21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_0651 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_0651  type II secretion system protein  100 
 
 		 615 aa  1204    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.219631 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0195  Type II secretion system F domain protein  48.09 
 
 		 616 aa  585  1.0000000000000001e-165  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.372674  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1648  type II secretion system protein  24.79 
 
 		 590 aa  139  1e-31  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.505042  hitchhiker  0.00186987 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0445  type II secretion system protein  22.65 
 
 		 604 aa  127  6e-28  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.179017  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0494  Type II secretion system F domain protein  22.35 
 
 		 658 aa  60.5  0.00000008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2354  type II secretion system protein  20.4 
 
 		 652 aa  57  0.000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.149954  normal  0.434022 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2401  type II secretion system protein  20.75 
 
 		 647 aa  50.1  0.0001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2815  type II secretion system protein  22.27 
 
 		 802 aa  50.1  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2002  type II secretion system protein  23.46 
 
 		 307 aa  49.7  0.0002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1903  type II secretion system protein  22.78 
 
 		 349 aa  49.7  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.697256 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1904  type II secretion system protein  24.58 
 
 		 224 aa  49.7  0.0002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.374216 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2404  type II secretion system protein  22.75 
 
 		 300 aa  46.6  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.633415 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1173  type II secretion system protein  21.06 
 
 		 641 aa  46.6  0.001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0525708  normal  0.392057 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2722  type II secretion system protein  20.59 
 
 		 807 aa  46.6  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.722587 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3168  type II secretion system protein  25.68 
 
 		 329 aa  46.2  0.002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.577481  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1065  Type II secretion system F domain protein  25.79 
 
 		 536 aa  46.2  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0252  type II secretion system protein  20.39 
 
 		 328 aa  45.4  0.003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.163074  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3169  type II secretion system protein  22.44 
 
 		 296 aa  45.4  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0805  type II secretion system protein  24.44 
 
 		 295 aa  45.4  0.003  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2686  type II secretion system protein  23.05 
 
 		 644 aa  45.1  0.004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.473115 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0008  Type II secretion system F domain protein  24.51 
 
 		 290 aa  45.1  0.004  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>