More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Memar_0358 on replicon NC_009051
Organism: Methanoculleus marisnigri JR1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009051  Memar_0358  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  100 
 
 
456 aa  921    Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.208353  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0666  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  50.9 
 
 
452 aa  414  1e-114  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2904  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  48.67 
 
 
448 aa  407  1.0000000000000001e-112  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0796  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  47.33 
 
 
448 aa  395  1e-109  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.608159 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1435  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerization region  42.6 
 
 
452 aa  379  1e-104  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.125021 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1885  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  44.52 
 
 
449 aa  379  1e-104  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.927345  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0570  glutathione reductase (NADPH)  42.98 
 
 
450 aa  375  1e-103  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1336  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  45.01 
 
 
448 aa  374  1e-102  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal  0.579467 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3786  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  42.13 
 
 
449 aa  346  5e-94  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3561  glutathione reductase (NADPH)  40.92 
 
 
450 aa  344  2e-93  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.445732 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1648  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  44.59 
 
 
450 aa  344  2e-93  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02575  regulatory protein  37.89 
 
 
455 aa  309  9e-83  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1019  glutathione reductase  36.67 
 
 
443 aa  266  8e-70  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1810  NADPH-glutathione reductase  32.47 
 
 
453 aa  223  4.9999999999999996e-57  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.251452  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1359  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  33.48 
 
 
453 aa  220  3.9999999999999997e-56  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.485419  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2722  NADPH-glutathione reductase  34.5 
 
 
448 aa  217  2.9999999999999998e-55  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.256149  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6352  NADPH-glutathione reductase  32.97 
 
 
452 aa  214  2.9999999999999995e-54  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3039  glutathione-disulfide reductase  31.8 
 
 
450 aa  214  2.9999999999999995e-54  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0947  glutathione reductase  32.61 
 
 
446 aa  214  2.9999999999999995e-54  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.666417  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG2023  mercuric reductase  30.85 
 
 
546 aa  213  3.9999999999999995e-54  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1254  mercuric reductase  30.92 
 
 
546 aa  213  4.9999999999999996e-54  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2351  glutathione reductase  31.51 
 
 
452 aa  212  1e-53  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.150308  normal  0.0125633 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4533  mercuric reductase  33.56 
 
 
546 aa  211  2e-53  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5726  glutathione-disulfide reductase  30.38 
 
 
451 aa  209  8e-53  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1608  glutathione reductase  31.96 
 
 
452 aa  209  8e-53  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.128494  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4955  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  32.39 
 
 
452 aa  208  1e-52  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.201124  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0404  glutathione reductase  30.92 
 
 
450 aa  208  2e-52  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0912  glutathione reductase  30.14 
 
 
435 aa  208  2e-52  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0414  glutathione reductase  30.92 
 
 
450 aa  208  2e-52  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.263005  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3185  mercuric reductase  34.83 
 
 
546 aa  206  5e-52  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1981  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  33.85 
 
 
461 aa  206  7e-52  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3819  glutathione reductase  32.45 
 
 
451 aa  205  2e-51  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.218299  normal  0.718715 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4254  glutathione reductase  29.87 
 
 
466 aa  204  2e-51  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1216  glutathione reductase  33.56 
 
 
448 aa  204  2e-51  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.286586  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2392  glutathione reductase  32.1 
 
 
451 aa  204  4e-51  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3006  glutathione-disulfide reductase  32.1 
 
 
451 aa  204  4e-51  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1485  NADPH-glutathione reductase  31.99 
 
 
449 aa  202  9e-51  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2928  glutathione reductase  30.92 
 
 
452 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00793619  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1950  glutathione reductase  32.45 
 
 
451 aa  202  9.999999999999999e-51  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.447652  normal  0.37845 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2002  glutathione-disulfide reductase  31.81 
 
 
452 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0884  glutathione-disulfide reductase  31.15 
 
 
452 aa  201  1.9999999999999998e-50  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal  0.508454 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2124  NADPH-glutathione reductase  31.49 
 
 
459 aa  201  1.9999999999999998e-50  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.575049  normal  0.929555 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3188  glutathione reductase  32.01 
 
 
451 aa  200  3.9999999999999996e-50  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2363  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  29.85 
 
 
457 aa  199  6e-50  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.651152  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0806  glutathione reductase  30.09 
 
 
443 aa  199  6e-50  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2915  glutathione-disulfide reductase  33.87 
 
 
451 aa  199  7e-50  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3025  glutathione-disulfide reductase  31.66 
 
 
451 aa  199  7e-50  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0358  NADPH-glutathione reductase  31.59 
 
 
452 aa  198  1.0000000000000001e-49  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0842  glutathione reductase  30.97 
 
 
446 aa  199  1.0000000000000001e-49  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.118007 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3535  glutathione reductase  31.79 
 
