More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC7_0262 on replicon NC_009637
Organism: Methanococcus maripaludis C7



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009637  MmarC7_0262  hypothetical protein  100 
 
 
334 aa  654    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  hitchhiker  0.00766044 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1639  hypothetical protein  89.82 
 
 
334 aa  603  9.999999999999999e-173  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0574  hypothetical protein  83.49 
 
 
321 aa  535  1e-151  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.877456  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1671  hypothetical protein  65.05 
 
 
334 aa  404  1e-111  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0245  hypothetical protein  46.22 
 
 
336 aa  319  3e-86  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0191  hypothetical protein  45.32 
 
 
336 aa  313  1.9999999999999998e-84  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0751  hypothetical protein  45.32 
 
 
336 aa  310  2.9999999999999997e-83  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1711  hypothetical protein  44.71 
 
 
336 aa  308  1.0000000000000001e-82  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.1929  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0445  hypothetical protein  38 
 
 
393 aa  256  3e-67  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  hitchhiker  0.000355219  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0372  hypothetical protein  24.62 
 
 
339 aa  118  9.999999999999999e-26  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2217  hypothetical protein  29.5 
 
 
351 aa  109  5e-23  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.253249  normal  0.0953517 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0560  protein of unknown function UPF0118  24.41 
 
 
339 aa  107  3e-22  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1154  hypothetical protein  27.64 
 
 
358 aa  107  4e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000550105  normal  0.0344505 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2944  hypothetical protein  28.12 
 
 
368 aa  105  1e-21  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.81591  decreased coverage  0.00297728 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3492  hypothetical protein  26.87 
 
 
387 aa  104  2e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.705437  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3717  hypothetical protein  25.55 
 
 
353 aa  103  4e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.396811  normal  0.610069 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2207  hypothetical protein  25.23 
 
 
354 aa  103  5e-21  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4026  hypothetical protein  26.19 
 
 
360 aa  101  2e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3531  hypothetical protein  25.23 
 
 
354 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.43917  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1830  hypothetical protein  24.92 
 
 
354 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1855  hypothetical protein  25.08 
 
 
354 aa  100  4e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0258165 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3210  hypothetical protein  24.29 
 
 
354 aa  97.8  2e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.212604 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2311  protein of unknown function UPF0118  27.62 
 
 
393 aa  98.2  2e-19  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2083  hypothetical protein  26.05 
 
 
356 aa  97.1  4e-19  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.84015  normal  0.251587 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3378  hypothetical protein  24.29 
 
 
354 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11000  hypothetical protein  25.32 
 
 
346 aa  94.7  2e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1326  hypothetical protein  24.31 
 
 
354 aa  94.7  2e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3980  hypothetical protein  25.79 
 
 
352 aa  94.7  2e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.0869717 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0987  hypothetical protein  24.53 
 
 
394 aa  94  3e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.89372 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4325  permease  27.22 
 
 
372 aa  93.6  4e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4337  permease  27.22 
 
 
372 aa  93.6  4e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4988  hypothetical protein  24.22 
 
 
347 aa  93.6  5e-18  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4490  hypothetical protein  26.95 
 
 
372 aa  93.2  6e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0811913  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2958  protein of unknown function UPF0118  24.62 
 
 
339 aa  92.8  8e-18  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4722  sporulation integral membrane protein YtvI  26.98 
 
 
372 aa  92.4  9e-18  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4711  sporulation integral membrane protein YtvI  26.95 
 
 
372 aa  92  1e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000506038 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4841  hypothetical protein  26.36 
 
 
365 aa  90.9  3e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4727  hypothetical protein  26.38 
 
 
365 aa  90.1  4e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3950  protein of unknown function UPF0118  23.82 
 
 
360 aa  90.5  4e-17  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0020  hypothetical protein  29.8 
 
 
358 aa  90.5  4e-17  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2709  hypothetical protein  28 
 
 
362 aa  89.4  8e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2289  hypothetical protein  24.4 
 
 
353 aa  88.6  1e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.864507  normal  0.333993 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0901  protein of unknown function UPF0118  24.13 
 
 
365 aa  89  1e-16  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0614  hypothetical protein  27.68 
 
 
358 aa  88.2  2e-16  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0854  membrane protein  27.14 
 
 
363 aa  87.4  3e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0563046  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1653  hypothetical protein  24.93 
 
 
362 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.212682  normal  0.81767 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2212  protein of unknown function UPF0118  24.71 
 
 
355 aa  87.4  3e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.000181482  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1300  protein of unknown function UPF0118  23.23 
 
 
345 aa  87.4  3e-16  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.316018  normal  0.608638 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0540  protein of unknown function UPF0118  25.53 
 
 
349 aa  87  4e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2416  protein of unknown function UPF0118  23.81 
 
 
378 aa  87  4e-16  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.25064  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1194  hypothetical protein  23.19 
 
 
396 aa  87  4e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2610  protein of unknown function UPF0118  25 
 
