40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_1966 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_1966  hypothetical protein  100 
 
 
279 aa  578  1e-164  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.192435  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2296  hypothetical protein  53.9 
 
 
277 aa  266  2e-70  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2309  hypothetical protein  53.9 
 
 
277 aa  266  2.9999999999999995e-70  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.363913  normal  0.020455 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2721  hypothetical protein  44.4 
 
 
261 aa  250  2e-65  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1639  hypothetical protein  44.4 
 
 
261 aa  250  2e-65  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000185406  hitchhiker  0.0000000387039 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2738  hypothetical protein  44.4 
 
 
261 aa  248  9e-65  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.000701952  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0556  hypothetical protein  41.13 
 
 
269 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.473562 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3822  hypothetical protein  40.73 
 
 
268 aa  216  4e-55  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1697  hypothetical protein  40.89 
 
 
261 aa  213  2.9999999999999995e-54  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5572  hypothetical protein  40 
 
 
259 aa  211  7.999999999999999e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1986  hypothetical protein  42.11 
 
 
248 aa  211  1e-53  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.280984  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5285  hypothetical protein  39.63 
 
 
259 aa  208  6e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2344  PRC-barrel domain protein  38.95 
 
 
258 aa  191  1e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.603276 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1131  hypothetical protein  34.33 
 
 
243 aa  182  6e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0891613  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3899  hypothetical protein  34.55 
 
 
272 aa  180  2e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.447694  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1683  hypothetical protein  33.09 
 
 
272 aa  167  1e-40  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1285  hypothetical protein  33.87 
 
 
253 aa  149  5e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01282  hypothetical protein  31.98 
 
 
249 aa  138  8.999999999999999e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  hitchhiker  0.0000306501  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1999  hypothetical protein  57.73 
 
 
100 aa  135  7.000000000000001e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.145821  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3180  hypothetical protein  32.52 
 
 
304 aa  53.5  0.000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1878  hypothetical protein  33.01 
 
 
324 aa  50.8  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.340374  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7896  hypothetical protein  28.97 
 
 
123 aa  51.2  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1539  hypothetical protein  22.06 
 
 
485 aa  50.1  0.00004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1132  hypothetical protein  25.53 
 
 
152 aa  48.9  0.00009  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.933223  hitchhiker  0.000112496 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2680  hypothetical protein  25.71 
 
 
248 aa  48.1  0.0002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4091  hypothetical protein  27.62 
 
 
130 aa  48.1  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1160  hypothetical protein  22.66 
 
 
175 aa  47.4  0.0003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.649409 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1242  hypothetical protein  24.74 
 
 
131 aa  46.6  0.0005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.475727 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0474  PRC-barrel domain-containing protein  29.9 
 
 
142 aa  44.3  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.903154  hitchhiker  0.00309714 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3327  hypothetical protein  33.33 
 
 
221 aa  44.3  0.002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1657  hypothetical protein  31.52 
 
 
311 aa  44.7  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.157539 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4658  PRC-barrel protein  31.82 
 
 
292 aa  44.7  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.659984  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2042  hypothetical protein  27.27 
 
 
142 aa  43.9  0.003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0437546  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1361  PRC-barrel domain-containing protein  20.8 
 
 
163 aa  43.1  0.005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.721312  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3141  PRC-barrel domain-containing protein  20.8 
 
 
163 aa  43.1  0.005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.719915  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2564  hypothetical protein  27.27 
 
 
119 aa  43.1  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3012  PRC-barrel domain-containing protein  20.8 
 
 
163 aa  43.1  0.005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0907577  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5622  PRC-barrel domain-containing protein  19.26 
 
 
160 aa  42.7  0.007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.100635 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_07780  hypothetical protein  25.49 
 
 
283 aa  42.4  0.008  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal  0.374906 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6353  PRC-barrel domain-containing protein  21.48 
 
 
160 aa  42  0.01  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>