family deoxyribonuclease  25.12 
 
 		 255 aa  48.5  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0035  TatD related DNase  25.12 
 
 		 255 aa  48.5  0.0002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2464  TatD-related deoxyribonuclease:radical SAM family protein  23.83 
 
 		 606 aa  48.1  0.0002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0037  TatD family deoxyribonuclease  25.12 
 
 		 255 aa  48.5  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0044  deoxyribonuclease, TatD family  25.12 
 
 		 255 aa  48.5  0.0002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0030  hydrolase, TatD family  23.51 
 
 		 263 aa  48.9  0.0002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.572785  normal  0.0962999 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1702  TatD family hydrolase  27.54 
 
 		 461 aa  48.1  0.0002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00243326  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1511  hydrolase, TatD family  24.66 
 
 		 253 aa  48.1  0.0002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00000000902805  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1615  putative metallodependent hydrolase  33.02 
 
 		 264 aa  48.5  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.0000000236116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0264  TatD family hydrolase  24.1 
 
 		 256 aa  48.5  0.0002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.281145  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0246  hydrolase, TatD family  27.22 
 
 		 256 aa  48.9  0.0002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1826  TatD-related deoxyribonuclease  34.4 
 
 		 259 aa  48.5  0.0002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4560  hydrolase, TatD family  27.05 
 
 		 280 aa  48.5  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2159  hypothetical protein  25.24 
 
 		 228 aa  48.5  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.575191  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1511  hydrolase, TatD family  24.91 
 
 		 293 aa  48.1  0.0003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.234409  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1801  hydrolase, TatD family  25.24 
 
 		 260 aa  47.8  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.164417  normal  0.0298218 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2068  TatD-related deoxyribonuclease  24.91 
 
 		 262 aa  47.8  0.0003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2855  hydrolase, TatD family  25.48 
 
 		 269 aa  48.1  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0246  TatD family hydrolase  23.57 
 
 		 258 aa  47.8  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1984  hydrolase, TatD family  26.76 
 
 		 269 aa  47.8  0.0003  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.902783  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0034  TatD family hydrolase  24.82 
 
 		 255 aa  48.1  0.0003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0037  TatD family deoxyribonuclease  24.45 
 
 		 255 aa  47.4  0.0004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3117  hydrolase, TatD family  24.09 
 
 		 262 aa  47.4  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0535409  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1010  hydrolase, TatD family  25.6 
 
 		 258 aa  47.4  0.0004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5272  deoxyribonuclease, TatD family  24.45 
 
 		 255 aa  47.4  0.0005  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0044  deoxyribonuclease, TatD family  24.45 
 
 		 255 aa  47  0.0005  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.413884  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0512  TatD family hydrolase  22.5 
 
 		 257 aa  47  0.0005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.155633  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0525  TatD family hydrolase  22.5 
 
 		 257 aa  47  0.0005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.117566  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0540  hydrolase, TatD family  27.17 
 
 		 267 aa  47.4  0.0005  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1018  TatD family hydrolase  25.48 
 
 		 261 aa  47.4  0.0005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.195274  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1533  TatD family hydrolase  25.24 
 
 		 271 aa  47  0.0006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.714911  normal  0.473764 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0212  TatD family deoxyribonuclease  21 
 
 		 254 aa  46.6  0.0007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0222  TatD family deoxyribonuclease  21 
 
 		 254 aa  46.6  0.0007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2224  putative metallodependent hydrolase  26.92 
 
 		 265 aa  46.6  0.0007  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.0000510394  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1479  putative metallodependent hydrolase  26.92 
 
 		 265 aa  46.6  0.0008  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000171284  hitchhiker  0.0000000124971 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>