187 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_3151 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_3151  SirA family protein  100 
 
 		 82 aa  166  1e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1014  putative aminotransferase  74.32 
 
 		 78 aa  123  9e-28  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0541001  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3080  SirA family protein  68.06 
 
 		 115 aa  107  4.0000000000000004e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000709238  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1287  SirA family protein  59.04 
 
 		 104 aa  97.8  4e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.413798  normal  0.313223 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2668  SirA-like protein  53.09 
 
 		 89 aa  92.8  1e-18  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.220469  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3302  SirA family protein  46.38 
 
 		 76 aa  76.3  0.0000000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.267105 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3534  SirA family protein  44.29 
 
 		 76 aa  75.5  0.0000000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.724974  decreased coverage  0.000159335 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1779  SirA family protein  39.71 
 
 		 81 aa  60.5  0.000000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1451  SirA family protein  43.55 
 
 		 75 aa  58.9  0.00000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0967  SirA family protein  35.21 
 
 		 72 aa  57.8  0.00000005  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.500955  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3119  putative aminotransferase  47.54 
 
 		 62 aa  57.8  0.00000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.711998  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3436  SirA family protein  36.23 
 
 		 81 aa  57.4  0.00000006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000543679  normal  0.174019 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00453  sulfur transfer protein SirA  36.92 
 
 		 82 aa  57.4  0.00000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0010  sirA protein  35.09 
 
 		 81 aa  56.6  0.0000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001993  tRNA 5-methylaminomethyl-2-thiouridine synthase TusA  35.38 
 
 		 82 aa  56.6  0.0000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04046  sirA protein  39.29 
 
 		 86 aa  56.6  0.0000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1799  SirA family protein  47.95 
 
 		 79 aa  57  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.297701 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1827  sulfur transfer protein SirA  38.24 
 
 		 84 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0248688  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3143  SirA family protein  45.71 
 
 		 82 aa  55.5  0.0000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2968  sulfur transfer protein SirA  35.29 
 
 		 83 aa  56.2  0.0000002  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0282279  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2495  sulfur transfer protein SirA  36.92 
 
 		 82 aa  55.8  0.0000002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1455  SirA family protein  52.94 
 
 		 74 aa  55.1  0.0000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.316855  normal  0.421643 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0436  SirA-like  29.41 
 
 		 75 aa  55.1  0.0000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1670  SirA family protein  36.76 
 
 		 80 aa  54.7  0.0000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4069  SirA family protein  37.5 
 
 		 81 aa  54.7  0.0000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3882  SirA family protein  37.29 
 
 		 81 aa  54.3  0.0000006  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0205  SirA family protein  36.84 
 
 		 81 aa  53.9  0.0000008  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.106509 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03319  cell developmental protein SirA  33.33 
 
 		 81 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0245  SirA family protein  33.33 
 
 		 81 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0094  SirA family protein  37.5 
 
 		 97 aa  53.1  0.000001  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.249319  normal  0.118348 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3852  sulfur transfer protein SirA  33.33 
 
 		 81 aa  53.1  0.000001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0246  sulfur transfer protein SirA  33.33 
 
 		 81 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3986  sulfur transfer protein SirA  35 
 
 		 84 aa  53.1  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1300  SirA family protein  36.76 
 
 		 77 aa  53.1  0.000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.0506875  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0570  sulfur transfer protein SirA  35 
 
 		 84 aa  53.1  0.000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0092  sulfur transfer protein SirA  35 
 
 		 80 aa  53.1  0.000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3770  hypothetical protein  33.33 
 
 		 111 aa  53.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3847  hypothetical protein  33.33 
 
 		 111 aa  53.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3780  hypothetical protein  33.33 
 
 		 111 aa  53.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2932  SirA family protein  28.57 
 
 		 77 aa  53.5  0.000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3754  sulfur transfer protein SirA  33.33 
 
 		 81 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3950  hypothetical protein  33.33 
 
 		 111 aa  53.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.785107  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3877  sulfur transfer protein SirA  31.88 
 
 		 81 aa  53.1  0.000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.899871  normal  0.161761 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03272  hypothetical protein  33.33 
 
 		 81 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4790  sulfur transfer protein SirA  33.33 
 
 		 81 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0232  sulfur transfer protein SirA  35 
 
 		 84 aa  53.1  0.000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3890  hypothetical protein  33.33 
 
 		 111 aa  53.1  0.000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3669  sulfur transfer protein SirA  33.33 
 
 		 81 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3952  sulfur transfer protein SirA  33.33 
 
 		 81 aa  53.1  0.000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4280  SirA-like  29.41 
 
 		 83 aa  52.8  0.000002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.277621  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0404  SirA family protein  42 
 
 		 81 aa  52.4  0.000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.188444  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0087  sulfur transfer protein SirA  34.38 
 
 		 81 aa  52.8  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.253958  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1458  SirA-like  34.78 
 
