More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_3592 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009783  VIBHAR_00523  glutathione reductase  71.02 
 
 		 464 aa  662    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0121  glutathione reductase  80.71 
 
 		 451 aa  765    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001954  glutathione reductase  72.51 
 
 		 451 aa  669    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4702  glutathione reductase  85.59 
 
 		 451 aa  810    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3660  glutathione reductase  80.04 
 
 		 451 aa  763    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.150077  normal  0.767021 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3543  glutathione reductase  80.27 
 
 		 451 aa  763    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4259  glutathione reductase  86.95 
 
 		 452 aa  825    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4395  glutathione reductase  87.61 
 
 		 452 aa  830    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0142  glutathione reductase  80.71 
 
 		 451 aa  766    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0120  glutathione reductase  70.51 
 
 		 451 aa  671    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4220  glutathione reductase  87.39 
 
 		 452 aa  826    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3592  glutathione reductase  100 
 
 		 452 aa  932    Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0121  glutathione reductase  86.92 
 
 		 451 aa  822    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.848122  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4068  glutathione reductase  80.93 
 
 		 451 aa  767    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4206  glutathione-disulfide reductase  69.35 
 
 		 449 aa  635    Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.486383  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4054  glutathione reductase  85.81 
 
 		 451 aa  810    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3845  glutathione reductase  85.37 
 
 		 451 aa  808    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3938  glutathione reductase  86.03 
 
 		 451 aa  812    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3877  glutathione reductase  86.25 
 
 		 451 aa  823    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2568  glutathione reductase  70.73 
 
 		 451 aa  659    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0084  glutathione reductase  86.92 
 
 		 451 aa  822    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0114  glutathione reductase  68.29 
 
 		 450 aa  629  1e-179  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4049  glutathione reductase  67.85 
 
 		 450 aa  625  1e-178  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4084  glutathione reductase  68.29 
 
 		 450 aa  627  1e-178  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.451157 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3911  glutathione reductase  67.85 
 
 		 450 aa  622  1e-177  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.239209  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3791  glutathione reductase  67.85 
 
 		 450 aa  621  1e-177  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.020575  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3869  glutathione reductase  67.85 
 
 		 450 aa  621  1e-177  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3972  glutathione reductase  67.85 
 
 		 450 aa  622  1e-177  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3803  glutathione reductase  67.85 
 
 		 450 aa  621  1e-177  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03349  glutathione reductase  66.96 
 
 		 450 aa  616  1e-175  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.470564  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0215  glutathione-disulfide reductase  66.74 
 
 		 450 aa  615  1e-175  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3789  glutathione reductase  67.18 
 
 		 450 aa  617  1e-175  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.459077 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4847  glutathione reductase  66.96 
 
 		 450 aa  616  1e-175  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  0.652539 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3913  glutathione reductase  67.85 
 
 		 450 aa  616  1e-175  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3700  glutathione reductase  66.96 
 
 		 450 aa  617  1e-175  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4714  glutathione reductase  66.52 
 
 		 450 aa  617  1e-175  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3982  glutathione reductase  66.96 
 
 		 450 aa  616  1e-175  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03302  hypothetical protein  66.96 
 
 		 450 aa  616  1e-175  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.60445  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0216  glutathione reductase  66.96 
 
 		 450 aa  617  1e-175  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.96555 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0013  glutathione reductase  66.74 
 
 		 450 aa  614  9.999999999999999e-175  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.607831  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4471  glutathione reductase  66.74 
 
 		 450 aa  612  9.999999999999999e-175  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.108339  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4186  glutathione reductase  66.96 
 
 		 450 aa  614  9.999999999999999e-175  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3822  glutathione reductase  66.74 
 
 		 450 aa  614  9.999999999999999e-175  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0014  glutathione reductase  66.08 
 
 		 450 aa  608  1e-173  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03497  glutathione reductase  65.47 
 
 		 449 aa  601  1.0000000000000001e-171  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1106  glutathione reductase  63.82 
 
 		 456 aa  597  1e-169  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0507  glutathione-disulfide reductase  65.55 
 
 		 452 aa  593  1e-168  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.243892  normal  0.086285 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6145  glutathione-disulfide reductase  64.37 
 
 		 449 aa  593  1e-168  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6438  glutathione-disulfide reductase  64.59 
 
 		 449 aa  594  1e-168  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.515437 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2004  glutathione reductase  60.98 
 
 		 451 aa  573  1.0000000000000001e-162  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0977143 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1693  glutathione reductase  62.75 
 
 		 451 aa  570  1e-161  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1966  glutathione reductase  62.53 
 
 		 451 aa  570  1e-161  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0447  glutathione reductase  62.08 
 
 		 450 aa  568  1e-161  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.026364  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2356  glutathione-disulfide reductase  61.25 
 
