More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_5215 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_3959  AMP-dependent synthetase and ligase  56.51 
 
 		 547 aa  635    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.511333  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13548  acyl-CoA synthetase  84.43 
 
 		 548 aa  957    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  3.89294e-46  hitchhiker  0.000000367112 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5009  acyl-CoA synthetase  83.61 
 
 		 549 aa  965    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.138056  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5215  acyl-CoA synthetase  100 
 
 		 549 aa  1118    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.240289 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1543  acyl-CoA synthetase  89.62 
 
 		 549 aa  1019    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4627  acyl-CoA synthetase  83.06 
 
 		 549 aa  957    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4715  acyl-CoA synthetase  83.06 
 
 		 549 aa  957    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2836  acyl-CoA synthetase  53.37 
 
 		 539 aa  568  1e-161  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.395619 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2639  acyl-CoA synthetase  52.28 
 
 		 540 aa  558  1e-157  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.981359  normal  0.229963 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2725  acyl-CoA synthetase  50.74 
 
 		 548 aa  529  1e-149  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.105793  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1485  CoA synthetase, long-chain fatty acid:CoA ligase  46.74 
 
 		 528 aa  464  1e-129  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3980  AMP-dependent synthetase and ligase  45.97 
 
 		 526 aa  458  9.999999999999999e-129  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2174  acyl-CoA synthetase  46.24 
 
 		 540 aa  457  1e-127  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.264892  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4748  AMP-dependent synthetase and ligase  45.61 
 
 		 528 aa  431  1e-119  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3496  AMP-dependent synthetase and ligase  43.97 
 
 		 544 aa  412  1e-114  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.38244  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0888  AMP-dependent synthetase and ligase  41.8 
 
 		 545 aa  397  1e-109  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1786  acyl-CoA synthetase  39.96 
 
 		 549 aa  380  1e-104  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1833  acyl-CoA synthetase  39.96 
 
 		 549 aa  380  1e-104  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.936288  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2248  acyl-CoA synthetase  41.18 
 
 		 550 aa  370  1e-101  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2118  AMP-dependent synthetase and ligase  39.27 
 
 		 545 aa  367  1e-100  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.172383  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1767  acyl-CoA synthetase  40.53 
 
 		 549 aa  368  1e-100  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.848326  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4335  acyl-CoA synthetase  40.49 
 
 		 550 aa  363  6e-99  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0901424  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2206  acyl-CoA synthetase  40.48 
 
 		 536 aa  359  6e-98  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0886048  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2010  acyl-CoA synthetase  39.92 
 
 		 550 aa  358  9.999999999999999e-98  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.324541 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1759  acyl-CoA synthetase  40.74 
 
 		 536 aa  355  7.999999999999999e-97  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0729 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0608  AMP-dependent synthetase and ligase  39.89 
 
 		 557 aa  355  1e-96  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.597937  normal  1 
 
 
-
 
NC_010333  Caul_5298  acyl-CoA synthetase  39.71 
 
 		 536 aa  345  2e-93  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2891  acyl-CoA synthetase  38.52 
 
 		 558 aa  335  1e-90  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2935  acyl-CoA synthetase  38.52 
 
 		 558 aa  335  1e-90  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.444954  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2921  acyl-CoA synthetase  38.52 
 
 		 558 aa  335  1e-90  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.250918 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13546  fatty-acid-CoA ligase fadD18  85.37 
 
 		 218 aa  300  7e-80  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  2.46199e-133  hitchhiker  0.000000428617 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0290  AMP-dependent synthetase and ligase  37.02 
 
 		 605 aa  294  2e-78  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  hitchhiker  0.000671199  hitchhiker  0.000133038 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0691  AMP-dependent synthetase and ligase  35.66 
 
 		 553 aa  286  8e-76  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1756  acyl-CoA synthetase  35.64 
 
 		 542 aa  285  2.0000000000000002e-75  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.317816  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1775  acyl-CoA synthetase  35.45 
 
 		 542 aa  283  4.0000000000000003e-75  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1822  acyl-CoA synthetase  35.45 
 
 		 542 aa  283  4.0000000000000003e-75  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.591345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4349  acyl-CoA synthetase  37.31 
 
 		 541 aa  271  2e-71  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1995  acyl-CoA synthetase  34.36 
 
 		 541 aa  270  5.9999999999999995e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1563  acyl-CoA synthetase  35.91 
 
 		 531 aa  265  2e-69  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.701309  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1531  acyl-CoA synthetase  33.09 
 
 		 531 aa  236  1.0000000000000001e-60  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4096  AMP-dependent synthetase and ligase  31.25 
 
 		 508 aa  202  1.9999999999999998e-50  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0377217  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3124  AMP-dependent synthetase and ligase  29.68 
 
 		 545 aa  197  5.000000000000001e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1806  AMP-dependent synthetase and ligase  29.5 
 
 		 526 aa  192  2e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2323  AMP-dependent synthetase and ligase  29.79 
 
 		 511 aa  191  2.9999999999999997e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4595  AMP-dependent synthetase and ligase  30.21 
 
 		 525 aa  190  5.999999999999999e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1025  AMP-dependent synthetase and ligase  30.81 
 
 		 528 aa  189  1e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1672  AMP-dependent synthetase and ligase  28.09 
 
 		 608 aa  188  2e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.47643  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3565  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  30.29 
 
 		 526 aa  187  3e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.011282  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5310  acyl-CoA synthetase  31.17 
 
 		 516 aa  185  1.0000000000000001e-45  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2525  AMP-dependent synthetase and ligase  29.01 
 
