More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_3261 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_3261  resolvase domain-containing protein  100 
 
 
194 aa  374  1e-103  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.154119  normal 
 
 
-
 
NC_009340  Mflv_5591  resolvase domain-containing protein  87.64 
 
 
180 aa  271  6e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009341  Mflv_5602  resolvase domain-containing protein  79.46 
 
 
213 aa  251  6e-66  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0143673  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2284  Resolvase domain protein  48.63 
 
 
190 aa  140  9.999999999999999e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.33789  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4555  resolvase domain-containing protein  58.33 
 
 
129 aa  128  4.0000000000000003e-29  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.191563  normal  0.331166 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2258  resolvase domain-containing protein  41.99 
 
 
195 aa  128  6e-29  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.880923  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2154  Resolvase domain protein  39.78 
 
 
185 aa  126  3e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.478214  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2967  DNA-invertase hin  39.56 
 
 
188 aa  124  8.000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000835062 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2948  DNA-invertase hin  39.56 
 
 
187 aa  123  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  1.3180099999999999e-20 
 
 
-
 
NC_008757  Pnap_4123  resolvase domain-containing protein  40.33 
 
 
185 aa  123  1e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.0694671 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2913  DNA-invertase hin  39.56 
 
 
190 aa  123  1e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.504047  normal  0.0309704 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3714  resolvase domain-containing protein  39.78 
 
 
188 aa  122  4e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.566828  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0019  ISSod9, DNA-invertase  40.44 
 
 
185 aa  121  5e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004349  SO_A0170  ISSod9, DNA-invertase  40.44 
 
 
185 aa  121  5e-27  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  normal  0.579928  n/a   
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0073  resolvase  40.54 
 
 
184 aa  121  7e-27  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1562  recombinase  40.11 
 
 
188 aa  120  9e-27  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006663  SEA0006  resolvase family site-specific recombinase  38.38 
 
 
192 aa  120  9.999999999999999e-27  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.105184  n/a   
 
 
-
 
NC_007641  Rru_B0010  resolvase  38.67 
 
 
185 aa  120  9.999999999999999e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0319649  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2148  resolvase domain-containing protein  54.17 
 
 
131 aa  120  1.9999999999999998e-26  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  decreased coverage  0.00363321  normal  0.0540104 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3474  resolvase domain-containing protein  40.66 
 
 
188 aa  120  1.9999999999999998e-26  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1403  resolvase domain-containing protein  38.67 
 
 
185 aa  119  3e-26  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.749996  normal 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0219  DNA-invertase hin  40 
 
 
184 aa  119  3e-26  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0242276 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0167  resolvase domain-containing protein  40.74 
 
 
196 aa  118  4.9999999999999996e-26  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5431  Resolvase domain protein  38.8 
 
 
185 aa  118  6e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.318584  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2489  Resolvase domain protein  40.78 
 
 
184 aa  114  6e-25  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.243262  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0466  resolvase  40.56 
 
 
193 aa  114  8.999999999999998e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.736746  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29040  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  40.96 
 
 
197 aa  113  1.0000000000000001e-24  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.436309  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0302  DNA-invertase  40.22 
 
 
184 aa  112  2.0000000000000002e-24  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.623719 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3440  invertase/recombinase protein  42.33 
 
 
188 aa  112  3e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.115695  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_2312  Resolvase domain  37.17 
 
 
201 aa  112  3e-24  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3862  resolvase domain-containing protein  40.72 
 
 
194 aa  112  3e-24  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0506724  unclonable  0.00000235811 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0536  resolvase domain-containing protein  40.76 
 
 
203 aa  112  4.0000000000000004e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.201567  normal 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2757  resolvase domain-containing protein  40.78 
 
 
188 aa  112  4.0000000000000004e-24  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000977256 
 
 
-
 
NC_009619  SaurJH1_2823  resolvase domain-containing protein  38.38 
 
 
197 aa  110  9e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008506  LACR_D15  site-specific recombinase, DNA invertase Pin related protein  36.76 
 
 
184 aa  110  9e-24  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009477  SaurJH9_2746  resolvase domain-containing protein  38.38 
 
 
197 aa  110  9e-24  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2668  helix-turn-helix, Fis-type  42.41 
 
 
204 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00804941  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1568  helix-turn-helix, Fis-type  42.41 
 
 
204 aa  110  1.0000000000000001e-23  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009958  Dshi_4081  resolvase domain-containing protein  44.32 
 
 
199 aa  110  1.0000000000000001e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.0381075 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3876  resolvase domain-containing protein  44.32 
 
 
199 aa  110  1.0000000000000001e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.3792 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21550  site-specific recombinase, DNA invertase Pin  41.85 
 
 
218 aa  110  1.0000000000000001e-23  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.850113  normal 
 
 
-
 
NC_009955  Dshi_3680  resolvase domain-containing protein  44.32 
 
 
199 aa  110  1.0000000000000001e-23  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0854  invertase/recombinase like protein  38.59 
 
 
198 aa  110  2.0000000000000002e-23  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.160403  normal  0.816153 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1818  Resolvase domain protein  38.67 
 
 
184 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.601257  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4128  Resolvase domain protein  42.25 
 
 
231 aa  110  2.0000000000000002e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4537  Resolvase domain protein  40.1 
 
 
198 aa  109  3e-23  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.41321 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5190  resolvase domain-containing protein  41.18 
 
