37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_0269 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_0269  hypothetical protein  100 
 
 
503 aa  964    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.719635  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7203  hypothetical protein  56.58 
 
 
406 aa  362  6e-99  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.685918  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2309  hypothetical protein  48.27 
 
 
565 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0115026 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2584  hypothetical protein  48.46 
 
 
565 aa  356  3.9999999999999996e-97  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.387529  normal  0.188326 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2266  conserved hypothetical proteinn  49.3 
 
 
553 aa  355  6.999999999999999e-97  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.884358  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6297  hypothetical protein  54.74 
 
 
406 aa  322  8e-87  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.327434  normal  0.062959 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5180  hypothetical protein  40.67 
 
 
391 aa  218  1e-55  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.26956  normal  0.552151 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1332  hypothetical protein  40.05 
 
 
556 aa  217  5e-55  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.046842  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1660  hypothetical protein  40.83 
 
 
486 aa  215  1.9999999999999998e-54  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3243  hypothetical protein  41.35 
 
 
393 aa  214  3.9999999999999995e-54  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.399185  normal  0.111483 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3863  hypothetical protein  40.81 
 
 
389 aa  209  6e-53  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2187  hypothetical protein  40 
 
 
391 aa  207  4e-52  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  decreased coverage  0.00178939  normal  0.0794458 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3110  hypothetical protein  40.65 
 
 
391 aa  207  4e-52  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.549538 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1841  hypothetical protein  37.39 
 
 
381 aa  184  3e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0950642  normal  0.010552 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2223  hypothetical protein  39.13 
 
 
382 aa  182  2e-44  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2040  hypothetical protein  37.5 
 
 
380 aa  181  2.9999999999999997e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1014  hypothetical protein  35.15 
 
 
380 aa  159  9e-38  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2009  hypothetical protein  35.79 
 
 
376 aa  155  2e-36  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1059  hypothetical protein  39.93 
 
 
377 aa  154  2.9999999999999998e-36  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.835096 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0610  hypothetical protein  29.97 
 
 
377 aa  117  3e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0861468  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2697  hypothetical protein  29.82 
 
 
377 aa  102  2e-20  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.43903  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1843  hypothetical protein  29.85 
 
 
378 aa  99.8  1e-19  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3571  hypothetical protein  26.59 
 
 
377 aa  92.8  1e-17  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.751929  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3364  hypothetical protein  25.22 
 
 
409 aa  73.9  0.000000000006  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1720  hypothetical protein  34.64 
 
 
371 aa  66.2  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.23043 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0867  hypothetical protein  34.96 
 
 
365 aa  60.1  0.00000009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.313809  normal  0.900347 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0882  hypothetical protein  29.22 
 
 
363 aa  54.7  0.000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.231025  normal  0.385569 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0912  hypothetical protein  23.86 
 
 
360 aa  54.3  0.000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.0185235 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1356  hypothetical protein  32.35 
 
 
406 aa  49.3  0.0002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.368501  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2077  hypothetical protein  32.77 
 
 
335 aa  49.3  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5421  hypothetical protein  31.29 
 
 
370 aa  48.5  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.29406 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0295  hypothetical protein  30.05 
 
 
444 aa  47.8  0.0005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1258  hypothetical protein  26.48 
 
 
363 aa  46.6  0.001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0670888  normal  0.0161568 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0399  hypothetical protein  30.94 
 
 
377 aa  45.8  0.002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.381465 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0494  hypothetical protein  29.84 
 
 
377 aa  43.9  0.007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6078  hypothetical protein  25.82 
 
 
392 aa  43.5  0.01  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4141  hypothetical protein  35.21 
 
 
375 aa  43.1  0.01  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0877657 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>