More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_0013 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
CP001509  ECD_03349  glutathione reductase  84.22 
 
 
450 aa  778    Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.470564  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0215  glutathione-disulfide reductase  84 
 
 
450 aa  777    Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4049  glutathione reductase  86.44 
 
 
450 aa  788    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0120  glutathione reductase  70.73 
 
 
451 aa  655    Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00523  glutathione reductase  72 
 
 
464 aa  659    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3803  glutathione reductase  84.22 
 
 
450 aa  781    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4702  glutathione reductase  69.4 
 
 
451 aa  661    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3791  glutathione reductase  84.22 
 
 
450 aa  781    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.020575  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4084  glutathione reductase  86.22 
 
 
450 aa  787    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.451157 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4220  glutathione reductase  70.29 
 
 
452 aa  665    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4259  glutathione reductase  69.62 
 
 
452 aa  662    Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0013  glutathione reductase  100 
 
 
450 aa  930    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.607831  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0084  glutathione reductase  69.84 
 
 
451 aa  660    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4471  glutathione reductase  88.89 
 
 
450 aa  816    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.108339  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4068  glutathione reductase  68.07 
 
 
451 aa  646    Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2356  glutathione-disulfide reductase  76.12 
 
 
465 aa  708    Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001954  glutathione reductase  72.51 
 
 
451 aa  661    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4714  glutathione reductase  84.89 
 
 
450 aa  781    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0014  glutathione reductase  92.22 
 
 
450 aa  836    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6145  glutathione-disulfide reductase  74.78 
 
 
449 aa  697    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4395  glutathione reductase  70.29 
 
 
452 aa  665    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3822  glutathione reductase  84 
 
 
450 aa  776    Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4054  glutathione reductase  69.84 
 
 
451 aa  666    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0114  glutathione reductase  86.44 
 
 
450 aa  789    Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3660  glutathione reductase  67.85 
 
 
451 aa  645    Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.150077  normal  0.767021 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0121  glutathione reductase  67.41 
 
 
451 aa  639    Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3972  glutathione reductase  84.44 
 
 
450 aa  781    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3789  glutathione reductase  84.67 
 
 
450 aa  782    Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.459077 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03302  hypothetical protein  84.22 
 
 
450 aa  778    Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.60445  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3700  glutathione reductase  84.44 
 
 
450 aa  780    Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0216  glutathione reductase  84.44 
 
 
450 aa  780    Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.96555 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3869  glutathione reductase  84.67 
 
 
450 aa  783    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4847  glutathione reductase  84.67 
 
 
450 aa  781    Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.652539 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2004  glutathione reductase  71.18 
 
 
451 aa  662    Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0977143 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0121  glutathione reductase  69.84 
 
 
451 aa  662    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.848122  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3913  glutathione reductase  84.22 
 
 
450 aa  776    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3982  glutathione reductase  84.22 
 
 
450 aa  778    Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1106  glutathione reductase  73.25 
 
 
456 aa  677    Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4186  glutathione reductase  89.33 
 
 
450 aa  819    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3845  glutathione reductase  70.07 
 
 
451 aa  669    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3938  glutathione reductase  69.84 
 
 
451 aa  665    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3543  glutathione reductase  68.07 
 
 
451 aa  656    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3877  glutathione reductase  67.41 
 
 
451 aa  649    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0142  glutathione reductase  67.85 
 
 
451 aa  649    Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3911  glutathione reductase  84.44 
 
 
450 aa  781    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.239209  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2568  glutathione reductase  74.06 
 
 
451 aa  675    Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6438  glutathione-disulfide reductase  74.55 
 
 
449 aa  694    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.515437 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3592  glutathione reductase  66.74 
 
 
452 aa  632  1e-180  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1693  glutathione reductase  69.62 
 
 
451 aa  629  1e-179  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4206  glutathione-disulfide reductase  69.21 
 
 
449 aa  627  1e-178  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.486383  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1966  glutathione reductase  68.74 
 
 
451 aa  620  1e-176  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4984  glutathione reductase  67.69 
 
 
454 aa  601  1.0000000000000001e-171  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03497  glutathione reductase  65.47 
 
 
449 aa  597  1e-169  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0507  glutathione-disulfide reductase  65.39 
 
 
452 aa  586  1e-166  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.243892  normal  0.086285 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0447  glutathione reductase  62.22 
 
 
450 aa  563  1.0000000000000001e-159  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.026364  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2516  glutathione-disulfide reductase  60.94 
 
