84 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_5162 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_5162  hypothetical protein  100 
 
 
71 aa  144  3e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.635112 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1595  hypothetical protein  89.23 
 
 
68 aa  118  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4583  hypothetical protein  80 
 
 
67 aa  112  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4671  hypothetical protein  80 
 
 
67 aa  112  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4966  hypothetical protein  80 
 
 
67 aa  112  1.0000000000000001e-24  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.612536 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10778  ferredoxin  70.31 
 
 
68 aa  94.7  4e-19  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3842  protein of unknown function DUF1271  58.06 
 
 
65 aa  67  0.00000000008  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0565  ferredoxin (3Fe-4S)  40.32 
 
 
63 aa  55.8  0.0000002  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.389131  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4655  hypothetical protein  45.9 
 
 
64 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0261344  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5038  hypothetical protein  45.9 
 
 
64 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.530492  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4743  hypothetical protein  45.9 
 
 
64 aa  54.7  0.0000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.06168  normal  0.882667 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2711  cytochrome P450 51  43.75 
 
 
551 aa  53.1  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_22740  ferredoxin  44.62 
 
 
65 aa  53.1  0.000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7491  ferredoxin reductase  40 
 
 
62 aa  52.8  0.000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0885689  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3878  ferredoxin protein  40.91 
 
 
79 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00422429 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4214  hypothetical protein  39.34 
 
 
64 aa  52.8  0.000002  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0009  hypothetical protein  44.26 
 
 
64 aa  51.6  0.000003  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.556546 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4168  ferredoxin (4Fe-4S)  40.32 
 
 
64 aa  51.2  0.000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.269718  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1736  ferredoxin reductase  40 
 
 
62 aa  50.4  0.000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0618  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding protein  40.62 
 
 
68 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0900  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  36.07 
 
 
68 aa  48.9  0.00002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.800089  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0631  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  40.62 
 
 
68 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0609  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  40.62 
 
 
68 aa  49.3  0.00002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0578713  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1933  putative ferredoxin  35.71 
 
 
75 aa  48.5  0.00003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  hitchhiker  0.00206821  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2692  putative ferredoxin  42.25 
 
 
69 aa  48.9  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.13983  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4831  hypothetical protein  45.31 
 
 
65 aa  48.1  0.00004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.154693  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0433  protein of unknown function DUF1271  41.94 
 
 
63 aa  48.1  0.00004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.179796  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1903  protein of unknown function DUF1271  38.57 
 
 
77 aa  48.1  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0215351  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3799  3Fe-4S ferredoxin  44.44 
 
 
62 aa  47.8  0.00005  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.131127  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0158  ferredoxin protein  44.26 
 
 
70 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.840482  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6843  hypothetical protein  41.67 
 
 
63 aa  47.8  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6256  putative ferredoxin  40 
 
 
64 aa  47.8  0.00005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.353466  normal  0.021312 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1996  putative ferredoxin  43.55 
 
 
63 aa  47.8  0.00006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2061  putative ferredoxin  43.55 
 
 
63 aa  47.8  0.00006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2015  putative ferredoxin  43.55 
 
 
63 aa  47.8  0.00006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3705  ferredoxin 1  46.03 
 
 
63 aa  47.4  0.00007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4111  putative ferredoxin  42.86 
 
 
64 aa  47.4  0.00007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0837096  normal  0.452006 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3778  ferredoxin 1  46.03 
 
 
63 aa  47.4  0.00007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.432439 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2235  putative ferredoxin  40 
 
 
64 aa  47  0.00008  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1837  putative ferredoxin  39.68 
 
 
69 aa  47  0.00009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3488  protein of unknown function DUF1271  42.19 
 
 
66 aa  46.6  0.0001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3718  ferredoxin 1  44.44 
 
 
63 aa  46.2  0.0001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0681  hypothetical protein  35.48 
 
 
66 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.327652  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3163  ferredoxin  38.33 
 
