More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1379 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_1379  GntR domain protein  100 
 
 		 243 aa  468  1.0000000000000001e-131  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.260247  normal  0.895969 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0046  GntR domain-containing protein  54.31 
 
 		 235 aa  233  2.0000000000000002e-60  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1785  GntR family transcriptional regulator  57.67 
 
 		 244 aa  207  1e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.751701  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5012  GntR domain protein  50.9 
 
 		 239 aa  182  6e-45  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.474023  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1899  GntR family transcriptional regulator  44.14 
 
 		 241 aa  153  2e-36  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.671252  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3530  GntR family transcriptional regulator  39.21 
 
 		 247 aa  140  1.9999999999999998e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0642963  normal  0.159703 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2064  GntR domain-containing protein  35.93 
 
 		 238 aa  135  8e-31  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.00000000113894  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2414  GntR domain-containing protein  44.02 
 
 		 253 aa  132  5e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.493248  normal  0.355489 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3688  GntR domain protein  38.84 
 
 		 248 aa  130  1.0000000000000001e-29  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2217  GntR domain protein  37.71 
 
 		 239 aa  129  3e-29  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2142  GntR domain protein  35.09 
 
 		 238 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.530271  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1981  GntR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 238 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000358345  normal  0.05165 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_1993  GntR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 238 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000185576  unclonable  0.0000207183 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2068  GntR family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 238 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000911573  hitchhiker  0.00000303995 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1327  GntR domain-containing protein  40.62 
 
 		 246 aa  120  9.999999999999999e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0190888  normal  0.291118 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0901  GntR-like  36.07 
 
 		 246 aa  118  7.999999999999999e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0894  GntR-like  36.12 
 
 		 253 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3532  GntR-like  35.11 
 
 		 244 aa  116  3.9999999999999997e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1760  GntR domain protein  37.17 
 
 		 277 aa  116  3.9999999999999997e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49240  GntR family regulatory protein  35.34 
 
 		 240 aa  113  3e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4214  GntR domain-containing protein  36.04 
 
 		 266 aa  112  6e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.827392 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3614  GntR domain-containing protein  38.84 
 
 		 250 aa  109  3e-23  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.661468  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0804  GntR family transcriptional regulator  32.54 
 
 		 240 aa  109  4.0000000000000004e-23  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3641  GntR domain protein  37.39 
 
 		 238 aa  108  7.000000000000001e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.716857 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5298  GntR domain-containing protein  35.59 
 
 		 232 aa  108  8.000000000000001e-23  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6253  GntR domain protein  34.06 
 
 		 256 aa  107  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.783578 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3228  GntR family transcriptional regulator  34.51 
 
 		 239 aa  107  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.542599  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0123  regulatory protein GntR HTH  38.03 
 
 		 261 aa  107  2e-22  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4115  galactonate operon transcriptional repressor  30.28 
 
 		 229 aa  106  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4222  galactonate operon transcriptional repressor  30.28 
 
 		 229 aa  106  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4164  galactonate operon transcriptional repressor  30.28 
 
 		 229 aa  106  3e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.935326  normal  0.912647 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5327  GntR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 237 aa  106  4e-22  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.941798  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5706  GntR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 237 aa  106  4e-22  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5416  GntR family transcriptional regulator  36.07 
 
 		 237 aa  106  4e-22  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.88633 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3975  transcriptional regulator  35.91 
 
 		 237 aa  105  5e-22  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.198442  normal  0.201233 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1994  GntR domain-containing protein  34.35 
 
 		 240 aa  105  7e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.122046  normal  0.944631 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1134  GntR domain protein  34.7 
 
 		 244 aa  104  1e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.102434 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0006  GntR family transcriptional regulator  30.28 
 
 		 229 aa  104  2e-21  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3773  transcriptional regulator, GntR family  33.63 
 
 		 237 aa  103  3e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.38941  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1707  transcriptional regulator GntR  33.63 
 
 		 237 aa  103  3e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0401914  normal  0.758482 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3667  GntR domain-containing protein  30.84 
 
 		 245 aa  103  4e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0203377  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2198  GntR domain protein  35.24 
 
 		 241 aa  102  6e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000682007 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3460  GntR domain-containing protein  33.77 
 
 		 248 aa  102  8e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.612558  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3422  GntR domain protein  33.04 
 
 		 244 aa  100  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.156381  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5910  GntR domain-containing protein  33.79 
 
 		 238 aa  101  1e-20  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0589896  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2131  GntR family transcriptional regulator  36.36 
 
 		 247 aa  99.4  4e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4786  GntR domain protein  33.75 
 
 		 268 aa  99.8  4e-20  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0885  GntR family transcriptional regulator  34.2 
 
 		 239 aa  99.4  5e-20  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0041  GntR domain-containing protein  29.52 
 
 		 252 aa  99  6e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.340559 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1724  GntR domain protein  31.22 
 
 		 261 aa  98.6  8e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.308508  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03578  predicted DNA-binding transcriptional regulator  28.9 
 
 		 229 aa  98.6  9e-20  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.753742  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0008  GntR domain protein  28.9 
 
