168 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmwyl1_1960 on replicon NC_009654
Organism: Marinomonas sp. MWYL1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009654  Mmwyl1_1960  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  100 
 
 
270 aa  540  1e-153  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.827435  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3055  H(+)-transporting ATP synthase, subunit B  56.47 
 
 
278 aa  288  5.0000000000000004e-77  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3100  hypothetical protein  52.61 
 
 
413 aa  270  2e-71  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  decreased coverage  0.00340418  normal  0.241509 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1167  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  50.58 
 
 
326 aa  263  2e-69  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.334044  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0946  alternate F1F0 ATPase, F0 subunit B  48.19 
 
 
278 aa  238  5.999999999999999e-62  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0728261  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2330  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  46.99 
 
 
271 aa  219  5e-56  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1655  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  41.28 
 
 
291 aa  208  1e-52  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0469  ATP synthase F0, H+-transporting two-sector ATPase B/B' subunit  40.16 
 
 
288 aa  179  4.999999999999999e-44  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.118797 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0894  alternate F1F0 ATPase, F0 subunit B  38.15 
 
 
253 aa  171  1e-41  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.170137 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1069  ATP synthase F0, subunit B  36.51 
 
 
264 aa  159  4e-38  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2995  ATP synthase F0, B subunit  34.87 
 
 
259 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2674  ATP synthase F0, B subunit  35.85 
 
 
302 aa  135  9.999999999999999e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.544708  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0441  ATP synthase F0, B subunit  31.35 
 
 
255 aa  102  8e-21  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.34839  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2701  ATP synthase F1, delta subunit, putative  27.35 
 
 
253 aa  92.8  5e-18  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2778  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  29.21 
 
 
259 aa  83.2  0.000000000000004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.392301 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4751  F0F1 ATP synthase subunit B  37.25 
 
 
156 aa  69.7  0.00000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1884  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  29.33 
 
 
249 aa  69.3  0.00000000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.278436  normal  0.658089 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1434  putative ATP synthase subunit b  28.24 
 
 
252 aa  68.2  0.0000000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.202305  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4314  F0F1 ATP synthase subunit B  36.27 
 
 
156 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0812029  hitchhiker  0.0000000000716533 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3849  F0F1 ATP synthase subunit B  30.26 
 
 
156 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.28383  hitchhiker  0.0000250407 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4511  F0F1 ATP synthase subunit B  36.27 
 
 
156 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00356652  normal  0.0257912 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4369  F0F1 ATP synthase subunit B  36.27 
 
 
156 aa  67.4  0.0000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.011989  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2333  hypothetical protein  23.14 
 
 
247 aa  67  0.0000000003  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3756  F0F1 ATP synthase subunit B  35 
 
 
156 aa  67  0.0000000003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0289991  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4490  F0F1 ATP synthase subunit B  34.31 
 
 
156 aa  66.6  0.0000000004  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.00698245  hitchhiker  0.00000569533 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4902  F0F1 ATP synthase subunit B  34.31 
 
 
156 aa  66.2  0.0000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.0000735989  normal  0.257522 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4370  F0F1 ATP synthase subunit B  35.29 
 
 
156 aa  65.5  0.0000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000255144  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1051  H+transporting two-sector ATPase B/B' subunit  26.07 
 
 
248 aa  60.8  0.00000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4244  F0F1 ATP synthase subunit B  34 
 
 
156 aa  60.8  0.00000002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.00033508  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0516  F0F1 ATP synthase subunit B  55.32 
 
 
163 aa  60.1  0.00000004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.188958  normal  0.601675 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1269  F0F1 ATP synthase subunit B  55.32 
 
 
163 aa  59.7  0.00000005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0102  F0F1 ATP synthase subunit B  31.97 
 
 
156 aa  58.9  0.00000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  decreased coverage  0.000584216  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2953  F0F1 ATP synthase subunit B  30.56 
 
