More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mrad2831_0108 on replicon NC_010505
Organism: Methylobacterium radiotolerans JCM 2831



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010505  Mrad2831_0108  50S ribosomal protein L21  100 
 
 		 104 aa  206  1e-52  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.111218 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4723  50S ribosomal protein L21  84.62 
 
 		 105 aa  146  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0388782  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4877  50S ribosomal protein L21  82.69 
 
 		 130 aa  144  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.388673 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4414  50S ribosomal protein L21  82.69 
 
 		 130 aa  144  4.0000000000000006e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4922  50S ribosomal protein L21  79.81 
 
 		 130 aa  142  2e-33  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0179671  normal  0.559364 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4210  50S ribosomal protein L21  80.77 
 
 		 105 aa  139  9.999999999999999e-33  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.124058 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0418  50S ribosomal protein L21  65.38 
 
 		 103 aa  137  4.999999999999999e-32  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.217833 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4288  50S ribosomal protein L21  67.31 
 
 		 104 aa  134  4e-31  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.997468  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3283  50S ribosomal protein L21  64.71 
 
 		 125 aa  133  8e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0994442 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3005  50S ribosomal protein L21  66.67 
 
 		 124 aa  132  9.999999999999999e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.765258 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3869  50S ribosomal protein L21  65.38 
 
 		 105 aa  132  9.999999999999999e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.43759  normal  0.014081 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4193  50S ribosomal protein L21  64.42 
 
 		 105 aa  131  3e-30  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1850  50S ribosomal protein L21  63.73 
 
 		 142 aa  125  2.0000000000000002e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1782  50S ribosomal protein L21  63.73 
 
 		 188 aa  125  2.0000000000000002e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.458304  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1050  50S ribosomal protein L21  63.73 
 
 		 129 aa  125  2.0000000000000002e-28  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.436024  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2784  50S ribosomal protein L21/unknown domain fusion protein  58.65 
 
 		 223 aa  115  1.9999999999999998e-25  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0566987  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0309  50S ribosomal protein L21  54.9 
 
 		 157 aa  114  6e-25  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.848766  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3590  50S ribosomal protein L21  51.92 
 
 		 102 aa  110  9e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000239742  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2238  ribosomal protein L21  50.96 
 
 		 104 aa  108  2.0000000000000002e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0929508  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1483  ribosomal protein L21  52.43 
 
 		 103 aa  106  9.000000000000001e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2219  50S ribosomal protein L21P  50.96 
 
 		 104 aa  106  9.000000000000001e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000152954  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1242  50S ribosomal protein L21P  56.31 
 
 		 100 aa  105  1e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.526712  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3189  50S ribosomal protein L21  52.88 
 
 		 104 aa  105  3e-22  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.136344  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0349  50S ribosomal protein L21  50 
 
 		 102 aa  105  3e-22  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000000694207  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3639  50S ribosomal protein L21  47.06 
 
 		 106 aa  104  4e-22  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.211161  normal  0.460303 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0194  50S ribosomal protein L21  51.46 
 
 		 171 aa  103  6e-22  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.472355 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2058  50S ribosomal protein L21  48.08 
 
 		 102 aa  103  1e-21  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.550778  normal  0.848803 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1380  50S ribosomal protein L21  49.04 
 
 		 102 aa  103  1e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1613  ribosomal protein L21  42.31 
 
 		 104 aa  102  1e-21  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00000143983  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0231  50S ribosomal protein L21  50.96 
 
 		 104 aa  102  2e-21  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3352  50S ribosomal protein L21P  53.4 
 
 		 101 aa  101  3e-21  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000809209  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2250  50S ribosomal protein L21  46.6 
 
 		 102 aa  101  4e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00445864  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0270  ribosomal protein L21  51.46 
 
 		 103 aa  100  6e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.656841  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4238  ribosomal protein L21  52.43 
 
 		 102 aa  99.8  1e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  decreased coverage  0.00000144419  hitchhiker  0.000000201625 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1416  50S ribosomal protein L21  50 
 
 		 102 aa  99  2e-20  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3461  50S ribosomal protein L21/unknown domain fusion protein  65.69 
 
 		 230 aa  98.6  2e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.2589  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0162  50S ribosomal protein L21  43.27 
 
 		 102 aa  98.6  2e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000233925  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0845  50S ribosomal protein L21  50.96 
 
 		 104 aa  99  2e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2005  ribosomal protein L21  51.46 
 
 		 103 aa  98.2  3e-20  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4182  50S ribosomal protein L21  50.96 
 
 		 101 aa  98.2  3e-20  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.190633  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0864  50S ribosomal protein L21P  48.08 
 
 		 103 aa  97.8  4e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0835554  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0145  50S ribosomal protein L21  43.27 
 
 		 102 aa  97.4  6e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2692  50S ribosomal protein L21P  45.19 
 
 		 149 aa  97.1  7e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00184818  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0745  ribosomal protein L21  44.23 
 
 		 156 aa  96.7  9e-20  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000031212  hitchhiker  0.00014666 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0898  ribosomal protein L21  45.63 
 
 		 103 aa  96.7  1e-19  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00000121247  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1817  ribosomal protein L21  40.78 
 
 		 104 aa  96.3  1e-19  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0474  50S ribosomal protein L21P  50 
 
 		 103 aa  96.3  1e-19  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.030685  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0361  50S ribosomal protein L21  50.96 
 
 		 103 aa  96.7  1e-19  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000287252  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1200  50S ribosomal protein L21/unknown domain fusion protein  51.43 
 
 		 198 aa  96.3  1e-19  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1633  50S ribosomal protein L21  44.23 
 
