More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PsycPRwf_2004 on replicon NC_009524
Organism: Psychrobacter sp. PRwf-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_03349  glutathione reductase  70.95 
 
 
450 aa  657    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.470564  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0215  glutathione-disulfide reductase  70.95 
 
 
450 aa  657    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0014  glutathione reductase  72.28 
 
 
450 aa  665    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2004  glutathione reductase  100 
 
 
451 aa  931    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0977143 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3913  glutathione reductase  71.4 
 
 
450 aa  656    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4186  glutathione reductase  72.28 
 
 
450 aa  670    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3869  glutathione reductase  71.84 
 
 
450 aa  665    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3982  glutathione reductase  70.95 
 
 
450 aa  657    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3700  glutathione reductase  71.18 
 
 
450 aa  658    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1693  glutathione reductase  82.04 
 
 
451 aa  759    Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3791  glutathione reductase  71.62 
 
 
450 aa  664    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.020575  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0114  glutathione reductase  72.06 
 
 
450 aa  661    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3972  glutathione reductase  71.84 
 
 
450 aa  664    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3789  glutathione reductase  71.18 
 
 
450 aa  658    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.459077 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0216  glutathione reductase  71.18 
 
 
450 aa  658    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.96555 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00523  glutathione reductase  70.89 
 
 
464 aa  643    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4471  glutathione reductase  71.84 
 
 
450 aa  666    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.108339  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4084  glutathione reductase  72.06 
 
 
450 aa  660    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.451157 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4714  glutathione reductase  71.62 
 
 
450 aa  659    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0013  glutathione reductase  71.18 
 
 
450 aa  663    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.607831  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4847  glutathione reductase  71.18 
 
 
450 aa  657    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.652539 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3803  glutathione reductase  71.62 
 
 
450 aa  664    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4049  glutathione reductase  71.84 
 
 
450 aa  659    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3822  glutathione reductase  70.73 
 
 
450 aa  655    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1966  glutathione reductase  81.6 
 
 
451 aa  751    Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2568  glutathione reductase  70.73 
 
 
451 aa  644    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3911  glutathione reductase  71.84 
 
 
450 aa  664    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.239209  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001954  glutathione reductase  71.18 
 
 
451 aa  647    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03302  hypothetical protein  70.95 
 
 
450 aa  657    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.60445  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1106  glutathione reductase  75.44 
 
 
456 aa  688    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0120  glutathione reductase  68.74 
 
 
451 aa  630  1e-179  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3543  glutathione reductase  65.85 
 
 
451 aa  625  1e-178  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3660  glutathione reductase  64.97 
 
 
451 aa  622  1e-177  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.150077  normal  0.767021 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4395  glutathione reductase  64.75 
 
 
452 aa  620  1e-176  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4220  glutathione reductase  64.97 
 
 
452 aa  620  1e-176  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4259  glutathione reductase  64.08 
 
 
452 aa  615  1e-175  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0121  glutathione reductase  64.52 
 
 
451 aa  617  1e-175  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.848122  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3845  glutathione reductase  63.64 
 
 
451 aa  616  1e-175  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4054  glutathione reductase  63.19 
 
 
451 aa  611  9.999999999999999e-175  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0084  glutathione reductase  63.41 
 
 
451 aa  611  9.999999999999999e-175  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3938  glutathione reductase  63.19 
 
 
451 aa  612  9.999999999999999e-175  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4702  glutathione reductase  62.97 
 
 
451 aa  608  1e-173  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3877  glutathione reductase  62.53 
 
 
451 aa  611  1e-173  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0121  glutathione reductase  62.53 
 
 
451 aa  604  9.999999999999999e-173  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0142  glutathione reductase  62.75 
 
 
451 aa  605  9.999999999999999e-173  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4068  glutathione reductase  62.08 
 
 
451 aa  602  1.0000000000000001e-171  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2356  glutathione-disulfide reductase  63.25 
 
 
465 aa  596  1e-169  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6145  glutathione-disulfide reductase  63.25 
 
 
449 aa  592  1e-168  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3592  glutathione reductase  60.98 
 
 
452 aa  594  1e-168  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03497  glutathione reductase  64.21 
 
 
449 aa  585  1e-166  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6438  glutathione-disulfide reductase  62.58 
 
 
449 aa  586  1e-166  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.515437 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4206  glutathione-disulfide reductase  62.78 
 
 
449 aa  571  1.0000000000000001e-162  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.486383  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0447  glutathione reductase  62.53 
 
