More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Gbem_3786 on replicon NC_011146
Organism: Geobacter bemidjiensis Bem



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011146  Gbem_3786  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  100 
 
 		 449 aa  920    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1435  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerization region  40.04 
 
 		 452 aa  355  6.999999999999999e-97  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.125021 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0358  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  42.13 
 
 		 456 aa  334  2e-90  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.208353  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0796  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  38.58 
 
 		 448 aa  331  2e-89  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.608159 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2904  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  39.42 
 
 		 448 aa  331  2e-89  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0570  glutathione reductase (NADPH)  35.82 
 
 		 450 aa  314  1.9999999999999998e-84  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1336  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  37.86 
 
 		 448 aa  313  3.9999999999999997e-84  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.579467 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0666  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  40.68 
 
 		 452 aa  311  2e-83  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3561  glutathione reductase (NADPH)  35.82 
 
 		 450 aa  309  8e-83  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.445732 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1885  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  37.7 
 
 		 449 aa  301  2e-80  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.927345  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1648  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  38.58 
 
 		 450 aa  299  8e-80  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02575  regulatory protein  31.78 
 
 		 455 aa  275  1.0000000000000001e-72  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1019  glutathione reductase  32.82 
 
 		 443 aa  243  7e-63  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3006  glutathione-disulfide reductase  30.23 
 
 		 451 aa  211  2e-53  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2392  glutathione reductase  30.23 
 
 		 451 aa  211  2e-53  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6352  NADPH-glutathione reductase  29.71 
 
 		 452 aa  207  4e-52  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3025  glutathione-disulfide reductase  30 
 
 		 451 aa  207  4e-52  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1254  mercuric reductase  28.98 
 
 		 546 aa  206  5e-52  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3000  glutathione-disulfide reductase  30.23 
 
 		 451 aa  206  7e-52  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.637847  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4533  mercuric reductase  29.21 
 
 		 546 aa  205  2e-51  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2086  mercuric reductase  32.39 
 
 		 550 aa  204  3e-51  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.00764416  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3050  glutathione-disulfide reductase  29.32 
 
 		 451 aa  204  3e-51  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2915  glutathione-disulfide reductase  29.93 
 
 		 451 aa  204  3e-51  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG2023  mercuric reductase  28.76 
 
 		 546 aa  203  6e-51  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3384  glutathione reductase  29.82 
 
 		 461 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0477625 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0912  glutathione reductase  27.86 
 
 		 435 aa  201  1.9999999999999998e-50  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3544  glutathione-disulfide reductase  29.05 
 
 		 464 aa  199  1.0000000000000001e-49  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.562382  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1359  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  29.02 
 
 		 453 aa  198  2.0000000000000003e-49  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.485419  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2057  glutathione reductase  29.15 
 
 		 461 aa  198  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.23782 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2196  glutathione-disulfide reductase  29.84 
 
 		 461 aa  195  2e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3185  mercuric reductase  30.27 
 
 		 546 aa  194  2e-48  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0317  glutathione-disulfide reductase  28.48 
 
 		 453 aa  189  5.999999999999999e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5726  glutathione-disulfide reductase  28.08 
 
 		 451 aa  189  9e-47  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3030  glutathione-disulfide reductase  28.7 
 
 		 453 aa  188  2e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.944241  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3819  glutathione reductase  30.82 
 
 		 451 aa  188  2e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.218299  normal  0.718715 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0303  glutathione-disulfide reductase  28.7 
 
 		 453 aa  188  2e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3362  glutathione-disulfide reductase  28.7 
 
 		 453 aa  188  2e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0498  glutathione-disulfide reductase  28.7 
 
 		 453 aa  188  2e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1608  glutathione reductase  30.73 
 
 		 452 aa  188  2e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.128494  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2063  glutathione-disulfide reductase  28.7 
 
 		 453 aa  188  2e-46  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1950  glutathione reductase  30.82 
 
 		 451 aa  187  2e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.447652  normal  0.37845 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2222  glutathione-disulfide reductase  28.7 
 
 		 453 aa  188  2e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.363669  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3535  glutathione reductase  30.82 
 
 		 451 aa  187  3e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0669246 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0272  glutathione-disulfide reductase  28.73 
 
 		 453 aa  186  1.0000000000000001e-45  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2124  NADPH-glutathione reductase  29.75 
 
 		 459 aa  185  2.0000000000000003e-45  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.575049  normal  0.929555 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0682  NADPH-glutathione reductase  29.68 
 
 		 459 aa  184  4.0000000000000006e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0286379  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2363  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  27.96 
 
 		 457 aa  183  4.0000000000000006e-45  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.651152  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2078  glutathione reductase  28.71 
 
 		 461 aa  184  4.0000000000000006e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.16044 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3188  glutathione reductase  30.59 
 
 		 451 aa  183  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1482  glutathione reductase  27.4 
 
 		 461 aa  181  2e-44  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.327802  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1810  NADPH-glutathione reductase  27.23 
 
