More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_1851 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_1851  glutathione reductase  100 
 
 		 449 aa  920    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.893411 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2351  glutathione reductase  59.07 
 
 		 452 aa  537  1e-151  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.150308  normal  0.0125633 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1608  glutathione reductase  56.47 
 
 		 452 aa  528  1e-149  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.128494  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4254  glutathione reductase  57.33 
 
 		 466 aa  521  1e-147  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2928  glutathione reductase  57.74 
 
 		 452 aa  508  1e-143  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00793619  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3819  glutathione reductase  58.67 
 
 		 451 aa  505  9.999999999999999e-143  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.218299  normal  0.718715 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3535  glutathione reductase  58.44 
 
 		 451 aa  501  1e-141  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0669246 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3263  glutathione reductase  58.31 
 
 		 451 aa  503  1e-141  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.383038  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1950  glutathione reductase  58.44 
 
 		 451 aa  502  1e-141  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.447652  normal  0.37845 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2363  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  53.88 
 
 		 457 aa  502  1e-141  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.651152  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3188  glutathione reductase  58 
 
 		 451 aa  502  1e-141  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38330  glutathione reductase  58.31 
 
 		 451 aa  504  1e-141  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0328915 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3112  glutathione reductase  56.76 
 
 		 452 aa  497  1e-139  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.091737  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1875  NADPH-glutathione reductase  57.14 
 
 		 454 aa  495  1e-139  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.105853  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2979  glutathione reductase  56.42 
 
 		 452 aa  493  9.999999999999999e-139  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0361278  normal  0.327486 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2124  NADPH-glutathione reductase  52.8 
 
 		 459 aa  492  9.999999999999999e-139  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.575049  normal  0.929555 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3544  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  57.65 
 
 		 455 aa  488  1e-137  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1359  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  54.67 
 
 		 453 aa  490  1e-137  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.485419  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0643  NADPH-glutathione reductase  53.29 
 
 		 459 aa  484  1e-135  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25010  glutathione reductase  54.65 
 
 		 452 aa  478  1e-134  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1095  glutathione-disulfide reductase  54.26 
 
 		 460 aa  473  1e-132  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.223789  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6352  NADPH-glutathione reductase  52.89 
 
 		 452 aa  473  1e-132  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4955  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  53.9 
 
 		 452 aa  469  1.0000000000000001e-131  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.201124  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2222  glutathione-disulfide reductase  53.59 
 
 		 453 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.363669  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0317  glutathione-disulfide reductase  53.59 
 
 		 453 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3362  glutathione-disulfide reductase  53.59 
 
 		 453 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0498  glutathione-disulfide reductase  53.59 
 
 		 453 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0303  glutathione-disulfide reductase  53.59 
 
 		 453 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2063  glutathione-disulfide reductase  53.59 
 
 		 453 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3030  glutathione-disulfide reductase  53.59 
 
 		 453 aa  467  9.999999999999999e-131  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.944241  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3006  glutathione-disulfide reductase  51.89 
 
 		 451 aa  464  1e-129  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3000  glutathione-disulfide reductase  51.45 
 
 		 451 aa  461  1e-129  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.637847  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2915  glutathione-disulfide reductase  52.34 
 
 		 451 aa  463  1e-129  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2392  glutathione reductase  51.89 
 
 		 451 aa  464  1e-129  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3025  glutathione-disulfide reductase  51.45 
 
 		 451 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3050  glutathione-disulfide reductase  52.12 
 
 		 451 aa  459  9.999999999999999e-129  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0272  glutathione-disulfide reductase  52.47 
 
 		 453 aa  456  1e-127  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1485  NADPH-glutathione reductase  51.79 
 
 		 449 aa  452  1.0000000000000001e-126  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5726  glutathione-disulfide reductase  50.45 
 
 		 451 aa  451  1e-125  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1216  glutathione reductase  50.79 
 
 		 448 aa  449  1e-125  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.286586  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0682  NADPH-glutathione reductase  48.77 
 
 		 459 aa  435  1e-120  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0286379  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3384  glutathione reductase  50.56 
 
 		 461 aa  434  1e-120  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0477625 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1810  NADPH-glutathione reductase  49.78 
 
 		 453 aa  432  1e-120  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.251452  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2094  glutathione reductase  48.78 
 
 		 464 aa  427  1e-118  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3039  glutathione-disulfide reductase  49.56 
 
 		 450 aa  423  1e-117  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2057  glutathione reductase  48.78 
 
 		 461 aa  421  1e-117  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.23782 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2722  NADPH-glutathione reductase  50.56 
 
 		 448 aa  420  1e-116  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.256149  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1012  glutathione reductase  47.66 
 
 		 464 aa  419  1e-116  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.853309  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1981  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  49.22 
 
 		 461 aa  420  1e-116  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1482  glutathione reductase  49.67 
 
 		 461 aa  420  1e-116  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.327802  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0978  glutathione reductase  47.66 
 
 		 464 aa  418  1e-116  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.200707  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2301  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  48.67 
 
