More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_2951 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_2951  thiamine pyrophosphate protein central region  100 
 
 		 536 aa  1052    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00103515  hitchhiker  0.000679979 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4034  thiamine pyrophosphate protein central region  54.4 
 
 		 541 aa  463  1e-129  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.350713  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0450  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding protein  48.94 
 
 		 534 aa  418  9.999999999999999e-116  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1583  thiamine pyrophosphate protein domain-containing protein  48.18 
 
 		 536 aa  368  1e-100  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.37341 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1795  hypothetical protein  42.05 
 
 		 544 aa  325  1e-87  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.522465  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2040  hypothetical protein  40.6 
 
 		 535 aa  319  6e-86  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.463751  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0538  hypothetical protein  40.92 
 
 		 530 aa  319  7.999999999999999e-86  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2183  hypothetical protein  40.72 
 
 		 535 aa  315  9.999999999999999e-85  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46120  hypothetical protein  39.28 
 
 		 533 aa  312  1e-83  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0624787  normal  0.341873 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5710  hypothetical protein  42.4 
 
 		 536 aa  311  2e-83  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4471  hypothetical protein  39.01 
 
 		 545 aa  306  5.0000000000000004e-82  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.658207  normal  0.413 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3922  hypothetical protein  39.7 
 
 		 533 aa  305  2.0000000000000002e-81  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.13227  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1035  hypothetical protein  39.89 
 
 		 545 aa  302  1e-80  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.516106  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2840  hypothetical protein  40.27 
 
 		 545 aa  301  1e-80  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4329  hypothetical protein  39.07 
 
 		 545 aa  301  3e-80  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.243186 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_65795  hypothetical protein  40.33 
 
 		 559 aa  300  4e-80  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.000547463  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1932  thiamine pyrophosphate protein TPP binding domain protein  32.47 
 
 		 554 aa  300  4e-80  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4418  hypothetical protein  38.5 
 
 		 545 aa  300  6e-80  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.954696  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1394  hypothetical protein  38.69 
 
 		 545 aa  299  8e-80  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C6721  hypothetical protein  40.51 
 
 		 564 aa  298  1e-79  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.527215  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0339  hypothetical protein  40.44 
 
 		 576 aa  296  8e-79  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0749  thiamine pyrophosphate binding domain-containing protein  40 
 
 		 546 aa  294  3e-78  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1549  hypothetical protein  32.72 
 
 		 580 aa  286  5e-76  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.607866 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0179  hypothetical protein  38.87 
 
 		 537 aa  282  1e-74  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3213  hypothetical protein  36.18 
 
 		 523 aa  267  4e-70  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.628959  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3820  hypothetical protein  38.43 
 
 		 522 aa  261  2e-68  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.366241  normal  0.547453 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3590  hypothetical protein  34.8 
 
 		 541 aa  259  1e-67  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.291615  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1547  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  34.99 
 
 		 569 aa  248  2e-64  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.272513  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3594  hypothetical protein  34.42 
 
 		 541 aa  245  9.999999999999999e-64  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.234761  normal  0.928094 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3087  thiamine pyrophosphate protein central region  37.35 
 
 		 564 aa  244  3e-63  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1072  acetolactate synthase large subunit, biosynthetic type  30.97 
 
 		 566 aa  241  2e-62  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5385  hypothetical protein  33.02 
 
 		 542 aa  239  6.999999999999999e-62  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.366398  normal  0.452356 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1693  hypothetical protein  33.73 
 
 		 541 aa  235  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0281  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.89 
 
 		 554 aa  234  2.0000000000000002e-60  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2937  hypothetical protein  33.4 
 
 		 543 aa  230  4e-59  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1703  hypothetical protein  33.59 
 
 		 558 aa  230  4e-59  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.603628  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1203  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.98 
 
 		 584 aa  229  9e-59  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4284  hypothetical protein  32.34 
 
 		 541 aa  229  1e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.95304  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4046  thiamine pyrophosphate protein central region  32.39 
 
 		 587 aa  226  7e-58  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.26689  normal  0.848458 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1689  hypothetical protein  32.26 
 
 		 547 aa  225  1e-57  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0231  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.76 
 
 		 582 aa  225  2e-57  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000329619  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1929  acetolactate synthase catalytic subunit  31.2 
 
 		 572 aa  223  7e-57  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0954  acetolactate synthase catalytic subunit  30.46 
 
 		 587 aa  223  7e-57  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0223  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  32.83 
 
 		 552 aa  223  8e-57  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.387939  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1643  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.39 
 
 		 572 aa  222  9.999999999999999e-57  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.169007  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0110  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  32.21 
 
 		 557 aa  222  9.999999999999999e-57  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0153  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.79 
 
 		 562 aa  221  1.9999999999999999e-56  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0209009 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0372  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.61 
 
 		 581 aa  221  3e-56  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0590  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.08 
 
 		 553 aa  220  5e-56  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.000000684717  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0239  acetolactate synthase catalytic subunit  30.64 
 
 		 587 aa  220  6e-56  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1642  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  33.03 
 
