More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_1112 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_1112  integrase, catalytic region  100 
 
 
148 aa  299  8.000000000000001e-81  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.329084  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1111  integrase catalytic subunit  93.75 
 
 
273 aa  279  1e-74  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.461857  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1456  integrase catalytic subunit  94.96 
 
 
345 aa  271  3e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1693  integrase catalytic subunit  94.96 
 
 
345 aa  271  3e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.770158  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1708  integrase catalytic subunit  94.96 
 
 
345 aa  271  3e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.420426  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2595  integrase catalytic subunit  94.96 
 
 
345 aa  271  3e-72  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0685219  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4204  integrase catalytic subunit  94.96 
 
 
345 aa  271  3e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.250601  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3188  integrase catalytic subunit  94.96 
 
 
345 aa  271  3e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.524164  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4763  integrase catalytic subunit  94.96 
 
 
345 aa  271  3e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.307384  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4752  integrase catalytic subunit  94.96 
 
 
345 aa  271  3e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5655  integrase catalytic subunit  94.96 
 
 
358 aa  270  4.0000000000000004e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.935858  normal 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5608  integrase catalytic subunit  94.96 
 
 
250 aa  270  5.000000000000001e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.120507  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1474  integrase catalytic subunit  94.96 
 
 
250 aa  270  5.000000000000001e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1721  integrase catalytic subunit  94.96 
 
 
250 aa  270  5.000000000000001e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1737  integrase catalytic subunit  94.96 
 
 
250 aa  270  5.000000000000001e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.524311  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1753  integrase catalytic subunit  94.96 
 
 
250 aa  270  5.000000000000001e-72  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.344033  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1664  integrase catalytic subunit  94.96 
 
 
250 aa  270  5.000000000000001e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.183363  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2264  integrase catalytic subunit  94.96 
 
 
250 aa  270  5.000000000000001e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.577576  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1590  integrase catalytic subunit  94.96 
 
 
250 aa  270  5.000000000000001e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5362  integrase catalytic subunit  94.96 
 
 
250 aa  270  5.000000000000001e-72  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.958298  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4452  integrase catalytic subunit  94.96 
 
 
250 aa  270  5.000000000000001e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_2014  Integrase catalytic region  71.23 
 
 
297 aa  214  2e-55  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1671  integrase catalytic subunit  96.34 
 
 
162 aa  162  2.0000000000000002e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.212751  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4475  Integrase catalytic region  48.32 
 
 
263 aa  140  6e-33  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1167  integrase catalytic subunit  44.97 
 
 
284 aa  134  5e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1301  integrase catalytic subunit  44.44 
 
 
231 aa  132  1.9999999999999998e-30  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0289  integrase catalytic subunit  44.44 
 
 
231 aa  132  1.9999999999999998e-30  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0273  integrase catalytic subunit  44.44 
 
 
231 aa  132  1.9999999999999998e-30  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0115  integrase catalytic subunit  44.44 
 
 
231 aa  132  1.9999999999999998e-30  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08090  transposase  48.3 
 
 
267 aa  126  8.000000000000001e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.757215 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_22000  transposase  48.3 
 
 
267 aa  126  8.000000000000001e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.208093 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_17090  transposase  48.3 
 
 
267 aa  126  8.000000000000001e-29  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.200015  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1310  transposase  42.07 
 
 
267 aa  125  1.0000000000000001e-28  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_90  transposase  42.07 
 
 
267 aa  125  1.0000000000000001e-28  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_776  transposase  42.07 
 
 
271 aa  126  1.0000000000000001e-28  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1333  transposase  42.07 
 
 
209 aa  125  2.0000000000000002e-28  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_65  transposase  42.07 
 
 
209 aa  125  2.0000000000000002e-28  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1290  Integrase catalytic region  43.83 
 
 
309 aa  124  6e-28  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1028  Integrase catalytic region  42.07 
 
 
276 aa  122  1e-27  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011758  Mchl_5526  Integrase catalytic region  46.53 
 
 
260 aa  122  2e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.109818 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3500  Integrase catalytic region  43.62 
 
 
265 aa  122  2e-27  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1112  Integrase catalytic region  46.53 
 
 
260 aa  122  2e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.323234 
 
 
-
 
NC_009468  Acry_3415  integrase catalytic subunit  42.28 
 
 
282 aa  122  2e-27  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009508  Swit_4908  integrase catalytic subunit  41.61 
 
 
283 aa  120  7e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.168017 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5378  Integrase catalytic region  42.28 
 
 
289 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0344  Integrase catalytic region  42.28 
 
 
289 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.954448 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3817  Integrase catalytic region  42.28 
 
 
289 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.306365  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1082  Integrase catalytic region  42.28 
 
 
289 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1055  Integrase catalytic region  42.28 
 
 
289 aa  119  9.999999999999999e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.697058  normal  0.657903 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3381  Integrase catalytic region  40.28 
 
 
278 aa  118  3e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02391  ISXoo3 transposase ORF B  43.66 
 
 
281 aa  118  3e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.555401  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3531  integrase catalytic region  40.28 
 
