More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmcs_1979 on replicon NC_008146
Organism: Mycobacterium sp. MCS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009338  Mflv_2855  AMP-dependent synthetase and ligase  65.7 
 
 		 829 aa  1043    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.577572 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4142  AMP-dependent synthetase and ligase  69.92 
 
 		 860 aa  1049    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5341  AMP-dependent synthetase and ligase  51.35 
 
 		 915 aa  729    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.795016 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1593  AMP-dependent synthetase and ligase  52.13 
 
 		 889 aa  714    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.813754 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1979  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 830 aa  1636    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.10033  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1889  AMP-dependent synthetase and ligase  54.43 
 
 		 860 aa  735    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0471823  normal  0.0591915 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2121  AMP-dependent synthetase and ligase  48.68 
 
 		 868 aa  713    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1959  AMP-dependent synthetase and ligase  99.52 
 
 		 830 aa  1630    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5747  AMP-dependent synthetase and ligase  65.99 
 
 		 831 aa  1042    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2025  AMP-dependent synthetase and ligase  100 
 
 		 830 aa  1636    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2199  AMP-dependent synthetase and ligase  69.38 
 
 		 862 aa  1018    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0560008  normal  0.885424 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2019  AMP-dependent synthetase and ligase  47.41 
 
 		 841 aa  598  1e-169  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  decreased coverage  0.00459182  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0772  AMP-dependent synthetase and ligase  35.98 
 
 		 887 aa  422  1e-116  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0989084 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2512  AMP-dependent synthetase and ligase  40.31 
 
 		 460 aa  290  7e-77  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.280527  normal  0.710337 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2621  AMP-dependent synthetase and ligase  39.16 
 
 		 453 aa  288  2.9999999999999996e-76  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2843  AMP-dependent synthetase and ligase  42.44 
 
 		 459 aa  267  5e-70  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0145799  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3177  AMP-dependent synthetase and ligase  31.78 
 
 		 471 aa  240  8e-62  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.733678  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3158  AMP-dependent synthetase and ligase  30.79 
 
 		 490 aa  195  3e-48  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1742  AMP-dependent synthetase and ligase  32.19 
 
 		 497 aa  187  5e-46  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.441923  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2785  AMP-dependent synthetase and ligase  42.7 
 
 		 534 aa  181  4e-44  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.634484  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3111  AMP-dependent synthetase and ligase  38.25 
 
 		 418 aa  179  1e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.0188419 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3314  amino acid adenylation domain-containing protein  27.41 
 
 		 923 aa  175  2.9999999999999996e-42  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0105674  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2958  AMP-dependent synthetase and ligase  42.12 
 
 		 523 aa  172  2e-41  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2866  AMP-dependent synthetase and ligase  41.61 
 
 		 523 aa  169  2e-40  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3152  amino acid adenylation domain-containing protein  26.3 
 
 		 923 aa  167  5e-40  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.595865 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3179  AMP-dependent synthetase and ligase  31.63 
 
 		 520 aa  166  2.0000000000000002e-39  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1249  AMP-dependent synthetase and ligase  41.03 
 
 		 530 aa  163  1e-38  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1082  AMP-dependent synthetase and ligase  35.71 
 
 		 526 aa  162  2e-38  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2563  antibiotic biosynthesis protein, putative  26.03 
 
 		 923 aa  155  2e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.136066  normal  0.595112 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4497  AMP-dependent synthetase and ligase  32.43 
 
 		 517 aa  153  2e-35  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5320  AMP-dependent synthetase and ligase  35.67 
 
 		 521 aa  144  7e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0267  long-chain fatty-acid-CoA ligase  32.32 
 
 		 492 aa  141  6e-32  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.250834 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2870  AMP-dependent synthetase and ligase  35.04 
 
 		 520 aa  139  2e-31  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1564  AMP-dependent synthetase and ligase  28.93 
 
