More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RSc0014 on replicon NC_003295
Organism: Ralstonia solanacearum GMI1000



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003295  RSc0014  glutathione reductase oxidoreductase protein  100 
 
 		 481 aa  937    Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  0.288559 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3742  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  74.26 
 
 		 474 aa  655    Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3419  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  74.32 
 
 		 477 aa  651    Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.195159  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3435  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase:pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region:FAD dependent oxidoreductase  50.96 
 
 		 463 aa  427  1e-118  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3554  FAD-dependent pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase  52.93 
 
 		 493 aa  394  1e-108  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_3000  glutathione-disulfide reductase  38.94 
 
 		 451 aa  280  3e-74  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.637847  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4955  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  38.43 
 
 		 452 aa  273  3e-72  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.201124  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1095  glutathione-disulfide reductase  34.84 
 
 		 460 aa  271  2e-71  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.223789  normal  1 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3025  glutathione-disulfide reductase  38.06 
 
 		 451 aa  271  2e-71  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2351  glutathione reductase  38.46 
 
 		 452 aa  271  2e-71  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.150308  normal  0.0125633 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6352  NADPH-glutathione reductase  38.41 
 
 		 452 aa  270  2.9999999999999997e-71  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0682  NADPH-glutathione reductase  36.99 
 
 		 459 aa  271  2.9999999999999997e-71  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.0286379  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3039  glutathione-disulfide reductase  33.76 
 
 		 450 aa  270  4e-71  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2392  glutathione reductase  38.06 
 
 		 451 aa  270  5e-71  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3006  glutathione-disulfide reductase  38.06 
 
 		 451 aa  270  5e-71  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1359  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  37.23 
 
 		 453 aa  266  4e-70  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.485419  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2915  glutathione-disulfide reductase  38.35 
 
 		 451 aa  266  8e-70  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3535  glutathione reductase  38.89 
 
 		 451 aa  266  8.999999999999999e-70  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0669246 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_3050  glutathione-disulfide reductase  38.25 
 
 		 451 aa  265  1e-69  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2244  glutathione reductase  34.31 
 
 		 458 aa  265  2e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2516  glutathione-disulfide reductase  38.12 
 
 		 446 aa  264  3e-69  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3188  glutathione reductase  38.98 
 
 		 451 aa  263  4e-69  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4747  glutathione reductase  33.62 
 
 		 447 aa  263  8e-69  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3819  glutathione reductase  38.46 
 
 		 451 aa  262  1e-68  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.218299  normal  0.718715 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1950  glutathione reductase  38.89 
 
 		 451 aa  262  1e-68  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.447652  normal  0.37845 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1810  NADPH-glutathione reductase  36.55 
 
 		 453 aa  261  3e-68  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.251452  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0317  glutathione-disulfide reductase  38.19 
 
 		 453 aa  260  4e-68  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3263  glutathione reductase  38.25 
 
 		 451 aa  259  5.0000000000000005e-68  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.383038  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3362  glutathione-disulfide reductase  38.22 
 
 		 453 aa  259  7e-68  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0498  glutathione-disulfide reductase  38.22 
 
 		 453 aa  259  7e-68  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2063  glutathione-disulfide reductase  38.22 
 
 		 453 aa  259  7e-68  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2222  glutathione-disulfide reductase  38.22 
 
 		 453 aa  259  7e-68  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.363669  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0303  glutathione-disulfide reductase  38.22 
 
 		 453 aa  259  7e-68  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3030  glutathione-disulfide reductase  38.22 
 
 		 453 aa  259  7e-68  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.944241  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0122  glutathione-disulfide reductase  36.54 
 
 		 474 aa  259  9e-68  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0842  glutathione reductase  36.09 
 
 		 446 aa  258  1e-67  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.118007 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4332  glutathione reductase  32.12 
 
 		 451 aa  259  1e-67  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38330  glutathione reductase  38.25 
 
 		 451 aa  258  1e-67  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0328915 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25010  glutathione reductase  39.74 
 
 		 452 aa  258  1e-67  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3112  glutathione reductase  37.39 
 
 		 452 aa  257  4e-67  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.091737  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2534  NADPH-glutathione reductase  37.02 
 
 		 451 aa  256  5e-67  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.23107 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0127  glutathione-disulfide reductase  36.89 
 
 		 448 aa  256  6e-67  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5726  glutathione-disulfide reductase  35.79 
 
 		 451 aa  256  6e-67  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1216  glutathione reductase  35.39 
 
 		 448 aa  256  7e-67  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.286586  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2979  glutathione reductase  37.18 
 
 		 452 aa  255  1.0000000000000001e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0361278  normal  0.327486 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2228  glutathione reductase  35.39 
 
 		 461 aa  255  1.0000000000000001e-66  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.941122  normal  0.773983 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2174  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerization region  36.55 
 
 		 457 aa  254  2.0000000000000002e-66  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1223  glutathione reductase  36.03 
 
 		 460 aa  254  3e-66  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0272  glutathione-disulfide reductase  37.58 
 
 		 453 aa  254  3e-66  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4254  glutathione reductase  36.05 
 
 		 466 aa  253  4.0000000000000004e-66  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1608  glutathione reductase  34.4 
 
 		 452 aa  253  7e-66  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.128494  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3289  glutathione reductase  33.4 
 
