274 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrub_1130 on replicon NC_013946
Organism: Meiothermus ruber DSM 1279



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013946  Mrub_1130  amidohydrolase  100 
 
 
425 aa  850    Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.524947  normal  0.474819 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2826  amidohydrolase  54.09 
 
 
461 aa  410  1e-113  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00342984  normal  0.0235152 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0420  amidohydrolase  53.01 
 
 
418 aa  405  1e-111  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3412  amidohydrolase  52.31 
 
 
409 aa  394  1e-108  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008243  Meso_4503  amidohydrolase  50.25 
 
 
408 aa  384  1e-105  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.327271  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4994  amidohydrolase  50.12 
 
 
413 aa  381  1e-104  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.939807 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1037  amidohydrolase  51.83 
 
 
405 aa  377  1e-103  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.976155 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2354  amidohydrolase  49.52 
 
 
420 aa  370  1e-101  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3782  amidohydrolase  50.24 
 
 
413 aa  370  1e-101  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.0062486  decreased coverage  0.00131434 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3741  amidohydrolase  50.24 
 
 
413 aa  371  1e-101  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.0189588 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4676  amidohydrolase  51.96 
 
 
414 aa  368  1e-101  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0192807  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3028  putative prolidase (Xaa-Pro dipeptidase)  49.4 
 
 
436 aa  366  1e-100  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0496396  normal  0.0296694 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2756  amidohydrolase  53.8 
 
 
403 aa  365  1e-100  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0215724  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0890  amidohydrolase  49.88 
 
 
412 aa  355  7.999999999999999e-97  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.559583  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2801  prolidase, putative  49.27 
 
 
419 aa  352  5.9999999999999994e-96  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.00617614  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2529  amidohydrolase  49.64 
 
 
419 aa  352  5.9999999999999994e-96  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.403539  normal  0.929586 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2089  amidohydrolase  47.34 
 
 
416 aa  343  2.9999999999999997e-93  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.608536  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3965  amidohydrolase  47.46 
 
 
411 aa  342  5.999999999999999e-93  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0436  amidohydrolase  47.61 
 
 
417 aa  340  2.9999999999999998e-92  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.753436  normal  0.872341 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4622  amidohydrolase  50.53 
 
 
405 aa  336  5e-91  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1549  amidohydrolase  51.77 
 
 
413 aa  335  1e-90  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.64121  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3838  amidohydrolase  47.29 
 
 
411 aa  334  2e-90  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1420  putative prolidase  45.01 
 
 
411 aa  332  1e-89  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0151921  normal  0.142512 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3137  amidohydrolase  46.73 
 
 
411 aa  325  1e-87  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1717  amidohydrolase  45.59 
 
 
407 aa  315  9.999999999999999e-85  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0545  amidohydrolase  49.32 
 
 
415 aa  313  2.9999999999999996e-84  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.472075 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00030  conserved hypothetical protein  44.63 
 
 
443 aa  310  4e-83  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.215737 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_01184  conserved hypothetical protein  40.34 
 
 
445 aa  296  5e-79  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4194  amidohydrolase  41.73 
 
 
406 aa  291  2e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.268221  normal  0.0453774 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2193  hypothetical protein  38.31 
 
 
412 aa  275  9e-73  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2221  hypothetical protein  38.07 
 
 
412 aa  275  2.0000000000000002e-72  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2362  amidohydrolase  39.18 
 
 
413 aa  273  5.000000000000001e-72  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4081  amidohydrolase  41.73 
 
 
425 aa  265  1e-69  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.709022 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4208  amidohydrolase  39.03 
 
 
391 aa  259  6e-68  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.309856  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5218  amidohydrolase  43.45 
 
 
393 aa  250  4e-65  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.392557  normal  0.244754 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3650  amidohydrolase  41.07 
 
 
428 aa  249  6e-65  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1661  hypothetical protein  36.02 
 
 
436 aa  244  1.9999999999999999e-63  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2289  amidohydrolase  38.53 
 
 
456 aa  240  2.9999999999999997e-62  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06184  prolidase  36.08 
 
 
420 aa  234  2.0000000000000002e-60  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2074  Xaa-Pro dipeptidase  36.08 
 
 
433 aa  231  2e-59  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.63699  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3872  amidohydrolase  36.26 
 
 
419 aa  226  5.0000000000000005e-58  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0983  amidohydrolase  36.62 
 
 
445 aa  225  9e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0761  hypothetical protein  37.74 
 
 
461 aa  224  2e-57  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.343621 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0060  amidohydrolase  33.17 
 
 
440 aa  224  2e-57  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2450  amidohydrolase  36.81 
 
 
478 aa  224  2e-57  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1727  amidohydrolase  38.97 
 
 
486 aa  219  6e-56  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3632  amidohydrolase  39.19 
 
 
447 aa  214  1.9999999999999998e-54  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1826  Pro-Hyp dipeptidase  35.42 
 
 
426 aa  213  7e-54  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0268  putative Xaa-Pro dipeptidase  35.24 
 
