223 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_0462 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_0462  transcriptional regulator, MerR family  100 
 
 		 264 aa  525  1e-148  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.102966 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2333  MerR family transcriptional regulator  65.6 
 
 		 253 aa  339  2e-92  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0149  transcriptional regulator, MerR family  49 
 
 		 248 aa  226  2e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3080  transcription regulator protein  42.97 
 
 		 256 aa  198  6e-50  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.730873  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1798  hypothetical protein  41.39 
 
 		 269 aa  197  2.0000000000000003e-49  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3016  transcriptional regulator, MerR family  41.86 
 
 		 272 aa  190  2e-47  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3363  transcriptional regulator, MerR family  41.86 
 
 		 272 aa  190  2e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.65953  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3330  MerR family transcriptional regulator  44.39 
 
 		 272 aa  190  2e-47  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0993383  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3602  MerR family transcriptional regulator  41.46 
 
 		 293 aa  187  2e-46  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4881  transcriptional regulator, MerR family  42.5 
 
 		 288 aa  183  3e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.458694  normal  0.771198 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4022  MerR family transcriptional regulator  41.02 
 
 		 279 aa  178  8e-44  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.28056  normal  0.857059 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3698  MerR family transcriptional regulator  41.02 
 
 		 282 aa  177  2e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.609999  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21070  MerR family transcriptional regulator  39.57 
 
 		 232 aa  177  2e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.471821  normal  1 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4670  MerR family transcriptional regulator  41.02 
 
 		 282 aa  177  2e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.940044  normal  0.613988 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5630  MerR family transcriptional regulator  41.02 
 
 		 282 aa  177  2e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.122388  normal  0.561699 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1153  MerR family transcriptional regulator  40.08 
 
 		 279 aa  176  3e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0304735  normal  0.508329 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1788  MerR family transcriptional regulator  41 
 
 		 297 aa  175  5e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000131469 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2529  MerR family transcriptional regulator  39.04 
 
 		 285 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0285  MerR family transcriptional regulator  39.04 
 
 		 285 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.184763  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0555  MerR family transcriptional regulator  39.04 
 
 		 285 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.119185  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1351  MerR family transcriptional regulator  39.04 
 
 		 285 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0327248  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1273  MerR family transcriptional regulator  39.04 
 
 		 285 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1013  MerR family transcriptional regulator  39.04 
 
 		 285 aa  172  3.9999999999999995e-42  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0106241  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1302  MerR family transcriptional regulator  39.04 
 
 		 268 aa  172  5e-42  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1468  MerR family transcriptional regulator  38.65 
 
 		 285 aa  171  1e-41  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4518  MerR family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 282 aa  167  2e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.584937  normal  0.575813 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4060  MerR family transcriptional regulator  40.62 
 
 		 282 aa  166  4e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00710658  normal  0.227534 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0231  transcriptional regulator, MerR family  40.36 
 
 		 250 aa  157  1e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4902  MerR family transcriptional regulator  36.75 
 
 		 287 aa  149  3e-35  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.337456  normal  0.546417 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0776  regulatory protein MerR  37.45 
 
 		 272 aa  147  2.0000000000000003e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1518  MerR family transcriptional regulator  35.32 
 
 		 288 aa  144  1e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.545801 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4344  regulatory protein MerR  35.51 
 
 		 264 aa  141  9.999999999999999e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3819  regulatory protein MerR  40.74 
 
 		 297 aa  122  7e-27  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.977775  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5121  transcriptional regulator, MerR family  35.51 
 
 		 242 aa  115  7.999999999999999e-25  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4750  transcriptional regulator, MerR family  34.44 
 
 		 243 aa  114  2.0000000000000002e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.772196  normal  0.219423 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3663  MerR family transcriptional regulator  48.86 
 
 		 259 aa  96.3  4e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.532115 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3650  MerR family transcriptional regulator  48.86 
 
 		 259 aa  95.9  5e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0795396  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3723  MerR family transcriptional regulator  48.86 
 
 		 259 aa  95.9  5e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.913976 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4126  MerR family transcriptional regulator  50 
 
 		 261 aa  95.9  6e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.711987 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2531  MerR family transcriptional regulator  48.86 
 
 		 246 aa  94.4  2e-18  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.410302  normal  0.827752 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3512  transcriptional regulator, MerR family  31.5 
 
 		 251 aa  87  3e-16  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4271  transcriptional regulator, MerR family  26.89 
 
 		 262 aa  87  3e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.194258  normal  0.647019 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1157  transcriptional regulator, MerR family  31.86 
 
 		 258 aa  87  3e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5802  transcriptional regulator, MerR family  30.65 
 
 		 284 aa  78.2  0.0000000000001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2120  MerR family transcriptional regulator  40 
 
 		 147 aa  59.3  0.00000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.00663209  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000376  predicted transcriptional regulator LiuR of leucine degradation pathway MerR family  39.73 
 
 		 128 aa  56.2  0.0000005  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05481  hypothetical protein  36.99 
 