 		 453 aa  181  2.9999999999999997e-44  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.251452  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3049  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  30.25 
 
 		 472 aa  180  4e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0397378  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0127  glutathione-disulfide reductase  27.25 
 
 		 448 aa  180  4e-44  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4332  glutathione reductase  26.97 
 
 		 451 aa  180  4.999999999999999e-44  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3485  NADPH-glutathione reductase  29.73 
 
 		 461 aa  180  4.999999999999999e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.749861  normal  0.666668 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2244  glutathione reductase  28.12 
 
 		 458 aa  180  5.999999999999999e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2561  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  30.87 
 
 		 464 aa  180  5.999999999999999e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.177221  normal  1 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1767  mercuric reductase MerA  30.52 
 
 		 548 aa  179  8e-44  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.47974  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1918  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.67 
 
 		 467 aa  178  2e-43  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.646629  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1847  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.67 
 
 		 467 aa  177  3e-43  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0173545  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1216  glutathione reductase  26.98 
 
 		 448 aa  177  3e-43  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.286586  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4269  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.6 
 
 		 462 aa  177  4e-43  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.170998  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4254  glutathione reductase  29.22 
 
 		 466 aa  177  5e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1223  glutathione reductase  27.56 
 
 		 460 aa  176  9e-43  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0842  glutathione reductase  27.17 
 
 		 446 aa  176  9e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.118007 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1033  acetoin/pyruvate dehydrogenase complex, E3 component, dihydrolipoamide dehydrogenase  27.66 
 
 		 584 aa  176  9.999999999999999e-43  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.394953  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3623  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  30.16 
 
 		 456 aa  176  9.999999999999999e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0259828 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1532  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.22 
 
 		 460 aa  176  9.999999999999999e-43  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.631051 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2351  glutathione reductase  28.89 
 
 		 452 aa  176  9.999999999999999e-43  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.150308  normal  0.0125633 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0984  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  27.69 
 
 		 457 aa  175  9.999999999999999e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.365373  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6744  mercuric reductase  29.55 
 
 		 453 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.520469  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1485  NADPH-glutathione reductase  27.92 
 
 		 449 aa  175  1.9999999999999998e-42  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0884  glutathione-disulfide reductase  29.02 
 
 		 452 aa  174  1.9999999999999998e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.508454 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3160  mercuric reductase  29.53 
 
 		 745 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4116  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.76 
 
 		 468 aa  174  2.9999999999999996e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.608117  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0404  glutathione reductase  26.35 
 
 		 450 aa  174  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0414  glutathione reductase  26.35 
 
 		 450 aa  174  2.9999999999999996e-42  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.263005  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1875  NADPH-glutathione reductase  29.89 
 
 		 454 aa  174  2.9999999999999996e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.105853  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0567  NADPH-glutathione reductase  25.47 
 
 		 459 aa  174  3.9999999999999995e-42  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.436662  n/a   
 
 
-
 
NC_012028  Hlac_2992  dihydrolipoamide dehydrogenase  27.44 
 
 		 459 aa  174  3.9999999999999995e-42  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0947  glutathione reductase  26.88 
 
 		 446 aa  173  5e-42  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.666417  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1709  SNARE associated Golgi protein  30.72 
 
 		 720 aa  173  5e-42  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000794028 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3112  glutathione reductase  28.77 
 
 		 452 aa  173  5.999999999999999e-42  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.091737  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1191  glutathione reductase  28.48 
 
 		 446 aa  173  5.999999999999999e-42  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1145  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase family protein  27.69 
 
 		 457 aa  173  6.999999999999999e-42  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00285558  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2009  glutathione reductase  27.19 
 
 		 461 aa  172  7.999999999999999e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0398  dihydrolipoamide dehydrogenase  29.19 
 
 		 467 aa  172  9e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.175439 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5831  mercuric reductase  29.41 
 
 		 455 aa  172  9e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.194109  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2002  glutathione-disulfide reductase  29.23 
 
 		 452 aa  172  1e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3435  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase:pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region:FAD dependent oxidoreductase  30 
 
 		 463 aa  172  1e-41  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0358  NADPH-glutathione reductase  28.79 
 
 		 452 aa  172  1e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0040  glutathione reductase  26.85 
 
 		 443 aa  172  1e-41  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0264  dihydrolipoamide dehydrogenase  27.35 
 
 		 473 aa  172  1e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0454  dihydrolipoamide dehydrogenase  25.9 
 
 		 470 aa  172  1e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_24082  glutathione reductase  27.75 
 
 		 519 aa  172  1e-41  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4513  dihydrolipoamide dehydrogenase  28.41 
 
 		 465 aa  172  1e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0173943  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2463  mercuric reductase  28.57 
 
 		 459 aa  171  2e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.736078 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1070  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  30.96 
 
 		 482 aa  171  2e-41  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3138  dihydrolipoamide dehydrogenase  26.95 
 
 		 465 aa  171  3e-41  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0938  dihydrolipoamide dehydrogenase  27.77 
 
 		 471 aa  171  4e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>