184 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_2376 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_2376  helix-turn-helix domain protein  100 
 
 		 282 aa  570  1.0000000000000001e-162  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.683565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1597  XRE family transcriptional regulator  43.97 
 
 		 282 aa  228  7e-59  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00863612 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0424  transcriptional regulator, XRE family  44.4 
 
 		 282 aa  222  4.9999999999999996e-57  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4643  helix-turn-helix domain protein  40.44 
 
 		 273 aa  192  7e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6363  hypothetical protein  37.36 
 
 		 283 aa  177  2e-43  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0272477  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6481  putative transcriptional regulator, XRE family  32.84 
 
 		 291 aa  111  1.0000000000000001e-23  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.787196  normal  0.247273 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2091  hypothetical protein  33.73 
 
 		 253 aa  104  2e-21  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0715  transcriptional regulator, XRE family  29.62 
 
 		 287 aa  100  4e-20  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0974  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  28.52 
 
 		 284 aa  99.4  6e-20  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1294  helix-turn-helix domain protein  32.2 
 
 		 290 aa  97.1  3e-19  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2126  transcriptional regulator, XRE family  27.24 
 
 		 284 aa  95.1  1e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000982759  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0234  helix-turn-helix domain-containing protein  30.34 
 
 		 285 aa  95.1  1e-18  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4123  helix-turn-helix domain-containing protein  32.19 
 
 		 326 aa  94  2e-18  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.54391  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4490  transcriptional regulator, XRE family  30.63 
 
 		 284 aa  92.8  6e-18  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3742  helix-turn-helix domain-containing protein  32.48 
 
 		 326 aa  90.1  3e-17  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.466202  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4696  helix-turn-helix domain protein  28.21 
 
 		 285 aa  88.6  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1729  helix-turn-helix domain-containing protein  31.95 
 
 		 280 aa  88.6  1e-16  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.095212  normal  0.0102473 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1746  helix-turn-helix domain-containing protein  32.33 
 
 		 280 aa  87.8  2e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.600914  normal  0.883752 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4524  hypothetical protein  33.87 
 
 		 221 aa  87  3e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5395  transcriptional regulator, XRE family  32.81 
 
 		 282 aa  86.7  4e-16  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.128681  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2449  helix-turn-helix domain-containing protein  29.93 
 
 		 293 aa  86.3  6e-16  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.17027  normal  0.257338 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2306  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  27.56 
 
 		 292 aa  85.9  7e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0392  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  26.74 
 
 		 281 aa  84.3  0.000000000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2072  hypothetical protein  28.18 
 
 		 282 aa  84.7  0.000000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.255323  normal  0.752202 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1229  helix-turn-helix domain-containing protein  29.57 
 
 		 290 aa  84  0.000000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.282504 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0442  helix-turn-helix domain protein  33.5 
 
 		 284 aa  84  0.000000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2659  helix-turn-helix domain protein  26.67 
 
 		 300 aa  84  0.000000000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000121562  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0398  putative DNA-binding protein  30.84 
 
 		 296 aa  84  0.000000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4245  transcriptional regulator, XRE family  26.52 
 
 		 288 aa  84  0.000000000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.116487 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7293  hypothetical protein  30.27 
 
 		 288 aa  83.6  0.000000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.805915  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2479  helix-turn-helix domain-containing protein  27.99 
 
 		 285 aa  83.6  0.000000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.292547 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0020  transcriptional regulator, XRE family  28.93 
 
 		 291 aa  83.6  0.000000000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0216  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  31.43 
 
 		 278 aa  81.6  0.00000000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0512  helix-turn-helix domain-containing protein  30.52 
 
 		 270 aa  80.9  0.00000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.89469  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2430  transcriptional regulator, XRE family  28.91 
 
 		 276 aa  81.3  0.00000000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7552  hypothetical protein  26.57 
 
 		 287 aa  80.9  0.00000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1803  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  27.99 
 
 		 279 aa  80.1  0.00000000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0229  XRE family transcriptional regulator  28.4 
 
 		 301 aa  80.1  0.00000000000004  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.981725 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3500  transcriptional regulator, XRE family  27.38 
 
 		 287 aa  78.2  0.0000000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0907  helix-turn-helix domain-containing protein  26.83 
 
 		 291 aa  78.6  0.0000000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.960814  normal  0.106337 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2542  putative transcriptional regulator, XRE family  27.75 
 
 		 277 aa  78.6  0.0000000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.259314  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1293  helix-turn-helix domain-containing protein  26.67 
 
 		 288 aa  77.4  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.663558  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1598  hypothetical protein  32.04 
 
 		 283 aa  77.4  0.0000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6648  helix-turn-helix domain-containing protein  28.8 
 
 		 287 aa  78.2  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.754069  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0875  helix-turn-helix domain protein  27.17 
 
 		 292 aa  77.4  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1963  helix-turn-helix domain protein  26.77 
 
 		 288 aa  77.8  0.0000000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00297567  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24740  Helix-turn-helix protein  29.26 
 
 		 283 aa  77.8  0.0000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7827  putative transcriptional regulator, XRE family  27.01 
 
 		 291 aa  77  0.0000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1502  XRE family transcriptional regulator  30.04 
 
 		 296 aa  76.6  0.0000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1296  transcriptional regulator, XRE family  29.74 
 
 		 286 aa  75.9  0.0000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1328  helix-turn-helix domain-containing protein  25.82 
 
 		 289 aa  75.9  0.0000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0977  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  31.43 
 
