More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_7453 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011894  Mnod_7453  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  100 
 
 
207 aa  385  1e-106  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.353642  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6543  lysine exporter protein LysE/YggA  74.27 
 
 
207 aa  236  2e-61  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.259984 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2082  lysine exporter protein LysE/YggA  52.68 
 
 
205 aa  190  1e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.295879  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6784  LysE family amino acid efflux protein  44.23 
 
 
206 aa  153  1e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0400664 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1265  lysine exporter protein LysE/YggA  47.37 
 
 
208 aa  151  5.9999999999999996e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1476  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  43.35 
 
 
205 aa  151  5.9999999999999996e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.779186  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4137  lysine exporter protein LysE/YggA  43.75 
 
 
205 aa  148  6e-35  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3980  lysine exporter protein LysE/YggA  42.79 
 
 
205 aa  146  3e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4318  lysine exporter protein LysE/YggA  42.7 
 
 
203 aa  136  2e-31  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0592644  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2480  lysine exporter protein LysE/YggA  40.39 
 
 
203 aa  131  6.999999999999999e-30  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.416487 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2985  lysine exporter protein LysE/YggA  37.86 
 
 
208 aa  130  2.0000000000000002e-29  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.120871  normal  0.440031 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1744  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  41.29 
 
 
204 aa  127  2.0000000000000002e-28  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0964  lysine exporter protein LysE/YggA  42.36 
 
 
205 aa  126  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.0177449 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3565  amino acid transporter LysE  39.9 
 
 
203 aa  125  5e-28  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.524256  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1401  lysine exporter protein LysE/YggA  38.38 
 
 
204 aa  125  6e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.582865  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2209  lysine exporter protein LysE/YggA  39.9 
 
 
203 aa  124  7e-28  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2356  lysine exporter protein LysE/YggA  38.42 
 
 
203 aa  122  4e-27  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.139066  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4402  lysine exporter protein LysE/YggA  37.91 
 
 
212 aa  122  5e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.649358  normal  0.816137 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1277  lysine exporter protein LysE/YggA  43.63 
 
 
212 aa  121  9e-27  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003581  probable homoserine/homoserine lactone efflux protein  33.82 
 
 
207 aa  120  9.999999999999999e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3684  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.89 
 
 
211 aa  120  9.999999999999999e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00000829033  unclonable  0.00000000000000893025 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0272  amino acid efflux pump, RhtB family protein  38.21 
 
 
211 aa  119  1.9999999999999998e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000337597  unclonable  0.000000635897 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3206  lysine exporter protein LysE/YggA  37.38 
 
 
208 aa  118  6e-26  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.84476  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0211  lysine exporter protein LysE/YggA  36.57 
 
 
212 aa  118  6e-26  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00252285  unclonable  0.00000000000676955 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1345  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  39.42 
 
 
208 aa  117  9.999999999999999e-26  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.123136  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1001  lysine exporter protein LysE/YggA  36.27 
 
 
206 aa  116  1.9999999999999998e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.953537  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4165  amino acid transporter LysE  37.56 
 
 
203 aa  116  3e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.785807 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0288  lysine exporter protein LysE/YggA  37.44 
 
 
211 aa  115  3.9999999999999997e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.00514446  hitchhiker  0.000000000772842 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2352  lysine exporter protein LysE/YggA  43.67 
 
 
215 aa  115  6e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2162  lysine exporter protein LysE/YggA  32.69 
 
 
209 aa  114  7.999999999999999e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0727412  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0815  lysine exporter protein LysE/YggA  37.81 
 
 
204 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3501  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.82 
 
 
207 aa  114  1.0000000000000001e-24  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.648819  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2876  lysine exporter protein LysE/YggA  34.09 
 
 
218 aa  113  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  unclonable  0.000000000054165  unclonable  0.00000000000000325534 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4576  lysine exporter protein LysE/YggA  38.35 
 
 
203 aa  112  3e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0303  lysine exporter protein LysE/YggA  34.74 
 
 
205 aa  112  4.0000000000000004e-24  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  2.85144e-16  normal  0.0852573 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2610  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.85 
 
 
211 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.817626  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0235  lysine exporter protein LysE/YggA  36.49 
 
 
211 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00162299  hitchhiker  0.00000000683509 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2321  putative homoserine/threonine efflux protein  30.95 
 
 
210 aa  110  1.0000000000000001e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2944  lysine exporter protein LysE/YggA  33.5 
 
 
203 aa  110  2.0000000000000002e-23  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal  0.424969 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3800  LysE family translocator protein  34.23 
 
 
222 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00135005  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0308  lysine exporter protein LysE/YggA  36.97 
 
 
211 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  hitchhiker  0.000182648  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3407  lysine exporter protein LysE/YggA  35.21 
 
 
213 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000235018  normal  0.66243 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3861  LysE family translocator protein  34.23 
 
 
222 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0165555  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2456  putative homoserine/threonine efflux protein  30.62 
 
 
210 aa  109  2.0000000000000002e-23  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.506268  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0704  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.29 
 
 
208 aa  110  2.0000000000000002e-23  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2798  lysine exporter protein LysE/YggA  36.97 
 
 
211 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00531331  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0227  lysine exporter protein LysE/YggA  36.02 
 
 
211 aa  109  2.0000000000000002e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0118628  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2117  homoserine/threonine efflux protein  30.92 
 
