116 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_R0093 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_R0093  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  172  9e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.449297  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0083  tRNA-Leu  96.55 
 
 		 87 bp  149  1.0000000000000001e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.285322  normal  0.0887227 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_R0004  tRNA-Leu  94.25 
 
 		 87 bp  133  6.999999999999999e-30  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.589228  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_R0048  tRNA-Leu  93.1 
 
 		 87 bp  125  2e-27  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.889527 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_R0049  tRNA-Leu  93.1 
 
 		 87 bp  125  2e-27  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_R0051  tRNA-Leu  93.1 
 
 		 87 bp  125  2e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0016  tRNA-Leu  88.51 
 
 		 87 bp  93.7  6e-18  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_R0036  tRNA-Leu  90 
 
 		 86 bp  87.7  4e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.305194  normal  0.429541 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_R0043  tRNA-Leu  88.41 
 
 		 87 bp  73.8  0.000000000006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.431799  normal  0.0378351 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_R0033  tRNA-Leu  89.83 
 
 		 87 bp  69.9  0.00000000009  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.336913  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_R0013  tRNA-Leu  97.14 
 
 		 86 bp  61.9  0.00000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.467746  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0033  tRNA-Leu  97.06 
 
 		 89 bp  60  0.00000009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_AR0015  tRNA-Leu  92.86 
 
 		 86 bp  60  0.00000009  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.418759  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0044  tRNA-Leu  86.59 
 
 		 89 bp  60  0.00000009  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0970337  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_R0020  tRNA-Leu  92.86 
 
 		 87 bp  60  0.00000009  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.191 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0044  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 87 bp  58  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_R0072  tRNA-Leu  85.51 
 
 		 87 bp  58  0.0000004  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0193588  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_tRNA26  tRNA-Leu  92.68 
 
 		 87 bp  58  0.0000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.211066 
 
 
-
 
NC_002977  MCA_tRNA-Leu-5  tRNA-Leu  88.46 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.517107  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0066  tRNA-Leu  94.44 
 
 		 89 bp  56  0.000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.623662  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0028  tRNA-Leu  85.92 
 
 		 85 bp  56  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.387678  hitchhiker  0.00101312 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1946  tRNA-Leu  85.92 
 
 		 87 bp  56  0.000001  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_R0027  tRNA-Leu  85.07 
 
 		 87 bp  54  0.000006  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.319265  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_R0031  tRNA-Leu  90.7 
 
 		 87 bp  54  0.000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.314623  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lppt42  tRNA-Leu  93.94 
 
 		 85 bp  50.1  0.00009  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt42  tRNA-Leu  93.94 
 
 		 85 bp  50.1  0.00009  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0058  tRNA-Leu  90.24 
 
 		 87 bp  50.1  0.00009  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.555666  normal  0.0187408 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_R0023  tRNA-Leu  90.24 
 
 		 86 bp  50.1  0.00009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.473121  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0039  tRNA-Leu  85.51 
 
 		 86 bp  50.1  0.00009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.217803  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_R0047  tRNA-Leu  93.94 
 
 		 85 bp  50.1  0.00009  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0137479 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0046  tRNA-Leu  93.94 
 
 		 85 bp  50.1  0.00009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00313005  normal  0.455942 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0048  tRNA-Leu  93.94 
 
 		 85 bp  50.1  0.00009  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.496608  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_R0033  tRNA-Leu  85 
 
 		 86 bp  48.1  0.0003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0750  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 84 bp  48.1  0.0003  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_R0002  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  48.1  0.0003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_R0037  tRNA-Leu  82.89 
 
 		 87 bp  48.1  0.0003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00000268992  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_R0054  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 82 bp  48.1  0.0003  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.292652 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3144t  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 82 bp  48.1  0.0003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000564151  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3146t  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 82 bp  48.1  0.0003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000598983  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3148t  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 82 bp  48.1  0.0003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000100991  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3150t  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 82 bp  48.1  0.0003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.00000767874  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I3153t  tRNA-Leu  96.43 
 
 		 82 bp  48.1  0.0003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  unclonable  0.00000997462  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_t00083  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_R0082  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  tRNA-Leu-4  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mflt010  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 89 bp  46.1  0.001  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  0.0109013  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0046  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 88 bp  46.1  0.001  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000000531396  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_R48  tRNA-Leu  84.75 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.331195 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0020  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 89 bp  46.1  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t29  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000148867  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_R0001  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_R0026  tRNA-Leu  85.92 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.247639  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0036  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 89 bp  46.1  0.001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_R0041  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.272755  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_R0044  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.152899 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_R0015  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0279286 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_R0020  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000402122  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_1651  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 92 bp  46.1  0.001  Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_R0014  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1031  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 88 bp  46.1  0.001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4726  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0202862  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_5112  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00828021  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_R0027  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000640555  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_R0022  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 88 bp  46.1  0.001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0559105  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0924  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 88 bp  46.1  0.001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_R0097  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.138568  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4752  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_R0008  tRNA-Leu  85.92 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4955  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.2776  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0019  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 89 bp  46.1  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.800017  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4835  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.80579 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4891  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.762047  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4742  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.101402 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4772  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.193191  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4872  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.0248766 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5788  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0370957  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_R0011  tRNA-Leu  88.37 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.664926  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_R0082  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_R0075  tRNA-Leu  93.55 
 
 		 85 bp  46.1  0.001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA_tRNA-Leu-5  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.138946  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_R0002  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 82 bp  44.1  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_R0025  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  decreased coverage  0.0001623  hitchhiker  0.000378957 
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_t1224  tRNA-Leu  88.1 
 
 		 84 bp  44.1  0.005  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  0.0795794  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_R0029  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0544306  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1974  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.232762  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00711  hypothetical protein  96.15 
 
 		 1389 bp  44.1  0.005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.0271557  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_tRNALeuVIMSS1309067  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 82 bp  44.1  0.005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.086825  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_tRNALeuVIMSS1309118  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 82 bp  44.1  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.253847  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3331  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0502824  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2346  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2388  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.519883  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1247  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.872872  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_tRNALeuVIMSS1309143  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 82 bp  44.1  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2647  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 89 bp  44.1  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.794839  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1619  tRNA-Leu  100 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.0724475  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_R0051  tRNA-Leu  84.29 
 
 		 83 bp  44.1  0.005  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0627973  hitchhiker  0.00000000000000388179 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0069  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0181808  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_R0008  tRNA-Leu  100 
 
 		 88 bp  44.1  0.005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_R0057  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 81 bp  44.1  0.005  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.279564 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0022  tRNA-Leu  100 
 
 		 86 bp  44.1  0.005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.106593  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>