25 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_R0044 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008781  Pnap_R0044  tRNA-Leu  100 
 
 		 87 bp  172  9e-42  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.152899 
 
 
-
 
NC_002967  TDE_tRNA-Leu-4  tRNA-Leu  88 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.000000432662  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0033  tRNA-Leu  96.67 
 
 		 87 bp  52  0.00002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1946  tRNA-Leu  91.89 
 
 		 87 bp  50.1  0.00009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_R0028  tRNA-Leu  91.89 
 
 		 85 bp  50.1  0.00009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.387678  hitchhiker  0.00101312 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_R0046  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 88 bp  48.1  0.0003  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000000531396  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0044  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 89 bp  48.1  0.0003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0970337  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2647  tRNA-Leu  91.67 
 
 		 89 bp  48.1  0.0003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.794839  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_R0020  tRNA-Leu  89.74 
 
 		 89 bp  46.1  0.001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_R0093  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.449297  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_t0012  tRNA-Leu  100 
 
 		 88 bp  46.1  0.001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.594813  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_R0019  tRNA-Leu  89.74 
 
 		 89 bp  46.1  0.001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.800017  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_R0083  tRNA-Leu  91.43 
 
 		 87 bp  46.1  0.001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.285322  normal  0.0887227 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0066  tRNA-Leu  96.3 
 
 		 89 bp  46.1  0.001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.623662  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_t29  tRNA-Leu  89.74 
 
 		 86 bp  46.1  0.001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.0000148867  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0043  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000643115  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_R0057  tRNA-Leu  88.1 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.311538  normal  0.840982 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_R0036  tRNA-Leu  89.47 
 
 		 89 bp  44.1  0.005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0086  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 83 bp  44.1  0.005  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000003449  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_R0023  tRNA-Leu  88.1 
 
 		 84 bp  44.1  0.005  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.0359439  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0048  tRNA-Leu  96.15 
 
 		 85 bp  44.1  0.005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000131819 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_R0022  tRNA-Leu  89.47 
 
 		 87 bp  44.1  0.005  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.35191  normal  0.518198 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_R0021  tRNA-Leu  89.47 
 
 		 84 bp  44.1  0.005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.148955  normal  0.272437 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_R0033  tRNA-Leu  91.18 
 
 		 89 bp  44.1  0.005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_t07695  tRNA-Leu  100 
 
 		 84 bp  44.1  0.005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>