More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_5959 on replicon NC_010510
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010510  Mrad2831_5959  cytochrome P450  100 
 
 
426 aa  839    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0244226 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0387  cytochrome P450  61.5 
 
 
427 aa  462  1e-129  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0770659  normal 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3627  hypothetical protein  40.98 
 
 
439 aa  258  2e-67  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.381059 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3674  cytochrome P450  36 
 
 
576 aa  244  1.9999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.683711 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2436  cytochrome P450  36 
 
 
576 aa  244  1.9999999999999999e-63  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8744  hypothetical protein  40.95 
 
 
441 aa  238  2e-61  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3578  hypothetical protein  32.24 
 
 
447 aa  150  5e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.228041  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0862  cytochrome P450-like  30.52 
 
 
1489 aa  122  9e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0969  cytochrome P450-like  32.43 
 
 
1486 aa  120  4.9999999999999996e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1797  cytochrome P450  31.43 
 
 
399 aa  81.3  0.00000000000004  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1870  cytochrome P-450 hydroxylase  31.07 
 
 
400 aa  79  0.0000000000001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2480  cytochrome P450  31.09 
 
 
408 aa  78.2  0.0000000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.59505  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2663  cytochrome P450  29.52 
 
 
408 aa  77  0.0000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000246371 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2861  cytochrome P450n  26.46 
 
 
938 aa  75.1  0.000000000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.151496 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3798  cytochrome P450-like protein  28.07 
 
 
1443 aa  74.7  0.000000000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4000  cytochrome P450  26.61 
 
 
412 aa  74.7  0.000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.854274  normal  0.53904 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6167  cytochrome P450  25.5 
 
 
402 aa  73.6  0.000000000007  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.761247  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1229  cytochrome P450  26.12 
 
 
405 aa  71.6  0.00000000002  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.4849  normal  0.22692 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1853  cytochrome P450-like enzyme  26.19 
 
 
402 aa  70.9  0.00000000004  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1731  cytochrome P450  27.73 
 
 
407 aa  70.9  0.00000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_4029  cytochrome P450  28.04 
 
 
422 aa  70.5  0.00000000005  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.738217 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6307  cytochrome P450  24.68 
 
 
421 aa  70.1  0.00000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4369  cytochrome P450  26.1 
 
 
412 aa  69.7  0.00000000009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.608864  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1581  cytochrome P450  28.45 
 
 
413 aa  68.9  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.845743  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4829  cytochrome P450  28.76 
 
 
435 aa  69.3  0.0000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.956879  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS01740  putative cytochrome P-450-like monooxygenase oxidoreductase protein  25.69 
 
 
398 aa  68.6  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3499  cytochrome P450  27.56 
 
 
422 aa  68.9  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.750178 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4234  cytochrome P450  26.79 
 
 
409 aa  68.9  0.0000000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.118496  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4481  cytochrome P450  25.58 
 
 
411 aa  68.2  0.0000000003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0557214  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0599  cytochrome P450  29.6 
 
 
425 aa  67.4  0.0000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00925226  normal  0.145551 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4098  cytochrome P450  27.38 
 
 
387 aa  67.8  0.0000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.1046  hitchhiker  0.00222438 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2582  cytochrome P450  27.3 
 
 
404 aa  67.4  0.0000000005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.668596 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2976  cytochrome P450-family protein  26.32 
 
 
367 aa  67  0.0000000006  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1782  cytochrome P450  28.83 
 
 
402 aa  67  0.0000000006  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.379724  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1426  cytochrome P450  31.99 
 
 
414 aa  66.6  0.0000000007  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6987  putative cytochrome P450  31.61 
 
 
409 aa  66.6  0.0000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0660812 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1428  cytochrome P450  28.37 
 
 
405 aa  66.6  0.0000000008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2099  cytochrome P450  31.13 
 
 
412 aa  66.2  0.000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.554694  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1912  cytochrome P450  26.02 
 
 
426 aa  65.9  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.997168  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2418  cytochrome P450  26.59 
 
 
409 aa  66.2  0.000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0896304  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0142  cytochrome P450  27.68 
 
 
426 aa  66.2  0.000000001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.120146  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5447  cytochrome P450  25.97 
 
 
399 aa  65.9  0.000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.154914  normal  0.0468411 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2110  cytochrome P450  25.85 
 
 
423 aa  65.9  0.000000001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0160  cytochrome P450  26.5 
 
 
413 aa  65.1  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.486467  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2829  cytochrome P450  28.46 
 
 
400 aa  64.7  0.000000003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.292136  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1189  cytochrome P450  26.65 
 
 
404 aa  63.9  0.000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.351372  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1860  cytochrome P450  30.18 
 
 
459 aa  63.9  0.000000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3938  cytochrome P450  32.09 
 
 
417 aa  63.9  0.000000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.0168475 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3880  cytochrome P450  25.96 
 
 
413 aa  63.5  0.000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.123005  normal  0.0220713 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1827  cytochrome P450  27.94 
 
 
417 aa  63.2  0.000000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0199087 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1945  putative cytochrome P450  27.34 
 