 		 78 aa  52  0.000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  hitchhiker  0.000274297  normal  0.357093 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2570  SirA family protein  34.38 
 
 		 78 aa  52  0.000003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0845145  normal  0.388571 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1633  sulfur transfer protein SirA  31.94 
 
 		 80 aa  51.6  0.000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.972147 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2018  SirA protein, putative  35.29 
 
 		 84 aa  51.6  0.000004  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0674453  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2116  sulfur transfer protein SirA  31.94 
 
 		 80 aa  50.8  0.000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.101058 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3888  sulfur transfer protein SirA  32.5 
 
 		 83 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.420847  normal  0.0778981 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1656  sulfur transfer protein SirA  31.94 
 
 		 80 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.100562  normal  0.450785 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0225  regulator of information in SirA family protein  37.74 
 
 		 78 aa  51.2  0.000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3625  sulfur transfer protein SirA  31.94 
 
 		 80 aa  50.8  0.000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.385858 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3766  sulfur transfer protein SirA  33.82 
 
 		 79 aa  51.2  0.000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.769061  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44270  sulfur transfer protein SirA  33.82 
 
 		 79 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0019  sulfur transfer protein SirA  27.94 
 
 		 81 aa  50.4  0.000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0017  sulfur transfer protein SirA  33.93 
 
 		 81 aa  50.8  0.000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000196342 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0015  sulfur transfer protein SirA  29.41 
 
 		 81 aa  50.8  0.000007  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0331062  normal  0.432402 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0020  sulfur transfer protein SirA  33.93 
 
 		 81 aa  50.4  0.000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000878962 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0012  sulfur transfer protein SirA  29.41 
 
 		 81 aa  50.4  0.000009  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1254  hypothetical protein  34.78 
 
 		 77 aa  50.1  0.00001  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2339  SirA family protein  33.82 
 
 		 75 aa  49.7  0.00001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0889916  normal  0.318145 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0017  sulfur transfer protein SirA  27.94 
 
 		 81 aa  49.7  0.00001  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000123371 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0021  sulfur transfer protein SirA  33.93 
 
 		 81 aa  49.7  0.00001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.628095  hitchhiker  0.000000017124 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0018  sulfur transfer protein SirA  27.94 
 
 		 81 aa  49.7  0.00001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0017  sulfur transfer protein SirA  27.94 
 
 		 81 aa  49.7  0.00001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.0103959 
 
 
-
 
NC_004310  BR2034  hypothetical protein  34.38 
 
 		 85 aa  48.9  0.00002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.358481  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1626  SirA-like  31.43 
 
 		 75 aa  48.9  0.00002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000122761  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1572  sulfur transfer protein SirA  32.73 
 
 		 79 aa  49.7  0.00002  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0013  sulfur transfer protein SirA  32.14 
 
 		 81 aa  49.3  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000182945 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0013  sulfur transfer protein SirA  32.14 
 
 		 81 aa  49.3  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.0557081 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0794  SirA family protein  29.41 
 
 		 76 aa  49.3  0.00002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000819157  normal  0.19401 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1218  SirA family protein  36.67 
 
 		 77 aa  49.3  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0011  sulfur transfer protein SirA  32.14 
 
 		 81 aa  49.3  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.119018  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0013  sulfur transfer protein SirA  32.14 
 
 		 81 aa  49.3  0.00002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0904  SirA family protein  35.94 
 
 		 78 aa  48.9  0.00002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.849606  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2653  SirA-like protein  43.14 
 
 		 78 aa  48.5  0.00003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00012248  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3894  SirA family protein  32.86 
 
 		 74 aa  48.5  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.401469  hitchhiker  0.00420681 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0093  SirA-like protein  34.72 
 
 		 82 aa  48.5  0.00003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0011  sulfur transfer protein SirA  33.93 
 
 		 81 aa  48.5  0.00003  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1085  SirA family protein  27.54 
 
 		 77 aa  48.5  0.00003  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0962  SirA family protein  31.43 
 
 		 92 aa  48.1  0.00004  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.3564  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0353  SirA-like  30.3 
 
 		 77 aa  48.1  0.00004  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0013  sulfur transfer protein SirA  33.33 
 
 		 81 aa  48.1  0.00004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000321499  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2558  SirA family protein  33.33 
 
 		 80 aa  48.1  0.00004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.488236 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1311  SirA family protein  33.8 
 
 		 200 aa  48.1  0.00004  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0861  SirA-like  32.35 
 
 		 75 aa  47.8  0.00005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3059  SirA-like  35.94 
 
 		 76 aa  47.8  0.00005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.282994  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_20060  sulfur transfer protein SirA  27.94 
 
 		 85 aa  47.8  0.00005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2890  SirA family protein  35.71 
 
 		 189 aa  47.8  0.00006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3601  SirA family protein  34.38 
 
 		 74 aa  47.4  0.00008  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2411  SirA-like protein  29.85 
 
 		 83 aa  47  0.00008  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>