 
450 aa  560  1e-158  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.026364  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4984  glutathione reductase  62.06 
 
 
454 aa  553  1e-156  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0507  glutathione-disulfide reductase  62.78 
 
 
452 aa  554  1e-156  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.243892  normal  0.086285 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1375  glutathione reductase  59.2 
 
 
449 aa  534  1e-150  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.013918  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2534  NADPH-glutathione reductase  54.99 
 
 
451 aa  513  1e-144  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.23107 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0127  glutathione-disulfide reductase  54.42 
 
 
448 aa  511  1e-143  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2516  glutathione-disulfide reductase  53.78 
 
 
446 aa  496  1e-139  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0140  glutathione reductase  51.21 
 
 
456 aa  478  1e-134  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0630  glutathione reductase  50.33 
 
 
452 aa  447  1.0000000000000001e-124  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0614  glutathione reductase  50.33 
 
 
452 aa  448  1.0000000000000001e-124  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0366  glutathione reductase  51.77 
 
 
449 aa  444  1e-123  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.736055  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2396  glutathione-disulfide reductase  49.12 
 
 
453 aa  443  1e-123  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0536  glutathione-disulfide reductase  51.77 
 
 
449 aa  444  1e-123  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00586443  unclonable  0.0000000000392976 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2174  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerization region  48.55 
 
 
457 aa  430  1e-119  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_35819  glutathione reductase  49.02 
 
 
496 aa  422  1e-117  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE01560  glutathione-disulfide reductase, putative  51.82 
 
 
479 aa  424  1e-117  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2351  glutathione reductase  42.79 
 
 
452 aa  375  1e-103  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.150308  normal  0.0125633 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2883  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  43.52 
 
 
452 aa  369  1e-101  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3819  glutathione reductase  42.79 
 
 
451 aa  365  1e-100  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.218299  normal  0.718715 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3188  glutathione reductase  43.24 
 
 
451 aa  368  1e-100  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_49167  glutathione-disulfide reductase  46.28 
 
 
507 aa  364  1e-99  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1950  glutathione reductase  42.79 
 
 
451 aa  364  2e-99  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.447652  normal  0.37845 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00932  hypothetical glutathione reductase (Eurofung)  45.86 
 
 
557 aa  363  3e-99  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0509896 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3535  glutathione reductase  42.57 
 
 
451 aa  362  6e-99  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0669246 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38330  glutathione reductase  42.35 
 
 
451 aa  361  2e-98  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0328915 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_42900  glutathione reductase  44.19 
 
 
489 aa  358  8e-98  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.113846 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4254  glutathione reductase  42.73 
 
 
466 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2928  glutathione reductase  43.46 
 
 
452 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00793619  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3263  glutathione reductase  41.91 
 
 
451 aa  358  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.383038  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1851  glutathione reductase  43.46 
 
 
449 aa  355  1e-96  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.893411 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25010  glutathione reductase  41.91 
 
 
452 aa  350  2e-95  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1857  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  43.36 
 
 
466 aa  347  3e-94  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0473556  normal  0.430164 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0842  glutathione reductase  41.11 
 
 
446 aa  343  4e-93  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.118007 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4747  glutathione reductase  42.7 
 
 
447 aa  342  8e-93  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0404  glutathione reductase  41.85 
 
 
450 aa  340  2.9999999999999998e-92  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0414  glutathione reductase  41.85 
 
 
450 aa  340  2.9999999999999998e-92  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.263005  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3362  glutathione-disulfide reductase  40.13 
 
 
453 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2222  glutathione-disulfide reductase  40.13 
 
 
453 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.363669  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0498  glutathione-disulfide reductase  40.13 
 
 
453 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0272  glutathione-disulfide reductase  40.35 
 
 
453 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2063  glutathione-disulfide reductase  40.13 
 
 
453 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0303  glutathione-disulfide reductase  40.13 
 
 
453 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3030  glutathione-disulfide reductase  40.13 
 
 
453 aa  337  1.9999999999999998e-91  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.944241  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0317  glutathione-disulfide reductase  40.13 
 
 
453 aa  337  2.9999999999999997e-91  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2244  glutathione reductase  40.48 
 
 
458 aa  335  1e-90  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3000  glutathione-disulfide reductase  39.02 
 
 
451 aa  330  3e-89  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.637847  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0643  NADPH-glutathione reductase  39.65 
 
 
459 aa  330  3e-89  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1608  glutathione reductase  40.22 
 
 
452 aa  330  4e-89  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.128494  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>