More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_5065 on replicon NC_014211
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007333  Tfu_2683  NADH dehydrogenase subunit M  66.49 
 
 
521 aa  711    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5065  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  100 
 
 
555 aa  1073    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0596  NADH dehydrogenase (quinone)  64.83 
 
 
509 aa  588  1e-167  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.815561  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4406  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  56.89 
 
 
516 aa  548  1e-155  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0293  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase subunit M  62.06 
 
 
502 aa  531  1e-149  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7679  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  60.47 
 
 
526 aa  528  1e-148  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4451  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  57.82 
 
 
510 aa  503  1e-141  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0655371 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1535  NADH dehydrogenase subunit M  56.49 
 
 
519 aa  499  1e-140  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.486598  normal  0.50499 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1873  NADH dehydrogenase subunit M  53.57 
 
 
526 aa  498  1e-140  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4053  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  57.44 
 
 
510 aa  498  1e-139  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.596762 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1565  NADH dehydrogenase subunit M  56.74 
 
 
517 aa  495  1e-139  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1589  NADH dehydrogenase subunit M  56.74 
 
 
518 aa  495  9.999999999999999e-139  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2704  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  54.04 
 
 
514 aa  489  1e-137  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4493  NADH dehydrogenase subunit M  54.09 
 
 
511 aa  483  1e-135  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.803352  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6082  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  52.6 
 
 
519 aa  482  1e-135  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.596347  normal  0.0617522 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1286  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase chain M  53.49 
 
 
509 aa  475  1e-133  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.763724  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13178  NADH dehydrogenase subunit M  52.99 
 
 
553 aa  470  1.0000000000000001e-131  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.146902  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0279  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  50.28 
 
 
507 aa  464  1e-129  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.716259  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0390  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  50.9 
 
 
535 aa  461  9.999999999999999e-129  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6670  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  52.77 
 
 
520 aa  461  9.999999999999999e-129  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0551  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  51.33 
 
 
507 aa  461  9.999999999999999e-129  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.253401  normal  0.781277 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0550  NADH dehydrogenase subunit M  53.29 
 
 
562 aa  437  1e-121  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.291589 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4546  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  53.77 
 
 
545 aa  436  1e-121  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.814127  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0532  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  51.05 
 
 
509 aa  437  1e-121  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3217  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  54.61 
 
 
507 aa  429  1e-119  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.141162  normal  0.0503138 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0986  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  52.87 
 
 
588 aa  422  1e-117  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_07500  NADH dehydrogenase subunit M  48.8 
 
 
567 aa  412  1e-114  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0225564 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3180  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  53.79 
 
 
491 aa  414  1e-114  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03280  NADH dehydrogenase subunit M  48.54 
 
 
534 aa  404  1e-111  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.992511 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0481  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  52.42 
 
 
527 aa  393  1e-108  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4232  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  42.07 
 
 
525 aa  370  1e-101  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0177133  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3343  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  40.97 
 
 
519 aa  360  4e-98  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.816819 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0350  NADH dehydrogenase I, M subunit  41.49 
 
 
522 aa  353  4e-96  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3623  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  41.94 
 
 
497 aa  350  5e-95  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0933316 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3126  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  44.24 
 
 
535 aa  347  4e-94  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0443  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  45.26 
 
 
542 aa  345  2e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0442  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  45.26 
 
 
542 aa  345  2e-93  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.990094  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0414  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  45.26 
 
 
542 aa  343  4e-93  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0425  NADH dehydrogenase subunit M  44.13 
 
 
496 aa  341  2e-92  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.271774  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1817  NADH dehydrogenase subunit M  44.13 
 
 
496 aa  341  2e-92  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1302  NADH dehydrogenase subunit M  44.13 
 
 
496 aa  341  2e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.982872  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1448  NADH dehydrogenase subunit M  44.13 
 
 
496 aa  341  2e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3998  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  43.12 
 
 
535 aa  341  2e-92  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000144113 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1142  NADH dehydrogenase subunit M  44.13 
 
 
496 aa  341  2e-92  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.400671  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1311  NADH dehydrogenase subunit M  44.13 
 
 
496 aa  341  2e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1073  NADH dehydrogenase subunit M  44.35 
 
 
496 aa  341  2e-92  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0725  NADH dehydrogenase subunit M  44.13 
 
 
496 aa  341  2e-92  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.10971  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3914  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  42.86 
 
 
535 aa  341  2.9999999999999998e-92  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0719914  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1728  NADH dehydrogenase subunit M  40.45 
 
 
512 aa  340  4e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.694351  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1365  NADH dehydrogenase subunit M  41.1 
 
 
503 aa  339  8e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.288443  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1567  NADH dehydrogenase subunit M  40.79 
 
 
510 aa  339  9.999999999999999e-92  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0145309  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1273  NADH dehydrogenase subunit M  40.7 
 
 
503 aa  337  2.9999999999999997e-91  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.218995  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2154  NADH dehydrogenase subunit M  44.16 
 
 
496 aa  336  5e-91  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.575239  normal  0.457666 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5565  NADH dehydrogenase subunit M  44.16 
 
 
496 aa  336  5e-91  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0400022  normal  0.331028 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2275  NADH dehydrogenase subunit M  43.94 
 
