193 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_2032 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_2032  2-dehydropantoate 2-reductase  100 
 
 
315 aa  651    Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1894  2-dehydropantoate 2-reductase  31.29 
 
 
296 aa  124  2e-27  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3648  2-dehydropantoate 2-reductase  30.23 
 
 
319 aa  115  6e-25  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0849606  normal  0.0204343 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0816  2-dehydropantoate 2-reductase  29.66 
 
 
320 aa  115  7.999999999999999e-25  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3535  2-dehydropantoate 2-reductase  29.76 
 
 
311 aa  115  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.40675  hitchhiker  0.0000949952 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3726  2-dehydropantoate 2-reductase  30.3 
 
 
312 aa  113  5e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3445  2-dehydropantoate 2-reductase  31.36 
 
 
310 aa  112  6e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000137485  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3116  2-dehydropantoate 2-reductase  31.38 
 
 
343 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0708  2-dehydropantoate 2-reductase  28.72 
 
 
311 aa  110  4.0000000000000004e-23  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3603  2-dehydropantoate 2-reductase  28.81 
 
 
311 aa  109  5e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_57160  2-dehydropantoate 2-reductase  28.28 
 
 
303 aa  108  1e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1095  2-dehydropantoate 2-reductase  30.93 
 
 
312 aa  107  3e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.82934  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2559  2-dehydropantoate 2-reductase  30.65 
 
 
300 aa  106  4e-22  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.195971 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03288  2-dehydropantoate 2-reductase  27.6 
 
 
296 aa  106  5e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0958  2-dehydropantoate 2-reductase  25.17 
 
 
305 aa  103  5e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002696  2-dehydropantoate 2-reductase  27.72 
 
 
296 aa  103  5e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3158  2-dehydropantoate 2-reductase  29.53 
 
 
326 aa  103  5e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4968  2-dehydropantoate 2-reductase  27.27 
 
 
303 aa  103  5e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3817  2-dehydropantoate 2-reductase  30.87 
 
 
327 aa  102  6e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1351  2-dehydropantoate 2-reductase  27.11 
 
 
305 aa  102  7e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.144072 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2895  2-dehydropantoate 2-reductase  29.57 
 
 
306 aa  102  7e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0400281  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4498  2-dehydropantoate 2-reductase  27.11 
 
 
305 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.774811  normal  0.6393 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4394  2-dehydropantoate 2-reductase  26.04 
 
 
306 aa  102  1e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.68453  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0809  2-dehydropantoate 2-reductase  29.19 
 
 
326 aa  102  1e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0942  2-dehydropantoate 2-reductase  29.03 
 
 
299 aa  102  1e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4373  2-dehydropantoate 2-reductase  27.11 
 
 
305 aa  102  1e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0586836 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2262  2-dehydropantoate 2-reductase  28.21 
 
 
299 aa  101  2e-20  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.354328  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_13400  2-dehydropantoate 2-reductase  27.14 
 
 
297 aa  99.4  7e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3184  2-dehydropantoate 2-reductase  28.71 
 
 
303 aa  97.4  2e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.547188  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0509  2-dehydropantoate 2-reductase  28.71 
 
 
303 aa  98.2  2e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.632143  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1362  2-dehydropantoate 2-reductase  28.37 
 
 
294 aa  97.8  2e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.274866  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3208  2-dehydropantoate 2-reductase  28.71 
 
 
303 aa  97.4  2e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000640508 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00373  2-dehydropantoate 2-reductase  28.71 
 
 
303 aa  97.1  3e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0497  2-dehydropantoate 2-reductase  28.71 
 
 
303 aa  97.1  3e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0347  2-dehydropantoate 2-reductase  28.71 
 
 
303 aa  97.4  3e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0780  2-dehydropantoate 2-reductase  29.05 
 
 
327 aa  97.4  3e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.977069  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00377  hypothetical protein  28.71 
 
 
303 aa  97.1  3e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1083  2-dehydropantoate 2-reductase  28.75 
 
 
303 aa  97.1  4e-19  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000208134 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0457  2-dehydropantoate 2-reductase  28.71 
 
 
303 aa  96.7  5e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4422  2-dehydropantoate 2-reductase  26.67 
 
 
305 aa  95.9  7e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0193  2-dehydropantoate 2-reductase  29.41 
 
 
285 aa  95.9  7e-19  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.0380974  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0461  2-dehydropantoate 2-reductase  28.39 
 
 
303 aa  95.5  1e-18  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0473  2-dehydropantoate 2-reductase  27.88 
 
 
303 aa  95.1  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3068  2-dehydropantoate 2-reductase  27.43 
 
 
303 aa  94.7  2e-18  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0481  2-dehydropantoate 2-reductase  27.44 
 
 
303 aa  94.7  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.378498 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0475  2-dehydropantoate 2-reductase  27.44 
 
 
303 aa  94.7  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3248  2-dehydropantoate 2-reductase  27.43 
 
 
303 aa  94.7  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0536  2-dehydropantoate 2-reductase  27.44 
 
 
303 aa  94.7  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.127784  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0494  2-dehydropantoate 2-reductase  27.44 
 
 
303 aa  94.7  2e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3106  2-dehydropantoate 2-reductase  27.43 
 
 
303 aa  94.7  2e-18  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02768  2-dehydropantoate 2-reductase  27.1 
 
 
313 aa  94  3e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2753  2-dehydropantoate 2-reductase  26.97 
 
 
309 aa  93.6  4e-18  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4088  2-dehydropantoate 2-reductase  25.52 
 
