More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Daci_2356 on replicon NC_010002
Organism: Delftia acidovorans SPH-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_03349  glutathione reductase  73.88 
 
 
450 aa  699    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.470564  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0215  glutathione-disulfide reductase  73.66 
 
 
450 aa  697    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0114  glutathione reductase  73.21 
 
 
450 aa  692    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03302  hypothetical protein  73.88 
 
 
450 aa  699    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.60445  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0216  glutathione reductase  74.11 
 
 
450 aa  700    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.96555 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3803  glutathione reductase  73.66 
 
 
450 aa  700    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0013  glutathione reductase  76.12 
 
 
450 aa  710    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.607831  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4084  glutathione reductase  73.21 
 
 
450 aa  691    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.451157 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3911  glutathione reductase  73.88 
 
 
450 aa  701    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.239209  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4049  glutathione reductase  72.99 
 
 
450 aa  689    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3791  glutathione reductase  73.88 
 
 
450 aa  701    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.020575  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3822  glutathione reductase  73.66 
 
 
450 aa  697    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3869  glutathione reductase  73.88 
 
 
450 aa  701    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4714  glutathione reductase  70.76 
 
 
450 aa  677    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3982  glutathione reductase  73.88 
 
 
450 aa  699    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3700  glutathione reductase  74.11 
 
 
450 aa  700    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4847  glutathione reductase  74.33 
 
 
450 aa  702    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.652539 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4471  glutathione reductase  74.11 
 
 
450 aa  698    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.108339  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3789  glutathione reductase  74.33 
 
 
450 aa  703    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.459077 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3913  glutathione reductase  72.54 
 
 
450 aa  686    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2356  glutathione-disulfide reductase  100 
 
 
465 aa  951    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3972  glutathione reductase  73.88 
 
 
450 aa  701    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0014  glutathione reductase  75.22 
 
 
450 aa  707    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6145  glutathione-disulfide reductase  72.83 
 
 
449 aa  684    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4186  glutathione reductase  73.88 
 
 
450 aa  697    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6438  glutathione-disulfide reductase  73.5 
 
 
449 aa  684    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.515437 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0142  glutathione reductase  63.7 
 
 
451 aa  618  1e-176  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3543  glutathione reductase  64.59 
 
 
451 aa  612  9.999999999999999e-175  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3660  glutathione reductase  63.7 
 
 
451 aa  611  1e-173  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.150077  normal  0.767021 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3845  glutathione reductase  63.47 
 
 
451 aa  609  1e-173  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4054  glutathione reductase  63.25 
 
 
451 aa  606  9.999999999999999e-173  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4395  glutathione reductase  63.7 
 
 
452 aa  605  9.999999999999999e-173  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0121  glutathione reductase  63.03 
 
 
451 aa  606  9.999999999999999e-173  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3938  glutathione reductase  63.25 
 
 
451 aa  606  9.999999999999999e-173  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4220  glutathione reductase  63.7 
 
 
452 aa  604  1.0000000000000001e-171  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2568  glutathione reductase  64.96 
 
 
451 aa  602  1.0000000000000001e-171  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0084  glutathione reductase  63.25 
 
 
451 aa  603  1.0000000000000001e-171  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0121  glutathione reductase  63.7 
 
 
451 aa  603  1.0000000000000001e-171  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.848122  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1106  glutathione reductase  64.32 
 
 
456 aa  603  1.0000000000000001e-171  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4259  glutathione reductase  63.25 
 
 
452 aa  602  1.0000000000000001e-171  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4702  glutathione reductase  62.58 
 
 
451 aa  601  1e-170  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4068  glutathione reductase  62.81 
 
 
451 aa  598  1e-170  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00523  glutathione reductase  64.65 
 
 
464 aa  598  1e-170  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001954  glutathione reductase  65.4 
 
 
451 aa  601  1e-170  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2004  glutathione reductase  63.25 
 
 
451 aa  595  1e-169  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0977143 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0120  glutathione reductase  63.62 
 
 
451 aa  597  1e-169  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3877  glutathione reductase  60.58 
 
 
451 aa  583  1.0000000000000001e-165  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3592  glutathione reductase  61.25 
 
 
452 aa  578  1e-164  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1693  glutathione reductase  61.47 
 
 
451 aa  577  1.0000000000000001e-163  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03497  glutathione reductase  61.16 
 
 
449 aa  573  1.0000000000000001e-162  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1966  glutathione reductase  60.58 
 
 
451 aa  573  1.0000000000000001e-162  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4206  glutathione-disulfide reductase  62.58 
 
 
449 aa  574  1.0000000000000001e-162  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.486383  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0507  glutathione-disulfide reductase  60.45 
 
