More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_4450 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_4450  aminotransferase class V  100 
 
 
405 aa  840    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.728371  hitchhiker  0.000499767 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3154  SufS subfamily cysteine desulfurase  51.65 
 
 
417 aa  408  1e-113  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0644  cysteine desulfurases, SufS subfamily protein  49.62 
 
 
420 aa  397  1e-109  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01360  Selenocysteine lyase/Cysteine desulfurase  48.27 
 
 
405 aa  388  1e-107  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0772728  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4272  SufS subfamily cysteine desulfurase  50.51 
 
 
451 aa  387  1e-106  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0975  aminotransferase class 5 protein; selenocysteine lyase  48.12 
 
 
419 aa  387  1e-106  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.18075  normal  0.925491 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0735  SufS subfamily cysteine desulfurase  50.38 
 
 
403 aa  385  1e-106  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2025  cysteine desulfurase, SufS subfamily  48.16 
 
 
418 aa  385  1e-106  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0859  SufS subfamily cysteine desulfurase  49.37 
 
 
403 aa  383  1e-105  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0854  aminotransferase, class V  49.12 
 
 
403 aa  382  1e-105  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1896  aminotransferase, class V  47.61 
 
 
404 aa  382  1e-105  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0767  SufS subfamily cysteine desulfurase  49.62 
 
 
403 aa  380  1e-104  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1347  SufS subfamily cysteine desulfurase  49.1 
 
 
405 aa  379  1e-104  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.969925  hitchhiker  0.000000000139909 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1178  SufS subfamily cysteine desulfurase  47.49 
 
 
404 aa  379  1e-104  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.99383  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1417  cysteine desulfurase  48.4 
 
 
417 aa  378  1e-104  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1762  SufS subfamily cysteine desulfurase  49.11 
 
 
572 aa  379  1e-104  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1505  cysteine desulfurases, SufS subfamily protein  46.12 
 
 
425 aa  369  1e-101  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.0740826  normal  0.129164 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0989  selenocysteine lyase  46.68 
 
 
414 aa  365  1e-100  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3789  aminotransferase, class V  48.61 
 
 
456 aa  367  1e-100  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0193  cysteine desulfurase, SufS subfamily  46.44 
 
 
408 aa  367  1e-100  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.70976  normal  0.651856 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0840  SufS subfamily cysteine desulfurase  47.86 
 
 
437 aa  365  1e-100  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.550163  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2777  aminotransferase, class V  48.76 
 
 
409 aa  368  1e-100  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3352  cysteine desulfurase, SufS subfamily  45.05 
 
 
415 aa  367  1e-100  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.143815 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0582  SufS subfamily cysteine desulfurase  46.12 
 
 
404 aa  364  1e-99  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0897789  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3259  SufS subfamily cysteine desulfurase  46.12 
 
 
414 aa  364  2e-99  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.797453  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3131  cysteine desulfurase  47.86 
 
 
415 aa  363  2e-99  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002694  cysteine desulfurase  46.02 
 
 
403 aa  363  3e-99  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3181  SufS subfamily cysteine desulfurase  46.88 
 
 
429 aa  363  3e-99  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2211  putative selenocysteine lyase  47.79 
 
 
569 aa  362  6e-99  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.686434  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2921  cysteine desulfurase, SufS subfamily  48.08 
 
 
406 aa  362  9e-99  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0836  cysteine desulfurase  47.86 
 
 
415 aa  361  1e-98  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0808  cysteine desulfurase  48.11 
 
 
415 aa  361  1e-98  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0893  SufS subfamily cysteine desulfurase  46.75 
 
 
412 aa  361  1e-98  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.918138  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3072  cysteine desulfurase, SufS subfamily  46.19 
 
 
406 aa  360  2e-98  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0743  SufS subfamily cysteine desulfurase  47.36 
 
 
445 aa  359  4e-98  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0892  cysteine desulfurase, SufS subfamily  47.19 
 
 
429 aa  358  8e-98  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0896  cysteine desulfurase, SufS subfamily  47.19 
 
 
429 aa  358  8e-98  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.825531  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0906  SufS subfamily cysteine desulfurase  47.19 
 
 
425 aa  358  9.999999999999999e-98  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.601083 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3507  cysteine desulfurase, SufS subfamily  47.36 
 
 
445 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0166  cysteine desulfurase, SufS subfamily  44.58 
 
 
412 aa  357  1.9999999999999998e-97  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.0000000385676  unclonable  0.00000000000000152095 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3698  SufS subfamily cysteine desulfurase  46.85 
 
 
445 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.348771 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_2036  cysteine sulfinate desulfinase/cysteine desulfurase  45.05 
 
 
408 aa  357  1.9999999999999998e-97  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1778  SufS subfamily cysteine desulfurase  44.75 
 
 
413 aa  357  2.9999999999999997e-97  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.169204  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1445  cysteine desulfurase  44.17 
 
 
405 aa  357  2.9999999999999997e-97  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1512  cysteine desulfurase SufS  44.17 
 
 
405 aa  356  3.9999999999999996e-97  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0846  SufS subfamily cysteine desulfurase  47.19 
 
 
429 aa  356  3.9999999999999996e-97  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.411085  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0690  cysteine desulfurase  45.12 
 
 
405 aa  356  5e-97  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.144442  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0735  aminotransferase, class V  46.21 
 
 
404 aa  355  7.999999999999999e-97  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0753  SufS subfamily cysteine desulfurase  47.75 
 
