More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1400 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_1400  Porphobilinogen synthase  100 
 
 
345 aa  696    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.175511 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2986  Porphobilinogen synthase  76.02 
 
 
348 aa  511  1e-144  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.199631  normal  0.556926 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3351  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.88 
 
 
326 aa  353  2.9999999999999997e-96  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1709  delta-aminolevulinic acid dehydratase  56.71 
 
 
338 aa  353  4e-96  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0153691 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_0042  delta-aminolevulinic acid dehydratase  56.7 
 
 
336 aa  351  8.999999999999999e-96  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0725426  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1752  delta-aminolevulinic acid dehydratase  57.14 
 
 
327 aa  350  2e-95  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.469855 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3449  Porphobilinogen synthase  49.7 
 
 
322 aa  350  2e-95  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.953419 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0957  delta-aminolevulinic acid dehydratase  56.07 
 
 
336 aa  347  2e-94  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.283226  decreased coverage  0.0000405036 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5386  Porphobilinogen synthase  54.18 
 
 
327 aa  346  3e-94  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3057  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.83 
 
 
324 aa  344  1e-93  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.223751 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1279  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.87 
 
 
325 aa  343  2e-93  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.116517  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0320  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50.77 
 
 
324 aa  342  5.999999999999999e-93  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.610881  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0777  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.78 
 
 
327 aa  341  9e-93  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0804  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.47 
 
 
327 aa  341  1e-92  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.591688  normal 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_12340  porphobilinogen synthase  55.35 
 
 
328 aa  341  1e-92  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1954  Porphobilinogen synthase  55.83 
 
 
325 aa  339  2.9999999999999998e-92  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.635001 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2730  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.23 
 
 
327 aa  338  5.9999999999999996e-92  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0690  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.52 
 
 
326 aa  338  9.999999999999999e-92  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2032  delta-aminolevulinic acid dehydratase  56.21 
 
 
327 aa  336  3.9999999999999995e-91  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.10895  normal  0.787355 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2247  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.27 
 
 
338 aa  335  7.999999999999999e-91  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0921714  normal  0.498116 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1075  delta-aminolevulinic acid dehydratase  48.91 
 
 
327 aa  334  1e-90  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.644944  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1246  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.21 
 
 
324 aa  335  1e-90  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.402082 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1574  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.4 
 
 
325 aa  334  1e-90  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.320709  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1013  delta-aminolevulinic acid dehydratase  48.91 
 
 
327 aa  333  3e-90  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  0.134605  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0884  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50 
 
 
323 aa  332  5e-90  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00634194  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1726  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50.94 
 
 
324 aa  331  1e-89  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.192115  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1760  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50.94 
 
 
324 aa  331  1e-89  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1232  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50.31 
 
 
324 aa  330  2e-89  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.222123  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1698  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50.31 
 
 
325 aa  330  2e-89  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3061  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.55 
 
 
325 aa  330  2e-89  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1415  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.94 
 
 
341 aa  330  3e-89  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.490344  normal  0.415067 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1686  delta-aminolevulinic acid dehydratase  48.45 
 
 
321 aa  329  3e-89  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1420  delta-aminolevulinic acid dehydratase  48.76 
 
 
321 aa  330  3e-89  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1503  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.1 
 
 
341 aa  328  7e-89  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  hitchhiker  0.00656754  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1407  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.1 
 
 
341 aa  328  8e-89  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.851255  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0381  Porphobilinogen synthase  50.78 
 
 
325 aa  328  9e-89  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.190849  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2452  delta-aminolevulinic acid dehydratase  53.8 
 
 
341 aa  328  1.0000000000000001e-88  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1740  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50.44 
 
 
347 aa  327  1.0000000000000001e-88  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1129  delta-aminolevulinic acid dehydratase  47.35 
 
 
326 aa  327  2.0000000000000001e-88  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1372  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50.62 
 
 
331 aa  326  3e-88  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_1348  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50.62 
 
 
325 aa  326  4.0000000000000003e-88  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.000833132  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2067  Porphobilinogen synthase  54.46 
 
 
330 aa  325  5e-88  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.355719  hitchhiker  0.00258041 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1254  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50.47 
 
 
325 aa  325  8.000000000000001e-88  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.267605  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2529  delta-aminolevulinic acid dehydratase  49.53 
 
 
326 aa  325  9e-88  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1257  Porphobilinogen synthase  57.1 
 
 
324 aa  324  1e-87  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0333  delta-aminolevulinic acid dehydratase  49.69 
 
 
322 aa  325  1e-87  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.153142  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1291  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.96 
 
 
352 aa  323  2e-87  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0189  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.72 
 
 
325 aa  324  2e-87  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000299034  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2160  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.57 
 
 
326 aa  323  2e-87  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0223266  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2578  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.72 
 
 
325 aa  323  2e-87  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5932  Porphobilinogen synthase  57.38 
 
