More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic_3742 on replicon NC_010682
Organism: Ralstonia pickettii 12J



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010682  Rpic_3742  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  100 
 
 		 474 aa  937    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3419  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  95.39 
 
 		 477 aa  880    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.195159  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0014  glutathione reductase oxidoreductase protein  74.26 
 
 		 481 aa  618  1e-176  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.288559 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3435  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase:pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region:FAD dependent oxidoreductase  51.94 
 
 		 463 aa  430  1e-119  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3554  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  51.94 
 
 		 493 aa  394  1e-108  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4955  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  37.39 
 
 		 452 aa  273  3e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.201124  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3000  glutathione-disulfide reductase  38.32 
 
 		 451 aa  263  6.999999999999999e-69  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.637847  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1095  glutathione-disulfide reductase  34.88 
 
 		 460 aa  262  8e-69  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.223789  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3039  glutathione-disulfide reductase  33.69 
 
 		 450 aa  261  2e-68  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1359  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  36.42 
 
 		 453 aa  259  8e-68  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.485419  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1485  NADPH-glutathione reductase  36.44 
 
 		 449 aa  256  4e-67  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2392  glutathione reductase  38.3 
 
 		 451 aa  256  5e-67  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3006  glutathione-disulfide reductase  38.3 
 
 		 451 aa  256  5e-67  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2244  glutathione reductase  35.83 
 
 		 458 aa  256  8e-67  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4747  glutathione reductase  34.25 
 
 		 447 aa  256  8e-67  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3025  glutathione-disulfide reductase  38.09 
 
 		 451 aa  256  9e-67  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2915  glutathione-disulfide reductase  38.51 
 
 		 451 aa  255  1.0000000000000001e-66  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2124  NADPH-glutathione reductase  35.85 
 
 		 459 aa  254  3e-66  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.575049  normal  0.929555 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3050  glutathione-disulfide reductase  38.11 
 
 		 451 aa  254  3e-66  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4332  glutathione reductase  34.04 
 
 		 451 aa  253  4.0000000000000004e-66  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2174  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerization region  35.7 
 
 		 457 aa  253  5.000000000000001e-66  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2351  glutathione reductase  36.55 
 
 		 452 aa  253  5.000000000000001e-66  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.150308  normal  0.0125633 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6352  NADPH-glutathione reductase  37.87 
 
 		 452 aa  252  9.000000000000001e-66  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3535  glutathione reductase  37.18 
 
 		 451 aa  250  3e-65  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0669246 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3112  glutathione reductase  36.59 
 
 		 452 aa  249  5e-65  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.091737  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2516  glutathione-disulfide reductase  36.44 
 
 		 446 aa  250  5e-65  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3030  glutathione-disulfide reductase  38.51 
 
 		 453 aa  249  7e-65  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.944241  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0303  glutathione-disulfide reductase  38.51 
 
 		 453 aa  249  7e-65  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3362  glutathione-disulfide reductase  38.51 
 
 		 453 aa  249  7e-65  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0498  glutathione-disulfide reductase  38.51 
 
 		 453 aa  249  7e-65  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2063  glutathione-disulfide reductase  38.51 
 
 		 453 aa  249  7e-65  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2222  glutathione-disulfide reductase  38.51 
 
 		 453 aa  249  7e-65  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.363669  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1223  glutathione reductase  36.33 
 
 		 460 aa  249  8e-65  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1810  NADPH-glutathione reductase  34.89 
 
 		 453 aa  249  8e-65  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.251452  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0317  glutathione-disulfide reductase  38.3 
 
 		 453 aa  248  1e-64  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2979  glutathione reductase  37.01 
 
 		 452 aa  248  2e-64  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0361278  normal  0.327486 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5726  glutathione-disulfide reductase  34.75 
 
 		 451 aa  247  3e-64  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2363  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  34.46 
 
 		 457 aa  247  3e-64  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.651152  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38330  glutathione reductase  37.79 
 
 		 451 aa  246  4.9999999999999997e-64  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0328915 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4254  glutathione reductase  35.52 
 
 		 466 aa  246  8e-64  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1216  glutathione reductase  35.47 
 
 		 448 aa  246  9e-64  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.286586  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0884  glutathione-disulfide reductase  37.97 
 
 		 452 aa  245  9.999999999999999e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.508454 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3289  glutathione reductase  35.39 
 
 		 459 aa  245  9.999999999999999e-64  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3263  glutathione reductase  37.58 
 
 		 451 aa  245  9.999999999999999e-64  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.383038  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3188  glutathione reductase  36.97 
 
 		 451 aa  245  1.9999999999999999e-63  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0842  glutathione reductase  36.38 
 
 		 446 aa  244  3e-63  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.118007 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3544  glutathione-disulfide reductase  34.93 
 
 		 464 aa  244  3e-63  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.562382  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2534  NADPH-glutathione reductase  35.24 
 
 		 451 aa  244  3e-63  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.23107 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0682  NADPH-glutathione reductase  34.75 
 
 		 459 aa  243  3.9999999999999997e-63  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0286379  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0414  glutathione reductase  32.7 
 
 		 450 aa  243  5e-63  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.263005  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0404  glutathione reductase  32.7 
 