 		 229 aa  98.6  9e-20  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4204  galactonate operon transcriptional repressor  28.9 
 
 		 229 aa  98.6  9e-20  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.763278  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3907  galactonate operon transcriptional repressor  28.9 
 
 		 229 aa  98.6  9e-20  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1098  galactonate operon transcriptional repressor  28.9 
 
 		 229 aa  98.6  9e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0008  GntR domain-containing protein  28.9 
 
 		 229 aa  98.6  9e-20  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4060  galactonate operon transcriptional repressor  28.9 
 
 		 229 aa  98.6  9e-20  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03522  hypothetical protein  28.9 
 
 		 229 aa  98.6  9e-20  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.700459  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3082  GntR domain-containing protein  33.03 
 
 		 241 aa  97.8  1e-19  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0951451 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1414  GntR domain-containing protein  34.2 
 
 		 241 aa  97.8  1e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1867  GntR family transcriptional regulator  33.18 
 
 		 245 aa  97.4  2e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0501  GntR domain-containing protein  33.19 
 
 		 237 aa  97.4  2e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4912  GntR domain-containing protein  42.51 
 
 		 244 aa  96.7  3e-19  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.47011 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0022  GntR domain protein  30.18 
 
 		 232 aa  96.7  3e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1284  GntR domain-containing protein  34.82 
 
 		 274 aa  95.9  5e-19  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0100582 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1472  GntR domain-containing protein  35.18 
 
 		 238 aa  95.9  5e-19  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1451  GntR domain-containing protein  35.18 
 
 		 238 aa  95.9  5e-19  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4144  GntR family transcriptional regulator  38.65 
 
 		 238 aa  95.1  8e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.278058  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1414  GntR domain-containing protein  32.16 
 
 		 250 aa  92  7e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.455285  normal  0.0932364 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1908  GntR domain protein  30.28 
 
 		 261 aa  92  7e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.287646  normal  0.900413 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1092  GntR family transcriptional regulator  30.33 
 
 		 238 aa  91.7  1e-17  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.191594 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2982  transcriptional regulator  31.48 
 
 		 228 aa  91.7  1e-17  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2718  GntR domain-containing protein  36.84 
 
 		 252 aa  90.5  2e-17  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2590  GntR domain-containing protein  35.43 
 
 		 234 aa  90.5  2e-17  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3616  GntR domain-containing protein  31.14 
 
 		 252 aa  90.9  2e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.760095 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1667  GntR domain-containing protein  32.04 
 
 		 248 aa  89.7  4e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.0248117 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4894  GntR domain-containing protein  30.48 
 
 		 229 aa  89  7e-17  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000861781  hitchhiker  0.000000633527 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2512  GntR family transcriptional regulator  32.47 
 
 		 239 aa  89  7e-17  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.289571  normal  0.109373 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0434  GntR domain-containing protein  35.65 
 
 		 287 aa  87.8  1e-16  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0144479  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1526  GntR domain-containing protein  35.5 
 
 		 238 aa  87.8  1e-16  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.72314 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1070  GntR-like  35.5 
 
 		 238 aa  87.8  1e-16  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2450  GntR family transcriptional regulator  34.52 
 
 		 246 aa  88.2  1e-16  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1550  GntR domain-containing protein  35.5 
 
 		 238 aa  87.8  1e-16  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1682  GntR domain-containing protein  34.59 
 
 		 238 aa  87.4  2e-16  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.119908 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0011  GntR family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 229 aa  86.3  4e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000398907  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0011  GntR family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 229 aa  86.3  4e-16  Yersinia pestis Angola  Bacteria  decreased coverage  0.00000019573  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_4206  GntR domain-containing protein  28.77 
 
 		 229 aa  86.3  4e-16  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000000481189  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3893  GntR domain protein  37.27 
 
 		 262 aa  86.3  4e-16  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0609104  normal  0.0327557 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4692  GntR family transcriptional regulator  35 
 
 		 238 aa  86.3  5e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.468803  normal  0.750448 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_24170  transcriptional regulator, GntR family  32.68 
 
 		 238 aa  85.1  8e-16  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.125788  normal  0.0229036 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0657  GntR family transcriptional regulator  37.74 
 
 		 261 aa  85.5  8e-16  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.483285 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2054  GntR-like  36.07 
 
 		 192 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2665  GntR domain-containing protein  36.07 
 
 		 192 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2694  GntR domain-containing protein  36.07 
 
 		 192 aa  84.7  0.000000000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1947  GntR domain protein  33.62 
 
 		 236 aa  84.3  0.000000000000002  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.946906  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3599  GntR domain-containing protein  32.99 
 
 		 251 aa  84  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.83049  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3527  GntR family transcriptional regulator  34.09 
 
 		 244 aa  84.3  0.000000000000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1725  GntR domain protein  30.77 
 
 		 241 aa  83.2  0.000000000000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2188  GntR domain-containing protein  29.17 
 
 		 240 aa  83.2  0.000000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.030411  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0746  GntR-like protein  29.9 
 
 		 241 aa  82.4  0.000000000000007  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>