 		 618 aa  219  7.999999999999999e-56  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.132379  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0608  acetolactate synthase large subunit biosynthetic type  30.68 
 
 		 566 aa  219  8.999999999999998e-56  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1170  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.67 
 
 		 583 aa  218  1e-55  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_01970  acetolactate synthase, large subunit  32.97 
 
 		 622 aa  219  1e-55  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.00241919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1674  acetolactate synthase catalytic subunit  30.67 
 
 		 587 aa  219  1e-55  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0218  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  30.33 
 
 		 588 aa  218  2e-55  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0158938 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0855  acetolactate synthase catalytic subunit  30.2 
 
 		 578 aa  217  2.9999999999999998e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3298  acetolactate synthase  30.23 
 
 		 550 aa  217  2.9999999999999998e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0757379  normal  0.853044 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0408  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  32.43 
 
 		 562 aa  217  4e-55  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1187  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.4 
 
 		 557 aa  217  4e-55  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1543  acetolactate synthase catalytic subunit  29.17 
 
 		 587 aa  217  4e-55  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.59725  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0502  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.7 
 
 		 535 aa  217  5e-55  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0235829  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0389  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.43 
 
 		 581 aa  216  8e-55  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.143896  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0605  acetolactate synthase, large subunit  29.93 
 
 		 567 aa  216  8e-55  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  1  normal  0.102703 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_07681  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  32.66 
 
 		 593 aa  216  9e-55  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0331014 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1910  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.99 
 
 		 565 aa  216  9.999999999999999e-55  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3554  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  32.54 
 
 		 581 aa  215  1.9999999999999998e-54  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.743835  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0139  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  31.95 
 
 		 612 aa  215  1.9999999999999998e-54  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2843  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  31.39 
 
 		 587 aa  214  1.9999999999999998e-54  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.882306 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1592  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  28.47 
 
 		 569 aa  214  2.9999999999999995e-54  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1692  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.93 
 
 		 563 aa  214  2.9999999999999995e-54  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1248  acetolactate synthase  29.79 
 
 		 550 aa  214  3.9999999999999995e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.888375 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0682  acetolactate synthase catalytic subunit  29.78 
 
 		 599 aa  213  5.999999999999999e-54  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2256  acetolactate synthase, large subunit  33.09 
 
 		 560 aa  213  7e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2168  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  30.4 
 
 		 573 aa  213  7.999999999999999e-54  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2596  acetolactate synthase catalytic subunit  29.74 
 
 		 577 aa  213  1e-53  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3580  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  32.03 
 
 		 558 aa  212  1e-53  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0486011  normal  0.793533 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2401  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.47 
 
 		 558 aa  213  1e-53  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5290  thiamine pyrophosphate protein domain protein TPP-binding protein  27.96 
 
 		 547 aa  211  2e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2757  acetolactate synthase 3 catalytic subunit  32.19 
 
 		 632 aa  212  2e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.928665  normal  0.703686 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1717  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.63 
 
 		 566 aa  211  4e-53  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.589802  normal  0.264845 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3720  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.02 
 
 		 566 aa  211  4e-53  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.104335  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4356  acetolactate synthase large subunit, biosynthetic type  31.02 
 
 		 597 aa  210  5e-53  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0195043  normal  0.165363 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2127  acetolactate synthase  30.43 
 
 		 547 aa  210  5e-53  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.240788  decreased coverage  0.000000336537 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0398  acetolactate synthase catalytic subunit  33.81 
 
 		 605 aa  210  6e-53  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0639  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  32.73 
 
 		 593 aa  210  6e-53  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0915985  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_09820  acetolactate synthase  30.1 
 
 		 547 aa  210  6e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.537219  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08870  acetolactate synthase 1 catalytic subunit  31.72 
 
 		 620 aa  210  6e-53  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0352  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  32.22 
 
 		 556 aa  209  8e-53  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1157  acetolactate synthase  30.16 
 
 		 547 aa  209  1e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.0170983 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3365  acetolactate synthase  30.16 
 
 		 547 aa  209  1e-52  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.248135  normal  0.345219 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2541  acetolactate synthase  27.12 
 
 		 544 aa  209  1e-52  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.77649 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0594  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.83 
 
 		 557 aa  209  1e-52  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000784156  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1242  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  29.36 
 
 		 563 aa  209  1e-52  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0519918 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0171  acetolactate synthase, large subunit, biosynthetic type  31.87 
 
 		 586 aa  209  1e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.458212  normal  0.847135 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1191  acetolactate synthase  30.16 
 
 		 547 aa  209  1e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.817809 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2393  acetolactate synthase  30.16 
 
 		 547 aa  209  1e-52  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.459354  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_08850  acetolactate synthase, large subunit  31.12 
 
 		 623 aa  208  2e-52  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.369585  normal  0.232213 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2585  acetolactate synthase  29.96 
 
 		 547 aa  208  2e-52  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.78585  normal  0.153261 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0101  acetolactate synthase  30.69 
 
 		 547 aa  208  2e-52  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.636834  normal  0.539081 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>