78 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_3232 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_3232  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  100 
 
 		 382 aa  733    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00415956 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2472  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  63.56 
 
 		 419 aa  437  1e-121  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4613  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  59.56 
 
 		 389 aa  414  1e-114  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.522364  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1479  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  59.56 
 
 		 389 aa  414  1e-114  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.805909  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1664  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  60.66 
 
 		 383 aa  390  1e-107  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.537362  normal  0.0255572 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3313  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  59.89 
 
 		 386 aa  377  1e-103  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.43165 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3541  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  57.53 
 
 		 386 aa  365  1e-100  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.123279  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2615  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  57.85 
 
 		 429 aa  323  2e-87  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.298091  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0457  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  50.83 
 
 		 384 aa  316  5e-85  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1047  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  45.41 
 
 		 387 aa  309  5.9999999999999995e-83  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000418188  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0042  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  48.61 
 
 		 402 aa  308  1.0000000000000001e-82  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.120445  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0041  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  48.33 
 
 		 385 aa  308  1.0000000000000001e-82  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.299856  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1661  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  46.81 
 
 		 400 aa  298  1e-79  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  normal  0.431835 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1992  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  46.81 
 
 		 400 aa  298  1e-79  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2839  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  51.26 
 
 		 378 aa  280  2e-74  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4643  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  49.73 
 
 		 383 aa  275  1.0000000000000001e-72  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1616  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein, putative  43.63 
 
 		 381 aa  270  4e-71  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.195431  n/a   
 
 
-
 
BN001306  ANIA_09133  malate permease (Eurofung)  37.96 
 
 		 361 aa  224  2e-57  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0625395  normal  0.622615 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4391  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  33.42 
 
 		 395 aa  171  1e-41  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0433  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  34.83 
 
 		 366 aa  171  2e-41  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5153  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  31.67 
 
 		 435 aa  158  2e-37  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3375  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  27.97 
 
 		 353 aa  149  1.0000000000000001e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.646539  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4384  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  33.15 
 
 		 374 aa  148  1.0000000000000001e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2914  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  32.77 
 
 		 369 aa  147  4.0000000000000006e-34  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2282  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  32.57 
 
 		 404 aa  136  5e-31  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.522283 
 
 
-
 
NC_006670  CNA05110  sulfite transporter, putative  30.88 
 
 		 517 aa  123  5e-27  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3436  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  30.27 
 
 		 375 aa  118  1.9999999999999998e-25  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1117  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  29.68 
 
 		 385 aa  114  2.0000000000000002e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2094  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  30.65 
 
 		 395 aa  109  7.000000000000001e-23  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.113103  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0680  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  30.86 
 
 		 346 aa  105  9e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30900  predicted protein  26.98 
 
 		 449 aa  103  6e-21  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.192917  normal  0.324549 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4610  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  30.35 
 
 		 374 aa  102  9e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.174728  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0404  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  25.42 
 
 		 343 aa  102  1e-20  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009043  PICST_44239  predicted protein  24.53 
 
 		 373 aa  96.3  8e-19  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.182141 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01472  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_8G04630)  23.73 
 
 		 395 aa  92.8  8e-18  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.00510243  normal  0.213682 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07797  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G17660)  24.43 
 
 		 375 aa  92.8  1e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0796042 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30901  predicted protein  25.85 
 
 		 433 aa  90.1  5e-17  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.314839 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2212  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  22.74 
 
 		 347 aa  90.5  5e-17  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.000186594  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_11016  malic acid transport protein, putative (AFU_orthologue; AFUA_4G09410)  26.67 
 
 		 388 aa  89.7  7e-17  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.522177 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0897  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  24.66 
 
 		 384 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0526316  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1807  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  26.43 
 
 		 373 aa  79  0.0000000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4856  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  29.81 
 
 		 363 aa  76.6  0.0000000000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0594836  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1964  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  22.25 
 
 		 341 aa  75.9  0.000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.449611  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_30899  predicted protein  22.19 
 
 		 438 aa  71.6  0.00000000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.341718  normal  0.766697 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1488  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  25.07 
 
 		 326 aa  67.4  0.0000000004  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.138957  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2878  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  30.93 
 
 		 356 aa  64.3  0.000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1002  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  22.47 
 
 		 326 aa  63.5  0.000000006  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0780  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  24.55 
 
 		 357 aa  61.6  0.00000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.439513  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3443  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  22.92 
 
 		 357 aa  62  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.288016  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2079  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  26.67 
 
 		 387 aa  61.2  0.00000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2613  putative C4-dicarboxylate transporter  26.01 
 
 		 367 aa  60.1  0.00000006  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1250  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  23.31 
 
 		 339 aa  60.1  0.00000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.618998 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1428  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  23.38 
 
 		 326 aa  58.9  0.0000001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.648837  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2173  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  26.22 
 
 		 387 aa  58.9  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0077  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  24.62 
 
 		 360 aa  58.5  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4485  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  22.95 
 
 		 331 aa  57  0.0000005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2285  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  21.61 
 
 		 342 aa  56.6  0.0000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1847  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein, putative  24.86 
 
 		 362 aa  56.2  0.0000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1525  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  24.86 
 
 		 362 aa  56.2  0.0000008  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0288585  normal  0.364123 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0262  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  21.41 
 
 		 326 aa  56.2  0.0000009  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.490453  n/a   
 
 
-
 
NC_006682  CNM00310  conserved hypothetical protein  22.54 
 
 		 382 aa  54.7  0.000003  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  decreased coverage  0.00875379  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1275  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  24.76 
 
 		 323 aa  54.3  0.000003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.360246  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_4140  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  25.47 
 
 		 374 aa  53.9  0.000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1761  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  26.83 
 
 		 387 aa  53.1  0.000007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.41649  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03304  hypothetical protein  24.67 
 
 		 324 aa  53.1  0.000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0374  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  23.27 
 
 		 321 aa  53.1  0.000007  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.273821  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0133  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  23.63 
 
 		 351 aa  53.1  0.000008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002682  tellurite resistance protein  24.91 
 
 		 324 aa  51.6  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0518365  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3523  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  26.57 
 
 		 366 aa  49.3  0.0001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00371301  normal  0.143874 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2530  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  25.44 
 
 		 323 aa  48.5  0.0002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2607  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  22.26 
 
 		 329 aa  47.8  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.898363  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1129  hypothetical protein  22.17 
 
 		 319 aa  46.6  0.0008  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  0.392621 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4602  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  28.18 
 
 		 357 aa  45.4  0.001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.681396 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3979  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  23.03 
 
 		 352 aa  46.2  0.001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.894801  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_2052  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  21.08 
 
 		 322 aa  45.8  0.001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3702  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  24.51 
 
 		 348 aa  43.1  0.007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0322958  normal  0.371988 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0542  hypothetical protein  28.57 
 
 		 239 aa  43.1  0.009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2801  C4-dicarboxylate transporter/malic acid transport protein  24.08 
 
 		 356 aa  42.7  0.01  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.518701  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>