 		 516 aa  184  3e-45  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.695888 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0734  AMP-dependent synthetase and ligase  31.62 
 
 		 511 aa  181  2.9999999999999997e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4826  AMP-dependent synthetase and ligase  30.5 
 
 		 520 aa  181  4e-44  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.0178748  normal  0.551416 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2924  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.05 
 
 		 526 aa  180  7e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.42655 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1180  hypothetical protein  27.2 
 
 		 544 aa  179  1e-43  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4700  acyl-CoA synthetase  30.59 
 
 		 516 aa  178  2e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2089  AMP-dependent synthetase and ligase  29.98 
 
 		 530 aa  178  3e-43  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2879  AMP-dependent synthetase and ligase  27.65 
 
 		 862 aa  176  9.999999999999999e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0353  AMP-dependent synthetase and ligase  29.01 
 
 		 520 aa  176  9.999999999999999e-43  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.504179  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3475  AMP-dependent synthetase and ligase  28.97 
 
 		 524 aa  175  1.9999999999999998e-42  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.440115  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4410  acyl-CoA synthetase  30.13 
 
 		 516 aa  175  1.9999999999999998e-42  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.648302  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5032  acyl-CoA synthetase  30.75 
 
 		 501 aa  175  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.672582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2094  AMP-dependent synthetase and ligase  29.83 
 
 		 520 aa  174  2.9999999999999996e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1472  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.7 
 
 		 514 aa  174  2.9999999999999996e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6618  AMP-dependent synthetase and ligase  31.72 
 
 		 493 aa  174  5e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1563  AMP-binding domain protein  30.29 
 
 		 538 aa  174  5e-42  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.716975 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3704  AMP-dependent synthetase and ligase  28.18 
 
 		 515 aa  173  5.999999999999999e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0990866  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1660  AMP-dependent synthetase and ligase  27.51 
 
 		 523 aa  173  6.999999999999999e-42  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.104845  normal  0.559317 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0582  AMP-binding domain protein  28.44 
 
 		 587 aa  173  7.999999999999999e-42  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.44238  normal  0.647319 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1605  AMP-dependent synthetase and ligase  27.96 
 
 		 526 aa  172  1e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4008  AMP-dependent synthetase and ligase  29.85 
 
 		 1043 aa  172  1e-41  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5438  AMP-dependent synthetase and ligase  28.54 
 
 		 515 aa  172  2e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.427259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4649  acyl-CoA synthetase  30.56 
 
 		 501 aa  172  2e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4737  acyl-CoA synthetase  30.56 
 
 		 501 aa  172  2e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.987006  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0681  acyl-CoA synthetase  28.68 
 
 		 520 aa  172  2e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.457647 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3600  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.12 
 
 		 525 aa  171  3e-41  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.887287  normal  0.975846 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2038  long-chain-fatty-acid--CoA ligase, putative  28.18 
 
 		 565 aa  171  4e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3987  AMP-dependent synthetase and ligase  28.07 
 
 		 662 aa  171  4e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1984  AMP-dependent synthetase and ligase  28.54 
 
 		 552 aa  170  5e-41  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2654  AMP-dependent synthetase and ligase  29.5 
 
 		 587 aa  170  7e-41  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4616  AMP-dependent synthetase and ligase  29.04 
 
 		 518 aa  169  9e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.892742  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2032  AMP-dependent synthetase and ligase  29.87 
 
 		 551 aa  169  9e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.367958 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0327  AMP-binding domain protein  28.91 
 
 		 549 aa  169  1e-40  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.347146  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0337  AMP-dependent synthetase and ligase  28.55 
 
 		 577 aa  169  2e-40  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.238028  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0310  AMP-dependent synthetase and ligase  28.57 
 
 		 533 aa  168  2e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.280778  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1041  AMP-binding domain protein  29.04 
 
 		 549 aa  169  2e-40  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1585  AMP-binding domain protein  28.73 
 
 		 549 aa  168  2.9999999999999998e-40  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0330  AMP-dependent synthetase and ligase  26.26 
 
 		 559 aa  167  4e-40  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.648816  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1964  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  28.46 
 
 		 525 aa  167  4e-40  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.132088  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1502  acyl-CoA synthetase  29.79 
 
 		 515 aa  167  4e-40  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1502  acyl-CoA synthetase  29.79 
 
 		 515 aa  167  4e-40  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1525  acyl-CoA synthetase  29.79 
 
 		 515 aa  167  4e-40  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1604  AMP-dependent synthetase and ligase  27.15 
 
 		 540 aa  167  5.9999999999999996e-40  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3335  AMP-dependent synthetase and ligase  28.38 
 
 		 512 aa  166  8e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.277543  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1465  acyl-CoA synthetase  29.26 
 
 		 487 aa  166  8e-40  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.845905  normal  0.967698 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1007  AMP-dependent synthetase and ligase  29.21 
 
 		 521 aa  166  1.0000000000000001e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0317729  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0403  AMP-binding domain protein  28.86 
 
 		 550 aa  166  1.0000000000000001e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.493287  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6878  AMP-dependent synthetase and ligase  28.52 
 
 		 509 aa  166  1.0000000000000001e-39  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.615245  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4867  AMP-binding domain protein  29.76 
 
 		 538 aa  166  1.0000000000000001e-39  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.223701  normal  0.186874 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0470  AMP-binding domain protein  29.78 
 
 		 579 aa  165  2.0000000000000002e-39  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.500012  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5140  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.17 
 
 		 525 aa  165  2.0000000000000002e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.24744  normal  0.25513 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>