More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dret_1336 on replicon NC_013223
Organism: Desulfohalobium retbaense DSM 5692



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013223  Dret_1336  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  100 
 
 
448 aa  913    Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.579467 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1885  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  50.9 
 
 
449 aa  445  1.0000000000000001e-124  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.927345  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0358  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  45.01 
 
 
456 aa  370  1e-101  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.208353  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1435  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerization region  42.34 
 
 
452 aa  368  1e-101  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.125021 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1648  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  43.46 
 
 
450 aa  353  2e-96  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2904  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  41.96 
 
 
448 aa  354  2e-96  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0666  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  43.78 
 
 
452 aa  354  2e-96  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0796  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  40.98 
 
 
448 aa  339  7e-92  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.608159 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0570  glutathione reductase (NADPH)  38.11 
 
 
450 aa  336  5e-91  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3786  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  37.86 
 
 
449 aa  313  2.9999999999999996e-84  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3561  glutathione reductase (NADPH)  35.9 
 
 
450 aa  311  2e-83  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.445732 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02575  regulatory protein  34.73 
 
 
455 aa  297  3e-79  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1019  glutathione reductase  36.02 
 
 
443 aa  281  2e-74  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0912  glutathione reductase  29.22 
 
 
435 aa  221  1.9999999999999999e-56  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2883  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  35.44 
 
 
452 aa  220  3.9999999999999997e-56  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0127  glutathione-disulfide reductase  32.88 
 
 
448 aa  219  7e-56  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2516  glutathione-disulfide reductase  33.33 
 
 
446 aa  215  9.999999999999999e-55  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2392  glutathione reductase  31.93 
 
 
451 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1191  glutathione reductase  29.29 
 
 
446 aa  214  1.9999999999999998e-54  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3006  glutathione-disulfide reductase  31.93 
 
 
451 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2534  NADPH-glutathione reductase  32.36 
 
 
451 aa  213  5.999999999999999e-54  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.23107 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0806  glutathione reductase  29.21 
 
 
443 aa  212  1e-53  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6352  NADPH-glutathione reductase  32.06 
 
 
452 aa  211  3e-53  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3025  glutathione-disulfide reductase  31.71 
 
 
451 aa  210  4e-53  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2174  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerization region  32.74 
 
 
457 aa  210  4e-53  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3039  glutathione-disulfide reductase  32.13 
 
 
450 aa  209  7e-53  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2124  NADPH-glutathione reductase  32.11 
 
 
459 aa  209  7e-53  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.575049  normal  0.929555 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1810  NADPH-glutathione reductase  32.08 
 
 
453 aa  207  4e-52  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.251452  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3050  glutathione-disulfide reductase  31.54 
 
 
451 aa  207  4e-52  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2222  glutathione-disulfide reductase  31.38 
 
 
453 aa  206  5e-52  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.363669  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3030  glutathione-disulfide reductase  31.38 
 
 
453 aa  206  5e-52  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.944241  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3362  glutathione-disulfide reductase  31.38 
 
 
453 aa  206  5e-52  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0498  glutathione-disulfide reductase  31.38 
 
 
453 aa  206  5e-52  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2063  glutathione-disulfide reductase  31.38 
 
 
453 aa  206  5e-52  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0303  glutathione-disulfide reductase  31.38 
 
 
453 aa  206  5e-52  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1411  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  30.96 
 
 
441 aa  206  6e-52  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0317  glutathione-disulfide reductase  31.38 
 
 
453 aa  206  6e-52  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3660  glutathione reductase  31.39 
 
 
451 aa  206  1e-51  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.150077  normal  0.767021 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0682  NADPH-glutathione reductase  29.73 
 
 
459 aa  205  2e-51  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0286379  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0122  glutathione-disulfide reductase  33.71 
 
 
474 aa  204  3e-51  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2915  glutathione-disulfide reductase  31.32 
 
 
451 aa  204  4e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3819  glutathione reductase  31.38 
 
 
451 aa  203  5e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.218299  normal  0.718715 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2244  glutathione reductase  29.93 
 
 
458 aa  203  6e-51  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4054  glutathione reductase  30.34 
 
 
451 aa  203  7e-51  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3938  glutathione reductase  30.34 
 
 
451 aa  202  7e-51  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0358  NADPH-glutathione reductase  34.36 
 
 
452 aa  202  9e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3845  glutathione reductase  29.95 
 
 
451 aa  202  9e-51  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3535  glutathione reductase  31.18 
 
 
451 aa  201  1.9999999999999998e-50  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0669246 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1216  glutathione reductase  31.83 
 
 
448 aa  201  1.9999999999999998e-50  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.286586  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4702  glutathione reductase  30.11 
 