 
156 aa  58.9  0.00000008  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.193165  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0183  F0F1 ATP synthase subunit B  30.56 
 
 
156 aa  58.9  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.939973  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3312  F0F1 ATP synthase subunit B  30.56 
 
 
156 aa  58.9  0.00000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0288951  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3359  F0F1 ATP synthase subunit B  30.56 
 
 
156 aa  58.9  0.00000008  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.903463  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1591  F0F1 ATP synthase subunit B  30.56 
 
 
156 aa  58.9  0.00000008  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  hitchhiker  0.000339431  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3972  F0F1 ATP synthase subunit B  30.56 
 
 
156 aa  58.9  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.993966  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_4046  F0F1 ATP synthase subunit B  30.56 
 
 
156 aa  58.9  0.00000008  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3011  F0F1 ATP synthase subunit B  30.56 
 
 
156 aa  58.9  0.00000008  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.209415  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3284  F0F1 ATP synthase subunit B  31.15 
 
 
156 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.294476  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0102  F0F1 ATP synthase subunit B  31.97 
 
 
156 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0367309  normal  0.480955 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_4049  F0F1 ATP synthase subunit B  29.51 
 
 
156 aa  58.2  0.0000001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0093  F0F1 ATP synthase subunit B  31.97 
 
 
156 aa  58.9  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0481406  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0118  F0F1 ATP synthase subunit B  31.15 
 
 
156 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.100936  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_3031  F0F1 ATP synthase subunit B  29.51 
 
 
156 aa  58.2  0.0000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2953  F0F1 ATP synthase subunit B  31.15 
 
 
156 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.043981  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3929  F0F1 ATP synthase subunit B  46 
 
 
156 aa  57.8  0.0000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.016356  hitchhiker  0.00620185 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_4021  F0F1 ATP synthase subunit B  46 
 
 
156 aa  57.8  0.0000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.165729  normal  0.907421 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0102  F0F1 ATP synthase subunit B  31.15 
 
 
156 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0776663  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4134  F0F1 ATP synthase subunit B  46 
 
 
156 aa  58.2  0.0000002  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000412529  hitchhiker  0.00502547 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0036  F0F1 ATP synthase subunit B  28.69 
 
 
156 aa  57  0.0000003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  decreased coverage  0.00144365  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3898  F0F1 ATP synthase subunit B  28.69 
 
 
156 aa  56.6  0.0000004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0846  ATP synthase F1, delta subunit, putative  21.43 
 
 
248 aa  56.6  0.0000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0989  F0F1 ATP synthase subunit B  30.83 
 
 
164 aa  55.5  0.0000008  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.644569 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5554  H+-transporting two-sector ATPase, B/B' subunit  34.83 
 
 
249 aa  55.1  0.000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.0698989  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3321  F0F1 ATP synthase subunit B  27.97 
 
 
156 aa  54.3  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00311324  normal  0.130575 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0425  ATP synthase F0, B subunit  34.78 
 
 
249 aa  53.9  0.000003  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.183073  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3191  F0F1 ATP synthase subunit B  30.48 
 
 
156 aa  53.9  0.000003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_17840  ATP synthase F0, B subunit  43.64 
 
 
166 aa  53.1  0.000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3516  F0F1 ATP synthase subunit B  30.48 
 
 
156 aa  53.1  0.000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.346164  hitchhiker  0.000127019 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3879  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.57 
 
 
443 aa  52.8  0.000006  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3648  F0F1 ATP synthase subunit B  32.56 
 
 
156 aa  52.8  0.000006  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000138088  unclonable  0.00000693674 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3953  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.57 
 
 
443 aa  52.8  0.000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.0109284 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3865  F0F1 ATP synthase subunit delta  28.57 
 
 
443 aa  52.8  0.000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.0308391 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19730  H+-transporting two-sector ATPase, B/B subunit  24.44 
 
 
246 aa  52.8  0.000006  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00206816  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4068  F0F1 ATP synthase subunit B  42.55 
 