 
327 aa  323  2e-87  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0571  delta-aminolevulinic acid dehydratase  48.3 
 
 
322 aa  323  3e-87  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.718551  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0504  delta-aminolevulinic acid dehydratase  49.54 
 
 
322 aa  322  5e-87  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.285468  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3178  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.56 
 
 
329 aa  322  9.000000000000001e-87  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0171  delta-aminolevulinic acid dehydratase  55.52 
 
 
324 aa  321  9.999999999999999e-87  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0135  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.41 
 
 
325 aa  320  1.9999999999999998e-86  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0840371  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1340  Porphobilinogen synthase  54.3 
 
 
336 aa  319  3.9999999999999996e-86  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0385  delta-aminolevulinic acid dehydratase  49.84 
 
 
323 aa  319  3.9999999999999996e-86  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0794  delta-aminolevulinic acid dehydratase  49.01 
 
 
327 aa  319  3.9999999999999996e-86  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  0.535148  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0235  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.81 
 
 
329 aa  319  5e-86  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3843  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.81 
 
 
338 aa  318  6e-86  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1788  delta-aminolevulinic acid dehydratase  49.69 
 
 
327 aa  318  7.999999999999999e-86  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0243323  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1495  delta-aminolevulinic acid dehydratase  48.91 
 
 
325 aa  318  7.999999999999999e-86  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.247037  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0225  delta-aminolevulinic acid dehydratase  49.54 
 
 
356 aa  318  1e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1701  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.88 
 
 
323 aa  318  1e-85  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0882  delta-aminolevulinic acid dehydratase  55.86 
 
 
327 aa  317  2e-85  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1946  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.3 
 
 
336 aa  316  3e-85  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0874  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.83 
 
 
324 aa  316  3e-85  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0654  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.25 
 
 
329 aa  317  3e-85  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4307  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.56 
 
 
329 aa  316  3e-85  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1027  Porphobilinogen synthase  48.29 
 
 
325 aa  316  3e-85  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0739722  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4553  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50.94 
 
 
329 aa  315  5e-85  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4359  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50.94 
 
 
329 aa  315  5e-85  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4206  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50.94 
 
 
329 aa  315  5e-85  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4694  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50.94 
 
 
329 aa  315  5e-85  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4549  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50.94 
 
 
329 aa  315  5e-85  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4598  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50.94 
 
 
329 aa  315  5e-85  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_11640  porphobilinogen synthase  53.61 
 
 
330 aa  315  5e-85  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.748781 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6504  Porphobilinogen synthase  48.61 
 
 
321 aa  315  8e-85  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.467866 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0410  delta-aminolevulinic acid dehydratase  49.37 
 
 
339 aa  315  8e-85  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0545  delta-aminolevulinic acid dehydratase  46.63 
 
 
322 aa  315  9.999999999999999e-85  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0403399  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4195  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50.62 
 
 
329 aa  314  9.999999999999999e-85  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1415  delta-aminolevulinic acid dehydratase  48.61 
 
 
322 aa  314  9.999999999999999e-85  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0410  delta-aminolevulinic acid dehydratase  49.06 
 
 
339 aa  315  9.999999999999999e-85  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4580  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.25 
 
 
329 aa  313  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1976  delta-aminolevulinic acid dehydratase  54.23 
 
 
326 aa  313  1.9999999999999998e-84  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0103  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3550  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.72 
 
 
335 aa  313  1.9999999999999998e-84  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1792  delta-aminolevulinic acid dehydratase  49.22 
 
 
326 aa  313  2.9999999999999996e-84  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00323607 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1224  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.35 
 
 
323 aa  313  2.9999999999999996e-84  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2487  delta-aminolevulinic acid dehydratase  51.53 
 
 
337 aa  312  3.9999999999999997e-84  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.413701  normal  0.4684 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3652  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50.77 
 
 
327 aa  312  4.999999999999999e-84  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.0241696 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0347  delta-aminolevulinic acid dehydratase  49.37 
 
 
337 aa  312  5.999999999999999e-84  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.000000508114  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2896  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.34 
 
 
330 aa  311  7.999999999999999e-84  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.259654  normal  0.138325 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_3298  delta-aminolevulinic acid dehydratase  52.34 
 
 
330 aa  311  7.999999999999999e-84  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.223319  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4608  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50.49 
 
 
333 aa  311  1e-83  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.30912  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0442  delta-aminolevulinic acid dehydratase  50.94 
 
 
325 aa  311  1e-83  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0019877  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2392  Porphobilinogen synthase  51.23 
 
 
325 aa  310  2e-83  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1127  delta-aminolevulinic acid dehydratase  46.71 
 
 
326 aa  310  2.9999999999999997e-83  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.80868 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1836  Porphobilinogen synthase  53.23 
 
 
326 aa  308  9e-83  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1546  delta-aminolevulinic acid dehydratase  48.76 
 
 
350 aa  308  1.0000000000000001e-82  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.208029  hitchhiker  0.000817175 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>