 
370 aa  86.7  5e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4706  sporulation integral membrane protein YtvI  26.56 
 
 
372 aa  86.7  6e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0531  sporulation integral membrane protein YtvI  26.56 
 
 
372 aa  86.3  7e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.671743 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2413  hypothetical protein  26.43 
 
 
345 aa  86.3  7e-16  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.480547  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2549  hypothetical protein  26.4 
 
 
352 aa  85.1  0.000000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.705186  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0292  hypothetical protein  25 
 
 
391 aa  85.9  0.000000000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3717  hypothetical protein  23.48 
 
 
350 aa  84.3  0.000000000000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0661403  normal  0.22421 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1821  hypothetical protein  23.28 
 
 
381 aa  85.1  0.000000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.693161 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2612  protein of unknown function UPF0118  23.87 
 
 
363 aa  84.7  0.000000000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.751344  normal  0.787744 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1907  protein of unknown function UPF0118  23.28 
 
 
352 aa  84.7  0.000000000000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.492921  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3708  hypothetical protein  23.77 
 
 
355 aa  84.7  0.000000000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.860776  normal  0.168874 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1226  hypothetical protein  29.94 
 
 
352 aa  84.7  0.000000000000002  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.974187 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2012  protein of unknown function UPF0118  28.8 
 
 
363 aa  84.7  0.000000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.578603 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_29820  hypothetical protein  26.1 
 
 
352 aa  84.3  0.000000000000002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0125581  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_4556  hypothetical protein  23.62 
 
 
398 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.173549  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5533  hypothetical protein  23.77 
 
 
355 aa  84  0.000000000000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3807  hypothetical protein  23.48 
 
 
353 aa  84.3  0.000000000000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.911463  normal  0.300572 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4931  hypothetical protein  28.02 
 
 
353 aa  83.2  0.000000000000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.850306  normal  0.602485 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0783  hypothetical protein  25.65 
 
 
353 aa  83.6  0.000000000000005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3280  sporulation integral membrane protein YtvI  23.51 
 
 
372 aa  83.2  0.000000000000006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2503  hypothetical protein  24.4 
 
 
352 aa  82.8  0.000000000000007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0253  hypothetical protein  24.4 
 
 
352 aa  82.8  0.000000000000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.077494  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2642  hypothetical protein  24.4 
 
 
352 aa  82.8  0.000000000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00776691  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1633  hypothetical protein  24.4 
 
 
352 aa  82.8  0.000000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0289  hypothetical protein  24.4 
 
 
352 aa  82.8  0.000000000000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.700262  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1436  hypothetical protein  24.4 
 
 
352 aa  82.8  0.000000000000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0937  PerM family permease  24.4 
 
 
374 aa  82.4  0.000000000000009  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0268  protein of unknown function UPF0118  26.38 
 
 
363 aa  82  0.00000000000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0940  protein of unknown function UPF0118  24.08 
 
 
345 aa  82  0.00000000000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.726387  normal  0.96935 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0529  hypothetical protein  26.43 
 
 
352 aa  82.4  0.00000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0916  protein of unknown function UPF0118  25.07 
 
 
355 aa  82  0.00000000000001  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  0.116301  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2425  hypothetical protein  25.97 
 
 
363 aa  81.6  0.00000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3249  hypothetical protein  31.18 
 
 
350 aa  81.3  0.00000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.691639  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4426  sporulation integral membrane protein YtvI  25.9 
 
 
372 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2229  hypothetical protein  25.5 
 
 
392 aa  80.9  0.00000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0792  protein of unknown function UPF0118  29.89 
 
 
344 aa  80.5  0.00000000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.101192 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0737  hypothetical protein  29.41 
 
 
356 aa  80.5  0.00000000000004  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.203827  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0488  hypothetical protein  23.88 
 
 
371 aa  80.5  0.00000000000004  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.131577  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2868  hypothetical protein  23.53 
 
 
358 aa  79.7  0.00000000000006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.838475  normal  0.0422213 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1578  protein of unknown function UPF0118  26.11 
 
 
373 aa  79.3  0.00000000000007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.373133  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2573  membrane protein  21.97 
 
 
361 aa  79.3  0.00000000000008  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0661  hypothetical protein  26.56 
 
 
351 aa  79.3  0.00000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0810  protein of unknown function UPF0118  26.56 
 
 
351 aa  79.3  0.00000000000009  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0338  hypothetical protein  24.56 
 
 
365 aa  79  0.0000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.88474  normal  0.474349 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2209  protein of unknown function UPF0118  24.86 
 
 
393 aa  77.8  0.0000000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0133966  normal  0.166807 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4931  hypothetical protein  23.96 
 
 
351 aa  77.8  0.0000000000003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2029  hypothetical protein  24.4 
 
 
348 aa  77.4  0.0000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.850073 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1971  hypothetical protein  28.79 
 
 
362 aa  77.8  0.0000000000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4053  hypothetical protein  30 
 
 
361 aa  77.4  0.0000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.920687 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>