 		 465 aa  557  1e-157  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4984  glutathione reductase  61.62 
 
 		 454 aa  545  1e-154  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1375  glutathione reductase  53.88 
 
 		 449 aa  498  1e-140  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.013918  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2534  NADPH-glutathione reductase  54.97 
 
 		 451 aa  498  1e-139  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.23107 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2516  glutathione-disulfide reductase  55.01 
 
 		 446 aa  483  1e-135  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0127  glutathione-disulfide reductase  51.21 
 
 		 448 aa  451  1e-125  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0630  glutathione reductase  49.45 
 
 		 452 aa  443  1e-123  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0536  glutathione-disulfide reductase  51.99 
 
 		 449 aa  442  1e-123  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00586443  unclonable  0.0000000000392976 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0366  glutathione reductase  51.99 
 
 		 449 aa  442  1e-123  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.736055  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0614  glutathione reductase  49.22 
 
 		 452 aa  441  9.999999999999999e-123  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0140  glutathione reductase  48.79 
 
 		 456 aa  435  1e-120  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2396  glutathione-disulfide reductase  49.78 
 
 		 453 aa  434  1e-120  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_35819  glutathione reductase  50 
 
 		 496 aa  422  1e-117  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE01560  glutathione-disulfide reductase, putative  49.15 
 
 		 479 aa  416  9.999999999999999e-116  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2174  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerization region  45.66 
 
 		 457 aa  389  1e-107  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3819  glutathione reductase  45.01 
 
 		 451 aa  378  1e-104  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.218299  normal  0.718715 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3535  glutathione reductase  45.45 
 
 		 451 aa  379  1e-104  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0669246 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3188  glutathione reductase  45.9 
 
 		 451 aa  380  1e-104  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00932  hypothetical glutathione reductase (Eurofung)  47.76 
 
 		 557 aa  377  1e-103  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  0.0509896 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2351  glutathione reductase  43.46 
 
 		 452 aa  377  1e-103  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.150308  normal  0.0125633 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1950  glutathione reductase  44.79 
 
 		 451 aa  374  1e-102  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.447652  normal  0.37845 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38330  glutathione reductase  45.01 
 
 		 451 aa  375  1e-102  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0328915 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4254  glutathione reductase  43.08 
 
 		 466 aa  370  1e-101  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3263  glutathione reductase  44.57 
 
 		 451 aa  371  1e-101  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.383038  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25010  glutathione reductase  44.79 
 
 		 452 aa  366  1e-100  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2928  glutathione reductase  44.79 
 
 		 452 aa  366  1e-100  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00793619  normal  1 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_42900  glutathione reductase  44.65 
 
 		 489 aa  366  1e-100  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.113846 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_49167  glutathione-disulfide reductase  46.07 
 
 		 507 aa  363  4e-99  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3112  glutathione reductase  43.68 
 
 		 452 aa  358  9.999999999999999e-98  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.091737  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2979  glutathione reductase  42.79 
 
 		 452 aa  355  1e-96  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0361278  normal  0.327486 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2883  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  45.78 
 
 		 452 aa  353  4e-96  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4955  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  41.46 
 
 		 452 aa  340  2e-92  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.201124  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0414  glutathione reductase  41.41 
 
 		 450 aa  335  1e-90  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.263005  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0404  glutathione reductase  41.41 
 
 		 450 aa  335  1e-90  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5726  glutathione-disulfide reductase  41.69 
 
 		 451 aa  331  2e-89  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0643  NADPH-glutathione reductase  39.69 
 
 		 459 aa  328  1.0000000000000001e-88  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2124  NADPH-glutathione reductase  38.62 
 
 		 459 aa  326  4.0000000000000003e-88  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.575049  normal  0.929555 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1851  glutathione reductase  41.69 
 
 		 449 aa  327  4.0000000000000003e-88  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.893411 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3039  glutathione-disulfide reductase  40.22 
 
 		 450 aa  324  2e-87  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3544  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  41.37 
 
 		 455 aa  323  4e-87  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0272  glutathione-disulfide reductase  39.78 
 
 		 453 aa  319  7.999999999999999e-86  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4332  glutathione reductase  39.12 
 
 		 451 aa  318  9e-86  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3000  glutathione-disulfide reductase  38.8 
 
 		 451 aa  318  1e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.637847  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1216  glutathione reductase  38.31 
 
 		 448 aa  317  2e-85  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.286586  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0682  NADPH-glutathione reductase  37.72 
 
 		 459 aa  317  3e-85  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0286379  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2301  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  41.45 
 
 		 466 aa  317  3e-85  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0108496  hitchhiker  0.00487639 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2576  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  41.23 
 
 		 461 aa  316  5e-85  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.135925  normal  0.213625 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>