62 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_3828 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_3828  Invasion associated locus B family protein  100 
 
 		 187 aa  380  1e-105  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0423931 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2193  invasion associated locus B family protein  78.57 
 
 		 251 aa  281  3.0000000000000004e-75  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3384  invasion associated locus B family protein  59.54 
 
 		 267 aa  208  3e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.877703 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3693  Invasion associated locus B family protein  59.54 
 
 		 267 aa  209  3e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.468736  normal  0.931761 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3575  Invasion associated locus B family protein  59.54 
 
 		 267 aa  207  6e-53  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0837139  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7180  Invasion associated locus B family protein  60.69 
 
 		 260 aa  198  3.9999999999999996e-50  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.467749  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1657  invasion associated locus B family protein  62.57 
 
 		 257 aa  194  5.000000000000001e-49  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0264072 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6313  invasion associated locus B family protein  60.95 
 
 		 253 aa  194  7e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00806169 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2626  invasion associated locus B  43.02 
 
 		 262 aa  142  2e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.194034  decreased coverage  0.0000348412 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2942  Invasion associated locus B family protein  43.35 
 
 		 248 aa  142  4e-33  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2049  invasion associated locus B  43.93 
 
 		 250 aa  139  1.9999999999999998e-32  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.49734  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2614  invasion associated locus B  45.06 
 
 		 253 aa  139  1.9999999999999998e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0807457  normal  0.637566 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4152  hypothetical protein  41.57 
 
 		 258 aa  137  7.999999999999999e-32  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.154991  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2846  invasion associated locus B  41.81 
 
 		 263 aa  135  2e-31  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.798447  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1509  invasion associated locus B  42.59 
 
 		 244 aa  134  9e-31  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.138245  normal  0.0458793 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0541  invasion associated locus B (IalB) protein  33.72 
 
 		 205 aa  96.7  2e-19  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0575  hypothetical protein  33.72 
 
 		 205 aa  95.9  3e-19  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3637  invasion associated locus B family protein  34.3 
 
 		 205 aa  95.1  5e-19  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1396  invasion associated locus B family protein  33.95 
 
 		 209 aa  92.8  2e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.213972  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2372  hypothetical protein  29.76 
 
 		 211 aa  82  0.000000000000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.889914  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1734  Invasion associated locus B family protein  30.86 
 
 		 221 aa  78.6  0.00000000000005  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.228228 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1918  Invasion associated locus B family protein  30.86 
 
 		 219 aa  77.4  0.0000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.308909  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1698  invasion associated locus B  30.67 
 
 		 204 aa  77  0.0000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3868  invasion associated locus B family protein  25.58 
 
 		 267 aa  71.2  0.000000000007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1236  Invasion associated locus B family protein  27.82 
 
 		 185 aa  61.6  0.000000006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0497767 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4649  invasion associated locus B family protein  29.63 
 
 		 190 aa  60.8  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.372829  normal  0.231313 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0800  invasion associated locus B family protein  24.56 
 
 		 204 aa  60.5  0.00000002  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0471  hypothetical protein  29.77 
 
 		 208 aa  59.3  0.00000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.613905  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0441  invasion associated locus B family protein  32.09 
 
 		 172 aa  59.7  0.00000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0581786  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0466  hypothetical protein  29.77 
 
 		 198 aa  59.7  0.00000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1038  invasion associated locus B  25 
 
 		 242 aa  58.9  0.00000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0641  Invasion associated locus B family protein  27.69 
 
 		 213 aa  58.9  0.00000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.285928 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0517  invasion associated locus B family protein  26.12 
 
 		 176 aa  58.5  0.00000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0580  invasion associated locus B family protein  29.1 
 
 		 204 aa  58.9  0.00000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0601  Invasion associated locus B family protein  27.69 
 
 		 213 aa  57.4  0.0000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0222  invasion associated locus B  22.56 
 
 		 195 aa  56.6  0.0000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1007  Invasion associated locus B family protein  25.56 
 
 		 176 aa  55.8  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0254  invasion associated locus B  22.56 
 
 		 186 aa  55.8  0.0000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0740  invasion associated locus B  26.87 
 
 		 172 aa  55.5  0.0000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0827  hypothetical protein  23.48 
 
 		 203 aa  55.1  0.0000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.187418 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4786  invasion associated locus B  21.05 
 
 		 191 aa  55.1  0.0000006  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.979313  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0587  invasion associated locus B  31.39 
 
 		 186 aa  54.7  0.0000007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0857316  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3491  invasion associated locus B family protein  29.63 
 
 		 177 aa  54.7  0.0000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.482775  normal  0.0568392 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0356  invasion protein B  29.85 
 
 		 184 aa  54.3  0.000001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.277938  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0898  Invasion associated locus B family protein  21.05 
 
 		 182 aa  53.9  0.000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1839  Invasion associated locus B family protein  30.37 
 
 		 166 aa  54.3  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0465261  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0731  invasion associated locus B family protein  27.41 
 
 		 213 aa  53.1  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0906658 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4589  invasion associated locus B  21.05 
 
 		 211 aa  53.1  0.000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.544468 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4885  invasion associated locus B family protein  29.63 
 
 		 166 aa  52.8  0.000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.349132  normal  0.015779 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0813  invasion associated locus B  21.05 
 
 		 214 aa  52.8  0.000003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.181742  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0566  Invasion associated locus B family protein  28.15 
 
 		 190 aa  52.4  0.000004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.165882 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1179  invasion associated locus B family protein  29.85 
 
 		 172 aa  52  0.000005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0591  invasion associated locus B family protein  28.15 
 
 		 180 aa  49.3  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.04899  normal  0.0705268 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0602  Invasion associated locus B family protein  28.15 
 
 		 180 aa  48.9  0.00004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.100157 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0588  invasion associated locus B  27.07 
 
 		 149 aa  49.3  0.00004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0223596  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2525  invasion associated locus B  30.77 
 
 		 205 aa  46.2  0.0003  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.91457 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5547  Invasion associated locus B family protein  28.36 
 
 		 169 aa  45.8  0.0004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.572174  hitchhiker  0.000199147 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0404  invasion associated locus B family protein  23.15 
 
 		 179 aa  45.1  0.0007  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0706  invasion associated locus B  35.71 
 
 		 186 aa  43.5  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.488377 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3094  invasion associated locus B family protein  23.57 
 
 		 185 aa  42.7  0.003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.40204 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3254  Invasion associated locus B family protein  24.03 
 
 		 236 aa  41.2  0.008  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.351607  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1381  invasion associated locus B family protein  24.19 
 
 		 262 aa  41.2  0.008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0695092  normal  0.770841 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>