 
71 aa  45.8  0.0002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.980888  hitchhiker  0.00034613 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3630  putative ferredoxin  40.32 
 
 
69 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.712603 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0591  hypothetical protein  35.48 
 
 
66 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2815  hypothetical protein  39.34 
 
 
63 aa  45.8  0.0002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.184095  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1256  hypothetical protein  34.92 
 
 
64 aa  45.1  0.0003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0858519 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0454  ferredoxin (3Fe-4S)  38.33 
 
 
63 aa  45.1  0.0004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.365861  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1636  hypothetical protein  39.39 
 
 
66 aa  44.7  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.228586  normal  0.056801 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0465  ferredoxin (3Fe-4S)  38.33 
 
 
63 aa  45.1  0.0004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.264194  normal  0.717772 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0441  ferredoxin (3Fe-4S)  38.33 
 
 
63 aa  45.1  0.0004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0174  hypothetical protein  35.94 
 
 
73 aa  44.3  0.0005  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.15739  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_33470  Protein of unknown function (DUF1271)  40 
 
 
68 aa  44.3  0.0005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.330575 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2739  hypothetical protein  41.27 
 
 
64 aa  43.9  0.0007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.104329  normal  0.880043 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1742  hypothetical protein  38.33 
 
 
67 aa  44.3  0.0007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3679  hypothetical protein  37.7 
 
 
65 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3752  hypothetical protein  37.7 
 
 
65 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.711087 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3692  hypothetical protein  37.7 
 
 
65 aa  43.9  0.0007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.303835  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1275  hypothetical protein  41.94 
 
 
63 aa  43.9  0.0008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3936  ferredoxin 1  40.68 
 
 
62 aa  43.9  0.0008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00512992 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1965  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain-containing protein  41.27 
 
 
65 aa  43.1  0.001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.838957  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2892  protein of unknown function DUF1271  45.45 
 
 
66 aa  43.1  0.001  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4601  ferredoxin protein  40 
 
 
71 aa  43.1  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.20068 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2133  protein of unknown function DUF1271  39.44 
 
 
78 aa  42.4  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1947  hypothetical protein  38.33 
 
 
79 aa  42.4  0.002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1634  hypothetical protein  33.87 
 
 
64 aa  42.4  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.34193 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1849  hypothetical protein  40.98 
 
 
62 aa  42.4  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.377437  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4179  ferredoxin 1  41.27 
 
 
63 aa  42.7  0.002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0661278  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1338  hypothetical protein  33.33 
 
 
68 aa  42.4  0.002  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3681  hypothetical protein  41.54 
 
 
70 aa  42.7  0.002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4371  ferredoxin protein  37.29 
 
 
73 aa  42  0.003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.581612  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4002  ferredoxin protein  37.29 
 
 
73 aa  42  0.003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.314508  normal  0.639017 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2802  hypothetical protein  36.51 
 
 
65 aa  41.6  0.004  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1038  protein of unknown function DUF1271  31.25 
 
 
65 aa  41.2  0.005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.2552  normal  0.0356011 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1825  hypothetical protein  36.36 
 
 
81 aa  41.2  0.005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0144614 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4483  ferredoxin protein  37.29 
 
 
71 aa  40.8  0.006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0590248  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0633  hypothetical protein  33.33 
 
 
65 aa  40.8  0.006  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.722049  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3693  protein of unknown function DUF1271  37.29 
 
 
65 aa  40.8  0.006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1222  ferredoxin reductase  41.67 
 
 
63 aa  40.8  0.006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.69438  normal  0.0120226 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0259  tRNA (guanine-N(7)-)-methyltransferase  33.33 
 
 
60 aa  40.8  0.006  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.088401  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0490  4Fe-4S ferredoxin iron-sulfur binding domain protein  39.66 
 
 
62 aa  40.8  0.007  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.049599 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0752  NADH dehydrogenase (quinone)  27.87 
 
 
505 aa  40.4  0.008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4926  putative ferredoxin  35.94 
 
 
66 aa  40  0.01  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0140269  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>