More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mmc1_2517 on replicon NC_008576
Organism: Magnetococcus sp. MC-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008576  Mmc1_2517  rhodanese domain-containing protein  100 
 
 
137 aa  279  1e-74  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.299389  normal  0.344118 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0088  rhodanese domain-containing protein  44.25 
 
 
153 aa  112  1.0000000000000001e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00487418 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2274  rhodanese-related sulfurtransferase  40 
 
 
280 aa  72.4  0.000000000002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000200812  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0061  Rhodanese domain protein  40.26 
 
 
277 aa  69.7  0.00000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2864  Rhodanese domain-containing protein  34.68 
 
 
143 aa  68.6  0.00000000003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1559  rhodanese-like protein  36.63 
 
 
142 aa  66.2  0.0000000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0146795  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2561  rhodanese-like protein  36.25 
 
 
288 aa  64.7  0.0000000004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.900675  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3039  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  27.81 
 
 
805 aa  64.7  0.0000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2007  metallo-beta-lactamase family protein  40.48 
 
 
361 aa  64.3  0.0000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.256762  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2186  UBA/THIF-type NAD/FAD binding protein  43.21 
 
 
389 aa  63.9  0.0000000008  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.0893637 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_2041  rhodanese-related sulfurtransferase  36.25 
 
 
124 aa  63.5  0.0000000008  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0378  Rhodanese domain protein  40 
 
 
284 aa  62.8  0.000000001  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.656719  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0130  rhodanese-like domain-containing protein  36.25 
 
 
124 aa  63.2  0.000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.0000130588  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0728  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  39.73 
 
 
566 aa  63.5  0.000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0715  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  39.73 
 
 
566 aa  63.5  0.000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1543  Rhodanese domain protein  40 
 
 
138 aa  63.2  0.000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.973949  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2261  rhodanese domain-containing protein  37.33 
 
 
279 aa  62  0.000000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2631  Rhodanese domain protein  40.79 
 
 
480 aa  62.4  0.000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2491  beta-lactamase-like  28.35 
 
 
455 aa  62  0.000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4320  rhodanese-like domain protein  33.71 
 
 
127 aa  61.6  0.000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0913  rhodanese-like domain protein  33.71 
 
 
127 aa  62  0.000000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.130078  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1937  rhodanese domain-containing protein  35.14 
 
 
269 aa  61.2  0.000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0286726  hitchhiker  0.00000000917613 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2849  beta-lactamase domain-containing protein  35.85 
 
 
480 aa  61.6  0.000000004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1807  Rhodanese domain protein  32.08 
 
 
264 aa  61.2  0.000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0253  Rhodanese domain protein  35 
 
 
265 aa  61.2  0.000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4064  rhodanese domain-containing protein  31.46 
 
 
127 aa  61.2  0.000000005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.585247  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1098  rhodanese-like domain-containing protein  35.44 
 
 
128 aa  60.8  0.000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.50034  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4186  sulphate transporter  34.21 
 
 
711 aa  60.8  0.000000006  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.680572  unclonable  0.000013918 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3438  rhodanese/sulfurtransferase-like protein  40.51 
 
 
123 aa  60.8  0.000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0176  nitrite and sulphite reductase 4Fe-4S region  31.37 
 
 
793 aa  60.5  0.000000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.9868  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2900  rhodanese domain-containing protein  31.46 
 
 
127 aa  60.5  0.000000007  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.423457  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0871  rhodanese domain-containing protein  30.17 
 
 
127 aa  60.5  0.000000008  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.436528  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4285  rhodanese-like domain-containing protein  35.53 
 
 
127 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4112  rhodanese-like domain-containing protein  35.53 
 
 
127 aa  59.7  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3953  rhodanese-related sulfurtransferase  35.53 
 
 
127 aa  59.7  0.00000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4797  beta-lactamase domain-containing protein  35.87 
 
 
356 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.303253  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3963  rhodanese-related sulfurtransferase  35.53 
 
 
127 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1707  Rhodanese domain protein  33.64 
 
 
472 aa  59.7  0.00000001  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.140865  normal  0.999922 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4432  rhodanese-like domain-containing protein  35.53 
 
 
127 aa  59.7  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4229  rhodanese-like domain protein  35.53 
 
 
127 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0893  sulphate transporter  31.03 
 
 
711 aa  59.7  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0524393 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4340  rhodanese-like domain protein  35.53 
 
 
127 aa  59.7  0.00000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1199  rhodanese domain-containing protein  36 
 
 
282 aa  59.7  0.00000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0177216  hitchhiker  0.00286909 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0153  coenzyme A disulfide reductase, putative  41.1 
 
 
565 aa  58.9  0.00000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1145  Rhodanese domain protein  29.5 
 
 
262 aa  59.3  0.00000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0709325  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0182  Beta-lactamase-like  35.87 
 
 
356 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.237116 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5389  beta-lactamase-like  35.87 
 
 
356 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5472  beta-lactamase domain-containing protein  35.87 
 
 
356 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.541734  normal  0.389446 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1475  rhodanese domain-containing protein  40.26 
 
 
119 aa  58.5  0.00000003  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0763814  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0429  uncharacterized NAD(FAD)-dependent dehydrogenase  36 
 
 
820 aa  58.5  0.00000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000601829  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1892  Rhodanese domain protein  33.67 
 