 
210 aa  109  3e-23  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.045272  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1009  lysine exporter protein LysE/YggA  36.36 
 
 
212 aa  109  3e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2131  homoserine/threonine efflux protein  30.92 
 
 
210 aa  108  4.0000000000000004e-23  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.000000187844  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0029  amino acid transporter LysE  35.14 
 
 
222 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0393564  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2374  putative homoserine/threonine efflux protein  30.92 
 
 
210 aa  108  4.0000000000000004e-23  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002123  putative threonine efflux protein  31.71 
 
 
205 aa  109  4.0000000000000004e-23  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0048  lysine exporter protein LysE/YggA  35.27 
 
 
208 aa  109  4.0000000000000004e-23  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.075881  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3121  amino acid transporter LysE  35.78 
 
 
218 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0201026  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2107  lysine exporter protein LysE/YggA  36.63 
 
 
210 aa  108  5e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.314049 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2194  homoserine/threonine efflux protein  30.92 
 
 
210 aa  108  5e-23  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0534032  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1714  lysine exporter protein LysE/YggA  38.83 
 
 
238 aa  108  5e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2355  homoserine/threonine efflux protein  30.92 
 
 
210 aa  108  5e-23  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2870  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.38 
 
 
211 aa  108  6e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.75176  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3092  lysine exporter protein LysE/YggA  34.62 
 
 
208 aa  108  8.000000000000001e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0606278  hitchhiker  0.00000000000145641 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1045  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  38.16 
 
 
211 aa  107  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1451  lysine exporter protein LysE/YggA  32.02 
 
 
209 aa  107  1e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.000194499  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2663  lysine exporter protein LysE/YggA  35.98 
 
 
211 aa  106  2e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0497346  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1731  lysine exporter protein LysE/YggA  29.81 
 
 
209 aa  107  2e-22  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.820642  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0287  lysine exporter protein LysE/YggA  34.11 
 
 
214 aa  105  3e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.167258  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2220  lysine exporter protein LysE/YggA  33.33 
 
 
213 aa  105  4e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000181241  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1618  lysine exporter protein LysE/YggA  37.44 
 
 
209 aa  105  4e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.360682  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0582  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  37.68 
 
 
211 aa  105  5e-22  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0426675 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0193  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.21 
 
 
213 aa  105  6e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.456922  normal  0.996717 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3922  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  30.96 
 
 
204 aa  105  6e-22  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.325521  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03703  neutral amino-acid efflux system  33.17 
 
 
206 aa  104  7e-22  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4155  homoserine/threonine efflux pump  33.17 
 
 
206 aa  104  7e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4291  homoserine/homoserine lactone efflux protein  33.17 
 
 
206 aa  104  7e-22  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4184  homoserine/homoserine lactone efflux protein  33.17 
 
 
206 aa  104  7e-22  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.340963 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03652  hypothetical protein  33.17 
 
 
206 aa  104  7e-22  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5265  homoserine/homoserine lactone efflux protein  33.17 
 
 
206 aa  104  7e-22  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.624144 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4048  homoserine/homoserine lactone efflux protein  33.17 
 
 
206 aa  104  7e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00299  homoserine/homoserine lactone efflux protein  32.21 
 
 
204 aa  104  8e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1730  amino acid transporter LysE  31.31 
 
 
208 aa  104  9e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  decreased coverage  0.00000000126843  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4191  homoserine/homoserine lactone efflux protein  33.17 
 
 
206 aa  104  9e-22  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00349541 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0938  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  33.33 
 
 
208 aa  104  1e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.283752  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1470  lysine exporter protein LysE/YggA  32.66 
 
 
207 aa  103  1e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2384  homoserine/homoserine lactone efflux protein  30.33 
 
 
205 aa  103  1e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3003  putative homoserine/threonine efflux protein  30.43 
 
 
210 aa  104  1e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.132575 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3665  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  34.48 
 
 
208 aa  104  1e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1191  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  35.75 
 
 
211 aa  104  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.217594  normal  0.390598 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4345  homoserine/homoserine lactone efflux protein  32.68 
 
 
206 aa  103  2e-21  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02476  hypothetical protein  32.85 
 
 
211 aa  103  2e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0244  homoserine/homoserine lactone efflux protein  34.93 
 
 
206 aa  103  2e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.347313  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4299  lysine exporter protein LysE/YggA  38.39 
 
 
218 aa  103  2e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4067  lysine exporter protein LysE/YggA  38.39 
 
 
218 aa  103  2e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0199  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  36.11 
 
 
213 aa  102  3e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00495295 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0100  Lysine exporter protein (LYSE/YGGA)  32.33 
 
 
234 aa  103  3e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1166  lysine exporter protein LysE/YggA  32.09 
 
 
211 aa  102  4e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3909  lysine exporter protein LysE/YggA  34.62 
 
 
210 aa  102  4e-21  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.806528  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1798  amino acid transport protein, LysE type  32.21 
 
 
213 aa  102  4e-21  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.701098  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2456  lysine exporter protein LysE/YggA  36.36 
 
 
205 aa  102  5e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.010294  normal  0.35895 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4247  putative homoserine/threonine efflux protein  30.81 
 
 
208 aa  102  6e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000239469 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02483  hypothetical protein  31.46 
 
 
209 aa  101  6e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>