 		 466 aa  415  9.999999999999999e-116  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0108496  hitchhiker  0.00487639 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1223  glutathione reductase  49.55 
 
 		 460 aa  418  9.999999999999999e-116  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_24082  glutathione reductase  49.78 
 
 		 519 aa  416  9.999999999999999e-116  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3544  glutathione-disulfide reductase  48.56 
 
 		 464 aa  417  9.999999999999999e-116  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.562382  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2196  glutathione-disulfide reductase  50.33 
 
 		 461 aa  414  1e-114  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2576  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  48.44 
 
 		 461 aa  413  1e-114  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.135925  normal  0.213625 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0884  glutathione-disulfide reductase  48.12 
 
 		 452 aa  415  1e-114  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.508454 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2085  glutathione reductase  47.11 
 
 		 462 aa  413  1e-114  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0404  glutathione reductase  48.01 
 
 		 450 aa  410  1e-113  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2244  glutathione reductase  47.49 
 
 		 458 aa  410  1e-113  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4780  glutathione-disulfide reductase  49.44 
 
 		 466 aa  410  1e-113  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.325962  normal  0.417103 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1461  glutathione reductase  47.43 
 
 		 460 aa  410  1e-113  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2257  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  48.22 
 
 		 466 aa  410  1e-113  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0633588  normal  0.450823 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0414  glutathione reductase  48.01 
 
 		 450 aa  410  1e-113  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.263005  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0434  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  48.03 
 
 		 466 aa  406  1.0000000000000001e-112  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.531083  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0358  NADPH-glutathione reductase  47.23 
 
 		 452 aa  407  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3485  NADPH-glutathione reductase  48.21 
 
 		 461 aa  407  1.0000000000000001e-112  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.749861  normal  0.666668 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2002  glutathione-disulfide reductase  47.01 
 
 		 452 aa  406  1.0000000000000001e-112  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2009  glutathione reductase  48.89 
 
 		 461 aa  408  1.0000000000000001e-112  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2696  glutathione-disulfide reductase  48.11 
 
 		 460 aa  404  1e-111  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.719185  normal  0.0349203 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2228  glutathione reductase  48.67 
 
 		 461 aa  402  1e-111  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.941122  normal  0.773983 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4747  glutathione reductase  47.32 
 
 		 447 aa  404  1e-111  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2078  glutathione reductase  48.11 
 
 		 461 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.16044 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0973  NADPH-glutathione reductase  46.98 
 
 		 462 aa  400  9.999999999999999e-111  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.116342  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3289  glutathione reductase  44.96 
 
 		 459 aa  396  1e-109  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4666  glutathione-disulfide reductase  46.89 
 
 		 466 aa  397  1e-109  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4332  glutathione reductase  44.47 
 
 		 451 aa  396  1e-109  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0122  glutathione-disulfide reductase  48.22 
 
 		 474 aa  398  1e-109  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3224  glutathione-disulfide reductase  47.88 
 
 		 455 aa  394  1e-108  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.354787  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0881  glutathione-disulfide reductase  48.77 
 
 		 470 aa  389  1e-107  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.449296  normal  0.121667 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0842  glutathione reductase  46.53 
 
 		 446 aa  391  1e-107  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.118007 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1571  glutathione reductase  47.56 
 
 		 463 aa  389  1e-107  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.483199  normal  0.747799 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1957  NADPH-glutathione reductase  46.89 
 
 		 451 aa  389  1e-107  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.168279 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2737  glutathione reductase  46.36 
 
 		 483 aa  386  1e-106  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.482914  normal  0.0373517 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3669  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  47.02 
 
 		 466 aa  378  1e-103  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.369147  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2516  glutathione-disulfide reductase  45.27 
 
 		 446 aa  374  1e-102  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3174  NADPH-glutathione reductase  42.59 
 
 		 484 aa  372  1e-102  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4186  glutathione reductase  46.67 
 
 		 450 aa  363  2e-99  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0604  glutathione reductase  43.02 
 
 		 461 aa  362  1e-98  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.633864  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4084  glutathione reductase  47.56 
 
 		 450 aa  360  3e-98  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.451157 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0114  glutathione reductase  47.56 
 
 		 450 aa  360  3e-98  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4049  glutathione reductase  47.33 
 
 		 450 aa  359  6e-98  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4714  glutathione reductase  47.11 
 
 		 450 aa  358  9.999999999999999e-98  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0215  glutathione-disulfide reductase  46.44 
 
 		 450 aa  357  2.9999999999999997e-97  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3700  glutathione reductase  46.44 
 
 		 450 aa  356  3.9999999999999996e-97  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3789  glutathione reductase  46.44 
 
 		 450 aa  356  3.9999999999999996e-97  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.459077 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0216  glutathione reductase  46.44 
 
 		 450 aa  356  3.9999999999999996e-97  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.96555 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03302  hypothetical protein  46.44 
 
 		 450 aa  356  3.9999999999999996e-97  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.60445  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3982  glutathione reductase  46.44 
 
 		 450 aa  356  3.9999999999999996e-97  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>