More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1374 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_1374  ABC transporter related protein  100 
 
 		 505 aa  983    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.770006 
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6251  ABC transporter related  53.52 
 
 		 508 aa  513  1e-144  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1130  ABC transporter related  50.71 
 
 		 503 aa  470  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3780  putative sugar ABC transporter, ATP-binding protein  50.71 
 
 		 503 aa  470  1.0000000000000001e-131  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02439  fused predicted sugar transporter subunits of ABC superfamily: ATP-binding components  50.51 
 
 		 503 aa  468  9.999999999999999e-131  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.978258  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1121  ABC transporter related protein  50.51 
 
 		 503 aa  468  9.999999999999999e-131  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2832  putative sugar ABC transporter, ATP-binding protein  50.51 
 
 		 503 aa  468  9.999999999999999e-131  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02403  hypothetical protein  50.51 
 
 		 503 aa  468  9.999999999999999e-131  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.615581  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2699  putative sugar ABC transporter, ATP-binding protein  50.51 
 
 		 503 aa  468  9.999999999999999e-131  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2700  putative sugar ABC transporter, ATP-binding protein  50.51 
 
 		 503 aa  468  9.999999999999999e-131  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4228  ABC transporter-related protein  51.83 
 
 		 512 aa  458  1e-127  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0946  ABC transporter related  43.88 
 
 		 499 aa  373  1e-102  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0298167  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2905  ABC transporter related  41.29 
 
 		 497 aa  365  1e-100  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.077452 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3279  ABC transporter related  37.58 
 
 		 505 aa  367  1e-100  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2266  ABC transporter related  39.06 
 
 		 499 aa  360  3e-98  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000122283  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3129  ABC transporter related  40.08 
 
 		 504 aa  360  4e-98  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.149382  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0157  ABC transporter related  37.5 
 
 		 507 aa  359  7e-98  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2122  ABC transporter related  39.12 
 
 		 511 aa  358  9e-98  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1049  ABC transporter related protein  39.96 
 
 		 496 aa  358  9.999999999999999e-98  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3104  ABC transporter related protein  41.07 
 
 		 511 aa  357  1.9999999999999998e-97  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0885  ABC sugar transporter, ATPase subunit  42.35 
 
 		 506 aa  358  1.9999999999999998e-97  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.533742  normal  0.302538 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0613  ABC transporter related  38.93 
 
 		 497 aa  358  1.9999999999999998e-97  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2242  ABC transporter related  38.71 
 
 		 499 aa  358  1.9999999999999998e-97  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6345  ABC transporter related  40.41 
 
 		 516 aa  357  1.9999999999999998e-97  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.174321  normal  0.144091 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1601  ABC transporter related  38.65 
 
 		 525 aa  357  1.9999999999999998e-97  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0873  ABC transporter related  40.62 
 
 		 514 aa  357  2.9999999999999997e-97  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.304732  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3491  ABC transporter related  42.32 
 
 		 517 aa  356  3.9999999999999996e-97  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.295162 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2687  ABC transporter related  38.87 
 
 		 495 aa  356  5.999999999999999e-97  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3784  ABC transporter related  42.48 
 
 		 506 aa  356  5.999999999999999e-97  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.915652  hitchhiker  0.00808443 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2455  ribose ABC transporter ATP-binding protein  42.26 
 
 		 524 aa  355  7.999999999999999e-97  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.785166  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2808  ABC transporter related  41.62 
 
 		 501 aa  355  1e-96  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1612  ABC transporter related  40.08 
 
 		 496 aa  355  1e-96  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1508  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  40.08 
 
 		 496 aa  355  1e-96  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.106354  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0779  ABC transporter related protein  42.51 
 
 		 528 aa  354  2e-96  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.63436  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2443  ABC transporter related  41.26 
 
 		 494 aa  354  2e-96  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C1350  ABC sugar transporter, fused ATPase subunits  41.75 
 
 		 504 aa  354  2e-96  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1962  ABC transporter-related protein  38.57 
 
 		 494 aa  354  2e-96  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0299142 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2492  ABC transporter related protein  38.01 
 
 		 498 aa  353  2.9999999999999997e-96  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1760  ribose ABC transporter ATP-binding protein  39.88 
 
 		 496 aa  353  2.9999999999999997e-96  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.185473  hitchhiker  0.0000761209 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0989  ABC transporter related  37.4 
 
 		 499 aa  353  2.9999999999999997e-96  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.86187  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2330  L-arabinose transporter ATP-binding protein  39.39 
 
 		 507 aa  353  4e-96  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0106  xylose transporter ATP-binding subunit  36.65 
 
 		 505 aa  353  4e-96  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3596  ABC transporter related  39.71 
 
 		 509 aa  353  4e-96  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.979323  normal  0.135552 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1399  ABC transporter ATP-binding protein  43.23 
 
 		 508 aa  353  4e-96  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.172278 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3235  ABC transporter related  39.8 
 
 		 506 aa  353  5.9999999999999994e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.365394  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4210  xylose transporter ATP-binding subunit  43.03 
 
 		 519 aa  353  5.9999999999999994e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3706  ABC transporter related  40.12 
 
 		 506 aa  353  5.9999999999999994e-96  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.594267  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1915  ABC transporter related  41.81 
 
 		 502 aa  353  5.9999999999999994e-96  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.483253  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2447  ABC transporter related protein  38.22 
 