 
446 aa  548  1e-155  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2534  NADPH-glutathione reductase  60.22 
 
 
451 aa  547  1e-154  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.23107 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0127  glutathione-disulfide reductase  57.27 
 
 
448 aa  533  1e-150  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1375  glutathione reductase  54.22 
 
 
449 aa  514  1e-144  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.013918  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0140  glutathione reductase  52.43 
 
 
456 aa  478  1e-134  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0536  glutathione-disulfide reductase  54.77 
 
 
449 aa  465  9.999999999999999e-131  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00586443  unclonable  0.0000000000392976 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0630  glutathione reductase  50.89 
 
 
452 aa  465  9.999999999999999e-131  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0366  glutathione reductase  54.77 
 
 
449 aa  465  9.999999999999999e-131  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.736055  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0614  glutathione reductase  50.89 
 
 
452 aa  464  1e-129  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE01560  glutathione-disulfide reductase, putative  53.86 
 
 
479 aa  464  1e-129  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2396  glutathione-disulfide reductase  53.08 
 
 
453 aa  460  9.999999999999999e-129  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2174  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerization region  49.44 
 
 
457 aa  436  1e-121  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011676  PHATRDRAFT_35819  glutathione reductase  50.11 
 
 
496 aa  416  9.999999999999999e-116  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00932  hypothetical glutathione reductase (Eurofung)  50 
 
 
557 aa  409  1e-113  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.0509896 
 
 
-
 
NC_009043  PICST_42900  glutathione reductase  46.47 
 
 
489 aa  394  1e-108  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.113846 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2883  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  48.49 
 
 
452 aa  389  1e-107  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2351  glutathione reductase  44.89 
 
 
452 aa  380  1e-104  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.150308  normal  0.0125633 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3188  glutathione reductase  45.56 
 
 
451 aa  380  1e-104  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3819  glutathione reductase  44.89 
 
 
451 aa  377  1e-103  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.218299  normal  0.718715 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1950  glutathione reductase  45.11 
 
 
451 aa  378  1e-103  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.447652  normal  0.37845 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25010  glutathione reductase  46 
 
 
452 aa  375  1e-103  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3535  glutathione reductase  45.11 
 
 
451 aa  378  1e-103  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0669246 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38330  glutathione reductase  45.11 
 
 
451 aa  374  1e-102  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0328915 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3263  glutathione reductase  45.33 
 
 
451 aa  375  1e-102  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.383038  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4254  glutathione reductase  44.17 
 
 
466 aa  374  1e-102  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1851  glutathione reductase  46.44 
 
 
449 aa  371  1e-101  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.893411 
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_49167  glutathione-disulfide reductase  47.06 
 
 
507 aa  369  1e-101  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2928  glutathione reductase  45.11 
 
 
452 aa  363  3e-99  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00793619  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4332  glutathione reductase  41.89 
 
 
451 aa  363  4e-99  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0842  glutathione reductase  43.43 
 
 
446 aa  359  5e-98  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.118007 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5726  glutathione-disulfide reductase  44.69 
 
 
451 aa  355  1e-96  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0404  glutathione reductase  42.16 
 
 
450 aa  354  2e-96  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0414  glutathione reductase  42.16 
 
 
450 aa  354  2e-96  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.263005  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3112  glutathione reductase  42.89 
 
 
452 aa  351  2e-95  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.091737  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2244  glutathione reductase  42.95 
 
 
458 aa  350  4e-95  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0303  glutathione-disulfide reductase  42.89 
 
 
453 aa  349  7e-95  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2063  glutathione-disulfide reductase  42.89 
 
 
453 aa  349  7e-95  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3362  glutathione-disulfide reductase  42.89 
 
 
453 aa  349  7e-95  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0498  glutathione-disulfide reductase  42.89 
 
 
453 aa  349  7e-95  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2222  glutathione-disulfide reductase  42.89 
 
 
453 aa  349  7e-95  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.363669  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3030  glutathione-disulfide reductase  42.89 
 
 
453 aa  349  7e-95  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.944241  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2979  glutathione reductase  42 
 
 
452 aa  347  2e-94  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0361278  normal  0.327486 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0317  glutathione-disulfide reductase  42.67 
 
 
453 aa  347  3e-94  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1875  NADPH-glutathione reductase  44.32 
 
 
454 aa  346  4e-94  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.105853  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0272  glutathione-disulfide reductase  42.89 
 
 
453 aa  346  5e-94  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>