 		 529 aa  130  9.000000000000001e-29  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2882  AMP-dependent synthetase and ligase  34.88 
 
 		 514 aa  127  7e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0125  AMP-dependent synthetase and ligase  33.33 
 
 		 533 aa  124  9e-27  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1956  AMP-dependent synthetase and ligase  32.88 
 
 		 538 aa  124  9.999999999999999e-27  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.536259  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3426  AMP-dependent synthetase and ligase  33.51 
 
 		 505 aa  121  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.872115 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4336  AMP-dependent synthetase and ligase  33.33 
 
 		 515 aa  120  7.999999999999999e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0623029  hitchhiker  0.00463044 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2020  AMP-dependent synthetase and ligase  32.16 
 
 		 523 aa  120  9e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.256098 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1472  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  29.07 
 
 		 514 aa  118  5e-25  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4273  acyl-CoA ligase (AMP-forming), exosortase system type 1 associated  32.97 
 
 		 536 aa  118  5e-25  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000408842 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3735  AMP-dependent synthetase and ligase  32.79 
 
 		 505 aa  118  6e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1292  AMP-dependent synthetase and ligase  32.99 
 
 		 523 aa  117  6e-25  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2434  AMP-dependent synthetase and ligase  31.59 
 
 		 553 aa  117  6.9999999999999995e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3648  AMP-dependent synthetase and ligase  27.82 
 
 		 519 aa  117  8.999999999999998e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3621  AMP-dependent synthetase and ligase  32.96 
 
 		 505 aa  116  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.531462  normal  0.0257473 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0111  AMP-dependent synthetase and ligase  32.97 
 
 		 526 aa  116  2.0000000000000002e-24  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.471366  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0705  AMP-binding domain-containing protein  35.15 
 
 		 535 aa  115  3e-24  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1574  AMP-binding domain-containing protein  35.15 
 
 		 535 aa  115  3e-24  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.575944  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2026  AMP-binding domain-containing protein  35.15 
 
 		 535 aa  115  3e-24  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2124  AMP-binding domain-containing protein  35.15 
 
 		 535 aa  115  3e-24  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2529  acyl-CoA ligase (AMP-forming), exosortase system type 1 associated  34.13 
 
 		 532 aa  115  3e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0437982 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3804  AMP-dependent synthetase and ligase  33.33 
 
 		 529 aa  115  3e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0616  AMP-binding domain-containing protein  35.15 
 
 		 608 aa  115  4.0000000000000004e-24  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.117672  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0656  long-chain-fatty-acid--CoA ligase  31.25 
 
 		 512 aa  114  6e-24  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.0055881  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2211  AMP-binding domain-containing protein  35.15 
 
 		 691 aa  114  1.0000000000000001e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1930  AMP-dependent synthetase and ligase  34.4 
 
 		 510 aa  113  1.0000000000000001e-23  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.426512  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1393  acyl-CoA ligase (AMP-forming), exosortase system type 1 associated  34.77 
 
 		 530 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0696312  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0096  AMP-dependent synthetase and ligase  32.51 
 
 		 527 aa  112  3e-23  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2384  long chain acyl-CoA synthetase  29.94 
 
 		 522 aa  112  3e-23  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.838987  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7014  acyl-CoA ligase (AMP-forming), exosortase system type 1 associated  35.09 
 
 		 529 aa  112  3e-23  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00188129 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1758  amino acid adenylation domain-containing protein  30 
 
 		 2386 aa  112  4.0000000000000004e-23  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6138  AMP-dependent synthetase and ligase  33.7 
 
 		 524 aa  111  4.0000000000000004e-23  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.623044  normal  0.113053 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3602  cyclic nucleotide-binding protein  31.75 
 
 		 8211 aa  111  5e-23  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4029  AMP-dependent synthetase and ligase  36.94 
 
 		 509 aa  111  5e-23  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.302171  normal  0.718731 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3506  AMP-dependent synthetase and ligase  28.82 
 