 		 103 aa  96.3  1e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.94154  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4335  50S ribosomal protein L21  50 
 
 		 101 aa  95.5  2e-19  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1460  50S ribosomal protein L21/unknown domain fusion protein  49.52 
 
 		 221 aa  95.9  2e-19  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0369658 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4313  50S ribosomal protein L21  50 
 
 		 101 aa  95.5  2e-19  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0304  50S ribosomal protein L21  42.31 
 
 		 102 aa  95.1  3e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000140365  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4577  50S ribosomal protein L21  45.19 
 
 		 102 aa  94.7  4e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.000000026821  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4536  50S ribosomal protein L21  45.19 
 
 		 102 aa  94.7  4e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.000000024347  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3206  ribosomal protein L21  50.49 
 
 		 103 aa  94.4  4e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.78407  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1573  50S ribosomal protein L21  42.31 
 
 		 103 aa  94.7  4e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.337451  normal  0.754011 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3470  50S ribosomal protein L21  43.27 
 
 		 103 aa  94.4  4e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00235402  normal  0.37333 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3159  50S ribosomal protein L21  45.19 
 
 		 102 aa  94.7  4e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0000000681834  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2583  50S ribosomal protein L21  45.19 
 
 		 102 aa  94.7  4e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.5903200000000002e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1848  50S ribosomal protein L21  46.15 
 
 		 104 aa  94.7  4e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2280  50S ribosomal protein L21/unknown domain fusion protein  46.67 
 
 		 258 aa  94.4  4e-19  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.372527  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1755  50S ribosomal protein L21  42.31 
 
 		 103 aa  94.7  4e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.092624  normal  0.0601991 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1004  50S ribosomal protein L21  49.04 
 
 		 103 aa  94.4  5e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000000156676  decreased coverage  0.00000356458 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2246  ribosomal protein L21  48.08 
 
 		 103 aa  94.4  5e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  hitchhiker  0.000000579103  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0528  LSU ribosomal protein L21P  45.1 
 
 		 105 aa  94  6e-19  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000314721  normal  0.0648097 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2551  50S ribosomal protein L21  44.23 
 
 		 102 aa  93.6  8e-19  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000316052  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2535  ribosomal protein L21  46.15 
 
 		 114 aa  93.6  8e-19  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00752962  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5486  ribosomal protein L21  46.15 
 
 		 103 aa  93.2  9e-19  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.145587  normal  0.514082 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3236  50S ribosomal protein L21  43.27 
 
 		 102 aa  93.2  1e-18  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000156169  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0341  ribosomal protein L21  48.57 
 
 		 104 aa  92.8  1e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000133447  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2542  50S ribosomal protein L21  44.23 
 
 		 102 aa  92.8  1e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0000000107252  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3738  50S ribosomal protein L21  47.12 
 
 		 103 aa  93.2  1e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000915025  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4328  50S ribosomal protein L21  49.04 
 
 		 138 aa  93.2  1e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.665904 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1180  50S ribosomal protein L21  44.66 
 
 		 104 aa  93.2  1e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00135426  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14120  ribosomal protein L21  44.23 
 
 		 132 aa  93.2  1e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000020004  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2853  50S ribosomal protein L21  48.08 
 
 		 103 aa  92  2e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000634591  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00800  50S ribosomal protein L21  48.08 
 
 		 103 aa  92  2e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0926  ribosomal protein L21  39.81 
 
 		 102 aa  92  2e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.0000000000598947  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0770  50S ribosomal protein L21  45.19 
 
 		 103 aa  92.8  2e-18  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0841  50S ribosomal protein L21  45.19 
 
 		 103 aa  92  2e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.498603 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2182  ribosomal protein L21  42.31 
 
 		 103 aa  92.4  2e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.035762  normal  0.921653 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1538  50S ribosomal protein L21  45.19 
 
 		 102 aa  92  2e-18  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0525  ribosomal protein L21  49.04 
 
 		 103 aa  92  2e-18  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4342  50S ribosomal protein L21  44.23 
 
 		 102 aa  91.7  3e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  decreased coverage  0.0000000792007  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4178  50S ribosomal protein L21  44.23 
 
 		 102 aa  91.7  3e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000215855  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4189  50S ribosomal protein L21  44.23 
 
 		 102 aa  91.7  3e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000000000221763  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001673  LSU ribosomal protein L21p  47.12 
 
 		 103 aa  91.7  3e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.000000280256  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4676  50S ribosomal protein L21  44.23 
 
 		 102 aa  91.7  3e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.000000000541425  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1815  50S ribosomal protein L21  45.19 
 
 		 103 aa  92  3e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4290  50S ribosomal protein L21  44.23 
 
 		 102 aa  91.7  3e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000204563  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0672  50S ribosomal protein L21  44.23 
 
 		 102 aa  91.7  3e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000058928  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3089  50S ribosomal protein L21  49.04 
 
 		 103 aa  92  3e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1340  50S ribosomal protein L21  44.23 
 
 		 102 aa  91.7  3e-18  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  0.0383215  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4524  50S ribosomal protein L21  44.23 
 
 		 102 aa  91.7  3e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.227549 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4562  50S ribosomal protein L21  44.23 
 
 		 102 aa  91.7  3e-18  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000104874  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4103  50S ribosomal protein L21  46.6 
 
 		 140 aa  91.7  3e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.509637 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3675  50S ribosomal protein L21  44.23 
 
 		 103 aa  91.3  4e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1268  ribosomal protein L21  43.69 
 
 		 131 aa  91.3  4e-18  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00033008  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>