More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CA2559_02575 on replicon NC_014230
Organism: Croceibacter atlanticus HTCC2559



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014230  CA2559_02575  regulatory protein  100 
 
 		 455 aa  942    Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1435  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerization region  41.98 
 
 		 452 aa  369  1e-101  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.125021 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0796  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  38.63 
 
 		 448 aa  330  3e-89  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.608159 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2904  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  36.5 
 
 		 448 aa  322  9.999999999999999e-87  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1648  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  36.78 
 
 		 450 aa  296  4e-79  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0570  glutathione reductase (NADPH)  35.96 
 
 		 450 aa  296  5e-79  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0358  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  37.89 
 
 		 456 aa  296  8e-79  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.208353  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1336  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  34.73 
 
 		 448 aa  293  6e-78  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.579467 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1885  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  36.12 
 
 		 449 aa  290  4e-77  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.927345  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0666  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  36.57 
 
 		 452 aa  288  1e-76  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1019  glutathione reductase  35.19 
 
 		 443 aa  271  1e-71  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3561  glutathione reductase (NADPH)  33.41 
 
 		 450 aa  269  8.999999999999999e-71  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.445732 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3786  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  31.78 
 
 		 449 aa  268  1e-70  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0912  glutathione reductase  34.83 
 
 		 435 aa  244  1.9999999999999999e-63  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0947  glutathione reductase  33.86 
 
 		 446 aa  244  1.9999999999999999e-63  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.666417  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2195  alpha keto acid dehydrogenase complex, E3 component, lipoamide dehydrogenase, putative  31.08 
 
 		 447 aa  216  8e-55  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1191  glutathione reductase  31.79 
 
 		 446 aa  214  2.9999999999999995e-54  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0806  glutathione reductase  31.45 
 
 		 443 aa  211  2e-53  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1411  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.04 
 
 		 441 aa  211  3e-53  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5726  glutathione-disulfide reductase  28.32 
 
 		 451 aa  208  2e-52  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3039  glutathione-disulfide reductase  28.48 
 
 		 450 aa  192  9e-48  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2722  NADPH-glutathione reductase  29.17 
 
 		 448 aa  191  2e-47  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.256149  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1981  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  29.82 
 
 		 461 aa  187  2e-46  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1216  glutathione reductase  28.09 
 
 		 448 aa  188  2e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.286586  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4332  glutathione reductase  27.47 
 
 		 451 aa  188  2e-46  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1095  glutathione-disulfide reductase  28.82 
 
 		 460 aa  186  8e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.223789  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0973  NADPH-glutathione reductase  28.51 
 
 		 462 aa  185  1.0000000000000001e-45  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.116342  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1608  glutathione reductase  29.91 
 
 		 452 aa  184  2.0000000000000003e-45  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.128494  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2057  glutathione reductase  29.28 
 
 		 461 aa  184  4.0000000000000006e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.23782 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1810  NADPH-glutathione reductase  27.53 
 
 		 453 aa  182  7e-45  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.251452  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0404  glutathione reductase  28.38 
 
 		 450 aa  182  1e-44  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2351  glutathione reductase  27.46 
 
 		 452 aa  182  1e-44  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.150308  normal  0.0125633 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0414  glutathione reductase  28.38 
 
 		 450 aa  182  1e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.263005  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4955  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  26.77 
 
 		 452 aa  181  2e-44  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.201124  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4254  glutathione reductase  27.72 
 
 		 466 aa  179  5.999999999999999e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2363  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  28.32 
 
 		 457 aa  180  5.999999999999999e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.651152  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0643  NADPH-glutathione reductase  27.15 
 
 		 459 aa  179  7e-44  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3544  glutathione-disulfide reductase  28.72 
 
 		 464 aa  178  2e-43  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.562382  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06311  glutathione reductase (NADPH)  29.09 
 
 		 454 aa  177  3e-43  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4533  mercuric reductase  29.96 
 
 		 546 aa  177  5e-43  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2575  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.6 
 
 		 459 aa  177  5e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.0023205  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0230  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.09 
 
 		 454 aa  176  6e-43  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.247688  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3384  glutathione reductase  28.19 
 
 		 461 aa  176  7e-43  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0477625 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03497  glutathione reductase  30.48 
 
 		 449 aa  175  9.999999999999999e-43  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0434  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  28.38 
 
 		 466 aa  175  9.999999999999999e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.531083  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2516  glutathione-disulfide reductase  28.09 
 
 		 446 aa  175  1.9999999999999998e-42  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2352  dihydrolipoamide dehydrogenase  31.12 
 
 		 467 aa  175  1.9999999999999998e-42  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.357235  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2502  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.29 
 
 		 459 aa  174  2.9999999999999996e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1359  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  27.11 
 
