85 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1065 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_1065  integral membrane protein  100 
 
 		 251 aa  474  1e-133  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.342023 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2504  putative integral membrane protein  58.78 
 
 		 250 aa  259  2e-68  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1064  putative integral membrane protein  57.26 
 
 		 251 aa  257  1e-67  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_5719  putative integral membrane protein  58.47 
 
 		 252 aa  251  7e-66  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.25277  hitchhiker  0.00426268 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3407  putative integral membrane protein  55.28 
 
 		 251 aa  239  2e-62  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3027  putative integral membrane protein  57.33 
 
 		 251 aa  238  9e-62  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.336074  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4376  putative integral membrane protein  58.3 
 
 		 250 aa  228  9e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0205704  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0652  zinc/iron permease  52.85 
 
 		 249 aa  224  1e-57  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_17830  predicted divalent heavy-metal cations transporter  55.6 
 
 		 250 aa  202  3e-51  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.63712  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2825  putative integral membrane protein  49 
 
 		 244 aa  186  2e-46  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15240  integral membrane protein  43.32 
 
 		 246 aa  164  1.0000000000000001e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0129  putative integral membrane protein  40.69 
 
 		 209 aa  150  2e-35  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0148971  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1644  integral membrane protein  42.5 
 
 		 248 aa  144  1e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.123548  normal  0.126341 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2260  zinc/iron permease  41.63 
 
 		 240 aa  127  1.0000000000000001e-28  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4234  putative integral membrane protein  38.46 
 
 		 234 aa  125  6e-28  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.355311  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4612  putative integral membrane protein  38.46 
 
 		 234 aa  125  6e-28  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4319  putative integral membrane protein  38.46 
 
 		 234 aa  125  6e-28  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.314963  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0769  putative integral membrane protein  33.33 
 
 		 228 aa  102  5e-21  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.130722 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5558  zinc/iron permease  38.8 
 
 		 243 aa  102  5e-21  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5177  zinc/iron permease  38.8 
 
 		 243 aa  102  6e-21  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5266  zinc/iron permease  38.8 
 
 		 243 aa  102  6e-21  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.362056  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3370  putative transcriptional regulator, Crp/Fnr family  40.3 
 
 		 425 aa  93.2  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2732  cyclic nucleotide-binding protein  40.3 
 
 		 425 aa  93.2  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4403  zinc/iron permease  29.36 
 
 		 232 aa  70.1  0.00000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4794  hypothetical protein  54.17 
 
 		 96 aa  60.5  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.173791  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0563  zinc/iron permease  25.7 
 
 		 239 aa  60.8  0.00000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0755  ZIP zinc transporter family protein  27.55 
 
 		 236 aa  59.7  0.00000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2539  ZIP zinc transporter family protein  26.25 
 
 		 237 aa  55.8  0.0000006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.0673891  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1721  zinc/iron permease  29.32 
 
 		 309 aa  53.9  0.000002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1873  zinc/iron permease  28.57 
 
 		 259 aa  53.9  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.62947  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1074  zinc/iron permease  22.62 
 
 		 255 aa  53.5  0.000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0256  zinc/iron permease  26.5 
 
 		 247 aa  53.1  0.000004  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.015628  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2594  zinc/iron permease  28.57 
 
 		 246 aa  52.8  0.000005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000119267  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0065  ZIP zinc transporter family protein  26.67 
 
 		 238 aa  52.8  0.000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00170  zinc/iron permease  27.36 
 
 		 261 aa  52.8  0.000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000172235  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2194  zinc/iron permease  32.54 
 
 		 285 aa  52  0.000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1616  zinc/iron permease  25.7 
 
 		 272 aa  50.8  0.00002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0408  zinc/iron permease  26.69 
 
 		 278 aa  50.1  0.00003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.194102 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0713  zinc/iron permease  26.67 
 
 		 258 aa  48.1  0.0001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.0000000233647  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1670  zinc/iron permease  26.53 
 
 		 255 aa  48.1  0.0001  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.31853  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1295  zinc/iron permease  26.61 
 
 		 258 aa  47.4  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.80159  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0382  gufA protein, putative  23.87 
 
 		 271 aa  47.8  0.0002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1445  zinc/iron permease  30 
 