 		 459 aa  251  1e-65  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2009  glutathione reductase  34.97 
 
 		 461 aa  252  1e-65  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2085  glutathione reductase  33.83 
 
 		 462 aa  251  2e-65  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3544  glutathione-disulfide reductase  36.08 
 
 		 464 aa  251  2e-65  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.562382  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1485  NADPH-glutathione reductase  36.11 
 
 		 449 aa  249  7e-65  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2696  glutathione-disulfide reductase  36.79 
 
 		 460 aa  249  1e-64  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.719185  normal  0.0349203 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2928  glutathione reductase  37.18 
 
 		 452 aa  248  2e-64  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  decreased coverage  0.00793619  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2722  NADPH-glutathione reductase  37.23 
 
 		 448 aa  248  2e-64  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.256149  normal  1 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0567  NADPH-glutathione reductase  30.75 
 
 		 459 aa  247  3e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.436662  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1851  glutathione reductase  33.62 
 
 		 449 aa  246  6.999999999999999e-64  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.893411 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0884  glutathione-disulfide reductase  36.75 
 
 		 452 aa  245  9.999999999999999e-64  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.508454 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0881  glutathione-disulfide reductase  36.11 
 
 		 470 aa  244  1.9999999999999999e-63  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.449296  normal  0.121667 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2124  NADPH-glutathione reductase  35.68 
 
 		 459 aa  243  5e-63  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.575049  normal  0.929555 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2363  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  32.84 
 
 		 457 aa  243  7.999999999999999e-63  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.651152  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4780  glutathione-disulfide reductase  36.75 
 
 		 466 aa  241  2e-62  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.325962  normal  0.417103 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3485  NADPH-glutathione reductase  34.33 
 
 		 461 aa  241  2e-62  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.749861  normal  0.666668 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0414  glutathione reductase  31.41 
 
 		 450 aa  240  2.9999999999999997e-62  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.263005  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0404  glutathione reductase  31.41 
 
 		 450 aa  240  2.9999999999999997e-62  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2002  glutathione-disulfide reductase  35.94 
 
 		 452 aa  240  4e-62  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1482  glutathione reductase  34.54 
 
 		 461 aa  240  5e-62  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.327802  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2094  glutathione reductase  33.62 
 
 		 464 aa  239  5.999999999999999e-62  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06311  glutathione reductase (NADPH)  30.28 
 
 		 454 aa  239  5.999999999999999e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4666  glutathione-disulfide reductase  36.92 
 
 		 466 aa  239  6.999999999999999e-62  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1571  glutathione reductase  34.67 
 
 		 463 aa  238  1e-61  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.483199  normal  0.747799 
 
 
-
 
NC_004310  BR1012  glutathione reductase  32.62 
 
 		 464 aa  238  1e-61  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.853309  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2356  glutathione-disulfide reductase  37.42 
 
 		 465 aa  239  1e-61  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06231  glutathione reductase (NADPH)  29.85 
 
 		 454 aa  237  3e-61  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2057  glutathione reductase  34.12 
 
 		 461 aa  237  4e-61  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.23782 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0358  NADPH-glutathione reductase  35.73 
 
 		 452 aa  236  5.0000000000000005e-61  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3224  glutathione-disulfide reductase  36.32 
 
 		 455 aa  236  6e-61  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.354787  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0978  glutathione reductase  32.41 
 
 		 464 aa  236  6e-61  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.200707  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_05931  glutathione reductase (NADPH)  30.49 
 
 		 454 aa  235  1.0000000000000001e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.351259  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2301  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  36.5 
 
 		 466 aa  235  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0108496  hitchhiker  0.00487639 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3384  glutathione reductase  33.12 
 
 		 461 aa  235  1.0000000000000001e-60  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0477625 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1461  glutathione reductase  34.87 
 
 		 460 aa  234  2.0000000000000002e-60  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0536  glutathione-disulfide reductase  36.81 
 
 		 449 aa  234  3e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.00586443  unclonable  0.0000000000392976 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3543  glutathione reductase  34.18 
 
 		 451 aa  234  3e-60  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0366  glutathione reductase  36.81 
 
 		 449 aa  234  3e-60  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.736055  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1957  NADPH-glutathione reductase  33.55 
 
 		 451 aa  234  3e-60  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.168279 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2576  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  36.29 
 
 		 461 aa  233  4.0000000000000004e-60  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.135925  normal  0.213625 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0973  NADPH-glutathione reductase  32.63 
 
 		 462 aa  233  6e-60  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.116342  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2257  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  36.34 
 
 		 466 aa  233  7.000000000000001e-60  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0633588  normal  0.450823 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0604  glutathione reductase  33.83 
 
 		 461 aa  229  7e-59  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.633864  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_24082  glutathione reductase  32.38 
 
 		 519 aa  228  1e-58  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3544  pyridine nucleotide-disulphide oxidoreductase dimerisation region  35.16 
 
 		 455 aa  228  2e-58  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2196  glutathione-disulfide reductase  33.48 
 
 		 461 aa  227  3e-58  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0003  NADPH-glutathione reductase  33.26 
 
 		 453 aa  227  4e-58  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3660  glutathione reductase  33.68 
 
 		 451 aa  226  5.0000000000000005e-58  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.150077  normal  0.767021 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3174  NADPH-glutathione reductase  33.4 
 
 		 484 aa  226  7e-58  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>