 
451 aa  212  1e-53  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.309565  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1062  amidohydrolase  32.94 
 
 
426 aa  210  3e-53  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.574986 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1266  amidohydrolase  34.43 
 
 
447 aa  211  3e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3588  amidohydrolase  36.54 
 
 
482 aa  210  4e-53  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0696  amidohydrolase  34.27 
 
 
444 aa  209  6e-53  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5232  amidohydrolase  36.26 
 
 
434 aa  207  2e-52  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2719  amidohydrolase  36.25 
 
 
440 aa  207  2e-52  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0482  amidohydrolase  34.28 
 
 
426 aa  206  4e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2716  amidohydrolase  32.1 
 
 
407 aa  201  9.999999999999999e-51  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2295  putative amidohydrolase  35.04 
 
 
490 aa  200  3e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21530  amidohydrolase, imidazolonepropionase  34.09 
 
 
447 aa  198  1.0000000000000001e-49  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3982  amidohydrolase  32.39 
 
 
445 aa  198  1.0000000000000001e-49  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0434  putative secreted hydrolase  33.5 
 
 
430 aa  197  2.0000000000000003e-49  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0533  amidohydrolase  35.28 
 
 
444 aa  197  4.0000000000000005e-49  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.200592  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1663  hypothetical protein  34.35 
 
 
429 aa  196  7e-49  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2224  amidohydrolase  36.66 
 
 
459 aa  195  1e-48  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.331693  normal  0.75215 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4277  amidohydrolase  31.9 
 
 
431 aa  191  2.9999999999999997e-47  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2318  amidohydrolase  35.22 
 
 
428 aa  189  5.999999999999999e-47  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.246502  normal  0.0431533 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0801  amidohydrolase  31.24 
 
 
437 aa  189  9e-47  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2992  amidohydrolase  34.13 
 
 
433 aa  188  2e-46  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2437  amidohydrolase  33.96 
 
 
411 aa  187  4e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.885711 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0913  amidohydrolase  37.84 
 
 
438 aa  185  1.0000000000000001e-45  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.887966  normal  0.946432 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2093  amidohydrolase  30.29 
 
 
431 aa  184  4.0000000000000006e-45  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.885062  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1967  amidohydrolase  33.88 
 
 
405 aa  183  5.0000000000000004e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.0915842 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2368  amidohydrolase  32.7 
 
 
441 aa  182  8.000000000000001e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3728  amidohydrolase  33.49 
 
 
417 aa  182  1e-44  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3715  amidohydrolase  33.49 
 
 
417 aa  182  1e-44  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.355417  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0626  amidohydrolase  34.56 
 
 
433 aa  182  1e-44  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.151482 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3788  amidohydrolase  33.49 
 
 
417 aa  182  1e-44  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.463322  normal  0.142834 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4188  amidohydrolase  34.18 
 
 
421 aa  180  4e-44  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0333  amidohydrolase  31.25 
 
 
407 aa  178  1e-43  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_13368  Xaa-Pro dipeptidase family enzyme  32.81 
 
 
426 aa  178  2e-43  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.256749  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3014  amidohydrolase  31.66 
 
 
459 aa  177  2e-43  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4215  amidohydrolase  33.89 
 
 
412 aa  177  3e-43  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.33185  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0087  amidohydrolase  32.52 
 
 
423 aa  177  3e-43  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0161193  normal  0.19517 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3741  amidohydrolase  31.03 
 
 
444 aa  177  4e-43  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04041  Xaa-Pro dipeptidase family enzyme  32.46 
 
 
430 aa  174  1.9999999999999998e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3761  amidohydrolase  34.68 
 
 
408 aa  175  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.225154  normal  0.880819 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3749  amidohydrolase  34.68 
 
 
408 aa  175  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.468026  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3822  amidohydrolase  34.68 
 
 
408 aa  175  1.9999999999999998e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.28333  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2466  amidohydrolase  31.93 
 
 
424 aa  172  7.999999999999999e-42  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.357249  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1348  putative Xaa-Pro dipeptidase  31.82 
 
 
434 aa  172  1e-41  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3308  amidohydrolase  33.89 
 
 
419 aa  172  1e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.692035  normal  0.417277 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2334  amidohydrolase  33.57 
 
 
455 aa  172  1e-41  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.202717 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4292  amidohydrolase  36.73 
 
 
402 aa  170  4e-41  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.756284 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2771  amidohydrolase  28.67 
 
 
413 aa  169  6e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1408  amidohydrolase  33.09 
 
 
402 aa  168  1e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.321357  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0432  amidohydrolase  32.05 
 
 
421 aa  168  2e-40  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4304  amidohydrolase  31.34 
 
 
470 aa  166  5.9999999999999996e-40  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2978  amidohydrolase  32.49 
 
 
429 aa  165  2.0000000000000002e-39  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0681  amidohydrolase  32.18 
 
 
432 aa  165  2.0000000000000002e-39  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.312549  normal  0.59002 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2711  amidohydrolase  32.6 
 
 
400 aa  163  7e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.959959  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>