More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MmarC6_1341 on replicon NC_009975
Organism: Methanococcus maripaludis C6



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009637  MmarC7_0577  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  93.75 
 
 
384 aa  722    Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.46258  normal  0.135048 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1341  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  100 
 
 
384 aa  784    Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0261  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  94.79 
 
 
384 aa  728    Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0643  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  71.09 
 
 
384 aa  588  1e-167  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1088  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  51.28 
 
 
427 aa  387  1e-106  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0490  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.74 
 
 
439 aa  119  7e-26  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0432917  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2329  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  27.75 
 
 
448 aa  105  2e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1205  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  24.6 
 
 
442 aa  100  6e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0635526  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15470  dihydrolipoamide dehydrogenase  27.41 
 
 
461 aa  83.6  0.000000000000005  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.33518  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1355  dihydrolipoamide dehydrogenase  22.79 
 
 
425 aa  83.2  0.000000000000008  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.297533  decreased coverage  0.00000000605303 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2801  dihydrolipoamide dehydrogenase  24.19 
 
 
459 aa  81.6  0.00000000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2575  dihydrolipoamide dehydrogenase  24.76 
 
 
459 aa  82  0.00000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0023205  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0365  dihydrolipoamide dehydrogenase  24.13 
 
 
458 aa  81.6  0.00000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2776  dihydrolipoamide dehydrogenase  24.04 
 
 
459 aa  82  0.00000000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0539747 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0643  NADPH-glutathione reductase  25.27 
 
 
459 aa  81.6  0.00000000000002  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1365  dihydrolipoamide dehydrogenase  25.67 
 
 
465 aa  80.5  0.00000000000005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0890108  normal  0.202546 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2536  dihydrolipoamide dehydrogenase  24.52 
 
 
459 aa  80.1  0.00000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0121  glutathione reductase  25.38 
 
 
451 aa  80.1  0.00000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0142  glutathione reductase  25.38 
 
 
451 aa  79.7  0.00000000000007  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3877  glutathione reductase  25.73 
 
 
451 aa  80.1  0.00000000000007  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3039  glutathione-disulfide reductase  27.13 
 
 
450 aa  79.7  0.00000000000009  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2635  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  22.4 
 
 
430 aa  79.7  0.00000000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1435  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerization region  25.3 
 
 
452 aa  78.2  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.125021 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4955  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  26.19 
 
 
452 aa  78.2  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.201124  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3447  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  26.85 
 
 
467 aa  78.2  0.0000000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0298342  normal  0.259477 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1811  dihydrolipoamide dehydrogenase  27.73 
 
 
465 aa  77.8  0.0000000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.352769 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4702  glutathione reductase  24.12 
 
 
451 aa  77.8  0.0000000000003  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2502  dihydrolipoamide dehydrogenase  23.87 
 
 
459 aa  77.4  0.0000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3938  glutathione reductase  24.12 
 
 
451 aa  77.4  0.0000000000004  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS2585  dihydrolipoamide dehydrogenase  23.87 
 
 
459 aa  77  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.295349  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2773  dihydrolipoamide dehydrogenase  23.87 
 
 
459 aa  77  0.0000000000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4054  glutathione reductase  24.12 
 
 
451 aa  77  0.0000000000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2822  dihydrolipoamide dehydrogenase  23.87 
 
 
459 aa  76.6  0.0000000000006  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0920611  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1482  glutathione reductase  23.05 
 
 
461 aa  76.6  0.0000000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.327802  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2511  dihydrolipoamide dehydrogenase  24.44 
 
 
459 aa  76.6  0.0000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.136342 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0084  glutathione reductase  24.86 
 
 
451 aa  76.6  0.0000000000007  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4513  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.38 
 
 
465 aa  76.3  0.0000000000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0173943  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3845  glutathione reductase  23.82 
 
 
451 aa  75.9  0.000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002978  WD0325  alpha keto acid dehydrogenase complex, E3 component, lipoamide dehydrogenase  27.12 
 
 
457 aa  74.7  0.000000000002  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5726  glutathione-disulfide reductase  26.07 
 
 
451 aa  75.1  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3592  glutathione reductase  25.36 
 
 
452 aa  75.1  0.000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1270  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.56 
 
 
459 aa  75.5  0.000000000002  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.211526  normal  0.789259 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2180  dihydrolipoamide dehydrogenase  26.89 
 
 
585 aa  75.1  0.000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000695519  hitchhiker  0.00000000000000384983 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1690  dihydrolipoamide dehydrogenase  24.27 
 
 
460 aa  74.3  0.000000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000000416898  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2992  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.39 
 
 
459 aa  74.3  0.000000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0509  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.86 
 
 
463 aa  74.3  0.000000000003  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.317708  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4395  glutathione reductase  23.55 
 
 
452 aa  74.3  0.000000000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1216  glutathione reductase  24.39 
 
 
448 aa  74.7  0.000000000003  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.286586  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4259  glutathione reductase  23.82 
 
 
452 aa  74.7  0.000000000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0463  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.03 
 
 
457 aa  74.3  0.000000000004  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0234  dihydrolipoamide dehydrogenase  25.3 
 
