154 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4652 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_4652  BioY protein  100 
 
 		 198 aa  365  1e-100  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.113128  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3228  BioY protein  52.38 
 
 		 201 aa  166  2.9999999999999998e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3464  BioY protein  56.82 
 
 		 205 aa  164  5.9999999999999996e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.454353 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_5281  BioY protein  58.24 
 
 		 202 aa  156  2e-37  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.170405  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5370  BioY protein  58.24 
 
 		 202 aa  156  2e-37  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5660  BioY protein  58.24 
 
 		 202 aa  156  2e-37  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0504  BioY protein  50.27 
 
 		 210 aa  140  9e-33  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1732  BioY protein  54.29 
 
 		 208 aa  135  3.0000000000000003e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3648  bioY family protein  43.16 
 
 		 191 aa  135  4e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1580  bioY family protein  42.11 
 
 		 191 aa  134  7.000000000000001e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000070307  normal  0.0383655 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3685  BioY protein  44.13 
 
 		 189 aa  134  9.999999999999999e-31  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3315  BioY protein  42.16 
 
 		 191 aa  132  3e-30  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00000166456  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0622  BioY protein  45.45 
 
 		 187 aa  128  4.0000000000000003e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.560526  normal  0.0354097 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0581  BioY protein  45.99 
 
 		 187 aa  128  4.0000000000000003e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.981929  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4131  BioY protein  43.33 
 
 		 189 aa  120  9.999999999999999e-27  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.777139  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1529  BioY protein  53.76 
 
 		 188 aa  119  3.9999999999999996e-26  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3331  bioY family protein  43.68 
 
 		 191 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.00000000423922  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3640  bioY family protein  43.68 
 
 		 191 aa  119  3.9999999999999996e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3287  BioY protein  46.55 
 
 		 192 aa  117  7.999999999999999e-26  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.508525  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3420  bioY family protein  43.16 
 
 		 191 aa  116  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.000000000218504  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3381  bioY family protein  43.16 
 
 		 191 aa  116  1.9999999999999998e-25  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  unclonable  4.96357e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3689  bioY family protein  43.16 
 
 		 191 aa  116  1.9999999999999998e-25  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000000000593466  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2307  BioY protein  45.18 
 
 		 184 aa  115  3.9999999999999997e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.366824  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2349  BioY protein  45.18 
 
 		 184 aa  115  3.9999999999999997e-25  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3737  bioY family protein  43.16 
 
 		 191 aa  115  3.9999999999999997e-25  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.776545  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5454  BioY protein  50 
 
 		 215 aa  115  6e-25  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0263826  normal  0.18678 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3659  bioY family protein  43.16 
 
 		 191 aa  115  6e-25  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00282906  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2113  BioY protein  41.15 
 
 		 224 aa  112  3e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0646325  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1004  biotin synthesis BioY protein  42.22 
 
 		 187 aa  112  4.0000000000000004e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1068  BioY protein  47.53 
 
 		 192 aa  111  6e-24  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4601  BioY protein  41.76 
 
 		 197 aa  111  7.000000000000001e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.440698  normal  0.800249 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1159  BioY protein  37.56 
 
 		 231 aa  111  9e-24  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.934928  normal  0.98055 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2320  BioY protein  49.72 
 
 		 180 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2314  hypothetical protein  52.81 
 
 		 222 aa  107  1e-22  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.462217  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0501  BioY protein  45.56 
 
 		 187 aa  107  1e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0382459  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1193  biotin transport protein BioY  38.33 
 
 		 184 aa  106  3e-22  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1864  BioY family protein  38.55 
 
 		 182 aa  102  4e-21  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1540  BioY protein  47.28 
 
 		 194 aa  102  5e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0463  BioY family protein  39.88 
 
 		 179 aa  101  8e-21  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2319  BioY protein  46.2 
 
 		 194 aa  100  1e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1953  hypothetical protein  34.44 
 
 		 189 aa  95.9  3e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.327178  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1855  BioY protein  38.38 
 
 		 216 aa  94.7  7e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000505992 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3349  BioY protein  40.96 
 
 		 207 aa  91.3  8e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0398  BioY family protein  35.84 
 
 		 179 aa  90.9  1e-17  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  unclonable  0.00000949175  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3386  BioY protein  44.26 
 
 		 182 aa  90.1  2e-17  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.812512  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2911  BioY protein  41.53 
 
 		 202 aa  89.7  3e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.464449 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0516  hypothetical protein  36.16 
 
 		 180 aa  85.9  3e-16  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.0355774  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3659  BioY protein  44.3 
 
 		 179 aa  85.5  5e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_21840  hypothetical protein  37.04 
 
 		 212 aa  85.1  6e-16  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.104795  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1681  BioY protein  41.94 
 
