More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Maeo_1088 on replicon NC_009635
Organism: Methanococcus aeolicus Nankai-3



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009635  Maeo_1088  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  100 
 
 
427 aa  851    Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1341  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  51.28 
 
 
384 aa  387  1e-106  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0577  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  52.56 
 
 
384 aa  380  1e-104  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.46258  normal  0.135048 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0643  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  48.97 
 
 
384 aa  369  1e-101  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0261  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  52.31 
 
 
384 aa  370  1e-101  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2329  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  26.68 
 
 
448 aa  132  1.0000000000000001e-29  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0490  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  24.89 
 
 
439 aa  125  1e-27  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0432917  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1205  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  25.84 
 
 
442 aa  125  2e-27  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0635526  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2635  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  24.82 
 
 
430 aa  112  9e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1355  dihydrolipoamide dehydrogenase  25.12 
 
 
425 aa  112  1.0000000000000001e-23  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.297533  decreased coverage  0.00000000605303 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0365  dihydrolipoamide dehydrogenase  25.92 
 
 
458 aa  92.4  1e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0608  dihydrolipoamide dehydrogenase  25.26 
 
 
458 aa  92  2e-17  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2776  dihydrolipoamide dehydrogenase  25.97 
 
 
459 aa  91.7  2e-17  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0539747 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2801  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.38 
 
 
459 aa  91.3  3e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2575  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.14 
 
 
459 aa  91.3  3e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0023205  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2585  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.73 
 
 
459 aa  90.9  4e-17  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.295349  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2502  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.73 
 
 
459 aa  90.9  4e-17  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2773  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.73 
 
 
459 aa  90.9  4e-17  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2822  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.73 
 
 
459 aa  90.9  4e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0920611  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2536  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.36 
 
 
459 aa  89.7  9e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0881  acetoin dehydrogenase, thymine PPi dependent, E3 component, dihydrolipoamide dehydrogenase  27.45 
 
 
585 aa  87.4  4e-16  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02575  regulatory protein  26.17 
 
 
455 aa  87  6e-16  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2782  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.41 
 
 
459 aa  86.7  7e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2180  dihydrolipoamide dehydrogenase  25.77 
 
 
585 aa  86.3  0.000000000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.000695519  hitchhiker  0.00000000000000384983 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1945  dihydrolipoamide dehydrogenase  23.55 
 
 
470 aa  85.1  0.000000000000002  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.605056  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1033  acetoin/pyruvate dehydrogenase complex, E3 component, dihydrolipoamide dehydrogenase  26.77 
 
 
584 aa  85.1  0.000000000000002  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.394953  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1851  glutathione reductase  23.33 
 
 
449 aa  84.7  0.000000000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.893411 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2511  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.09 
 
 
459 aa  84.3  0.000000000000004  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.136342 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1456  dihydrolipoamide dehydrogenase  25.79 
 
 
463 aa  83.2  0.000000000000008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0222  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  23.81 
 
 
473 aa  83.2  0.000000000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.100657 
 
 
-
 
NC_002978  WD0325  alpha keto acid dehydrogenase complex, E3 component, lipoamide dehydrogenase  30.09 
 
 
457 aa  82.4  0.00000000000001  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2095  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  25.27 
 
 
446 aa  81.6  0.00000000000002  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1079  2-oxoisovalerate dehydrogenase, E3 component, lipoamide dehydrogenase  23.48 
 
 
473 aa  82  0.00000000000002  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0264  dihydrolipoamide dehydrogenase  23.79 
 
 
473 aa  81.6  0.00000000000002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3160  mercuric reductase  26.98 
 
 
745 aa  80.9  0.00000000000004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0234  dihydrolipoamide dehydrogenase  25.86 
 
 
551 aa  80.9  0.00000000000004  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0230  dihydrolipoamide dehydrogenase  25.45 
 
 
454 aa  80.9  0.00000000000004  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.247688  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0846  dihydrolipoamide dehydrogenase  24.1 
 
 
465 aa  80.5  0.00000000000005  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_24082  glutathione reductase  24.07 
 
 
519 aa  80.5  0.00000000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12727  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  29.35 
 
 
468 aa  80.1  0.00000000000006  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0643  NADPH-glutathione reductase  24.09 
 
 
459 aa  79.3  0.0000000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1402  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.1 
 
 
443 aa  79  0.0000000000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0133365 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1365  dihydrolipoamide dehydrogenase  22.97 
 
 
465 aa  78.6  0.0000000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0890108  normal  0.202546 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1178  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.78 
 
 
468 aa  78.6  0.0000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  unclonable  0.00000305556  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0843  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  25.31 
 
 
472 aa  79  0.0000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1363  dihydrolipoamide dehydrogenase  24.87 
 
 
448 aa  79  0.0000000000002  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2064  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  24.38 
 
 
438 aa  79  0.0000000000002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.833302 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1156  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.78 
 
 
468 aa  78.6  0.0000000000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.00928669  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3544  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  23.72 
 
 
455 aa  78.6  0.0000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0683  dihydrolipoamide dehydrogenase  27.8 
 
 
468 aa  77.8  0.0000000000003  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0138  dihydrolipoamide dehydrogenase  24.2 
 
 
491 aa  77.8  0.0000000000003  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0570  glutathione reductase (NADPH)  25.39 
 
