86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_3527 on replicon NC_011894
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011894  Mnod_3527  Fibronectin type III domain protein  100 
 
 		 3521 aa  7044    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3882  Fibronectin type III domain protein  79.12 
 
 		 3238 aa  2305    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7024  Fibronectin type III domain protein  73.13 
 
 		 3006 aa  2168    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4057  Fibronectin type III domain protein  83.12 
 
 		 2900 aa  2495    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5047  Fibronectin type III domain protein  81 
 
 		 2899 aa  2429    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5750  Fibronectin type III domain protein  85.31 
 
 		 3286 aa  3191    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6221  hypothetical protein  66.5 
 
 		 729 aa  770    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6222  Fibronectin type III domain protein  54.76 
 
 		 2140 aa  515  1e-144  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1698  bacteriophage protein  38.52 
 
 		 1051 aa  483  1e-134  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0606223  normal  0.0762686 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3882  hypothetical protein  37.93 
 
 		 1100 aa  484  1e-134  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.673506  normal  1 
 
 
-
 
NC_010158  YpAngola_0094  fibronectin type III domain-containing protein  36.96 
 
 		 1543 aa  467  1e-129  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000020422 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1062  host specificity protein J  38.23 
 
 		 1101 aa  464  9.999999999999999e-129  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1694  hypothetical protein  37.91 
 
 		 1092 aa  461  1e-127  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1634  hypothetical protein  38.18 
 
 		 1133 aa  460  1e-127  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.154038  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08300  putative phage-related protein, tail component  36.08 
 
 		 1219 aa  423  1e-116  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0627181  hitchhiker  0.0000838912 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3382  Phage-related protein tail component-like protein  37.06 
 
 		 1103 aa  424  1e-116  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000000619193 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0785  carbohydrate-binding family V/XII protein  36.08 
 
 		 1221 aa  423  1e-116  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2219  fibronectin, type III domain-containing protein  34.86 
 
 		 1061 aa  413  1e-113  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2940  prophage LambdaSo, host specificity protein J, putative  34.35 
 
 		 1341 aa  413  1e-113  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2576  Protein of unknown function DUF1983  33.52 
 
 		 1816 aa  409  1.0000000000000001e-112  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  0.191174 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2374  fibronectin type III domain-containing protein  34.45 
 
 		 1067 aa  408  1.0000000000000001e-112  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.213672  normal  0.639425 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2796  host specificity protein  39.17 
 
 		 1120 aa  401  1e-109  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2426  type III fibronectin  34.29 
 
 		 1188 aa  398  1e-109  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.506749  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0708  host specificity protein  39.01 
 
 		 1120 aa  398  1e-108  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.024039 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3248  hypothetical protein  67.29 
 
 		 425 aa  395  1e-108  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1203  fibronectin type III domain-containing protein  35.41 
 
 		 1159 aa  392  1e-107  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.272473  normal  0.0174889 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3188  hypothetical protein  36.73 
 
 		 1158 aa  390  1e-106  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000183265 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1878  hypothetical protein  36.73 
 
 		 1158 aa  390  1e-106  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.1744 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0913  hypothetical protein  36.01 
 
 		 1137 aa  390  1e-106  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00750  hypothetical protein  35.37 
 
 		 1132 aa  386  1e-105  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_10054  tail:host specificity protein  35.37 
 
 		 1132 aa  386  1e-105  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1158  host specificity protein J  34.83 
 
 		 1116 aa  385  1e-105  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.410108  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2109  hypothetical protein  35.05 
 
 		 1159 aa  388  1e-105  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.000420238  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3120  hypothetical protein  37.18 
 
 		 1157 aa  387  1e-105  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0703076 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1638  hypothetical protein  35.18 
 
 		 1132 aa  386  1e-105  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.498718 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1086  host specificity protein J  34.69 
 
 		 1116 aa  383  1e-104  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0443  putative prophage LambdaSo, host specificity protein J  33.86 
 
 		 1057 aa  380  1e-103  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2772  fibronectin, type III  33.42 
 
 		 1194 aa  380  1e-103  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00979345 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0880  host specificity protein  35.97 
 
 		 1157 aa  376  1e-102  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2762  hypothetical protein  36.24 
 
 		 1159 aa  377  1e-102  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.619674 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2873  hypothetical protein  36.64 
 
 		 1159 aa  375  1e-102  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00489128 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1201  hypothetical protein  38.18 
 
 		 1157 aa  374  1e-101  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3927  hypothetical protein  32.4 
 
 		 2007 aa  357  2e-96  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.202078  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2168  host specificity protein  39.61 
 