 		 282 aa  75.5  0.0000000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.820681  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1906  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  40.4 
 
 		 128 aa  75.5  0.0000000000009  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.000000000040825  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6121  transcriptional regulator, XRE family  24.9 
 
 		 285 aa  74.7  0.000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0488  transcriptional regulator, XRE family  25.61 
 
 		 267 aa  75.5  0.000000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3446  XRE family transcriptional regulator  27.52 
 
 		 288 aa  74.7  0.000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3103  helix-turn-helix domain-containing protein  27.89 
 
 		 284 aa  74.3  0.000000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.28133  normal  0.182055 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1172  helix-turn-helix domain-containing protein  24.91 
 
 		 296 aa  73.9  0.000000000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0036  helix-turn-helix domain-containing protein  28.52 
 
 		 293 aa  73.6  0.000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.254759  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0041  XRE family transcriptional regulator  28.14 
 
 		 293 aa  72.8  0.000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0600  helix-turn-helix domain-containing protein  26.14 
 
 		 291 aa  72.8  0.000000000006  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0021  transcriptional regulator, XRE family  30.53 
 
 		 298 aa  72.8  0.000000000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0292  XRE family transcriptional regulator  30.49 
 
 		 278 aa  72.4  0.000000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1446  transcriptional regulator, XRE family  25.75 
 
 		 276 aa  72.4  0.000000000007  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0731579  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4681  transcriptional regulator, XRE family  28.62 
 
 		 278 aa  72.4  0.000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.52911  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5446  helix-turn-helix domain protein  30.54 
 
 		 270 aa  72.4  0.000000000008  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.284222  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4247  helix-turn-helix domain-containing protein  27.21 
 
 		 410 aa  72.4  0.000000000008  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.710263  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1305  transcriptional regulator, XRE family  26.48 
 
 		 278 aa  72  0.00000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0383802  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0566  hypothetical protein  28.42 
 
 		 294 aa  71.6  0.00000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1160  helix-turn-helix domain-containing protein  29.26 
 
 		 281 aa  70.9  0.00000000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.190961  unclonable  0.0000000484081 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4987  transcriptional regulator, XRE family  27.68 
 
 		 285 aa  71.2  0.00000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.815997  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7488  hypothetical protein  26.73 
 
 		 303 aa  71.2  0.00000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.151706  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5680  transcriptional regulator, XRE family  29 
 
 		 282 aa  70.5  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1270  helix-turn-helix domain-containing protein  29.89 
 
 		 281 aa  70.1  0.00000000004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2968  XRE family transcriptional regulator  27.91 
 
 		 278 aa  70.1  0.00000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000227824 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1944  transcriptional regulator, XRE family  27.01 
 
 		 279 aa  70.1  0.00000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1944  helix-turn-helix domain protein  25.74 
 
 		 293 aa  69.7  0.00000000005  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00923208  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3762  helix-turn-helix domain protein  26.07 
 
 		 284 aa  69.3  0.00000000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1518  helix-turn-helix domain-containing protein  27.52 
 
 		 278 aa  69.3  0.00000000007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.606963  normal  0.022428 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5737  helix-turn-helix domain-containing protein  26.16 
 
 		 276 aa  69.3  0.00000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.598241 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1351  putative DNA-binding protein  24.9 
 
 		 299 aa  68.9  0.00000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.298494  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1133  helix-turn-helix domain-containing protein  27.41 
 
 		 291 aa  68.9  0.00000000008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.924131  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2702  XRE family transcriptional regulator  27.06 
 
 		 282 aa  68.2  0.0000000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_20620  Helix-turn-helix protein  27.8 
 
 		 281 aa  68.6  0.0000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0588198  normal  0.440077 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4567  hypothetical protein  30.21 
 
 		 264 aa  67.8  0.0000000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.266381 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1835  helix-turn-helix domain protein  27.01 
 
 		 284 aa  68.2  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.660299  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1970  helix-turn-helix domain protein  27.72 
 
 		 299 aa  67.8  0.0000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00381006  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6434  helix-turn-helix domain protein  27.94 
 
 		 279 aa  67.8  0.0000000002  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.147514  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6214  helix-turn-helix domain protein  28.17 
 
 		 303 aa  67.8  0.0000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0199858  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1780  XRE family transcriptional regulator  26.98 
 
 		 292 aa  67.4  0.0000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.154146 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2512  hypothetical protein  29.81 
 
 		 288 aa  67.4  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.164807  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36660  predicted transcriptional regulator with C-terminal CBS domains  26.16 
 
 		 293 aa  67  0.0000000003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.0372485  normal  0.380414 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0520  helix-turn-helix domain protein  25.26 
 
 		 285 aa  67  0.0000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5038  helix-turn-helix domain protein  27.76 
 
 		 287 aa  66.6  0.0000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3365  helix-turn-helix domain-containing protein  30.3 
 
 		 286 aa  65.9  0.0000000008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00818505 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0373  transcriptional regulator, XRE family  28.92 
 
 		 287 aa  65.5  0.0000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2602  helix-turn-helix domain-containing protein  26.88 
 
 		 295 aa  65.5  0.0000000009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0577635  normal  0.0482464 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1248  helix-hairpin-helix DNA-binding motif-containing protein  26.67 
 
 		 267 aa  65.5  0.000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2091  hypothetical protein  27.76 
 
 		 295 aa  65.5  0.000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.222911  normal  0.0505226 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1651  transcriptional regulator, XRE family  25.18 
 
 		 272 aa  65.1  0.000000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.115849  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>