 		 127 aa  55.8  0.0000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1604  MerR family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 132 aa  55.5  0.0000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.408044  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001544  predicted transcriptional regulator LiuR of leucine degradation pathway MerR family  36.99 
 
 		 124 aa  54.7  0.000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4036  MerR family transcriptional regulator  44.29 
 
 		 155 aa  54.7  0.000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.614609  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2796  MerR family transcriptional regulator  40 
 
 		 132 aa  55.1  0.000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1531  transcriptional regulator, MerR family  38.57 
 
 		 135 aa  53.5  0.000004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.152534  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1898  transcriptional regulator, putative  38.57 
 
 		 134 aa  53.5  0.000004  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2321  MerR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 134 aa  53.5  0.000004  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2393  MerR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 134 aa  53.5  0.000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  0.790409 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1673  MerR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 134 aa  53.5  0.000004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1363  MerR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 134 aa  53.5  0.000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.381305 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2845  MerR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 135 aa  53.5  0.000004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2972  MerR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 135 aa  53.5  0.000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.54764  normal  0.504684 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2827  MerR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 135 aa  53.5  0.000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1720  MerR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 134 aa  53.5  0.000004  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2726  transcriptional regulator, MerR family protein  36.11 
 
 		 136 aa  53.1  0.000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.505695  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0820  MerR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 131 aa  52.4  0.000007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.575513  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0770  MerR family transcriptional regulator  41.67 
 
 		 151 aa  52.4  0.000007  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.744449  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3222  MerR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 132 aa  52  0.000009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.012049 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3400  zinc-responsive transcriptional regulator  40.58 
 
 		 156 aa  51.6  0.00001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2244  regulatory protein, MerR  34.72 
 
 		 135 aa  52  0.00001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0464  transcriptional regulator, MerR family  40.51 
 
 		 134 aa  51.2  0.00002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1459  MerR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 132 aa  51.2  0.00002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.425414 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4252  MerR family transcriptional regulator  40.51 
 
 		 134 aa  50.8  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.285942  normal  0.211109 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2569  MerR family transcriptional regulator  37.14 
 
 		 133 aa  50.8  0.00002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2071  MerR family transcriptional regulator  49.09 
 
 		 177 aa  50.4  0.00003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.776641  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4035  zinc-responsive transcriptional regulator  40.58 
 
 		 176 aa  50.1  0.00004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3912  zinc-responsive transcriptional regulator  40.58 
 
 		 171 aa  50.1  0.00004  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0445  zinc-responsive transcriptional regulator  39.13 
 
 		 159 aa  50.1  0.00004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  0.261357 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3839  zinc-responsive transcriptional regulator  40.58 
 
 		 171 aa  50.1  0.00004  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.231012 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4888  transcriptional regulator, MerR family  37.14 
 
 		 92 aa  49.7  0.00005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.715098  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0421  zinc-responsive transcriptional regulator  40.58 
 
 		 176 aa  49.7  0.00005  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0181  MerR family transcriptional regulator  39.24 
 
 		 144 aa  49.3  0.00007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.911706  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2034  MerR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 128 aa  49.3  0.00007  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.327556  normal  0.554633 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0443  zinc-responsive transcriptional regulator  37.68 
 
 		 163 aa  48.9  0.00008  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3653  MerR family transcriptional regulator  38.57 
 
 		 133 aa  48.9  0.00008  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0576381 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1094  MerR family transcriptional regulator  43.08 
 
 		 159 aa  48.9  0.00008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3449  MerR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 98 aa  48.9  0.00009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1773  transcriptional regulator, MerR family  35.06 
 
 		 142 aa  48.5  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2322  transcriptional regulator, MerR family  36.76 
 
 		 129 aa  48.5  0.0001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0442  zinc-responsive transcriptional regulator  36.23 
 
 		 157 aa  48.1  0.0001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2851  transcriptional regulator, MerR family  41.43 
 
 		 135 aa  47.8  0.0002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5280  transcriptional regulator CadR  35.14 
 
 		 148 aa  47.4  0.0002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0130  transcriptional regulator, MerR family  38.46 
 
 		 165 aa  47.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2472  regulatory protein, MerR  35.62 
 
 		 130 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.0886191 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2996  transcriptional regulator, MerR family  34.48 
 
 		 152 aa  48.1  0.0002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0102  MerR family transcriptional regulator  38.27 
 
 		 144 aa  47.8  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0138  transcriptional regulator, MerR family  38.46 
 
 		 165 aa  47.8  0.0002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2924  MerR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 131 aa  47.4  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0024  MerR family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 156 aa  47.4  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3583  zinc-responsive transcriptional regulator  36.23 
 
 		 157 aa  48.1  0.0002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38430  regulatory gene of gnyRDBHAL cluster, GnyR  37.14 
 
 		 134 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.187805 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2733  MerR family transcriptional regulator  46.81 
 
 		 135 aa  47.4  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_49570  transcriptional regulatory protein, MerR family  35.23 
 
 		 133 aa  47.4  0.0002  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0397848  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>