 
496 aa  334  2e-90  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.229712  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2261  NADH dehydrogenase subunit M  44.87 
 
 
496 aa  333  4e-90  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.796685  normal  0.444802 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1040  NADH dehydrogenase subunit M  45.1 
 
 
496 aa  333  4e-90  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.926201  normal  0.336803 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1625  NADH dehydrogenase subunit M  44.87 
 
 
496 aa  333  4e-90  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.209377  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2237  NADH dehydrogenase subunit M  44.87 
 
 
496 aa  333  4e-90  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.759454  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2232  NADH dehydrogenase subunit M  41.54 
 
 
513 aa  331  2e-89  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.976155 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1992  NADH dehydrogenase subunit M  41.47 
 
 
513 aa  330  3e-89  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4155  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  44.61 
 
 
534 aa  331  3e-89  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0166298 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1034  NADH dehydrogenase subunit M  42.31 
 
 
501 aa  330  5.0000000000000004e-89  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2411  NADH dehydrogenase subunit M  40.53 
 
 
502 aa  329  8e-89  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0139684  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1929  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  42.44 
 
 
585 aa  328  1.0000000000000001e-88  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.341288  normal  0.991992 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0759  NADH dehydrogenase subunit M  40.21 
 
 
521 aa  328  1.0000000000000001e-88  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3212  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  42.17 
 
 
517 aa  328  2.0000000000000001e-88  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3286  NADH dehydrogenase subunit M  41.15 
 
 
505 aa  328  2.0000000000000001e-88  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.573256  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1875  NADH dehydrogenase subunit M  37.85 
 
 
502 aa  327  3e-88  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.123353  normal  0.162516 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2873  NADH dehydrogenase subunit M  40.72 
 
 
505 aa  327  4.0000000000000003e-88  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.593537  normal  0.190787 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4621  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  40.33 
 
 
503 aa  327  4.0000000000000003e-88  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.0225414 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01299  NADH dehydrogenase subunit M  39.37 
 
 
491 aa  326  5e-88  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.648189  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0814  NADH dehydrogenase subunit M  40.34 
 
 
502 aa  326  7e-88  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.669912  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2529  NADH dehydrogenase subunit M  41.1 
 
 
513 aa  325  1e-87  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0432269  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1997  NADH dehydrogenase subunit M  42.73 
 
 
497 aa  324  2e-87  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.425538  normal  0.176809 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1195  NADH dehydrogenase subunit M  41.2 
 
 
514 aa  324  2e-87  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1190  NADH dehydrogenase subunit M  40.89 
 
 
513 aa  323  4e-87  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.602239  normal  0.417902 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3202  NADH dehydrogenase subunit M  44.03 
 
 
496 aa  323  4e-87  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.422188  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1355  NADH dehydrogenase subunit M  43.6 
 
 
496 aa  323  4e-87  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000992227  normal  0.0345123 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2586  NADH dehydrogenase subunit M  40.3 
 
 
505 aa  323  5e-87  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.277846  normal  0.933861 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0809  NADH dehydrogenase subunit M  40.13 
 
 
502 aa  323  7e-87  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4549  NADH dehydrogenase subunit M  40.17 
 
 
502 aa  321  1.9999999999999998e-86  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.899725  normal  0.177769 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3214  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  39.55 
 
 
514 aa  320  3e-86  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0790  NADH dehydrogenase subunit M  41.44 
 
 
489 aa  320  5e-86  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0146664  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1328  NADH dehydrogenase subunit M  41.08 
 
 
515 aa  319  7.999999999999999e-86  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0365587 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2386  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  39.95 
 
 
507 aa  319  7.999999999999999e-86  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0446554  normal  0.771852 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2930  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  40.65 
 
 
503 aa  318  1e-85  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2208  NADH dehydrogenase subunit M  39.45 
 
 
502 aa  318  1e-85  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4138  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  40.63 
 
 
506 aa  317  3e-85  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.68162  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0902  NADH dehydrogenase subunit M  41.13 
 
 
503 aa  317  3e-85  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.485511  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0720  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  39.46 
 
 
504 aa  317  3e-85  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.362005  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2416  NADH dehydrogenase subunit M  41.1 
 
 
506 aa  317  4e-85  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.185861  hitchhiker  0.00201163 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1304  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  42.83 
 
 
521 aa  317  4e-85  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.278041  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2819  NADH dehydrogenase subunit M  39.25 
 
 
502 aa  317  5e-85  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2050  NADH dehydrogenase subunit M  41.06 
 
 
488 aa  315  9.999999999999999e-85  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.232549  normal  0.0955875 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2997  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  42.06 
 
 
508 aa  315  1.9999999999999998e-84  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0150  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  39.17 
 
 
508 aa  314  1.9999999999999998e-84  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000116263  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1248  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  43.37 
 
 
534 aa  314  1.9999999999999998e-84  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.130648  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1202  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  40.09 
 
 
527 aa  314  2.9999999999999996e-84  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1073  proton-translocating NADH-quinone oxidoreductase, chain M  40.09 
 
 
527 aa  313  3.9999999999999997e-84  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.397792  normal  0.614174 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>