 		 453 aa  174  2.9999999999999996e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.485419  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1254  mercuric reductase  30.22 
 
 		 546 aa  174  3.9999999999999995e-42  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3819  glutathione reductase  28.26 
 
 		 451 aa  173  5e-42  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.218299  normal  0.718715 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2801  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.29 
 
 		 459 aa  172  7.999999999999999e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2536  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.67 
 
 		 459 aa  172  1e-41  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1805  dihydrolipoamide dehydrogenase  27.73 
 
 		 616 aa  172  1e-41  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2196  glutathione-disulfide reductase  28.19 
 
 		 461 aa  172  1e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2585  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.2 
 
 		 459 aa  172  2e-41  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.295349  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0962  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.4 
 
 		 462 aa  171  2e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1950  glutathione reductase  28.04 
 
 		 451 aa  171  2e-41  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.447652  normal  0.37845 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2773  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.2 
 
 		 459 aa  172  2e-41  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0842  glutathione reductase  27.97 
 
 		 446 aa  171  2e-41  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.118007 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2782  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.48 
 
 		 459 aa  172  2e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3535  glutathione reductase  28.04 
 
 		 451 aa  172  2e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0669246 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2023  mercuric reductase  29.69 
 
 		 546 aa  171  3e-41  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3188  glutathione reductase  27.83 
 
 		 451 aa  171  3e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1485  NADPH-glutathione reductase  27.54 
 
 		 449 aa  171  3e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2992  dihydrolipoamide dehydrogenase  27.37 
 
 		 459 aa  171  3e-41  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2622  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.5 
 
 		 462 aa  170  5e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1851  glutathione reductase  26.77 
 
 		 449 aa  170  6e-41  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.893411 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0040  glutathione reductase  31.2 
 
 		 443 aa  170  6e-41  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0074  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.82 
 
 		 462 aa  169  7e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.490103  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2244  glutathione reductase  27.02 
 
 		 458 aa  169  8e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4961  mercuric reductase  27.45 
 
 		 460 aa  169  8e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.184484  normal  0.142844 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2936  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.9 
 
 		 468 aa  169  9e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3385  putative mercuric reductase protein  27.35 
 
 		 477 aa  169  9e-41  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.329574  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2776  dihydrolipoamide dehydrogenase  27.33 
 
 		 459 aa  169  1e-40  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.0539747 
 
 
-
 
NC_006369  lpl0614  glutathione reductase  28.7 
 
 		 452 aa  168  1e-40  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2534  NADPH-glutathione reductase  27.72 
 
 		 451 aa  169  1e-40  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.23107 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3485  NADPH-glutathione reductase  29.42 
 
 		 461 aa  168  2e-40  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.749861  normal  0.666668 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0683  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.41 
 
 		 468 aa  168  2e-40  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0630  glutathione reductase  28.48 
 
 		 452 aa  168  2e-40  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0265  mycothione reductase  28.72 
 
 		 468 aa  168  2e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0608  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.78 
 
 		 458 aa  168  2e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0682  NADPH-glutathione reductase  27.53 
 
 		 459 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0286379  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2511  dihydrolipoamide dehydrogenase  27.85 
 
 		 459 aa  167  2.9999999999999998e-40  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  0.136342 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0884  glutathione-disulfide reductase  28.76 
 
 		 452 aa  167  2.9999999999999998e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.508454 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4747  glutathione reductase  27.16 
 
 		 447 aa  167  2.9999999999999998e-40  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3435  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase:pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region:FAD dependent oxidoreductase  26.75 
 
 		 463 aa  167  4e-40  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2822  dihydrolipoamide dehydrogenase  27.19 
 
 		 459 aa  167  4e-40  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0920611  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25010  glutathione reductase  25.49 
 
 		 452 aa  167  5e-40  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3050  glutathione-disulfide reductase  26.86 
 
 		 451 aa  166  5e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4702  glutathione reductase  27.19 
 
 		 451 aa  166  6.9999999999999995e-40  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2002  glutathione-disulfide reductase  28.33 
 
 		 452 aa  166  6.9999999999999995e-40  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3362  glutathione-disulfide reductase  27.8 
 
 		 453 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3030  glutathione-disulfide reductase  27.8 
 
 		 453 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.944241  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0498  glutathione-disulfide reductase  27.8 
 
 		 453 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0303  glutathione-disulfide reductase  27.8 
 
 		 453 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2222  glutathione-disulfide reductase  27.8 
 
 		 453 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.363669  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2063  glutathione-disulfide reductase  27.8 
 
 		 453 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1543  dihydrolipoamide dehydrogenase  27.51 
 
 		 470 aa  166  6.9999999999999995e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.593732  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2915  glutathione-disulfide reductase  26.86 
 
 		 451 aa  166  6.9999999999999995e-40  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>