 
278 aa  117  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4814  Integrase catalytic region  40.28 
 
 
250 aa  117  6e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1494  Integrase catalytic region  40.28 
 
 
278 aa  117  7e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03601  ISXoo3 transposase ORF B  42.96 
 
 
281 aa  116  9.999999999999999e-26  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.332143  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04437  ISXoo3 transposase ORF B  42.96 
 
 
281 aa  115  1.9999999999999998e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0142  putative insertion element protein  40.69 
 
 
240 aa  114  3.9999999999999997e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0210  putative insertion element protein  40.69 
 
 
240 aa  114  3.9999999999999997e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal  0.401167 
 
 
-
 
NC_009475  BBta_p0205  putative insertion element protein  40.69 
 
 
240 aa  114  3.9999999999999997e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009508  Swit_5097  integrase catalytic subunit  42.07 
 
 
286 aa  114  3.9999999999999997e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.545434 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04310  ISXoo3 transposase ORF B  42.25 
 
 
281 aa  114  3.9999999999999997e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0166  ISDet2, transposase orfB  41.38 
 
 
274 aa  114  6e-25  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.101481  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04192  ISXoo3 transposase ORF B  41.55 
 
 
281 aa  113  8.999999999999998e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2312  Integrase catalytic region  40.69 
 
 
282 aa  112  1.0000000000000001e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.939374 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2309  Integrase catalytic region  40.69 
 
 
282 aa  113  1.0000000000000001e-24  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.652004 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_55060  hypothetical protein  43.45 
 
 
280 aa  112  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000896639  unclonable  2.5426499999999997e-21 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03997  ISXoo3 transposase ORF B  41.55 
 
 
281 aa  112  1.0000000000000001e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02941  ISXoo3 transposase ORF B  41.55 
 
 
281 aa  113  1.0000000000000001e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0359782  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_06055  integrase core domain protein  41.55 
 
 
281 aa  113  1.0000000000000001e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.130337  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03932  ISXoo3 transposase ORF B  41.55 
 
 
281 aa  112  2.0000000000000002e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0294  integrase catalytic subunit  42.86 
 
 
279 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4864  integrase catalytic subunit  42.86 
 
 
279 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03170  hypothetical protein  42.07 
 
 
279 aa  111  4.0000000000000004e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000150794  hitchhiker  0.00000000404269 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3301  integrase catalytic subunit  42.86 
 
 
279 aa  111  4.0000000000000004e-24  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3513  transposase IS3/IS911 family protein  39.04 
 
 
370 aa  110  6e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5979  transposase IS3/IS911 family protein  39.04 
 
 
370 aa  110  6e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4211  transposase IS3/IS911 family protein  39.04 
 
 
370 aa  110  6e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.122928  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6345  transposase IS3/IS911 family protein  39.04 
 
 
370 aa  110  6e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3491  transposase IS3/IS911 family protein  39.04 
 
 
370 aa  110  6e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.841443  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1392  transposase IS3/IS911 family protein  39.04 
 
 
370 aa  110  6e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3517  transposase IS3/IS911 family protein  39.04 
 
 
370 aa  110  6e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.148961  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2634  IS3 family transposase B  44.44 
 
 
279 aa  110  7.000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.000000161209  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4519  IS3 family transposase B  44.44 
 
 
279 aa  110  7.000000000000001e-24  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.00000685336  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0603  integrase catalytic subunit  41.5 
 
 
271 aa  110  7.000000000000001e-24  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02652  ISXoo3 transposase ORF B  40.85 
 
 
281 aa  109  1.0000000000000001e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013442  Gbro_4903  Integrase catalytic region  39.04 
 
 
277 aa  108  2.0000000000000002e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02902  Integrase, catalytic region  39.73 
 
 
267 aa  108  2.0000000000000002e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1549  Integrase catalytic region  38.62 
 
 
269 aa  108  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4711  Integrase catalytic region  38.36 
 
 
277 aa  107  4.0000000000000004e-23  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.988899  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0637  transposase OrfB  37.59 
 
 
249 aa  107  5e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.417638 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0640  transposase OrfB  37.59 
 
 
249 aa  107  5e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.263209 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0849  transposase OrfB  37.59 
 
 
249 aa  107  5e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.553346 
 
 
-
 
NC_003296  RSp0558  ISRSO16-transposase ORFB protein  39.86 
 
 
280 aa  107  6e-23  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.269801 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2543  Integrase catalytic region  43.92 
 
 
280 aa  107  6e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2624  integrase protein  40.54 
 
 
237 aa  107  8.000000000000001e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.947279  normal  0.151967 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3223  integrase protein  40.54 
 
 
237 aa  107  8.000000000000001e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0342368  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3526  integrase protein  40.54 
 
 
237 aa  107  8.000000000000001e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.0130406 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3728  integrase protein  40.54 
 
 
237 aa  107  8.000000000000001e-23  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1827  hypothetical protein  45.3 
 
 
195 aa  106  9.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3557  hypothetical protein  45.3 
 
 
195 aa  106  9.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>