More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2689 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_2689  N-6 DNA methylase  100 
 
 		 709 aa  1361    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.227134 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1917  N-6 DNA methylase  40.26 
 
 		 673 aa  347  5e-94  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00444003  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0961  N-6 DNA methylase  38.66 
 
 		 677 aa  344  2.9999999999999997e-93  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1409  N-6 DNA methylase  39.55 
 
 		 698 aa  335  2e-90  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0261  hypothetical protein  39.11 
 
 		 680 aa  314  2.9999999999999996e-84  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.746292  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1912  N-6 DNA methylase  39.86 
 
 		 691 aa  309  1.0000000000000001e-82  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0212938  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1580  Type I restriction-modification system methyltransferase subunit-like protein  37.52 
 
 		 636 aa  305  3.0000000000000004e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0850  N-6 DNA methylase  37.53 
 
 		 675 aa  278  2e-73  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.149563 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1637  N-6 DNA methylase  35.14 
 
 		 625 aa  271  2.9999999999999997e-71  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.579596 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2731  N-6 DNA methylase  37.12 
 
 		 626 aa  262  2e-68  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.427246 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2674  N-6 DNA methylase  34.44 
 
 		 746 aa  231  5e-59  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.559823  normal  0.558712 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1349  putative type I restriction system adenine methylase  37.8 
 
 		 558 aa  140  7e-32  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2599  type I restriction-modification system, M subunit  26.46 
 
 		 505 aa  107  7e-22  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0274218  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0039  N-6 DNA methylase  27.68 
 
 		 501 aa  106  2e-21  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.250679  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2927  type I restriction-modification system, M subunit  31.14 
 
 		 504 aa  103  8e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0019  N-6 DNA methylase  26.94 
 
 		 501 aa  103  9e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00151011 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3429  type I restriction-modification system, M subunit  29.88 
 
 		 505 aa  102  2e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4819  N-6 DNA methylase  27.11 
 
 		 499 aa  102  2e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1779  type I restriction-modification system specificity subunit  27.46 
 
 		 799 aa  102  3e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1644  N-6 DNA methylase  26.62 
 
 		 498 aa  102  3e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3981  N-6 DNA methylase  25.89 
 
 		 499 aa  101  4e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.625863  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0788  type I restriction-modification system, M subunit  26.58 
 
 		 523 aa  100  7e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.237272  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0840  type I restriction-modification system, M subunit  26.58 
 
 		 508 aa  100  8e-20  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.10678  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0286  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  26.24 
 
 		 497 aa  100  8e-20  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0369  type I restriction-modification system, M subunit  27.71 
 
 		 871 aa  100  1e-19  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0952  type I restriction-modification system, M subunit  25.93 
 
 		 809 aa  99  2e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000609916 
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1539  type I restriction-modification system, M subunit  24.34 
 
 		 500 aa  98.2  5e-19  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  hitchhiker  0.00000000154488  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06810  type I restriction enzyme M protein  27.25 
 
 		 526 aa  97.4  8e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0224  Type I restriction-modification system, M subunit  28.76 
 
 		 519 aa  97.4  8e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0405  type I restriction-modification system, M subunit  27.43 
 
 		 799 aa  97.4  8e-19  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2853  N-6 DNA methylase  29.92 
 
 		 810 aa  96.3  2e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0991376 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0988  N-6 DNA methylase  27.97 
 
 		 527 aa  96.3  2e-18  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4623  type I restriction-modification system, M subunit  27.35 
 
 		 810 aa  95.9  2e-18  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.218097 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2908  N-6 DNA methylase  26.12 
 
 		 523 aa  95.5  3e-18  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0251  type I restriction-modification system, M subunit  28.11 
 
 		 808 aa  94.7  4e-18  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0286  N4/N6-methyltransferase family protein  25.37 
 
 		 569 aa  95.1  4e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2193  type I restriction-modification system, M subunit  28.76 
 
 		 847 aa  95.1  4e-18  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.184981  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4006  N-6 DNA methylase  23.96 
 
 		 514 aa  95.1  4e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0450  type I restriction-modification system, M subunit  26.6 
 
 		 537 aa  95.1  4e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00003054 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_17670  type I restriction-modification system methyltransferase subunit  25.58 
 
 		 503 aa  95.1  4e-18  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0383  type I restriction-modification system, M subunit  25.96 
 
 		 585 aa  94.7  5e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0942  Type I restriction-modification system M subunit  24.79 
 
 		 495 aa  94.7  5e-18  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.100571  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2033  N-6 DNA methylase  35.42 
 
 		 775 aa  94.7  5e-18  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.599209  normal  0.628554 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3794  type I restriction-modification system, M subunit  25 
 
 		 574 aa  94.7  5e-18  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2691  N-6 DNA methylase  29 
 
 		 523 aa  94.7  5e-18  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0869  N-6 DNA methylase  28.88 
 
 		 510 aa  94.4  6e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0925  type I restriction-modification system, M subunit  25.63 
 
 		 535 aa  94.4  6e-18  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  decreased coverage  0.000528021  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2789  N-6 DNA methylase  27.18 
 
 		 532 aa  94.4  6e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.206405 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3128  N-6 DNA methylase  26.4 
 
 		 518 aa  94.4  7e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.465456  decreased coverage  0.00982418 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3148  N-6 DNA methylase  28.06 
 
 		 540 aa  94.4  7e-18  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.303766 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1220  type I restriction-modification system, M subunit  24.59 
 