 
451 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0669246 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3000  glutathione-disulfide reductase  32.6 
 
 
451 aa  198  1.0000000000000001e-49  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.637847  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4332  glutathione reductase  29.76 
 
 
451 aa  198  2.0000000000000003e-49  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25010  glutathione reductase  31.59 
 
 
452 aa  197  3e-49  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2534  NADPH-glutathione reductase  32.83 
 
 
451 aa  197  3e-49  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.23107 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3050  glutathione-disulfide reductase  34.1 
 
 
451 aa  197  3e-49  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1451  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.85 
 
 
466 aa  197  4.0000000000000005e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0127  glutathione-disulfide reductase  30.17 
 
 
448 aa  196  5.000000000000001e-49  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2516  glutathione-disulfide reductase  30.67 
 
 
446 aa  196  5.000000000000001e-49  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1851  glutathione reductase  29.45 
 
 
449 aa  196  7e-49  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.893411 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0074  dihydrolipoamide dehydrogenase  30.59 
 
 
462 aa  194  2e-48  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.490103  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0567  NADPH-glutathione reductase  29.51 
 
 
459 aa  194  2e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.436662  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5390  pyridine nucleotide-disulfide oxidoreductase dimerization region  34.64 
 
 
465 aa  195  2e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.685666 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3384  glutathione reductase  30.65 
 
 
461 aa  194  4e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.0477625 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2174  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerization region  30.65 
 
 
457 aa  193  6e-48  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2244  glutathione reductase  30.9 
 
 
458 aa  192  8e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3543  glutathione reductase  30.26 
 
 
451 aa  192  8e-48  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06311  glutathione reductase (NADPH)  30.66 
 
 
454 aa  192  8e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1095  glutathione-disulfide reductase  30.44 
 
 
460 aa  192  9e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.223789  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2195  alpha keto acid dehydrogenase complex, E3 component, lipoamide dehydrogenase, putative  28.86 
 
 
447 aa  192  1e-47  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0682  NADPH-glutathione reductase  31.09 
 
 
459 aa  192  1e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0286379  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3112  glutathione reductase  30.95 
 
 
452 aa  191  2e-47  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.091737  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2979  glutathione reductase  31.17 
 
 
452 aa  192  2e-47  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0361278  normal  0.327486 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2196  glutathione-disulfide reductase  30.82 
 
 
461 aa  191  2e-47  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3742  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  33.63 
 
 
474 aa  191  2e-47  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2085  glutathione reductase  30.74 
 
 
462 aa  190  4e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3845  glutathione reductase  28.63 
 
 
451 aa  190  4e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3263  glutathione reductase  30.55 
 
 
451 aa  189  5.999999999999999e-47  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.383038  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_1191  glutathione reductase  30.39 
 
 
446 aa  190  5.999999999999999e-47  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2009  glutathione reductase  33.33 
 
 
461 aa  189  7e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38330  glutathione reductase  30.33 
 
 
451 aa  189  7e-47  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.0328915 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0840  mercuric reductase  30.04 
 
 
469 aa  189  8e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2228  glutathione reductase  32.47 
 
 
461 aa  189  8e-47  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.941122  normal  0.773983 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2903  mercuric reductase  33.03 
 
 
767 aa  189  1e-46  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4054  glutathione reductase  28.79 
 
 
451 aa  189  1e-46  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3938  glutathione reductase  28.79 
 
 
451 aa  189  1e-46  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4395  glutathione reductase  28.95 
 
 
452 aa  188  2e-46  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3419  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  32.77 
 
 
477 aa  188  2e-46  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.195159  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06231  glutathione reductase (NADPH)  29.91 
 
 
454 aa  188  2e-46  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1571  glutathione reductase  30.07 
 
 
463 aa  187  2e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.483199  normal  0.747799 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3913  glutathione reductase  30.37 
 
 
450 aa  188  2e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3544  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  29.98 
 
 
455 aa  187  3e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3435  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase:pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region:FAD dependent oxidoreductase  33.26 
 
 
463 aa  187  4e-46  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0976  NADPH-glutathione reductase  31.82 
 
 
452 aa  187  4e-46  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.911583  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4068  glutathione reductase  27.95 
 
 
451 aa  187  4e-46  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3669  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  31.75 
 
 
466 aa  187  4e-46  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.369147  normal 
 
 
-
 
NC_006348  BMA3362  glutathione-disulfide reductase  31.58 
 
 
453 aa  186  5e-46  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0498  glutathione-disulfide reductase  31.58 
 
 
453 aa  186  5e-46  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0303  glutathione-disulfide reductase  31.58 
 
 
453 aa  186  5e-46  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2222  glutathione-disulfide reductase  31.58 
 
 
453 aa  186  5e-46  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.363669  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3030  glutathione-disulfide reductase  31.58 
 
 
453 aa  186  5e-46  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.944241  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>