 
191 aa  108  3e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000411755  n/a   
 
 
-
 
NC_010502  Mrad2831_6497  resolvase domain-containing protein  39.56 
 
 
193 aa  108  3e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4386  resolvase  41.08 
 
 
219 aa  108  3e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3031  DNA-invertase  39.11 
 
 
197 aa  108  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00130363 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1503  resolvase  39.89 
 
 
182 aa  108  4.0000000000000004e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.236013  normal 
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5436  Resolvase domain  39.67 
 
 
193 aa  108  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0471  resolvase  38.07 
 
 
197 aa  108  5e-23  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011061  Paes_2392  Resolvase domain  37.5 
 
 
197 aa  108  6e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.000064315  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2637  resolvase domain-containing protein  39.11 
 
 
182 aa  108  6e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal  0.0771518 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3662  Resolvase domain protein  37.7 
 
 
188 aa  106  2e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010518  Mrad2831_6450  resolvase domain-containing protein  38.59 
 
 
193 aa  106  2e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008771  Veis_5037  resolvase domain-containing protein  36.31 
 
 
201 aa  106  2e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.931406  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1397  Resolvase domain protein  41.8 
 
 
209 aa  106  2e-22  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.954133  n/a   
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6373  resolvase domain-containing protein  38.59 
 
 
193 aa  105  3e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010517  Mrad2831_6403  resolvase domain-containing protein  38.59 
 
 
193 aa  105  3e-22  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007103  pE33L466_0068  resolvase  33.33 
 
 
181 aa  104  7e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0902003  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01209  bacteriocin production protein  34.39 
 
 
198 aa  104  8e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.000000702686  n/a   
 
 
-
 
NC_008739  Maqu_3982  resolvase domain-containing protein  38.1 
 
 
201 aa  104  9e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.364011  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0631  resolvase domain-containing protein  38.1 
 
 
201 aa  104  9e-22  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0955  Resolvase domain protein  41.45 
 
 
194 aa  103  1e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3660  resolvase domain-containing protein  37.91 
 
 
202 aa  103  1e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3670  resolvase domain-containing protein  36.41 
 
 
185 aa  103  1e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0095  resolvase domain-containing protein  38.8 
 
 
189 aa  103  1e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.386301 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1445  Resolvase domain  36.22 
 
 
188 aa  103  1e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2702  resolvase domain-containing protein  38.62 
 
 
307 aa  104  1e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.264305  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2944  resolvase domain-containing protein  38.62 
 
 
307 aa  104  1e-21  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.857733  normal 
 
 
-
 
NC_008766  Ajs_4249  resolvase domain-containing protein  38.55 
 
 
191 aa  102  2e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.251845 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2147  Resolvase domain protein  38.55 
 
 
191 aa  102  2e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2363  resolvase-like protein  41.49 
 
 
228 aa  103  2e-21  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.379523  normal  0.343568 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6187  resolvase-like protein  37.57 
 
 
186 aa  103  2e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0984609  hitchhiker  0.0000107923 
 
 
-
 
NC_008738  Maqu_4154  resolvase domain-containing protein  38.38 
 
 
199 aa  103  2e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1093  Resolvase domain  37.5 
 
 
196 aa  102  3e-21  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.531001  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1326  resolvase domain-containing protein  36.81 
 
 
180 aa  102  3e-21  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2582  resolvase domain-containing protein  36.61 
 
 
185 aa  102  3e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3045  Resolvase domain protein  37.43 
 
 
189 aa  102  4e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.436524  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4137  resolvase domain-containing protein  40.31 
 
 
224 aa  102  4e-21  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.130251  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1132  Resolvase domain  43.65 
 
 
184 aa  102  4e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4383  resolvase  36.11 
 
 
193 aa  102  4e-21  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6376  resolvase domain-containing protein  40.22 
 
 
206 aa  102  4e-21  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1006  Resolvase domain protein  37.16 
 
 
189 aa  102  4e-21  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0149  resolvase  35.56 
 
 
189 aa  102  5e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5628  Resolvase domain  39.56 
 
 
198 aa  102  5e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.526216 
 
 
-
 
NC_011881  Achl_4598  Resolvase domain protein  38.8 
 
 
188 aa  101  6e-21  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2322  resolvase domain-containing protein  37.04 
 
 
186 aa  101  6e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_43160  Resolvase-like protein  37.3 
 
 
189 aa  101  6e-21  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2355  Resolvase domain protein  34.74 
 
 
186 aa  100  9e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.230305  normal  0.6636 
 
 
-
 
NC_006365  plpp0052  hypothetical protein  38.59 
 
 
201 aa  100  1e-20  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0021  resolvase-like protein  37.02 
 
 
189 aa  100  1e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1494  resolvase-like protein  37.57 
 
 
186 aa  100  1e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.493325 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6748  resolvase domain-containing protein  37.57 
 
 
201 aa  100  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.167425 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3678  Resolvase domain  36.46 
 
 
190 aa  100  1e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.134045  n/a   
 
 
-
 
NC_008607  Ppro_3694  resolvase domain-containing protein  38.83 
 
 
206 aa  100  1e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6405  resolvase domain-containing protein  37.89 
 
 
185 aa  100  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009671  Oant_4668  resolvase domain-containing protein  37.89 
 
 
189 aa  100  2e-20  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>