 
551 aa  73.9  0.000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0230  dihydrolipoamide dehydrogenase  26.82 
 
 
454 aa  73.6  0.000000000005  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.247688  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12727  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  27.19 
 
 
468 aa  73.9  0.000000000005  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0138  dihydrolipoamide dehydrogenase  25.53 
 
 
491 aa  73.6  0.000000000005  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0473  mercuric reductase  25.43 
 
 
507 aa  73.6  0.000000000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000001036 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2782  dihydrolipoamide dehydrogenase  23.08 
 
 
459 aa  73.6  0.000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4220  glutathione reductase  23.55 
 
 
452 aa  73.2  0.000000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1847  dihydrolipoamide dehydrogenase  27.44 
 
 
464 aa  73.2  0.000000000008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0478321  normal  0.511647 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0222  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  28.12 
 
 
473 aa  72.8  0.000000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.100657 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0532  dihydrolipoamide dehydrogenase  25.96 
 
 
449 aa  72.8  0.000000000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0112141  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3660  glutathione reductase  22.74 
 
 
451 aa  72.8  0.00000000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.150077  normal  0.767021 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2645  alpha keto acid dehydrogenase complex, E3 component, lipoamide dehydrogenase  28.5 
 
 
459 aa  72.4  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0617764  normal 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0427  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.11 
 
 
453 aa  72.4  0.00000000001  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.0240951  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4068  glutathione reductase  22.16 
 
 
451 aa  72.8  0.00000000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4961  mercuric reductase  23.81 
 
 
460 aa  72.4  0.00000000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.184484  normal  0.142844 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0608  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.3 
 
 
458 aa  72  0.00000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0802  alpha keto acid dehydrogenase complex, E3 component, lipoamide dehydrogenase  23.17 
 
 
449 aa  71.6  0.00000000002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5151  dihydrolipoamide dehydrogenase  23.56 
 
 
465 aa  71.6  0.00000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0369329  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0994  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.65 
 
 
459 aa  71.6  0.00000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  decreased coverage  0.000667663  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0570  glutathione reductase (NADPH)  24.34 
 
 
450 aa  71.6  0.00000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1223  glutathione reductase  25.45 
 
 
460 aa  72  0.00000000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2717  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase dimerization region  24.17 
 
 
472 aa  71.6  0.00000000002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2968  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.58 
 
 
468 aa  72  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.462781  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0546  dihydrolipoamide dehydrogenase  25.75 
 
 
449 aa  72  0.00000000002  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.614447  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0457  mercuric reductase  26.59 
 
 
507 aa  71.6  0.00000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1248  mercuric reductase  27.35 
 
 
460 aa  71.6  0.00000000002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0590144  normal  0.359043 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1614  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.05 
 
 
464 aa  72  0.00000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.0956162 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1086  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  27.27 
 
 
469 aa  72  0.00000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0903  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.19 
 
 
462 aa  72  0.00000000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0121  glutathione reductase  23.27 
 
 
451 aa  71.2  0.00000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.848122  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4780  glutathione-disulfide reductase  25.46 
 
 
466 aa  70.9  0.00000000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.325962  normal  0.417103 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1096  dihydrolipoamide dehydrogenase  27.91 
 
 
464 aa  70.9  0.00000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2512  mercuric reductase MerA  26.58 
 
 
479 aa  70.5  0.00000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.442864 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2327  acetoin dehydrogenase, E3 component, dihydrolipoamide dehydrogenase  27.3 
 
 
450 aa  70.1  0.00000000006  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3544  glutathione-disulfide reductase  23.05 
 
 
464 aa  70.1  0.00000000006  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.562382  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0992  dihydrolipoamide dehydrogenase  26.23 
 
 
468 aa  70.1  0.00000000006  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2064  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  22.53 
 
 
438 aa  70.1  0.00000000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.833302 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0242  putative mercuric reductase  27.03 
 
 
467 aa  70.1  0.00000000006  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02949  putative mercuric reductase  26.58 
 
 
503 aa  70.1  0.00000000007  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.187984  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6352  NADPH-glutathione reductase  22.56 
 
 
452 aa  69.7  0.00000000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3050  glutathione-disulfide reductase  21.34 
 
 
451 aa  70.1  0.00000000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1118  mercuric reductase  23.44 
 
 
516 aa  69.7  0.00000000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.583122  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3384  glutathione reductase  23.08 
 
 
461 aa  69.7  0.00000000008  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0477625 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2683  mercuric reductase MerA  26.64 
 
 
475 aa  69.7  0.00000000008  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.824433 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6317  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  27.95 
 
 
467 aa  69.7  0.00000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0419159  normal  0.418244 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0248  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase YkgC  26.73 
 
 
446 aa  69.7  0.00000000009  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0163606  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3185  mercuric reductase  27.37 
 
 
546 aa  69.3  0.00000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0611  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.5 
 
 
463 aa  68.9  0.0000000001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0512717  normal  0.622001 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2351  glutathione reductase  22.78 
 
 
452 aa  68.9  0.0000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.150308  normal  0.0125633 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2755  dihydrolipoamide dehydrogenase  25.81 
 
 
466 aa  68.9  0.0000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0982206  hitchhiker  0.000532855 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>