48 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_0165 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008553  Mthe_0165  hypothetical protein  100 
 
 
200 aa  404  1.0000000000000001e-112  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1546  protein of unknown function UPF0153  43.89 
 
 
186 aa  125  6e-28  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0737  hypothetical protein  41.99 
 
 
180 aa  119  3e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.23045  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2168  hypothetical protein  32.22 
 
 
268 aa  118  7e-26  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2772  protein of unknown function UPF0153  35.81 
 
 
237 aa  107  2e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1587  hypothetical protein  37.78 
 
 
179 aa  104  9e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2907  protein of unknown function UPF0153  36.32 
 
 
218 aa  104  1e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1302  protein of unknown function UPF0153  33.94 
 
 
224 aa  103  2e-21  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1445  hypothetical protein  36.42 
 
 
172 aa  97.1  1e-19  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3209  protein of unknown function UPF0153  31.42 
 
 
230 aa  92  5e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.348826  normal  0.121177 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1882  hypothetical protein  33.9 
 
 
236 aa  90.9  1e-17  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0557  protein of unknown function UPF0153  31.33 
 
 
246 aa  84.7  7e-16  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0097  hypothetical protein  36.56 
 
 
140 aa  55.5  0.0000006  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.348391  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1740  hypothetical protein  33.98 
 
 
137 aa  54.3  0.000001  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal  0.0376744 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0387  hypothetical protein  29.51 
 
 
141 aa  53.5  0.000002  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal  0.104898 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1611  hypothetical protein  32.08 
 
 
240 aa  53.5  0.000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.574947 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1142  protein of unknown function UPF0153  32.99 
 
 
142 aa  53.5  0.000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.000623582  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1354  hypothetical protein  33.33 
 
 
137 aa  53.5  0.000002  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  normal  0.0640158 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0883  hypothetical protein  33 
 
 
133 aa  52.8  0.000003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1736  protein of unknown function UPF0153  32.98 
 
 
152 aa  51.6  0.000007  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.408494  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0830  protein of unknown function UPF0153  34.04 
 
 
166 aa  51.6  0.000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1468  hypothetical protein  31.43 
 
 
229 aa  50.1  0.00002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1303  hypothetical protein  30.28 
 
 
168 aa  50.1  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_3041  protein of unknown function UPF0153  28.04 
 
 
175 aa  49.7  0.00003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0897677 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1120  hypothetical protein  30.48 
 
 
140 aa  49.3  0.00004  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1944  hypothetical protein  32.67 
 
 
153 aa  48.9  0.00004  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0467  hypothetical protein  31.68 
 
 
163 aa  48.5  0.00006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0193429  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1987  hypothetical protein  28.72 
 
 
151 aa  48.5  0.00006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.805923  normal  0.188082 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1550  hypothetical protein  31.68 
 
 
163 aa  48.5  0.00006  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1377  hypothetical protein  29.23 
 
 
210 aa  48.1  0.00009  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.240563  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0729  hypothetical protein  29.35 
 
 
127 aa  47.4  0.0002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0121863  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0539  hypothetical protein  29.35 
 
 
156 aa  47  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000059551  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0177  hypothetical protein  27.07 
 
 
224 aa  46.6  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011672  PHATRDRAFT_44566  predicted protein  25.42 
 
 
271 aa  47  0.0002  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.730004  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0369  hypothetical protein  30.69 
 
 
163 aa  46.2  0.0003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal  0.0145545 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0491  hypothetical protein  28 
 
 
246 aa  46.2  0.0003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0442  hypothetical protein  28.12 
 
 
163 aa  45.8  0.0004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.00675545  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0749  hypothetical protein  29.09 
 
 
194 aa  45.8  0.0004  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0644  hypothetical protein  28.57 
 
 
243 aa  45.4  0.0005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_0924  conserved hypothetical protein (UPF0153 domain protein)  30.85 
 
 
122 aa  45.4  0.0005  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0356  hypothetical protein  31 
 
 
237 aa  45.4  0.0005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.172392  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2019  protein of unknown function UPF0153  24.39 
 
 
222 aa  44.3  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.290422  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1438  hypothetical protein  28.12 
 
 
124 aa  44.7  0.001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.903885  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0986  protein of unknown function UPF0153  28.72 
 
 
149 aa  43.5  0.002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003912  CJE0604  hypothetical protein  29.79 
 
 
124 aa  43.5  0.002  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1308  protein of unknown function UPF0153  31.19 
 
 
126 aa  43.9  0.002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0836472  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0517  hypothetical protein  28.72 
 
 
124 aa  43.1  0.003  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0525  hypothetical protein  24.28 
 
 
187 aa  41.6  0.008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>