 		 225 aa  83.2  0.000000000000003  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0061  BioY protein  33.71 
 
 		 182 aa  81.3  0.000000000000009  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.0000000000303529  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_05160  BioY protein  32.99 
 
 		 184 aa  79.7  0.00000000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3071  BioY protein  47.42 
 
 		 204 aa  77.8  0.00000000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0144  BioY protein  40.23 
 
 		 189 aa  77.8  0.0000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.964994 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0733  BioY protein  35.43 
 
 		 190 aa  77.4  0.0000000000001  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.307469  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1156  BioY protein  39.08 
 
 		 199 aa  77  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2689  BioY protein  38.24 
 
 		 197 aa  75.9  0.0000000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_20560  hypothetical protein  42.33 
 
 		 221 aa  76.3  0.0000000000003  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0586  biotin synthesis BioY protein  34.64 
 
 		 187 aa  72.4  0.000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0283  BioY protein  34.83 
 
 		 179 aa  72.4  0.000000000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0233  BioY protein  37.7 
 
 		 197 aa  72  0.000000000006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1206  bioY family protein  33.33 
 
 		 175 aa  70.9  0.00000000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0845  BioY protein  45.9 
 
 		 181 aa  70.5  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0726  biotin synthase  35.66 
 
 		 179 aa  69.3  0.00000000003  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  unclonable  0.00000014315  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2173  hypothetical protein  45.36 
 
 		 181 aa  68.9  0.00000000005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1200  BioY family protein  32.82 
 
 		 216 aa  68.2  0.00000000007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000053254 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3231  BioY protein  30.68 
 
 		 184 aa  68.2  0.00000000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  unclonable  0.000000000266759  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4523  BioY protein  35.25 
 
 		 206 aa  67  0.0000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.850691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0018  BioY protein  33.74 
 
 		 205 aa  66.2  0.0000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000199845 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3677  BioY protein  34.67 
 
 		 182 aa  66.2  0.0000000003  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.00000000940294  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_01740  hypothetical protein  45.74 
 
 		 204 aa  65.9  0.0000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.770223 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2139  BioY protein  35.43 
 
 		 192 aa  65.5  0.0000000005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.990413  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1961  BioY protein  35.43 
 
 		 187 aa  65.1  0.0000000006  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0357  hypothetical protein  34.3 
 
 		 182 aa  64.7  0.0000000009  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2213  BioY protein  32.58 
 
 		 182 aa  64.3  0.000000001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000012911  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21300  hypothetical protein  35.51 
 
 		 197 aa  63.2  0.000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.380414 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3185  BioY protein  32.45 
 
 		 178 aa  62.8  0.000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5033  BioY protein  43.93 
 
 		 191 aa  61.6  0.000000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.301047  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2725  BioY protein  30.43 
 
 		 184 aa  61.2  0.000000009  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.401651  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1198  BioY protein  36.11 
 
 		 191 aa  61.2  0.00000001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1014  BioY protein  32.4 
 
 		 169 aa  59.7  0.00000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.842683  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1749  BioY protein  33.12 
 
 		 182 aa  57.8  0.00000009  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.969315  normal  0.0325978 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3097  BioY protein  32.57 
 
 		 187 aa  57.8  0.0000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0991  BioY protein  33.79 
 
 		 199 aa  57.4  0.0000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4638  BioY protein  36.09 
 
 		 203 aa  57.4  0.0000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.395619 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2725  BioY protein  34.97 
 
 		 195 aa  57.4  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.318668  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1123  BioY protein  30.6 
 
 		 197 aa  57  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.432616  normal  0.483731 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2735  BioY protein  34.97 
 
 		 195 aa  56.2  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0539  BioY protein  37.31 
 
 		 203 aa  56.2  0.0000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.203446  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2901  BioY protein  40.59 
 
 		 208 aa  55.8  0.0000004  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.0000326686  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0476  BioY protein  41.67 
 
 		 182 aa  55.8  0.0000004  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.014299 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3688  BioY protein  34.53 
 
 		 190 aa  55.8  0.0000004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.983357  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0129  BioY protein  32.94 
 
 		 169 aa  55.5  0.0000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0127  BioY protein  32.94 
 
 		 169 aa  55.5  0.0000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.12372  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1647  BioY protein  40 
 
 		 169 aa  55.1  0.0000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1671  BioY protein  29.34 
 
 		 207 aa  53.9  0.000001  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000998664 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1651  BioY family protein  44.71 
 
 		 203 aa  53.5  0.000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  unclonable  0.00000000463296  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1333  BioY protein  44.93 
 
 		 144 aa  53.9  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.692637  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4207  BioY protein  36.04 
 
 		 195 aa  53.9  0.000002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.759379 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1496  hypothetical protein  33.08 
 
 		 165 aa  53.5  0.000002  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.41192 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>