 
164 aa  52  0.000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0525312  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3989  F0F1 ATP synthase subunit B  30.99 
 
 
156 aa  52.4  0.000009  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2848  ATP synthase F0, B subunit  28.78 
 
 
162 aa  52  0.00001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.134419 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_1231  ATP synthase F0, B subunit  36.46 
 
 
164 aa  51.6  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0329  ATP synthase F0, B subunit  30.1 
 
 
161 aa  51.6  0.00001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3879  ATP synthase F0, B subunit  30.34 
 
 
156 aa  51.2  0.00002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  decreased coverage  0.0000993244  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0022  ATP synthase F0, B subunit  32.38 
 
 
156 aa  51.2  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0311887  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3960  F0F1 ATP synthase subunit B  32.79 
 
 
156 aa  50.8  0.00002  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.399325  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3419  F0F1 ATP synthase subunit B  37.88 
 
 
178 aa  50.8  0.00002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2591  ATP synthase F0, B subunit  27.5 
 
 
156 aa  50.8  0.00002  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.165312  normal  0.0791897 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3515  F0F1 ATP synthase subunit B  30.07 
 
 
156 aa  50.8  0.00002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4543  F0F1 ATP synthase subunit B  30.99 
 
 
156 aa  50.4  0.00003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.000204898  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3498  F0F1 ATP synthase subunit B  29.52 
 
 
156 aa  50.4  0.00003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.00465631  normal  0.23975 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2329  ATP synthase F0, B subunit  28.12 
 
 
156 aa  50.8  0.00003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  hitchhiker  0.000028913  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3350  F0F1 ATP synthase subunit B  29.52 
 
 
156 aa  50.1  0.00004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0868788  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3078  F0F1 ATP synthase subunit B  44.19 
 
 
156 aa  50.1  0.00004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0404416  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4169  ATP synthase F0, B subunit  24.34 
 
 
165 aa  50.1  0.00004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0813106  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4128  F0F1 ATP synthase subunit B  29.58 
 
 
156 aa  50.1  0.00004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.00062325  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2801  F-type H+-transporting ATP synthase, subunit B  46.51 
 
 
156 aa  49.3  0.00007  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0112017  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2524  F0F1 ATP synthase subunit B  31.15 
 
 
156 aa  49.3  0.00007  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00056725  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2143  F0F1 ATP synthase subunit B  30.61 
 
 
173 aa  48.9  0.00009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.631434  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2181  F0F1 ATP synthase subunit B  30.61 
 
 
173 aa  48.9  0.00009  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.273543  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_5125  F0F1 ATP synthase subunit B  28.57 
 
 
156 aa  48.1  0.0001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0727464  normal  0.577364 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_0489  F0F1 ATP synthase subunit B  31.76 
 
 
177 aa  48.9  0.0001  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.0554467  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0476  F0F1 ATP synthase subunit B  39.13 
 
 
156 aa  48.1  0.0001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.219933  normal  0.615826 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2788  putative ATP synthase F0, B subunit  52.63 
 
 
249 aa  48.5  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2748  F0F1 ATP synthase subunit B  27.67 
 
 
156 aa  47.8  0.0002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.000265032  normal  0.27853 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4200  F0F1 ATP synthase subunit B  27.12 
 
 
156 aa  47.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.109353  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4299  F0F1 ATP synthase subunit B  29.46 
 
 
156 aa  48.1  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0127167  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4079  F0F1 ATP synthase subunit B  27.12 
 
 
156 aa  47.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.0615149  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_73290  F0F1 ATP synthase subunit B  26.54 
 
 
156 aa  47.8  0.0002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4150  F0F1 ATP synthase subunit B  27.12 
 
 
156 aa  47.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.039629  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4094  F0F1 ATP synthase subunit B  27.12 
 
 
156 aa  47.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000422543  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4259  F0F1 ATP synthase subunit B  27.12 
 
 
156 aa  47.8  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0777142  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>