 
450 aa  78.2  0.0000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0839  dihydrolipoamide dehydrogenase  25.47 
 
 
451 aa  77.4  0.0000000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1270  dihydrolipoamide dehydrogenase  27.83 
 
 
459 aa  77.4  0.0000000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.211526  normal  0.789259 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2512  mercuric reductase MerA  28.44 
 
 
479 aa  77.8  0.0000000000004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.442864 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1128  dihydrolipoamide dehydrogenase  26.13 
 
 
470 aa  77.4  0.0000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.025111 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0797  mercuric reductase  26.82 
 
 
767 aa  77  0.0000000000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1237  dihydrolipoamide dehydrogenase  25.79 
 
 
465 aa  77  0.0000000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.319499  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2683  mercuric reductase MerA  24.52 
 
 
475 aa  77  0.0000000000006  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.824433 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1978  hypothetical protein  23.5 
 
 
462 aa  77  0.0000000000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0026  dihydrolipoamide dehydrogenase  27.14 
 
 
563 aa  77  0.0000000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000184744  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06311  glutathione reductase (NADPH)  27.94 
 
 
454 aa  77  0.0000000000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3769  dihydrolipoamide dehydrogenase  27.14 
 
 
562 aa  76.6  0.0000000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2903  mercuric reductase  26.38 
 
 
767 aa  76.6  0.0000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0992  dihydrolipoamide dehydrogenase  25.68 
 
 
468 aa  76.6  0.0000000000008  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1690  dihydrolipoamide dehydrogenase  24.55 
 
 
460 aa  76.3  0.0000000000009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0000000416898  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15470  dihydrolipoamide dehydrogenase  24.72 
 
 
461 aa  76.3  0.0000000000009  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.33518  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2645  alpha keto acid dehydrogenase complex, E3 component, lipoamide dehydrogenase  26.07 
 
 
459 aa  76.3  0.0000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0617764  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06231  glutathione reductase (NADPH)  27.22 
 
 
454 aa  76.3  0.0000000000009  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5831  mercuric reductase  22.01 
 
 
455 aa  76.3  0.0000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.194109  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01787  mercuric reductase (Hg(II) reductase)  26.19 
 
 
717 aa  75.9  0.000000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2630  mercuric reductase  24.23 
 
 
466 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.641804 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0703  dihydrolipoamide dehydrogenase  24.46 
 
 
454 aa  75.9  0.000000000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1810  NADPH-glutathione reductase  23.13 
 
 
453 aa  75.9  0.000000000001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.251452  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2883  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  21.94 
 
 
452 aa  75.9  0.000000000001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2057  glutathione reductase  23.4 
 
 
461 aa  75.9  0.000000000001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.23782 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0825  dihydrolipoamide dehydrogenase  26.14 
 
 
446 aa  75.9  0.000000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0472213  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0947  glutathione reductase  25.37 
 
 
446 aa  76.3  0.000000000001  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.666417  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3485  NADPH-glutathione reductase  30.32 
 
 
461 aa  75.5  0.000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.749861  normal  0.666668 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4388  dihydrolipoamide dehydrogenase  23.9 
 
 
465 aa  75.1  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1847  dihydrolipoamide dehydrogenase  24.31 
 
 
464 aa  75.1  0.000000000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0478321  normal  0.511647 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0509  dihydrolipoamide dehydrogenase  26.46 
 
 
463 aa  75.5  0.000000000002  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.317708  n/a   
 
 
-
 
NC_012854  Rleg_6500  dihydrolipoamide dehydrogenase  24.63 
 
 
465 aa  75.5  0.000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.264998  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6317  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  29.17 
 
 
467 aa  74.7  0.000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0419159  normal  0.418244 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3883  soluble pyridine nucleotide transhydrogenase  26.97 
 
 
470 aa  74.3  0.000000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.616657  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3142  mercuric reductase  22.56 
 
 
459 aa  74.7  0.000000000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1439  dihydrolipoamide dehydrogenase  23.42 
 
 
469 aa  74.7  0.000000000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3204  mercuric reductase  22.56 
 
 
459 aa  74.7  0.000000000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.337711 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3154  mercuric reductase  22.56 
 
 
459 aa  74.7  0.000000000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0072  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  22.87 
 
 
451 aa  74.7  0.000000000003  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.201849  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3984  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.06 
 
 
470 aa  73.9  0.000000000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3880  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.06 
 
 
470 aa  73.9  0.000000000004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4955  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  27.01 
 
 
452 aa  73.9  0.000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.201124  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4760  dihydrolipoamide dehydrogenase  22.93 
 
 
462 aa  74.3  0.000000000004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4181  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.06 
 
 
470 aa  73.9  0.000000000004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.321449  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2363  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  28.31 
 
 
457 aa  74.3  0.000000000004  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.651152  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2419  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  19.95 
 
 
458 aa  74.3  0.000000000004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.103015  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2775  dihydrolipoamide dehydrogenase  25.62 
 
 
452 aa  74.3  0.000000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.373811  normal  0.869545 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4676  dihydrolipoamide dehydrogenase  24.36 
 
 
462 aa  73.9  0.000000000004  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5726  glutathione-disulfide reductase  25.14 
 
 
451 aa  73.9  0.000000000005  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>