 
442 aa  63.2  0.000000009  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1831  cytochrome P450  25.8 
 
 
403 aa  63.2  0.000000009  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.248728  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4560  cytochrome P450  26.64 
 
 
395 aa  62.8  0.00000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.924133  normal  0.0532868 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0631  cytochrome P450  31.46 
 
 
427 aa  62.8  0.00000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0693761 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_5328  cytochrome P450  27.9 
 
 
407 aa  62.8  0.00000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.0552066  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4947  cytochrome P450  27.9 
 
 
407 aa  62.8  0.00000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.681312  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_5035  cytochrome P450  27.9 
 
 
407 aa  62.8  0.00000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.833738  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0597  cytochrome P450  30.1 
 
 
393 aa  62.8  0.00000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.16463  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_05028  Fatty acid oxygenasePutative uncharacterized protein ; [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q6IYE5]  22.97 
 
 
1117 aa  61.6  0.00000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.446409  normal  0.730918 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4599  cytochrome P450  33.77 
 
 
417 aa  61.6  0.00000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.995024  normal  0.135664 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1260  cytochrome P450  31.03 
 
 
421 aa  62  0.00000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000262244 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3252  cytochrome P450  28.48 
 
 
402 aa  62  0.00000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.176211  normal  0.95794 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0765  cytochrome P450  28.04 
 
 
402 aa  62  0.00000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.356539 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4932  cytochrome P450  28.01 
 
 
423 aa  61.6  0.00000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.847622  normal  0.613377 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0979  cytochrome P450  26.97 
 
 
407 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.492068  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8837  cytochrome P450 family protein  23.99 
 
 
418 aa  61.2  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0842422 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1966  cytochrome P450  33.76 
 
 
411 aa  60.5  0.00000005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.940612  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3241  cytochrome P450  28.15 
 
 
402 aa  60.5  0.00000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3303  cytochrome P450  28.15 
 
 
402 aa  60.5  0.00000005  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0174773 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2239  cytochrome P450  27.93 
 
 
415 aa  60.8  0.00000005  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1946  cytochrome P450 hydroxylase  29.84 
 
 
393 aa  60.1  0.00000007  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0546  cytochrome P450  28.46 
 
 
390 aa  60.1  0.00000008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.636119  normal  0.852036 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3779  cytochrome P450  24.92 
 
 
412 aa  60.1  0.00000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1892  cytochrome P450  27.52 
 
 
396 aa  59.7  0.00000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4590  cytochrome P450  29.71 
 
 
398 aa  59.3  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.28178  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1606  putative cytochrome P450  32.97 
 
 
418 aa  59.3  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3162  cytochrome P450  39.08 
 
 
430 aa  58.9  0.0000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.394046  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5300  cytochrome P450  25.44 
 
 
420 aa  58.9  0.0000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.572435  normal  0.152988 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1193  cytochrome P450  30.18 
 
 
390 aa  59.3  0.0000001  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.577803 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5579  cytochrome P450  32.86 
 
 
419 aa  59.3  0.0000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3964  cytochrome P450  30.66 
 
 
423 aa  59.7  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.403344  normal  0.433493 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3149  cytochrome P450  25.61 
 
 
408 aa  58.5  0.0000002  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.58668  normal  0.0958953 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3475  cytochrome P450  35.34 
 
 
398 aa  58.5  0.0000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  decreased coverage  0.000451038  hitchhiker  0.00686408 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5278  ferredoxin:cytochrome P450:oxidoreductase FAD/NAD(P)-binding:oxidoreductase FAD-binding region  28.81 
 
 
783 aa  58.5  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2451  cytochrome P450  27.57 
 
 
414 aa  58.5  0.0000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5420  cytochrome P450  25.48 
 
 
468 aa  58.5  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4449  cytochrome P450  27.12 
 
 
401 aa  58.5  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.002835 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_2003  cytochrome P450  29.41 
 
 
410 aa  58.9  0.0000002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7254  cytochrome P450  31.33 
 
 
431 aa  58.5  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2020  cytochrome P450  29.41 
 
 
418 aa  58.5  0.0000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4927  putative cytochrome P450  28.04 
 
 
404 aa  58.5  0.0000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0738351  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1670  cytochrome P450  24.08 
 
 
455 aa  58.5  0.0000002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0452772  normal  0.0820261 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1994  cytochrome P450  27.53 
 
 
425 aa  58.9  0.0000002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.269689  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2066  cytochrome P450  29.41 
 
 
410 aa  58.9  0.0000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2583  cytochrome P450  27.83 
 
 
401 aa  58.9  0.0000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.0000851846  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5217  cytochrome P450  25.09 
 
 
402 aa  58.9  0.0000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.301453 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2696  cytochrome p450  23.97 
 
 
410 aa  58.2  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.138541  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1608  cytochrome P450  30.31 
 
 
416 aa  58.2  0.0000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.894041  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2331  cytochrome P450  28.8 
 
 
417 aa  58.2  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.24175 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3767  cytochrome P450  24.92 
 
 
412 aa  58.2  0.0000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.319516  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>