 		 450 aa  243  5e-63  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3819  glutathione reductase  36.76 
 
 		 451 aa  242  1e-62  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.218299  normal  0.718715 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1950  glutathione reductase  37.18 
 
 		 451 aa  242  1e-62  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.447652  normal  0.37845 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2696  glutathione-disulfide reductase  36.71 
 
 		 460 aa  242  1e-62  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.719185  normal  0.0349203 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0272  glutathione-disulfide reductase  37.45 
 
 		 453 aa  241  2e-62  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25010  glutathione reductase  38.19 
 
 		 452 aa  241  2e-62  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1608  glutathione reductase  33.19 
 
 		 452 aa  240  4e-62  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.128494  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3485  NADPH-glutathione reductase  34.82 
 
 		 461 aa  240  5e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.749861  normal  0.666668 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3384  glutathione reductase  33.76 
 
 		 461 aa  239  5.999999999999999e-62  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0477625 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0567  NADPH-glutathione reductase  32.77 
 
 		 459 aa  238  1e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.436662  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2228  glutathione reductase  33.54 
 
 		 461 aa  238  2e-61  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.941122  normal  0.773983 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1851  glutathione reductase  35.46 
 
 		 449 aa  238  2e-61  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.893411 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0122  glutathione-disulfide reductase  34.89 
 
 		 474 aa  238  2e-61  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2057  glutathione reductase  34.46 
 
 		 461 aa  237  3e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.23782 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2928  glutathione reductase  36.08 
 
 		 452 aa  237  4e-61  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00793619  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2085  glutathione reductase  32.77 
 
 		 462 aa  236  6e-61  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2301  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  36.46 
 
 		 466 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0108496  hitchhiker  0.00487639 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2002  glutathione-disulfide reductase  36.5 
 
 		 452 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2009  glutathione reductase  33.12 
 
 		 461 aa  234  2.0000000000000002e-60  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2722  NADPH-glutathione reductase  35.32 
 
 		 448 aa  234  2.0000000000000002e-60  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.256149  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0881  glutathione-disulfide reductase  33.97 
 
 		 470 aa  234  3e-60  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.449296  normal  0.121667 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1375  glutathione reductase  33.26 
 
 		 449 aa  233  5e-60  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.013918  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06311  glutathione reductase (NADPH)  32.77 
 
 		 454 aa  233  5e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3544  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  35.58 
 
 		 455 aa  233  6e-60  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1482  glutathione reductase  34.45 
 
 		 461 aa  232  1e-59  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.327802  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2257  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  36.19 
 
 		 466 aa  231  2e-59  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0633588  normal  0.450823 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3543  glutathione reductase  32.29 
 
 		 451 aa  231  2e-59  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2576  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  36.65 
 
 		 461 aa  231  2e-59  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.135925  normal  0.213625 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0358  NADPH-glutathione reductase  36.29 
 
 		 452 aa  231  3e-59  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0973  NADPH-glutathione reductase  33.83 
 
 		 462 aa  231  3e-59  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.116342  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4666  glutathione-disulfide reductase  35.74 
 
 		 466 aa  230  5e-59  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_4780  glutathione-disulfide reductase  35.82 
 
 		 466 aa  229  8e-59  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.325962  normal  0.417103 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3224  glutathione-disulfide reductase  34.68 
 
 		 455 aa  229  1e-58  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.354787  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0643  NADPH-glutathione reductase  34.74 
 
 		 459 aa  228  1e-58  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0976  NADPH-glutathione reductase  36.82 
 
 		 452 aa  226  5.0000000000000005e-58  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.911583  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2094  glutathione reductase  31.85 
 
 		 464 aa  226  7e-58  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0127  glutathione-disulfide reductase  33.12 
 
 		 448 aa  225  1e-57  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18091  glutathione reductase (NADPH)  36 
 
 		 453 aa  224  2e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0957316 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1981  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  34.75 
 
 		 461 aa  224  2e-57  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05931  glutathione reductase (NADPH)  33.12 
 
 		 454 aa  224  4e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.351259  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1012  glutathione reductase  31.85 
 
 		 464 aa  224  4e-57  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.853309  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0140  glutathione reductase  29.75 
 
 		 456 aa  224  4e-57  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1875  NADPH-glutathione reductase  35.23 
 
 		 454 aa  223  4.9999999999999996e-57  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.105853  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2883  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  35.29 
 
 		 452 aa  223  4.9999999999999996e-57  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2196  glutathione-disulfide reductase  34.02 
 
 		 461 aa  223  7e-57  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2078  glutathione reductase  34.39 
 
 		 461 aa  223  7e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.16044 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0978  glutathione reductase  31.85 
 
 		 464 aa  223  8e-57  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.200707  n/a   
 
 
-
 
NC_006687  CNE01560  glutathione-disulfide reductase, putative  31.33 
 
 		 479 aa  222  9.999999999999999e-57  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06231  glutathione reductase (NADPH)  32.08 
 
 		 454 aa  221  1.9999999999999999e-56  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0003  NADPH-glutathione reductase  33.12 
 
 		 453 aa  221  1.9999999999999999e-56  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>