43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_2854 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_2854  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 128 aa  254  2e-67  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0770075  normal  0.3412 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2614  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 127 aa  253  7e-67  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.105443  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2662  XRE family transcriptional regulator  99.22 
 
 		 128 aa  252  1.0000000000000001e-66  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1263  XRE family transcriptional regulator  48.04 
 
 		 117 aa  92.8  1e-18  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.197496  normal  0.35007 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0826  XRE family transcriptional regulator  35.42 
 
 		 96 aa  60.5  0.000000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.000131659  unclonable  0.000000470251 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1422  transcriptional regulator, XRE family  32.14 
 
 		 652 aa  57.4  0.00000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013206  Aaci_2954  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 223 aa  55.5  0.0000002  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  unclonable  0.00000000000401895  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2752  XRE family transcriptional regulator  32.95 
 
 		 113 aa  54.3  0.0000005  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.272342  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0642  XRE family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 161 aa  53.9  0.0000008  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.112362  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0655  XRE family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 161 aa  53.9  0.0000008  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0535888  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0635  XRE family transcriptional regulator  35.37 
 
 		 161 aa  53.9  0.0000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.453741  normal  0.0430623 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0650  transcriptional regulator, XRE family  31.25 
 
 		 110 aa  50.8  0.000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10482  transcriptional regulator  34.15 
 
 		 140 aa  50.4  0.000008  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0807  XRE family transcriptional regulator  32.93 
 
 		 176 aa  49.7  0.00001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.163665  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0101  XRE family transcriptional regulator  34.15 
 
 		 182 aa  50.1  0.00001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0310115  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1953  transcriptional regulator, XRE family  31.58 
 
 		 131 aa  49.7  0.00001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1750  XRE family transcriptional regulator  31.58 
 
 		 129 aa  49.3  0.00002  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00805015  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_217  hypothetical protein  28.16 
 
 		 132 aa  47.8  0.00005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1064  transcriptional regulator, XRE family  40 
 
 		 206 aa  47.4  0.00006  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0300833  n/a   
 
 
-
 
NC_009340  Mflv_5593  XRE family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 118 aa  47.4  0.00007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8227  transcriptional regulator, XRE family  30.86 
 
 		 165 aa  47  0.00008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.556785  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2894  XRE family transcriptional regulator  34.38 
 
 		 131 aa  45.4  0.0002  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2728  DNA-binding protein  32.14 
 
 		 282 aa  45.4  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.925835  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1142  transcriptional regulator, XRE family  35.62 
 
 		 111 aa  45.4  0.0003  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000709447  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0214  XRE family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 131 aa  45.4  0.0003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02480  Helix-turn-helix protein  28.89 
 
 		 156 aa  45.1  0.0004  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.251654  normal  0.974666 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1900  transcriptional regulator, XRE family  34.12 
 
 		 104 aa  44.3  0.0005  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  1.43236e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0379  XRE family transcriptional regulator  32 
 
 		 191 aa  43.9  0.0008  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0164716 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0316  XRE family transcriptional regulator  32 
 
 		 191 aa  43.9  0.0008  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0663  transcriptional regulator, XRE family  27.19 
 
 		 145 aa  43.1  0.001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1013  XRE family transcriptional regulator  36.59 
 
 		 491 aa  42.4  0.002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1827  XRE family transcriptional regulator  36 
 
 		 252 aa  42.4  0.002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0400601  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0949  putative transcriptional regulator, XRE family  30.38 
 
 		 175 aa  42.4  0.002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.596696  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1745  XRE family transcriptional regulator  30.61 
 
 		 126 aa  41.6  0.003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000375519  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4622  transcriptional regulator, XRE family  32.18 
 
 		 170 aa  42  0.003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.759922  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0773  helix-turn-helix domain protein  32.93 
 
 		 141 aa  42  0.003  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0962  transcriptional regulator, XRE family  28.77 
 
 		 109 aa  42  0.003  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.0119843  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6774  transcriptional regulator, XRE family  26.92 
 
 		 128 aa  41.2  0.005  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.314572  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1668  transcriptional regulator, XRE family  32.65 
 
 		 256 aa  41.2  0.006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000231765  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0488  XRE family transcriptional regulator  29.11 
 
 		 145 aa  40.4  0.008  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.578439  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0371  XRE family transcriptional regulator  32.88 
 
 		 91 aa  40.4  0.008  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.340091  normal  0.26916 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0300  XRE family transcriptional regulator  28.77 
 
 		 146 aa  40.4  0.009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.223259  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4201  helix-turn-helix domain-containing protein  32.14 
 
 		 128 aa  40  0.01  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>