140 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_2834 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008576  Mmc1_2834  hemerythrin-like metal-binding protein  100 
 
 		 249 aa  514  1.0000000000000001e-145  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.970767 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3109  hemerythrin-like metal-binding protein  59.68 
 
 		 253 aa  333  1e-90  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.37545  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1089  hemerythrin-like metal-binding protein  29.84 
 
 		 135 aa  72.8  0.000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000902332  normal  0.270492 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0454  hemerythrin-like metal-binding protein  31.45 
 
 		 135 aa  72  0.000000000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.150441 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1698  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  33.07 
 
 		 963 aa  67  0.0000000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0386  hemerythrin-like metal-binding protein  32.2 
 
 		 135 aa  63.5  0.000000003  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.235664  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2241  hemerythrin-like metal-binding protein  29.85 
 
 		 134 aa  63.2  0.000000004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3068  hemerythrin-like metal-binding protein  28.24 
 
 		 133 aa  62.4  0.000000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00047967 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3898  hemerythrin-like metal-binding protein  30 
 
 		 132 aa  61.6  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0330247 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0092  hemerythrin-like, metal-binding protein  30.23 
 
 		 146 aa  61.2  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3562  hemerythrin-like metal-binding protein  27.61 
 
 		 138 aa  61.2  0.00000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1984  hemerythrin-like metal-binding protein  29.32 
 
 		 134 aa  60.8  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0219  hemerythrin-like, metal-binding protein  28.37 
 
 		 138 aa  59.7  0.00000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.852988  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0606  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.51 
 
 		 779 aa  59.7  0.00000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.532561  normal  0.695827 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0110  hemerythrin-like metal-binding protein  29.46 
 
 		 146 aa  59.3  0.00000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.786855  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1013  hemerythrin-related protein  34.11 
 
 		 137 aa  58.9  0.00000008  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0407  hypothetical protein  29.85 
 
 		 161 aa  58.5  0.0000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.388824  normal  0.189045 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0099  hemerythrin-like metal-binding protein  29.46 
 
 		 144 aa  58.2  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.161287  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3116  hemerythrin-like metal-binding protein  31.93 
 
 		 133 aa  58.2  0.0000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.294641  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2929  hypothetical protein  28.57 
 
 		 131 aa  57.8  0.0000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3217  hemerythrin-like metal-binding protein  31.93 
 
 		 133 aa  57.8  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3016  hemerythrin-like, metal-binding protein  32.48 
 
 		 133 aa  57.8  0.0000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3958  hemerythrin-like metal-binding protein  29.69 
 
 		 131 aa  57.4  0.0000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000239483 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3870  hemerythrin-like metal-binding protein  28.91 
 
 		 131 aa  57.4  0.0000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3017  hemerythrin-like, metal-binding protein  31.62 
 
 		 133 aa  57  0.0000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0400  response regulator receiver protein  30.71 
 
 		 320 aa  56.6  0.0000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.401585  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1585  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.46 
 
 		 997 aa  57  0.0000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0506564  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0230  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  31.45 
 
 		 963 aa  57  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2798  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.1 
 
 		 689 aa  57  0.0000003  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.803852 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0966  hemerythrin-like, metal-binding  28.89 
 
 		 135 aa  56.2  0.0000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.208932  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2231  hemerythrin-like metal-binding protein  33.07 
 
 		 134 aa  56.6  0.0000004  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.29139  normal  0.35041 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3223  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.12 
 
 		 529 aa  56.2  0.0000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000784984 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2635  hypothetical protein  29.69 
 
 		 139 aa  55.8  0.0000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0508  hemerythrin  24.44 
 
 		 135 aa  55.8  0.0000006  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0834  hemerythrin-like, metal-binding protein  27.86 
 
 		 155 aa  55.8  0.0000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3650  hemerythrin-like, metal-binding  28.93 
 
 		 132 aa  55.8  0.0000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.151887  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1539  hemerythrin-like metal-binding protein  26.61 
 
 		 135 aa  55.8  0.0000006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.0293600000000005e-29 
 
 
-
 
NC_004347  SO_3890  methyl-accepting chemotaxis protein  28.8 
 
 		 529 aa  55.8  0.0000007  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3564  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.91 
 
 		 529 aa  55.5  0.0000007  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0820  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.91 
 
 		 529 aa  55.5  0.0000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000219782 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3216  hemerythrin-like metal-binding protein  31.62 
 
 		 133 aa  55.5  0.0000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0633  hemerythrin-like metal-binding protein  27.74 
 
 		 173 aa  55.5  0.0000008  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0795  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.91 
 
 		 529 aa  55.5  0.0000008  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0827  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.91 
 
 		 529 aa  55.5  0.0000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  0.456094 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0612  hemerythrin-like metal-binding protein  29.37 
 
 		 142 aa  55.5  0.0000008  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.326939  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3115  hemerythrin-like metal-binding protein  31.62 
 
 		 133 aa  55.5  0.0000008  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.278333  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0776  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.91 
 
 		 526 aa  55.5  0.0000009  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.534221  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5247  hemerythrin-like metal-binding protein  29.91 
 
 		 138 aa  54.7  0.000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0766  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.12 
 
 		 529 aa  55.1  0.000001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00205391 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0739  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  28.12 
 
 		 529 aa  54.7  0.000001  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00129252 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2058  hemerythrin-like metal-binding protein  24.64 
 