 
452 aa  544  1e-153  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.243892  normal  0.086285 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0447  glutathione reductase  59.02 
 
 
450 aa  541  9.999999999999999e-153  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.026364  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4984  glutathione reductase  59.38 
 
 
454 aa  534  1e-150  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2516  glutathione-disulfide reductase  59.69 
 
 
446 aa  527  1e-148  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1375  glutathione reductase  54.02 
 
 
449 aa  509  1e-143  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.013918  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2534  NADPH-glutathione reductase  57.94 
 
 
451 aa  511  1e-143  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.23107 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0127  glutathione-disulfide reductase  55.46 
 
 
448 aa  491  1e-137  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0630  glutathione reductase  50.44 
 
 
452 aa  465  9.999999999999999e-131  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0614  glutathione reductase  50.22 
 
 
452 aa  462  1e-129  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE01560  glutathione-disulfide reductase, putative  51.39 
 
 
479 aa  455  1e-127  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0366  glutathione reductase  54.79 
 
 
449 aa  452  1.0000000000000001e-126  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.736055  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0536  glutathione-disulfide reductase  54.79 
 
 
449 aa  452  1.0000000000000001e-126  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00586443  unclonable  0.0000000000392976 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2396  glutathione-disulfide reductase  52.55 
 
 
453 aa  434  1e-120  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00932  hypothetical glutathione reductase (Eurofung)  50.64 
 
 
557 aa  426  1e-118  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0509896 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2174  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerization region  48.88 
 
 
457 aa  427  1e-118  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0140  glutathione reductase  47.99 
 
 
456 aa  427  1e-118  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_35819  glutathione reductase  48.48 
 
 
496 aa  407  1.0000000000000001e-112  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2883  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  50.66 
 
 
452 aa  401  9.999999999999999e-111  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_42900  glutathione reductase  43.66 
 
 
489 aa  378  1e-103  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.113846 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3819  glutathione reductase  44.84 
 
 
451 aa  369  1e-101  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.218299  normal  0.718715 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3188  glutathione reductase  45.74 
 
 
451 aa  372  1e-101  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3535  glutathione reductase  45.29 
 
 
451 aa  368  1e-100  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0669246 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4332  glutathione reductase  41.11 
 
 
451 aa  365  1e-100  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_49167  glutathione-disulfide reductase  47.23 
 
 
507 aa  367  1e-100  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1950  glutathione reductase  45.07 
 
 
451 aa  368  1e-100  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.447652  normal  0.37845 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2351  glutathione reductase  44.62 
 
 
452 aa  363  4e-99  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.150308  normal  0.0125633 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25010  glutathione reductase  46.41 
 
 
452 aa  363  4e-99  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38330  glutathione reductase  45.07 
 
 
451 aa  361  1e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0328915 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4254  glutathione reductase  42.83 
 
 
466 aa  358  9.999999999999999e-98  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3263  glutathione reductase  44.62 
 
 
451 aa  358  9.999999999999999e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.383038  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0414  glutathione reductase  42.22 
 
 
450 aa  357  1.9999999999999998e-97  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.263005  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0404  glutathione reductase  42.22 
 
 
450 aa  357  1.9999999999999998e-97  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3000  glutathione-disulfide reductase  44.39 
 
 
451 aa  353  2e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.637847  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2928  glutathione reductase  44.62 
 
 
452 aa  353  5e-96  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00793619  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4955  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  44.52 
 
 
452 aa  349  6e-95  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.201124  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5726  glutathione-disulfide reductase  43.24 
 
 
451 aa  347  2e-94  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3039  glutathione-disulfide reductase  41.11 
 
 
450 aa  344  2e-93  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6352  NADPH-glutathione reductase  42.83 
 
 
452 aa  342  1e-92  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3030  glutathione-disulfide reductase  43.27 
 
 
453 aa  341  2e-92  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.944241  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3362  glutathione-disulfide reductase  43.27 
 
 
453 aa  341  2e-92  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0303  glutathione-disulfide reductase  43.27 
 
 
453 aa  341  2e-92  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0498  glutathione-disulfide reductase  43.27 
 
 
453 aa  341  2e-92  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2222  glutathione-disulfide reductase  43.27 
 
 
453 aa  341  2e-92  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.363669  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2063  glutathione-disulfide reductase  43.27 
 
 
453 aa  341  2e-92  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1851  glutathione reductase  42.83 
 
 
449 aa  340  2.9999999999999998e-92  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.893411 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0317  glutathione-disulfide reductase  43.05 
 
 
453 aa  339  7e-92  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2124  NADPH-glutathione reductase  41.46 
 
 
459 aa  338  9e-92  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.575049  normal  0.929555 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0842  glutathione reductase  41.8 
 
 
446 aa  338  9.999999999999999e-92  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.118007 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>