 		 540 aa  94  8e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.107175  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1222  N-6 DNA methylase  28.64 
 
 		 519 aa  94  8e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2389  type I restriction-modification system, M subunit  25.26 
 
 		 574 aa  94  8e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.48944  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1096  N-6 DNA methylase  32.81 
 
 		 543 aa  94  9e-18  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2236  N-6 DNA methylase  28.49 
 
 		 528 aa  92.8  2e-17  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1086  type I restriction-modification system, M subunit  27.5 
 
 		 576 aa  92.8  2e-17  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1120  type I restriction-modification system specificity subunit  27.7 
 
 		 527 aa  93.2  2e-17  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2743  type I restriction system adenine methylase  32.29 
 
 		 518 aa  92.8  2e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1792  N-6 adenine-specific DNA methylase  26.85 
 
 		 587 aa  92.8  2e-17  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1102  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine- specific)  33.16 
 
 		 548 aa  93.2  2e-17  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.358797  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2248  N-6 DNA methylase  27.52 
 
 		 521 aa  92.8  2e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0522014  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0427  type I restriction-modification system, M subunit  28.11 
 
 		 827 aa  92  3e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0032  N-6 DNA methylase  27.85 
 
 		 544 aa  92  3e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.885751  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0161  type I restriction-modification system, M subunit  25.71 
 
 		 506 aa  92  3e-17  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3551  type I restriction-modification system, M subunit  30.04 
 
 		 499 aa  92  3e-17  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.795147  normal  0.253327 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2791  type I restriction-modification system, M subunit  29.03 
 
 		 633 aa  92.4  3e-17  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2017  N-6 DNA methylase  31.77 
 
 		 517 aa  91.7  4e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.54323  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1858  N-6 DNA methylase  30.54 
 
 		 540 aa  91.7  4e-17  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1089  N-6 DNA methylase  27.96 
 
 		 527 aa  90.9  6e-17  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2453  Site-specific DNA-methyltransferase (adenine-specific)  31.63 
 
 		 538 aa  90.9  7e-17  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.53896  normal  0.845275 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2909  N4/N6-methyltransferase family protein  25.27 
 
 		 515 aa  90.9  7e-17  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0036  type I restriction enzyme  21.07 
 
 		 510 aa  90.5  1e-16  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  0.27058  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1303  N-6 DNA methylase  27.55 
 
 		 529 aa  89.4  2e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.529987 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3006  N-6 DNA methylase  30.05 
 
 		 520 aa  89.7  2e-16  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.809429  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2666  type I restriction-modification system specificity subunit  23.55 
 
 		 508 aa  88.6  3e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.289078  normal  0.157244 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1672  N-6 DNA methylase  25.31 
 
 		 516 aa  89  3e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.179457  hitchhiker  0.001187 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1085  type I restriction-modification system, M subunit  23.73 
 
 		 547 aa  88.6  3e-16  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.103049  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2372  type I restriction-modification system, M subunit  24.38 
 
 		 537 aa  89  3e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.728855  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2003  type I restriction-modification system, M subunit  24.38 
 
 		 537 aa  89  3e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2903  Type I restriction-modification system M subunit  26.35 
 
 		 574 aa  88.2  4e-16  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0483  N-6 DNA methylase  27.92 
 
 		 568 aa  88.6  4e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0283562  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4820  N-6 DNA methylase  27.82 
 
 		 496 aa  88.2  4e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1211  N-6 DNA methylase  29.77 
 
 		 522 aa  88.6  4e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0614  type I restriction-modification system, M subunit  24.14 
 
 		 494 aa  88.6  4e-16  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0763672  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2418  N-6 DNA methylase  30.26 
 
 		 525 aa  88.2  5e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.572428  normal  0.0719197 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2793  type I restriction-modification system, M subunit  30.26 
 
 		 525 aa  88.2  5e-16  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3758  N-6 DNA methylase  28.8 
 
 		 511 aa  87.4  7e-16  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.921564  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0792  N-6 DNA methylase  23.35 
 
 		 621 aa  87  9e-16  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.869542  hitchhiker  0.0032636 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1545  type I restriction-modification system, M subunit  24.65 
 
 		 522 aa  87  0.000000000000001  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.648114  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3380  N-6 DNA methylase  23.99 
 
 		 570 aa  86.7  0.000000000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.368642  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3155  N-6 DNA methylase  29.96 
 
 		 498 aa  87  0.000000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0466  type I restriction-modification system, M subunit  25.51 
 
 		 518 aa  86.7  0.000000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1809  hypothetical protein  27.41 
 
 		 849 aa  85.9  0.000000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3984  N-6 DNA methylase  26.1 
 
 		 505 aa  86.3  0.000000000000002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0990  type I restriction-modification system, M subunit  22.64 
 
 		 501 aa  85.9  0.000000000000002  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.555022  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0454  type I restriction-modification system, M subunit  25.51 
 
 		 518 aa  86.7  0.000000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05613  type I restriction-modification system specificity subunit  24.5 
 
 		 873 aa  86.3  0.000000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2348  type I restriction-modification system, M subunit  28.85 
 
 		 505 aa  85.5  0.000000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.427504  hitchhiker  0.00993981 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04440  type I restriction-modification system, M subunit  23.97 
 
 		 495 aa  85.5  0.000000000000003  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0005  type I restriction-modification system, M subunit  26.69 
 
 		 528 aa  85.5  0.000000000000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>