 		 143 aa  54.7  0.000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0326251  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2701  hemerythrin-like metal-binding protein  25.81 
 
 		 135 aa  54.7  0.000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000000332936  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3631  GGDEF domain-containing protein  30.51 
 
 		 722 aa  54.3  0.000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.770761  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0632  chemotaxis sensory transducer  25.35 
 
 		 736 aa  53.9  0.000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.180969  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3068  hemerythrin-like metal-binding protein  25.56 
 
 		 138 aa  54.3  0.000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3031  hemerythrin-like metal-binding protein  27.13 
 
 		 137 aa  54.7  0.000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2484  hemerythrin-like metal-binding protein  28.33 
 
 		 130 aa  53.5  0.000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0423908  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0453  hemerythrin-like metal-binding protein  29.51 
 
 		 138 aa  53.5  0.000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0402  hemerythrin family protein  28.23 
 
 		 135 aa  52.8  0.000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.551551  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1333  hypothetical protein  27.22 
 
 		 153 aa  52.8  0.000005  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.792826 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1252  hemerythrin-like metal-binding protein  27.69 
 
 		 140 aa  52.8  0.000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.145484  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3954  PAS:GGDEF:hemerythrin HHE cation binding region  26.92 
 
 		 667 aa  52.4  0.000007  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.567366  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1042  hypothetical protein  25.81 
 
 		 134 aa  51.2  0.00001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3121  hemerythrin-like, metal-binding protein  29.84 
 
 		 135 aa  51.2  0.00001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2359  hemerythrin-like metal-binding protein  26.23 
 
 		 131 aa  51.6  0.00001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.236367  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0550  putative methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  25.98 
 
 		 518 aa  51.6  0.00001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0126879 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3050  hemerythrin-like metal-binding protein  28.23 
 
 		 137 aa  51.6  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.653955  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0173  hemerythrin-like metal-binding protein  24.8 
 
 		 132 aa  52  0.00001  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3599  hypothetical protein  29.69 
 
 		 153 aa  51.2  0.00002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2998  hemerythrin-like metal-binding protein  29.66 
 
 		 135 aa  50.4  0.00002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.541154 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3696  hemerythrin HHE cation binding region  28.23 
 
 		 142 aa  50.4  0.00003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0858  hemerythrin-like metal-binding protein  25.2 
 
 		 144 aa  50.4  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.511508  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4355  hypothetical protein  27.59 
 
 		 213 aa  50.1  0.00003  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.340338  normal  0.157708 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1660  hemerythrin HHE cation binding region  29.41 
 
 		 128 aa  49.7  0.00004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1809  hemerythrin-like metal-binding protein  28.26 
 
 		 147 aa  49.7  0.00004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.216325  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42860  hypothetical protein  29.69 
 
 		 153 aa  49.7  0.00005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_4119  hemerythrin-like metal-binding protein  29.13 
 
 		 133 aa  49.7  0.00005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.345239  normal  0.186868 
 
 
-
 
NC_003912  CJE1359  hemerythrin family non-heme iron protein  29.09 
 
 		 199 aa  49.3  0.00007  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  0.237377  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_1237  hemerythrin family non-heme iron protein  29.09 
 
 		 199 aa  49.3  0.00007  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000133018  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0509  hemerythrin-like metal-binding protein  26.61 
 
 		 158 aa  48.5  0.00009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3573  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  30.33 
 
 		 927 aa  48.5  0.00009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000390838  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2835  hemerythrin-like metal-binding protein  30 
 
 		 143 aa  48.5  0.00009  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.06522  normal  0.202912 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_4250  hemerythrin-like metal-binding protein  31.78 
 
 		 133 aa  48.5  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.507447  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1962  hemerythrin-like metal-binding protein  25.81 
 
 		 152 aa  48.1  0.0001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1106  conserved hypothetical protein, putative non-heme iron protein, hemerythrin family  28.18 
 
 		 187 aa  48.1  0.0001  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3651  hemerythrin-like, metal-binding  25.21 
 
 		 152 aa  48.5  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.766451  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4443  hemerythrin-like, metal-binding  20.45 
 
 		 134 aa  48.5  0.0001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2935  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  27.59 
 
 		 941 aa  48.5  0.0001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.328788  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3058  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.81 
 
 		 518 aa  48.1  0.0001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0492  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  29.13 
 
 		 530 aa  48.1  0.0001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4225  hemerythrin-like metal-binding protein  31.78 
 
 		 133 aa  48.5  0.0001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.960265  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2156  diguanylate cyclase  27.68 
 
 		 470 aa  47.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.117189 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0473  hemerythrin-like metal-binding protein  23.62 
 
 		 134 aa  47.8  0.0002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_3118  hemerythrin-like metal-binding protein  30.33 
 
 		 129 aa  47.8  0.0002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2752  hemerythrin-like metal-binding protein  25.85 
 
 		 150 aa  47.4  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.976413  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1895  hemerythrin-like metal-binding protein  29.06 
 
 		 129 aa  47.4  0.0002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.689554  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0040  methyl-accepting chemotaxis sensory transducer  26.19 
 
 		 515 aa  47.4  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_4009  hemerythrin-like metal-binding protein  30.89 
 
 		 133 aa  47.4  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.0070242  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1400  hemerythrin-like metal-binding protein  25 
 
 		 155 aa  47  0.0003  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_4100  hemerythrin-like, metal-binding protein  31.54 
 
 		 133 aa  47  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>