 
278 aa  58.5  0.00000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.474796  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2096  Rhodanese domain protein  30.84 
 
 
258 aa  58.5  0.00000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1837  rhodanese domain-containing protein  36.25 
 
 
150 aa  58.5  0.00000003  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2356  Rhodanese domain protein  32.58 
 
 
124 aa  58.5  0.00000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0174  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  36.71 
 
 
938 aa  58.2  0.00000004  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3313  beta-lactamase domain-containing protein  35.71 
 
 
356 aa  57.8  0.00000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.412228  normal  0.175146 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0218  Rhodanese domain protein  32.58 
 
 
124 aa  58.2  0.00000004  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2962  rhodanese domain-containing protein  38.16 
 
 
145 aa  57.8  0.00000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0469  rhodanese domain-containing protein  34.21 
 
 
272 aa  57.4  0.00000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.596122 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5355  beta-lactamase domain-containing protein  33.7 
 
 
356 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1592  rhodanese domain-containing protein  32.89 
 
 
128 aa  57.4  0.00000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0744252  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1761  rhodanese domain-containing protein  39.74 
 
 
119 aa  57.4  0.00000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.043359  normal  0.0113467 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1625  rhodanese domain-containing protein  32.89 
 
 
128 aa  57.4  0.00000007  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.535046  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0737  rhodanese domain-containing protein  29.32 
 
 
144 aa  57  0.00000008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.109302  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4814  beta-lactamase domain-containing protein  33.7 
 
 
356 aa  57  0.00000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.116566  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3847  Rhodanese domain protein  38.16 
 
 
129 aa  57  0.00000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.323646  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2090  Rhodanese domain protein  39.74 
 
 
137 aa  57  0.00000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.147548  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2696  rhodanese domain-containing protein  40.26 
 
 
119 aa  57  0.00000009  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1238  Rhodanese domain protein  32.86 
 
 
98 aa  56.2  0.0000001  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2338  beta-lactamase domain-containing protein  32.5 
 
 
478 aa  56.6  0.0000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.415527  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2188  rhodanese-like protein  43.59 
 
 
119 aa  56.6  0.0000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.845551  decreased coverage  0.00268823 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0535  Rhodanese domain protein  36.25 
 
 
141 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3523  hydroxyacylglutathione hydrolase  33.75 
 
 
478 aa  56.6  0.0000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11818  conserved hypothetical rhodanese-domain protein  33.33 
 
 
125 aa  56.2  0.0000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.799219  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3559  thioredoxin  35.9 
 
 
229 aa  56.6  0.0000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.254418 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3735  rhodanese domain-containing protein  34.34 
 
 
113 aa  56.2  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00254792 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0573  rhodanese-like protein  37.35 
 
 
109 aa  55.8  0.0000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.000000000146252  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00543  rhodanese domain protein  29.25 
 
 
141 aa  55.8  0.0000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6898  Rhodanese domain protein  30 
 
 
222 aa  55.5  0.0000002  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4180  putative rhodanese-related sulfurtransferase  35 
 
 
141 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2723  beta-lactamase domain protein  33.33 
 
 
476 aa  55.5  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.00124827  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1557  rhodanese domain-containing protein  34.18 
 
 
150 aa  55.8  0.0000002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.031347  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1212  rhodanese domain-containing protein  34.57 
 
 
146 aa  55.8  0.0000002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0258  Rhodanese domain protein  35.05 
 
 
124 aa  55.8  0.0000002  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2633  Rhodanese domain protein  38.67 
 
 
123 aa  55.1  0.0000003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.728751  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3931  Rhodanese domain protein  36.84 
 
 
129 aa  55.1  0.0000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0175301 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1732  hydroxyacylglutathione hydrolase  33.75 
 
 
478 aa  55.5  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00322507 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1816  rhodanese-like domain-containing protein  36.84 
 
 
120 aa  54.7  0.0000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.717844  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1642  rhodanese domain-containing protein  35.53 
 
 
103 aa  54.7  0.0000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2361  metallo-beta-lactamase/rhodanese-like domain-containing protein  33.75 
 
 
484 aa  54.7  0.0000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0105565  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2319  hydroxyacylglutathione hydrolase  33.75 
 
 
478 aa  54.7  0.0000004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.001105  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2277  hydroxyacylglutathione hydrolase  33.75 
 
 
478 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.95304  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_3085  rhodanese-like protein  31.17 
 
 
459 aa  54.7  0.0000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2538  metallo-beta-lactamase/rhodanese-like domain-containing protein  33.75 
 
 
484 aa  54.7  0.0000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.343645  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1406  rhodanese-like protein  34.58 
 
 
119 aa  54.7  0.0000004  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0700677  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1703  Rhodanese domain protein  37.5 
 
 
167 aa  54.7  0.0000004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000369251 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2552  metallo-beta-lactamase/rhodanese-like domain protein  33.75 
 
 
478 aa  54.7  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.08286e-25 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2224  rhodanese domain-containing protein  37.18 
 
 
199 aa  54.7  0.0000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.335069 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0406  rhodanese domain-containing protein  31.53 
 
 
278 aa  54.3  0.0000005  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.932253 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0918  Rhodanese domain-containing protein  33.75 
 
 
99 aa  53.9  0.0000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.112795 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>