 		 312 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.67  normal  0.0542344 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2053  hypothetical protein  28.18 
 
 		 305 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0183571  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3452  zinc transporter ZupT  27.8 
 
 		 257 aa  47.8  0.0002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0404231 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3874  zinc/iron permease  29.09 
 
 		 312 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0665498  normal  0.190441 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0715  zinc/iron permease  25.58 
 
 		 262 aa  47  0.0003  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00169409 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0510  zinc/iron permease  26.07 
 
 		 271 aa  47  0.0003  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1836  hypothetical protein  28.64 
 
 		 250 aa  46.6  0.0004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.438488  normal  1 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0056  zinc/iron permease  27.03 
 
 		 271 aa  46.2  0.0004  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0157  zinc transporter ZupT  25.59 
 
 		 268 aa  46.6  0.0004  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3261  zinc/iron permease  27.95 
 
 		 304 aa  46.6  0.0004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.28457  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0655  zinc/iron permease  28.24 
 
 		 270 aa  46.6  0.0004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0529529  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1414  zinc/iron permease  28.18 
 
 		 312 aa  46.2  0.0005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2787  Zinc transporter ZIP  28.77 
 
 		 309 aa  46.2  0.0005  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3472  zinc transporter ZupT  26.78 
 
 		 253 aa  46.2  0.0005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000026596  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0214  zinc/iron permease  23.2 
 
 		 268 aa  46.2  0.0006  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000199646  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3371  zinc transporter ZupT  28.33 
 
 		 257 aa  45.8  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3543  zinc transporter ZupT  28.33 
 
 		 257 aa  45.8  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.519213  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2322  ZIP zinc transporter family protein  23.79 
 
 		 237 aa  45.8  0.0007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.532948  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3448  zinc transporter ZupT  28.33 
 
 		 257 aa  45.8  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3376  zinc transporter ZupT  28.33 
 
 		 257 aa  45.8  0.0007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.59755 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03733  ZIP zinc transporter family protein  26.32 
 
 		 238 aa  45.4  0.0008  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3441  zinc transporter ZupT  28.33 
 
 		 257 aa  45.4  0.0008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.321701  normal  1 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3615  zinc/iron permease  27.71 
 
 		 260 aa  44.7  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.314729  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1862  Zinc transporter ZIP  27.48 
 
 		 308 aa  44.7  0.001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.697173 
 
 
-
 
NC_009957  Dshi_3953  zinc/iron permease  27.71 
 
 		 260 aa  44.7  0.001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.210601  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0415  zinc/iron permease  25.22 
 
 		 264 aa  45.1  0.001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4121  zinc/iron permease  25.35 
 
 		 259 aa  45.1  0.001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.543426  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1152  zinc/iron permease  26.21 
 
 		 271 aa  44.3  0.002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.661251  normal  0.519901 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1427  zinc/iron permease  23.87 
 
 		 272 aa  43.9  0.002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0387  zinc/iron permease  27.23 
 
 		 300 aa  43.9  0.003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.314049  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3117  zinc/iron permease  24.32 
 
 		 251 aa  43.5  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1307  zinc/iron permease  22.58 
 
 		 245 aa  43.5  0.003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0199  zinc/iron permease  23.31 
 
 		 239 aa  43.5  0.003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1749  zinc/iron permease  25.13 
 
 		 244 aa  43.5  0.003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2969  zinc/iron permease  25.91 
 
 		 306 aa  43.1  0.004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4285  zinc transporter ZupT  26.86 
 
 		 255 aa  43.1  0.005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2324  hypothetical protein  28.19 
 
 		 305 aa  42.7  0.005  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1087  zinc/iron permease  25 
 
 		 245 aa  42.7  0.006  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1033  zinc/iron permease  25 
 
 		 245 aa  42.7  0.006  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0092  hypothetical protein  25.68 
 
 		 247 aa  42.7  0.006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.796375  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4452  putative integral membrane protein  29.17 
 
 		 244 aa  42.7  0.006  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.457589  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3571  zinc/iron permease  26.94 
 
 		 270 aa  42  0.009  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.640289  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_29340  Zinc/divalent heavy metal cation permease  27.14 
 
 		 317 aa  42  0.009  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>