 
420 aa  355  7.999999999999999e-97  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4195  aminotransferase, class V  47.26 
 
 
401 aa  355  8.999999999999999e-97  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.836408  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3575  SufS subfamily cysteine desulfurase  46.85 
 
 
445 aa  354  1e-96  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0813  cysteine desulfurase SufS  44.11 
 
 
414 aa  355  1e-96  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.0265605  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0117  cysteine desulfurase SufS  45.55 
 
 
406 aa  353  2e-96  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5086  cysteine desulfurase SufS  45.55 
 
 
406 aa  353  2e-96  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4690  aminotransferase, class V; cysteine desulfhydrase  45.55 
 
 
406 aa  353  2e-96  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5123  cysteine desulfurase SufS  45.55 
 
 
406 aa  353  2e-96  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0415456  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1529  cysteine sulfinate desulfinase  47.26 
 
 
401 aa  353  2.9999999999999997e-96  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.126316  normal  0.13044 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0928  aminotransferase, class V  43.78 
 
 
414 aa  353  2.9999999999999997e-96  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.870705  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2252  SufS subfamily cysteine desulfurase  44 
 
 
414 aa  353  2.9999999999999997e-96  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.766677  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0934  aminotransferase, class V  43.78 
 
 
414 aa  353  4e-96  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.603819  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1319  SufS subfamily cysteine desulfurase  44.08 
 
 
413 aa  353  4e-96  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0340803  normal  0.349427 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5780  cysteine desulfurase, SufS subfamily  43.58 
 
 
408 aa  353  4e-96  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.649929  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0143  selenocysteine lyase  43.46 
 
 
410 aa  352  5e-96  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3577  SufS subfamily cysteine desulfurase  45.78 
 
 
406 aa  352  8e-96  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5118  aminotransferase, class V  45.55 
 
 
406 aa  352  1e-95  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4849  aminotransferase, class V  45.55 
 
 
406 aa  352  1e-95  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4705  aminotransferase, class V, cysteine desulfhydrase  45.55 
 
 
406 aa  352  1e-95  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2593  SufS subfamily cysteine desulfurase  47.62 
 
 
408 aa  351  1e-95  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.266337  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1465  SufS subfamily cysteine desulfurase  44.33 
 
 
413 aa  351  1e-95  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.204095  normal  0.0534707 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2487  cysteine desulphurases, SufS  47.01 
 
 
420 aa  352  1e-95  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0224  cysteine desulfurase, SufS subfamily  45.45 
 
 
414 aa  351  1e-95  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5121  cysteine desulfurase SufS  45.29 
 
 
406 aa  351  2e-95  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.835968  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0536  SufS subfamily cysteine desulfurase  45.73 
 
 
416 aa  350  3e-95  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04465  selenocysteine lyase  42.18 
 
 
412 aa  349  4e-95  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0409  SufS subfamily cysteine desulfurase  45.41 
 
 
412 aa  349  5e-95  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5215  aminotransferase, class V  45.55 
 
 
406 aa  349  5e-95  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4803  SufS subfamily cysteine desulfurase  44.78 
 
 
406 aa  349  5e-95  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2440  aminotransferase  45.3 
 
 
416 aa  348  9e-95  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1745  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  45.45 
 
 
406 aa  348  1e-94  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.0000031207  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0429  cysteine desulfurase, SufS subfamily  44.17 
 
 
419 aa  347  1e-94  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03290  hypothetical protein  45.27 
 
 
403 aa  347  2e-94  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4090  aminotransferase class V  47.26 
 
 
401 aa  347  2e-94  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0418  cysteine desulfurase, SufS subfamily  44.17 
 
 
419 aa  347  2e-94  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1798  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  46.19 
 
 
406 aa  346  4e-94  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0228411  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1851  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  45.2 
 
 
406 aa  346  4e-94  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00184689  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0488  cysteine desulfurase, SufS subfamily  45.09 
 
 
774 aa  346  4e-94  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0995  hypothetical protein  44.91 
 
 
412 aa  345  6e-94  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal  0.20271 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4466  SufS subfamily cysteine desulfurase  44.55 
 
 
419 aa  345  6e-94  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.523936 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5845  cysteine desulfurase, SufS subfamily  44.25 
 
 
413 aa  345  7e-94  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.187018  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3980  SufS subfamily cysteine desulfurase  44.39 
 
 
418 aa  345  8e-94  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.970806 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4348  cysteine desulfurase, SufS subfamily  44.39 
 
 
418 aa  345  8.999999999999999e-94  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3227  SufS subfamily cysteine desulfurase  46.48 
 
 
662 aa  344  1e-93  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.545837  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1896  cysteine desulfurase, SufS subfamily  43.83 
 
 
413 aa  344  1e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00682669 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2590  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  44.95 
 
 
406 aa  344  1e-93  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1486  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  45.95 
 
 
406 aa  344  2e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.199299  hitchhiker  0.000000000797081 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1138  aminotransferase class V  46.77 
 
 
401 aa  344  2e-93  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.787846 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1505  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  45.95 
 
 
406 aa  344  2e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000304018 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1698  cysteine desulfurase, SufS subfamily  44.7 
 
 
417 aa  344  2e-93  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  hitchhiker  0.00263306  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1470  bifunctional cysteine desulfurase/selenocysteine lyase  46.46 
 
 
406 aa  343  2.9999999999999997e-93  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.244975  normal  0.102192 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1684  SufS subfamily cysteine desulfurase  43.39 
 
 
444 aa  343  4e-93  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>