 		 505 aa  111  7.000000000000001e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0661851  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3987  AMP-dependent synthetase and ligase  28.04 
 
 		 662 aa  110  8.000000000000001e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2735  bacitracin synthetase 1  25.7 
 
 		 2336 aa  110  1e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.56804e-17 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2131  nonribosomal peptide synthetase  27.84 
 
 		 2385 aa  110  1e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2540  AMP-binding enzyme  25.83 
 
 		 2345 aa  109  2e-22  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0191  amino acid adenylation domain-containing protein  29.41 
 
 		 1071 aa  109  2e-22  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.604981  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2147  nonribosomal peptide synthetase  27.84 
 
 		 2385 aa  108  3e-22  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.633458  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2390  nonribosomal peptide synthetase DhbF  27.84 
 
 		 2385 aa  108  3e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0422  putative AMP-dependent synthetase and ligase  34.39 
 
 		 538 aa  108  3e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.838411  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2089  amino acid adenylation domain-containing protein  27.4 
 
 		 2138 aa  108  4e-22  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0699  AMP-dependent synthetase and ligase  31.44 
 
 		 545 aa  108  4e-22  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1834  AMP-dependent synthetase and ligase  31.62 
 
 		 529 aa  108  4e-22  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1958  non-ribosomal peptide synthase:amino acid adenylation  30.66 
 
 		 2666 aa  107  1e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.815513 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0286  AMP-dependent synthetase and ligase  32.16 
 
 		 511 aa  107  1e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2337  nonribosomal peptide synthetase DhbF  29.84 
 
 		 2385 aa  107  1e-21  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010180  BcerKBAB4_5489  amino acid adenylation domain-containing protein  25.67 
 
 		 2439 aa  107  1e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00934581 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6505  acyl-CoA ligase (AMP-forming), exosortase system type 1 associated  32.97 
 
 		 527 aa  106  2e-21  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.679628 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2208  nonribosomal peptide synthetase DhbF  27.84 
 
 		 2385 aa  106  2e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0707  AMP-binding domain-containing protein  32.11 
 
 		 522 aa  106  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.160608  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2554  bacitracin synthetase 1  25.35 
 
 		 2338 aa  106  2e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000340307 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2372  nonribosomal peptide synthetase DhbF  27.84 
 
 		 2385 aa  106  2e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0137  acyl-CoA ligase (AMP-forming), exosortase system type 1 associated  34.74 
 
 		 539 aa  106  2e-21  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2988  nonribosomal peptide synthetase DhbF  29.77 
 
 		 2385 aa  105  3e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2670  AMP-dependent synthetase and ligase  31.64 
 
 		 531 aa  105  3e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1923  2-acyl-glycerophospho-ethanolamine acyltransferase  27.6 
 
 		 1150 aa  105  4e-21  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1959  amino acid adenylation  28.54 
 
 		 2154 aa  105  4e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.992857 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5649  AMP-dependent synthetase and ligase  32.97 
 
 		 531 aa  105  4e-21  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0472962  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6014  AMP-dependent synthetase and ligase  32.97 
 
 		 531 aa  105  4e-21  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.010036  normal  1 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7423  AMP-dependent synthetase and ligase  32.51 
 
 		 524 aa  105  5e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.113615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0490  AMP-dependent synthetase and ligase  30.94 
 
 		 512 aa  103  1e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3468  Non-ribosomal peptide synthetase modules and related protein-like protein  32.78 
 
 		 7541 aa  103  1e-20  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.247204 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0737  acylglycerophosphoethanolamine acyltransferase  29.72 
 
 		 1131 aa  103  1e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00473153  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3455  AMP-dependent synthetase and ligase  28.39 
 
 		 583 aa  103  1e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2179  amino acid adenylation domain-containing protein  27.16 
 
 		 2386 aa  103  1e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>