 
306 aa  91.3  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.77552  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0730  2-dehydropantoate 2-reductase  26.27 
 
 
322 aa  90.1  5e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2889  2-dehydropantoate 2-reductase  27.83 
 
 
302 aa  90.1  5e-17  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1035  2-dehydropantoate 2-reductase  27.92 
 
 
302 aa  89.4  7e-17  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.324105  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0937  2-dehydropantoate 2-reductase  25.26 
 
 
303 aa  89.4  8e-17  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.21317 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3679  2-dehydropantoate 2-reductase  25.16 
 
 
296 aa  89  1e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.953522  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3973  2-dehydropantoate 2-reductase  25.73 
 
 
296 aa  88.6  1e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000131427  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3966  2-dehydropantoate 2-reductase  26.14 
 
 
294 aa  87.8  2e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3771  2-dehydropantoate 2-reductase  25.16 
 
 
296 aa  88.2  2e-16  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4059  2-dehydropantoate 2-reductase  25.16 
 
 
294 aa  88.2  2e-16  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00247246  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3276  2-dehydropantoate 2-reductase  26.95 
 
 
302 aa  87  3e-16  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0768  2-dehydropantoate 2-reductase  28.12 
 
 
324 aa  86.3  6e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000150905  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0892  2-dehydropantoate 2-reductase  25.97 
 
 
303 aa  85.9  8e-16  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.868359  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3747  2-dehydropantoate 2-reductase  26.45 
 
 
293 aa  85.9  9e-16  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0684201  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1881  2-dehydropantoate 2-reductase  28.52 
 
 
306 aa  85.5  0.000000000000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3080  2-dehydropantoate 2-reductase  26.4 
 
 
306 aa  85.5  0.000000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.850912  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0958  2-dehydropantoate 2-reductase  25.96 
 
 
294 aa  84.7  0.000000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4021  2-dehydropantoate 2-reductase  25.64 
 
 
296 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.023351  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1220  2-dehydropantoate 2-reductase  26.28 
 
 
296 aa  84.3  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00748883  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3662  2-dehydropantoate 2-reductase  25.49 
 
 
295 aa  83.2  0.000000000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000000935391  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3935  2-dehydropantoate 2-reductase  25.49 
 
 
295 aa  83.2  0.000000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.665009 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3687  2-dehydropantoate 2-reductase  30.33 
 
 
302 aa  81.6  0.00000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2147  2-dehydropantoate 2-reductase  25.5 
 
 
303 aa  79  0.00000000000009  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1009  2-dehydropantoate 2-reductase  29.84 
 
 
307 aa  78.2  0.0000000000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0902  2-dehydropantoate 2-reductase  25.99 
 
 
294 aa  76.6  0.0000000000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0296  2-dehydropantoate 2-reductase  27.43 
 
 
309 aa  75.5  0.000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.961677  normal  0.11487 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2570  2-dehydropantoate 2-reductase  25.34 
 
 
296 aa  72  0.00000000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00232131  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0462  2-dehydropantoate 2-reductase  25.18 
 
 
303 aa  71.2  0.00000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1998  2-dehydropantoate 2-reductase  24.92 
 
 
310 aa  71.2  0.00000000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2874  2-dehydropantoate 2-reductase  26.32 
 
 
336 aa  71.2  0.00000000002  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2486  2-dehydropantoate 2-reductase  23.81 
 
 
319 aa  68.6  0.0000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.570621  n/a   
 
 
-
 
BN001303  ANIA_10586  2-dehydropantoate 2-reductase, putative (AFU_orthologue; AFUA_3G06390)  22.6 
 
 
424 aa  68.2  0.0000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.873381  normal 
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0272  2-dehydropantoate 2-reductase  24.84 
 
 
289 aa  67.8  0.0000000002  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.300395  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3139  2-dehydropantoate 2-reductase  23.81 
 
 
319 aa  66.2  0.0000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.13385  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1361  2-dehydropantoate 2-reductase  23.45 
 
 
305 aa  66.2  0.0000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0528481  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1519  2-dehydropantoate 2-reductase  23.66 
 
 
309 aa  62.4  0.000000009  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.982841  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2523  2-dehydropantoate 2-reductase  25.52 
 
 
312 aa  62  0.00000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4498  2-dehydropantoate 2-reductase  24.91 
 
 
312 aa  62  0.00000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.646734  normal  0.399113 
 
 
-
 
NC_009042  PICST_54699  2-dehydropantoate 2-reductase (Ketopantoate reductase) (KPA reductase) (KPR)  26.69 
 
 
357 aa  61.6  0.00000002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1100  2-dehydropantoate 2-reductase  28.57 
 
 
302 aa  60.5  0.00000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0140808  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0383  2-dehydropantoate 2-reductase  25.65 
 
 
280 aa  60.1  0.00000005  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0693726 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0788  2-dehydropantoate 2-reductase  22.04 
 
 
307 aa  59.7  0.00000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0218  2-dehydropantoate 2-reductase  21.05 
 
 
300 aa  59.7  0.00000007  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1546  2-dehydropantoate 2-reductase  24.6 
 
 
312 aa  59.3  0.00000007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0839  2-dehydropantoate 2-reductase  23 
 
 
307 aa  59.3  0.00000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1567  2-dehydropantoate 2-reductase  23.41 
 
 
318 aa  58.9  0.0000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.62221  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0021  2-dehydropantoate 2-reductase  23.28 
 
 
306 aa  58.9  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2967  2-dehydropantoate 2-reductase  22.97 
 
 
311 aa  57.8  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.53344  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>