 
451 aa  201  3e-50  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1223  glutathione reductase  30.63 
 
 
460 aa  201  3e-50  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3000  glutathione-disulfide reductase  31.28 
 
 
451 aa  201  3e-50  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.637847  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1950  glutathione reductase  31.38 
 
 
451 aa  201  3e-50  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.447652  normal  0.37845 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0142  glutathione reductase  30.72 
 
 
451 aa  200  3.9999999999999996e-50  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0272  glutathione-disulfide reductase  31.59 
 
 
453 aa  200  5e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4395  glutathione reductase  30.79 
 
 
452 aa  200  5e-50  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0121  glutathione reductase  30.94 
 
 
451 aa  200  5e-50  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5726  glutathione-disulfide reductase  30.09 
 
 
451 aa  199  7e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0567  NADPH-glutathione reductase  29.32 
 
 
459 aa  199  7.999999999999999e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.436662  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3544  glutathione-disulfide reductase  30.84 
 
 
464 aa  198  1.0000000000000001e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.562382  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4259  glutathione reductase  30.56 
 
 
452 aa  199  1.0000000000000001e-49  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2002  glutathione-disulfide reductase  33.33 
 
 
452 aa  199  1.0000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0084  glutathione reductase  30.11 
 
 
451 aa  198  2.0000000000000003e-49  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3188  glutathione reductase  30.93 
 
 
451 aa  197  3e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0121  glutathione reductase  30.56 
 
 
451 aa  197  4.0000000000000005e-49  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.848122  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4220  glutathione reductase  30.56 
 
 
452 aa  196  5.000000000000001e-49  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4714  glutathione reductase  31.43 
 
 
450 aa  197  5.000000000000001e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0947  glutathione reductase  29.38 
 
 
446 aa  196  7e-49  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.666417  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0014  glutathione reductase  31.67 
 
 
450 aa  196  1e-48  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3543  glutathione reductase  30.04 
 
 
451 aa  196  1e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0884  glutathione-disulfide reductase  33.26 
 
 
452 aa  195  1e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.508454 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3877  glutathione reductase  31.1 
 
 
451 aa  195  1e-48  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1608  glutathione reductase  31.58 
 
 
452 aa  195  2e-48  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.128494  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3592  glutathione reductase  30.43 
 
 
452 aa  194  2e-48  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_2004  glutathione reductase  30.64 
 
 
451 aa  195  2e-48  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal  0.0977143 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1693  glutathione reductase  30.88 
 
 
451 aa  194  3e-48  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3485  NADPH-glutathione reductase  30.31 
 
 
461 aa  193  5e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.749861  normal  0.666668 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4068  glutathione reductase  29.82 
 
 
451 aa  193  6e-48  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1359  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  30.49 
 
 
453 aa  192  1e-47  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.485419  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0013  glutathione reductase  31.83 
 
 
450 aa  192  1e-47  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.607831  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4186  glutathione reductase  31.1 
 
 
450 aa  192  1e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0881  glutathione-disulfide reductase  32.07 
 
 
470 aa  192  1e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.449296  normal  0.121667 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2363  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  28.79 
 
 
457 aa  192  1e-47  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.651152  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0973  NADPH-glutathione reductase  31.32 
 
 
462 aa  192  1e-47  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.116342  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0963  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  31.4 
 
 
475 aa  192  1e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.335815  normal  0.311479 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0936  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  31.18 
 
 
475 aa  191  2e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1482  glutathione reductase  29.91 
 
 
461 aa  191  2.9999999999999997e-47  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.327802  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3289  glutathione reductase  29.42 
 
 
459 aa  191  2.9999999999999997e-47  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0414  glutathione reductase  29.5 
 
 
450 aa  190  5e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.263005  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0404  glutathione reductase  29.5 
 
 
450 aa  190  5e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2085  glutathione reductase  29.95 
 
 
462 aa  190  5e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2356  glutathione-disulfide reductase  31.69 
 
 
465 aa  190  5e-47  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2992  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.33 
 
 
459 aa  189  7e-47  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3384  glutathione reductase  29.95 
 
 
461 aa  189  7e-47  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0477625 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2057  glutathione reductase  30.63 
 
 
461 aa  189  1e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal  0.23782 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1966  glutathione reductase  28.95 
 
 
451 aa  188  1e-46  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0842  glutathione reductase  29.29 
 
 
446 aa  188  2e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.118007 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6438  glutathione-disulfide reductase  30.17 
 
 
449 aa  188  2e-46  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.515437 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6145  glutathione-disulfide reductase  30.17 
 
 
449 aa  187  3e-46  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03497  glutathione reductase  31.01 
 
 
449 aa  187  4e-46  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>