 		 522 aa  337  2e-90  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.524267  normal  0.854577 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0663  gp29  31.33 
 
 		 1059 aa  335  1e-89  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000117932 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1474  fibronectin type III domain protein  36.8 
 
 		 1012 aa  326  6e-87  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1639  fibronectin type III domain-containing protein  34.68 
 
 		 881 aa  224  3e-56  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.994447  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1802  hypothetical protein  38.49 
 
 		 951 aa  199  7e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.0582533 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3247  hypothetical protein  41.36 
 
 		 287 aa  182  1e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2167  hypothetical protein  33.5 
 
 		 837 aa  160  4e-37  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.981242  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1994  phage tail fiber protein  27.59 
 
 		 1564 aa  151  2.0000000000000003e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.38979  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3498  Phage-related protein tail component-like protein  25.77 
 
 		 960 aa  144  3e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010182  BcerKBAB4_5328  phage minor structural protein  26.22 
 
 		 2196 aa  132  1.0000000000000001e-28  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1315  Hedgehog/intein hint domain protein  40.23 
 
 		 1115 aa  117  3e-24  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1893  Phage-related protein tail component-like  23.74 
 
 		 1644 aa  81.3  0.0000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0293426 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1639  Phage-related protein tail component-like protein  23.96 
 
 		 918 aa  76.3  0.00000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2685  Phage-related protein tail component-like protein  24.32 
 
 		 1171 aa  70.5  0.0000000005  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4217  hypothetical protein  29.58 
 
 		 284 aa  63.5  0.00000007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.284727 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1850  hypothetical protein  27.6 
 
 		 417 aa  60.5  0.0000006  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.182025  normal  0.771462 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1851  hypothetical protein  28.97 
 
 		 270 aa  57  0.000007  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.459823  normal  0.905068 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3558  hypothetical protein  23.56 
 
 		 1172 aa  54.7  0.00003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0198  pentapeptide repeat-containing protein  20.66 
 
 		 862 aa  54.7  0.00003  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.726788  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1764  hypothetical protein  28.92 
 
 		 771 aa  54.3  0.00004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0992615  normal  0.125596 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1315  hypothetical protein  30.05 
 
 		 702 aa  54.3  0.00005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0563  pentapeptide repeat-containing protein  19.63 
 
 		 386 aa  53.5  0.00006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.643792 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3499  hypothetical protein  30.25 
 
 		 833 aa  53.1  0.00009  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3762  pentapeptide repeat protein  20.97 
 
 		 343 aa  52.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3811  pentapeptide repeat protein  20.97 
 
 		 343 aa  52.4  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3342  hypothetical protein  40.28 
 
 		 849 aa  51.6  0.0003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.696824  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2288  pentapeptide repeat protein  17.29 
 
 		 277 aa  51.6  0.0003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00748476  unclonable  0.0000000000682389 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1024  pentapeptide repeat-containing protein  18.22 
 
 		 389 aa  50.8  0.0005  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.299453  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0677  pentapeptide repeat-containing protein  20 
 
 		 214 aa  50.1  0.0008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.606696  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4644  pentapeptide repeat-containing protein  22.02 
 
 		 416 aa  49.3  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1663  pentapeptide repeat protein  23.18 
 
 		 309 aa  48.1  0.003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.885449  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3893  hypothetical protein  32.97 
 
 		 762 aa  47.8  0.004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1254  pentapeptide repeat-containing protein  19.08 
 
 		 213 aa  47.8  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6284  pentapeptide repeat-containing protein  23.72 
 
 		 381 aa  47.8  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1270  hypothetical protein  32.97 
 
 		 762 aa  47.8  0.004  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0211  pentapeptide repeat-containing protein  17.49 
 
 		 219 aa  47.8  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2144  pentapeptide repeat protein  22.14 
 
 		 245 aa  47.4  0.005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.433776 
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5439  hypothetical protein  26.89 
 
 		 1172 aa  47.4  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.861943  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3321  pentapeptide repeat protein  16.08 
 
 		 340 aa  47.4  0.006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4850  pentapeptide repeat-containing protein  19.27 
 
 		 576 aa  47  0.007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00626433 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1849  phage minor structural protein  26.01 
 
 		 466 aa  46.6  0.008  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0322579  normal  0.615795 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5006  pentapeptide repeat-containing protein  26.32 
 
 		 267 aa  46.6  0.008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.993691  normal  0.304437 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3090  ice nucleation protein  28.26 
 
 		 519 aa  46.6  0.01  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>