 		 495 aa  352  5.9999999999999994e-96  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000548266  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3235  ABC transporter related  42.12 
 
 		 517 aa  352  5.9999999999999994e-96  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.157816  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3524  ABC transporter related  37.2 
 
 		 514 aa  352  7e-96  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.503605  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2030  L-arabinose transporter ATP-binding protein  39.47 
 
 		 507 aa  352  8e-96  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.288148  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1644  ABC transporter related  36.82 
 
 		 495 aa  352  8e-96  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.121193  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5318  ABC transporter related  40.28 
 
 		 508 aa  352  8.999999999999999e-96  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.398307  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2474  ABC transporter related  39.79 
 
 		 513 aa  351  1e-95  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0599981  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_5597  ABC transporter related  40.25 
 
 		 503 aa  350  2e-95  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.609428  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2021  xylose transporter ATP-binding subunit  38.84 
 
 		 504 aa  351  2e-95  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3166  ABC transporter related  38.22 
 
 		 500 aa  351  2e-95  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6035  xylose transporter ATP-binding subunit  43 
 
 		 519 aa  351  2e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0730737  normal  0.8225 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3041  ABC transporter related protein  37.7 
 
 		 511 aa  351  2e-95  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4658  ABC transporter related  41.22 
 
 		 497 aa  350  3e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6474  ABC transporter related  40.6 
 
 		 514 aa  350  3e-95  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.891446  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6709  ABC transporter related  40.6 
 
 		 514 aa  350  3e-95  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.268301  normal  0.306288 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3345  ribose transport protein RbsA  43.7 
 
 		 510 aa  350  4e-95  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.121309  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1911  L-arabinose transporter ATP-binding protein  39.18 
 
 		 506 aa  349  7e-95  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.389706  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3003  ABC transporter related  41.65 
 
 		 495 aa  349  7e-95  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00261146  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6315  ABC transporter related  40.6 
 
 		 514 aa  349  7e-95  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.681428  normal  0.300453 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4200  ABC transporter related  42.48 
 
 		 528 aa  349  8e-95  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50310  ABC transporter ATP-binding protein  39.96 
 
 		 523 aa  349  8e-95  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.433727  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4723  ABC transporter related  42.48 
 
 		 506 aa  348  9e-95  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.943494  normal  0.164035 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0291  ABC transporter related  40.28 
 
 		 514 aa  348  1e-94  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1957  ABC transporter related  41.83 
 
 		 517 aa  348  1e-94  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.45423  normal  0.0285383 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2620  xylose transporter ATP-binding subunit  42.21 
 
 		 519 aa  347  2e-94  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3330  ABC transporter related protein  39.55 
 
 		 497 aa  347  3e-94  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1825  ABC transporter related  41.45 
 
 		 505 aa  347  3e-94  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0788496  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3601  L-arabinose transporter ATP-binding protein  41.86 
 
 		 508 aa  347  4e-94  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.611963  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3415  xylose transporter ATP-binding subunit  41.3 
 
 		 511 aa  346  5e-94  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.055967  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02652  conserved hypothetical protein  37.9 
 
 		 499 aa  346  7e-94  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22700  ABC transporter related  37.93 
 
 		 501 aa  346  7e-94  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00201717  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1667  ABC transporter related  38.32 
 
 		 502 aa  346  7e-94  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.338027  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02613  hypothetical protein  37.9 
 
 		 499 aa  346  7e-94  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4170  ABC transporter related  40.33 
 
 		 503 aa  345  1e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.611876  normal  0.0273413 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1684  ABC transporter related  42.54 
 
 		 519 aa  345  1e-93  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.200207  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3540  ABC transporter related protein  35.38 
 
 		 504 aa  344  2e-93  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.285144  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1188  ABC transporter related  41.05 
 
 		 511 aa  344  2e-93  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.909394  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2444  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  36.25 
 
 		 506 aa  345  2e-93  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6631  xylose transporter ATP-binding subunit  41.62 
 
 		 519 aa  344  2e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1088  ABC transporter related  39.88 
 
 		 507 aa  344  2e-93  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.117363 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3218  ribose import ATP-binding protein RbsA  36.91 
 
 		 501 aa  345  2e-93  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2152  ABC transporter  41.7 
 
 		 517 aa  344  2.9999999999999997e-93  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.73393 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2428  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  35.85 
 
 		 506 aa  343  2.9999999999999997e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6335  xylose transporter ATP-binding subunit  42.21 
 
 		 519 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2148  L-arabinose transporter ATP-binding protein  38.95 
 
 		 507 aa  344  2.9999999999999997e-93  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5471  ABC transporter related  39.47 
 
 		 520 aa  344  2.9999999999999997e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.428158  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0061  ABC transporter related  39.96 
 
 		 516 aa  344  2.9999999999999997e-93  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0411  ABC transporter related  37.76 
 
 		 494 aa  343  4e-93  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.046808  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8259  ABC transporter-related protein  43.44 
 
 		 509 aa  343  4e-93  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.332477  decreased coverage  0.00989255 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2379  galactose/methyl galaxtoside transporter ATP-binding protein  35.85 
 
 		 506 aa  343  4e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2340  xylose transporter ATP-binding subunit  41.45 
 
 		 519 aa  343  4e-93  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2904  ABC transporter related  38.78 
 
 		 503 aa  343  4e-93  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>